itchange from mm/yr to m/yr in matlab files - cosmo - front and backend for Markov-Chain Monte Carlo inversion of cosmogenic nuclide concentrations	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
hgit clone git://src.adamsgaard.dk/cosmo	URL:git://src.adamsgaard.dk/cosmo	mx1.adamsgaard.dk	70
1Log	/src/log.gph	mx1.adamsgaard.dk	70
1Files	/src/files.gph	mx1.adamsgaard.dk	70
1Refs	/src/refs.gph	mx1.adamsgaard.dk	70
1README	/src/file/README.md.gph	mx1.adamsgaard.dk	70
1LICENSE	/src/file/LICENSE.gph	mx1.adamsgaard.dk	70
i---	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
1commit 56a526072365d711c52d0350ce0e90670cacaa02	/src/commit/56a526072365d711c52d0350ce0e90670cacaa02.gph	mx1.adamsgaard.dk	70
1parent 74cedd1436caf6714e2420a0d876d372a2ea344a	/src/commit/74cedd1436caf6714e2420a0d876d372a2ea344a.gph	mx1.adamsgaard.dk	70
hAuthor: Anders Damsgaard <anders.damsgaard@geo.au.dk>	URL:mailto:anders.damsgaard@geo.au.dk	mx1.adamsgaard.dk	70
iDate:   Thu,  3 Dec 2015 12:34:04 +0100	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
ichange from mm/yr to m/yr in matlab files	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
iDiffstat:	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i  M matlab/generate_plots.m             |      36 ++++++++++++++++----------------	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i  M matlab/import_php_file.m            |      10 +++++-----	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i2 files changed, 23 insertions(+), 23 deletions(-)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i---	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
1diff --git a/matlab/generate_plots.m b/matlab/generate_plots.m	/src/file/matlab/generate_plots.m.gph	mx1.adamsgaard.dk	70
it@@ -241,8 +241,8 @@ for i1 = 1:M % for each model parameter	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     %bar(xbins{i1},Nhistc,'histc')	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     if i1 == 1 || i1 == 2	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-        % change units from mm/yr to m/Myr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-        histogram(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1000., xbins{i1}*1000.);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+        % change units from m/yr to m/Myr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+        histogram(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1.0e6, xbins{i1}*1.0e6);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     else	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         histogram(Ss{iwalk}.ms(i1,:), xbins{i1});	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     end	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
it@@ -254,9 +254,9 @@ for i1 = 1:M % for each model parameter	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         xlabel('\epsilon_{int} [m/Myr]')	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         text(0.02,0.98,'a', 'Units', ...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i             'Normalized', 'VerticalAlignment', 'Top')	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-        epsilon_int_25(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1000., 25);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-        epsilon_int_50(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1000., 50);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-        epsilon_int_75(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1000., 75);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+        epsilon_int_25(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1.0e6, 25);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+        epsilon_int_50(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1.0e6, 50);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+        epsilon_int_75(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1.0e6, 75);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     elseif i1 == 2	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         %xlabel('Glacial erosion rate [mm/yr]')	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
it@@ -264,9 +264,9 @@ for i1 = 1:M % for each model parameter	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         xlabel('\epsilon_{gla} [m/Myr]')	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         text(0.02,0.98,'b', 'Units', ...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i             'Normalized', 'VerticalAlignment', 'Top')	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-        epsilon_gla_25(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1000., 25);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-        epsilon_gla_50(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1000., 50);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-        epsilon_gla_75(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1000., 75);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+        epsilon_gla_25(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1.0e6, 25);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+        epsilon_gla_50(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1.0e6, 50);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+        epsilon_gla_75(iwalk) = prctile(Ss{iwalk}.ms(i1,:)*1.0e6, 75);	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     elseif i1 == 3	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         %xlabel('Timing of last deglaciation [yr]')	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
it@@ -292,8 +292,8 @@ for i1 = 1:M % for each model parameter	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     if i1 == 1 || i1 == 2 % shift axes for new units	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         switch mDistr(i1,:)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-            case 'uniform', set(gca,'xscale','lin','xlim',mminmax(i1,:)*1000.)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-            case 'logunif', set(gca,'xscale','log','xlim',mminmax(i1,:)*1000.)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+            case 'uniform', set(gca,'xscale','lin','xlim',mminmax(i1,:)*1.0e6)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+            case 'logunif', set(gca,'xscale','log','xlim',mminmax(i1,:)*1.0e6)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         end	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     else	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         switch mDistr(i1,:)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
it@@ -317,7 +317,7 @@ for i1 = 1:M % for each model parameter	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     data = [];	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     for iwalker=1:Nwalkers	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         if i1 == 1 || i1 == 2	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-            data = [data, Ss{iwalker}.ms(i1,:)*1000.];	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+            data = [data, Ss{iwalker}.ms(i1,:)*1.0e6];	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         else	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i             data = [data, Ss{iwalker}.ms(i1,:)];	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         end	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
it@@ -327,7 +327,7 @@ for i1 = 1:M % for each model parameter	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     %Nhistc=histc(data, xbins{i1});	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     %bar(xbins{i1},Nhistc,'histc')	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     if i1 == 1 || i1 == 2	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-        xbins{i1} = xbins{i1}*1000.; % change to m/Myr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+        xbins{i1} = xbins{i1}*1.0e6; % change to m/Myr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     end	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     histogram(data, xbins{i1});	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
it@@ -399,8 +399,8 @@ for i1 = 1:M % for each model parameter	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     if i1 == 1 || i1 == 2 % shift axes for new units	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         switch mDistr(i1,:)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-            case 'uniform', set(gca,'xscale','lin','xlim',mminmax(i1,:)*1000.)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-            case 'logunif', set(gca,'xscale','log','xlim',mminmax(i1,:)*1000.)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+            case 'uniform', set(gca,'xscale','lin','xlim',mminmax(i1,:)*1.0e6)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+            case 'logunif', set(gca,'xscale','log','xlim',mminmax(i1,:)*1.0e6)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         end	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     else	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i         switch mDistr(i1,:)	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
it@@ -943,13 +943,13 @@ html = ['\n' ...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     '        </tr>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     '        <tr>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     '            <td>&epsilon;<sub>gla</sub></td>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-    '            <td>' num2str(epsilon_gla_min*1000.) ...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-    ' to ' num2str(epsilon_gla_max*1000.) ' m/Myr</td>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+    '            <td>' num2str(epsilon_gla_min*1.0e6) ...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+    ' to ' num2str(epsilon_gla_max*1.0e6) ' m/Myr</td>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     '        </tr>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     '        <tr>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     '            <td>&epsilon;<sub>int</sub></td>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-    '            <td>' num2str(epsilon_int_min*1000.) ...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-    ' to ' num2str(epsilon_int_max*1000.) ' m/Myr</td>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+    '            <td>' num2str(epsilon_int_min*1.0e6) ...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+    ' to ' num2str(epsilon_int_max*1.0e6) ' m/Myr</td>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     '        </tr>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     '        <tr>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i     '            <td><i>t</i><sub>degla</sub></td>\n'...	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
1diff --git a/matlab/import_php_file.m b/matlab/import_php_file.m	/src/file/matlab/import_php_file.m.gph	mx1.adamsgaard.dk	70
it@@ -174,7 +174,7 @@ al_prod_muon = al_prod_muon*1000.; % atoms/g/yr to atoms/kg/yr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i c_prod_muon  =  c_prod_muon*1000.; % atoms/g/yr to atoms/kg/yr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i ne_prod_muon = ne_prod_muon*1000.; % atoms/g/yr to atoms/kg/yr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i 	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-epsilon_gla_min = epsilon_gla_min/1000.; % m/Myr to mm/yr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-epsilon_gla_max = epsilon_gla_max/1000.; % m/Myr to mm/yr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-epsilon_int_min = epsilon_int_min/1000.; % m/Myr to mm/yr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-epsilon_int_max = epsilon_int_max/1000.; % m/Myr to mm/yr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i-\ No newline at end of file	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+epsilon_gla_min = epsilon_gla_min/1.0e6; % m/Myr to m/yr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+epsilon_gla_max = epsilon_gla_max/1.0e6; % m/Myr to m/yr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+epsilon_int_min = epsilon_int_min/1.0e6; % m/Myr to m/yr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+epsilon_int_max = epsilon_int_max/1.0e6; % m/Myr to m/yr	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
i+\ No newline at end of file	Err	mx1.adamsgaard.dk	70
.