'Pseudomonas denitrificans': 30 24 389 137 86 6 27 9 350 403 147 3 63 16 107 178 12 125 14 16 205 192 17 24 111 290 25 108 634 503 92 45 602 105 140 21 373 249 72 39 249 159 58 33 208 101 95 240 330 334 210 81 85 73 10 251 77 9 421 69 226 101 2 7 21 Acetobacter aceti: 10 11 71 26 61 14 6 20 25 189 70 20 23 26 66 19 53 50 13 32 110 49 33 40 35 83 42 68 122 62 93 26 163 39 126 31 46 96 100 86 73 112 61 24 112 51 47 146 39 64 127 78 61 25 12 127 82 7 105 121 133 78 6 1 3 Acetobacter diazotrophicus: 1 1 14 9 8 0 0 0 5 31 0 0 2 0 6 13 0 9 2 1 23 15 0 0 11 26 1 2 32 30 0 5 35 9 9 3 15 16 2 3 5 24 15 4 31 7 9 9 3 23 14 10 11 3 0 33 1 1 18 5 11 9 1 0 0 Acetobacter europaeus: 6 5 81 11 61 10 11 0 15 162 32 1 10 4 65 40 8 65 5 8 115 82 4 7 64 125 24 48 149 109 24 12 211 31 98 6 96 74 38 8 128 106 26 0 114 29 40 100 34 127 87 64 52 26 15 118 12 5 123 31 78 86 3 2 1 Acetobacter liquefaciens: 1 0 17 4 1 0 1 0 10 25 1 0 0 1 5 3 0 11 0 1 25 8 0 0 25 10 0 3 30 17 0 2 42 1 0 0 27 13 0 3 11 16 1 0 12 12 2 7 9 29 4 14 2 0 0 11 1 0 17 0 5 10 0 0 1 Acetobacter pasteurianus: 12 31 99 72 89 33 32 11 63 180 92 10 55 17 54 38 58 77 26 60 77 88 26 67 55 103 43 114 156 97 117 47 164 75 113 40 81 88 106 75 97 99 49 37 131 48 69 119 83 114 148 65 71 47 27 80 72 15 69 79 110 90 6 1 5 Acetobacter polyoxogenes: 5 1 77 8 56 4 4 0 13 148 24 1 7 3 51 35 4 65 5 6 82 60 1 3 47 84 15 33 116 98 20 5 171 36 80 6 78 79 27 9 114 78 12 0 98 21 27 92 32 119 59 41 35 10 11 82 10 4 113 25 77 53 2 1 2 Acetobacter sp.: 4 15 21 24 8 17 12 2 10 25 17 2 6 6 10 10 4 13 5 14 19 12 4 15 14 19 10 14 27 26 15 12 19 15 9 5 13 17 7 18 14 13 5 5 21 6 10 20 11 21 20 9 6 6 6 20 8 6 17 7 22 15 1 1 2 Acetobacter xylinum: 23 41 418 162 247 15 34 12 149 814 212 5 95 55 204 251 35 201 61 84 323 324 21 52 261 413 81 174 562 610 110 83 478 254 189 41 288 416 140 72 240 256 146 39 519 94 185 319 213 373 327 125 209 64 30 312 136 31 422 151 318 198 7 0 16 Acetobacter xylinus: 2 3 37 25 14 2 3 0 9 75 17 3 3 3 23 16 3 21 6 3 36 31 1 2 32 30 5 20 49 61 11 5 60 23 25 6 26 51 19 7 19 27 11 0 44 13 22 45 20 32 45 13 19 4 6 27 12 4 24 16 38 20 0 1 1 Acetobacterium woodii: 4 12 8 15 11 10 0 2 1 10 18 22 22 15 1 8 2 1 15 18 25 10 14 12 4 12 9 25 25 14 27 22 7 14 40 21 7 7 34 48 11 11 25 21 17 2 14 67 16 11 42 5 17 1 4 10 25 11 12 65 31 2 3 1 0 Acetomicrobium flavidum: 3 1 9 2 6 8 11 4 5 20 13 11 24 6 5 1 8 12 0 8 8 12 7 6 16 9 17 14 16 6 18 17 20 15 12 17 19 18 13 12 32 12 14 12 5 9 17 40 25 13 32 13 16 8 7 11 21 23 13 22 26 7 1 2 0 Acholeplasma axanthum: 1 1 0 0 9 11 0 6 1 0 1 8 0 7 0 0 4 2 4 4 0 0 9 5 0 0 3 9 3 0 10 8 0 1 12 6 1 0 16 24 5 3 6 8 1 2 4 22 1 2 4 1 6 1 0 1 3 2 3 10 4 3 1 0 0 Acholeplasma laidlawii: 5 1 1 0 20 35 2 13 2 1 22 83 3 33 0 1 37 5 18 47 6 0 31 54 0 2 24 71 3 6 76 22 17 3 94 48 12 14 69 102 22 32 43 45 3 13 17 102 17 18 64 9 27 3 1 18 46 16 41 79 43 9 5 0 0 Acholeplasma sp.: 1 1 3 0 11 6 0 1 0 0 3 14 0 6 0 0 3 1 0 6 0 0 6 5 0 0 4 9 3 1 10 8 2 0 9 8 0 0 14 23 3 6 9 8 0 0 3 20 1 3 4 3 7 0 0 2 2 0 7 7 3 3 1 0 0 Achromobacter cycloclastes: 3 1 30 6 6 0 2 1 21 40 9 1 7 2 11 20 0 13 0 2 44 25 6 3 11 44 6 14 64 41 10 8 72 7 17 8 44 38 12 5 64 43 10 5 23 20 17 32 36 53 21 24 10 12 0 40 2 0 42 5 42 16 1 1 1 Achromobacter lyticus: 2 10 44 8 5 1 2 1 7 38 2 0 8 1 12 48 2 37 2 0 67 18 2 3 12 36 3 7 52 59 10 6 90 4 17 3 21 26 5 1 27 53 4 8 27 17 7 9 11 37 11 29 7 12 3 29 0 0 32 2 13 19 0 0 2 Acidaminococcus fermentans: 7 0 13 41 38 22 2 0 7 168 3 1 7 1 47 4 16 33 5 1 88 21 12 3 41 47 37 23 121 10 84 16 117 40 47 35 39 77 42 106 74 86 27 4 79 24 30 155 10 80 78 58 39 40 6 75 13 0 117 27 77 31 6 0 1 Acidianus ambivalens: 11 0 0 0 1 41 13 52 7 8 27 124 20 39 11 10 38 14 19 43 6 13 66 51 8 2 43 101 12 13 52 88 17 13 43 90 7 11 56 71 49 35 50 25 19 15 18 61 39 29 49 54 60 8 9 62 50 129 17 65 67 50 7 1 3 Acidiphilium facilis: 1 1 8 9 2 2 1 0 12 7 2 1 2 1 3 9 0 5 3 1 4 8 1 3 9 6 2 4 16 12 2 2 15 24 5 0 8 13 1 13 13 6 5 6 9 4 0 14 9 9 7 9 2 0 0 7 5 2 13 3 11 3 0 0 1 Acidothermus cellulolyticus: 1 3 9 11 0 0 0 2 11 18 1 0 5 2 10 15 3 18 6 9 12 29 2 1 5 34 6 11 17 19 4 12 24 2 8 5 21 17 1 2 8 26 11 5 23 5 1 3 4 20 7 18 4 6 0 13 3 1 11 9 7 22 1 0 0 Acinetobacter anitratus: 1 0 5 0 17 0 0 0 0 0 18 16 3 2 0 0 9 4 2 6 1 2 13 8 1 2 9 12 2 11 17 0 7 0 23 8 0 2 18 21 2 10 7 7 3 12 3 22 4 14 12 12 5 1 3 12 8 0 17 12 15 4 1 0 0 Acinetobacter baumannii: 9 16 38 23 55 8 8 11 27 42 46 64 62 36 13 25 30 27 16 30 30 32 51 32 19 34 26 90 46 62 61 15 61 19 91 36 35 46 67 74 45 45 51 63 46 31 49 112 73 52 88 32 48 18 14 53 67 21 56 63 71 52 6 2 1 Acinetobacter calcoaceticus: 115 194 319 95 899 127 27 303 304 627 620 1149 733 584 133 211 467 328 491 608 602 345 565 693 134 280 502 1319 612 506 726 478 727 259 1307 597 450 651 752 1618 463 527 1260 1281 762 218 698 1642 497 516 1608 318 950 144 307 353 1259 188 633 1695 889 496 83 12 19 Acinetobacter haemolyticus: 2 5 7 2 9 6 1 7 4 2 8 20 5 7 3 3 7 4 11 5 8 5 5 6 0 1 6 14 7 3 11 4 8 3 7 4 5 8 5 25 6 1 13 19 7 1 14 17 5 5 16 4 9 6 1 1 11 3 3 19 11 11 2 0 0 Acinetobacter lwoffii: 2 2 4 0 8 2 0 8 8 10 7 14 9 4 0 7 4 1 4 9 4 6 7 6 3 4 10 17 4 9 12 3 5 1 22 3 3 4 10 22 11 4 14 18 7 3 9 18 1 3 24 4 9 2 3 4 14 1 5 23 9 4 2 0 0 Acinetobacter lwoffii K24: 6 4 51 18 16 1 6 7 30 63 13 1 32 5 11 20 5 22 9 4 25 34 8 9 5 53 5 19 40 82 11 8 65 14 27 17 34 45 19 10 52 29 14 18 42 29 18 48 44 59 36 19 16 7 1 37 14 4 58 16 35 16 3 0 3 Acinetobacter sp.: 28 35 122 47 132 29 17 65 64 183 104 183 169 93 66 54 111 131 84 88 155 77 87 106 45 109 109 206 202 150 178 61 223 69 310 120 124 180 175 312 166 189 247 240 149 84 100 433 183 172 356 113 175 57 66 137 275 69 162 285 261 151 19 3 6 Acinetobacter sp. 13: 1 1 0 2 3 1 0 3 3 3 4 3 1 3 1 2 1 2 0 2 0 1 3 1 0 1 3 8 3 4 0 2 3 1 1 3 1 1 3 3 1 0 3 7 5 1 6 9 1 1 6 0 6 0 1 1 4 0 1 7 6 3 0 0 1 Acinetobacter sp. 6: 1 0 1 1 3 2 0 3 1 0 4 7 4 3 0 1 4 0 2 1 0 0 4 2 1 0 0 10 0 3 2 0 2 1 2 3 2 1 5 6 2 1 3 4 2 1 5 10 4 1 6 0 6 0 1 0 5 2 0 4 4 3 1 0 0 Acinetobacter sp. ADP1: 5 11 17 5 43 7 0 19 27 33 33 64 50 36 8 16 36 18 39 30 26 24 30 31 6 15 30 90 48 31 46 30 35 13 62 34 30 32 31 118 29 26 71 54 49 15 41 84 28 28 80 16 59 4 12 12 82 14 36 119 65 25 4 0 1 Acinetobacter sp. SUN: 1 2 3 2 3 0 3 2 4 2 1 2 3 1 1 2 0 1 0 3 1 2 1 4 1 2 2 6 4 9 5 1 5 6 2 2 5 1 2 0 3 1 1 1 2 3 0 6 14 5 8 3 4 3 1 3 2 3 7 2 2 7 1 0 0 Actinobacillus actinomycetemcomitans: 26 9 84 5 176 16 8 31 27 46 64 172 117 34 74 20 53 65 38 40 124 38 78 40 8 95 42 162 144 147 106 35 180 31 199 107 46 169 112 380 61 108 128 152 39 55 69 290 86 108 160 60 105 26 18 96 82 11 128 202 128 63 21 3 2 Actinobacillus pleuropneumoniae: 70 175 220 47 692 221 30 249 168 216 517 1675 475 518 184 297 490 322 536 410 528 395 507 228 47 415 220 947 342 679 674 487 665 245 1429 664 265 532 660 2085 375 533 1243 1069 320 217 428 1527 514 423 1557 365 909 68 109 496 906 159 604 1425 507 344 63 6 1 Actinobacillus pleuropneumoniae 1: 1 1 0 0 2 1 0 4 0 1 3 16 3 7 1 4 8 3 8 6 4 1 6 10 0 5 3 6 3 5 11 7 7 2 12 13 2 2 7 37 8 2 26 10 3 1 1 20 5 4 23 3 9 0 1 2 4 5 2 11 12 2 1 0 0 Actinobacillus pleuropneumoniae 2: 4 14 10 7 49 20 4 25 16 3 50 137 45 49 4 3 50 23 48 44 11 16 58 20 4 3 22 62 16 21 65 42 31 16 103 66 6 18 68 142 31 29 99 99 17 11 36 120 31 21 111 17 60 2 2 24 72 15 34 135 28 25 4 0 0 Actinobacillus pleuropneumoniae 5: 2 6 5 2 13 12 2 17 5 6 11 53 10 28 8 6 29 14 13 27 6 6 25 8 0 0 10 33 8 4 38 42 9 9 44 25 8 7 32 67 14 16 63 40 10 5 14 37 15 17 67 5 23 1 0 9 26 12 19 55 8 11 2 0 0 Actinobacillus suis: 3 6 5 1 13 12 2 17 5 6 12 55 11 27 5 7 29 15 14 27 8 6 24 8 1 1 10 33 9 4 39 42 10 8 45 26 8 7 30 68 16 17 66 41 8 4 15 39 14 17 67 6 24 1 0 9 25 12 19 57 9 12 2 0 1 Actinomadura hibisca: 11 3 125 78 4 0 6 1 68 160 3 0 7 0 25 49 2 47 1 2 83 49 0 0 58 102 1 2 175 178 3 3 171 54 6 1 114 115 2 1 38 36 1 2 48 60 0 16 142 165 8 59 0 23 0 79 0 0 89 0 55 33 1 1 9 Actinomadura sp.: 1 0 14 8 0 0 3 0 21 32 0 0 0 0 18 9 0 9 0 0 23 11 0 0 21 8 0 2 52 28 1 4 44 13 4 0 28 22 0 0 6 12 0 1 11 7 0 3 40 36 0 8 0 2 0 9 0 0 10 0 10 8 0 0 1 Actinomyces naeslundii: 8 16 78 45 27 4 16 5 75 125 7 1 0 29 104 51 6 59 11 14 192 64 15 21 95 89 37 25 213 67 19 47 167 62 42 2 135 84 11 1 113 112 8 11 106 50 5 12 92 169 19 84 11 18 1 66 1 1 91 6 45 53 0 0 8 Actinomyces pyogenes: 3 10 20 8 10 7 6 4 20 8 12 6 11 7 14 16 10 13 2 7 13 13 6 6 11 8 5 11 19 16 13 22 17 8 10 4 20 7 16 25 16 9 8 12 11 11 6 34 17 20 11 6 8 5 3 12 12 2 12 17 12 15 0 0 3 Actinomyces viscosus: 3 13 61 30 9 1 9 0 47 76 1 0 0 10 62 45 10 56 3 4 152 103 2 11 56 133 15 25 158 86 17 6 140 36 28 1 78 49 8 0 100 94 1 3 79 51 4 7 82 122 15 54 0 20 3 35 0 1 77 4 22 32 0 0 3 Actinoplanes ATCC31351: 1 0 11 8 3 0 0 0 15 28 0 0 1 0 5 5 0 3 0 1 15 2 0 0 5 15 0 0 27 17 0 1 30 3 4 0 14 8 0 0 18 13 0 0 13 11 0 0 24 37 1 11 1 0 0 22 0 0 13 0 4 5 0 0 1 Actinoplanes missouriensis: 1 0 14 3 6 0 0 0 21 22 0 0 0 0 4 5 1 4 0 1 13 4 0 0 5 13 0 1 26 17 2 4 26 1 6 0 10 10 1 0 20 13 0 0 13 11 0 1 26 33 0 12 0 0 0 22 0 0 14 0 4 5 0 0 1 Actinoplanes teichomyceticus: 3 7 48 45 8 2 5 0 37 51 2 0 2 2 12 16 0 13 4 2 42 26 1 4 11 58 0 5 79 45 8 12 92 23 23 11 47 43 4 1 20 14 1 0 44 39 5 3 59 56 7 18 0 11 0 21 0 0 31 1 15 9 0 1 2 Actinoplanes utahensis: 1 1 36 30 2 0 2 1 30 21 0 0 0 3 12 13 1 17 1 2 37 17 0 1 16 37 0 7 55 40 2 6 53 12 8 2 32 30 0 1 7 23 0 1 20 17 2 9 14 49 6 18 3 8 0 26 0 0 29 1 10 15 0 0 1 Actinosynnema pretiosum auranticum: 1 0 16 11 0 0 3 0 8 21 0 0 1 0 5 8 1 6 1 0 13 5 0 0 9 10 0 1 31 24 0 1 28 4 0 0 17 22 0 0 5 6 0 0 17 12 0 0 23 26 0 5 0 4 0 17 0 0 9 0 10 8 0 0 1 Acyrthosiphon kondoi endosymbiont: 16 2 53 2 108 4 4 7 13 95 11 15 34 4 21 8 39 19 4 10 38 18 41 22 1 33 19 60 32 40 72 4 66 12 128 43 35 40 74 100 68 42 23 42 35 19 13 71 46 24 35 19 18 8 4 52 24 9 79 57 59 12 16 0 0 Aerococcus viridans: 1 0 3 0 15 1 0 5 0 0 3 16 1 12 1 0 7 0 3 7 1 0 8 14 2 0 1 14 5 3 18 4 3 1 28 8 3 3 10 17 3 8 9 12 0 4 5 21 2 12 14 10 6 0 0 6 7 0 13 12 8 5 0 1 0 Aeromonas caviae: 10 11 64 29 25 9 8 5 86 189 22 11 30 17 72 31 17 112 28 43 154 46 28 19 63 81 28 50 245 78 27 47 163 62 77 33 88 130 29 63 120 140 94 38 156 41 18 54 112 109 99 78 72 16 4 96 41 20 94 44 77 101 6 0 4 Aeromonas hydrophila: 62 117 545 297 238 51 72 70 490 1350 129 34 216 113 387 216 88 588 152 99 772 207 136 157 400 483 171 243 1125 512 324 157 1015 334 434 128 462 819 157 220 714 598 260 253 876 309 152 371 738 636 561 357 288 206 65 497 166 151 654 143 460 425 24 2 36 Aeromonas jandaei: 3 2 37 19 13 5 2 1 25 92 2 2 15 1 11 13 3 18 10 0 29 7 3 4 15 13 5 7 46 29 10 4 26 19 14 3 26 40 5 8 16 14 3 10 49 14 16 21 42 24 39 8 20 8 3 17 12 3 30 10 26 7 0 1 2 Aeromonas salmonicida: 33 33 277 127 219 44 32 37 243 693 103 49 165 94 224 104 126 285 101 85 446 99 138 74 157 196 96 194 593 248 253 92 462 171 396 132 238 360 165 213 377 423 226 191 416 132 87 325 351 327 419 204 174 56 47 275 153 106 379 164 293 212 21 2 10 Aeromonas sobria: 8 3 61 25 31 7 6 2 69 146 26 1 29 14 48 30 12 99 18 8 134 26 12 20 62 70 24 22 171 63 25 27 134 53 50 13 64 93 25 30 99 63 55 26 121 34 29 39 113 81 65 66 62 16 8 72 24 15 84 24 57 76 4 0 4 Aeromonas sp.: 4 8 25 16 18 3 5 2 21 89 4 1 10 4 20 40 10 71 8 33 160 63 27 11 14 156 10 41 108 44 33 5 138 10 42 15 48 69 18 7 65 65 20 25 53 19 13 26 12 54 31 52 18 24 6 41 5 2 63 5 37 46 1 0 3 Aeromonas veronii: 1 0 5 5 0 0 0 0 1 19 3 0 1 3 2 2 0 6 1 1 7 4 1 0 2 11 1 1 10 7 3 1 11 7 4 1 4 18 2 2 16 7 1 2 7 7 0 4 8 8 4 9 3 2 0 4 4 2 8 1 7 5 1 0 0 Agrobacterium aurantiacum: 5 0 80 38 7 1 0 1 8 151 7 0 8 1 16 31 1 18 0 1 51 25 1 1 40 51 4 11 83 99 3 7 83 41 8 0 50 55 2 3 36 22 5 3 37 35 34 13 36 81 29 17 35 14 0 45 14 0 70 3 37 39 0 1 4 Agrobacterium gelatinovorum: 1 6 11 6 8 2 3 5 3 9 5 4 7 4 2 8 3 1 2 3 8 3 5 5 5 8 11 15 5 10 11 10 11 8 10 4 10 11 6 4 11 7 3 6 12 5 6 10 15 20 13 6 6 4 2 14 7 2 8 5 14 1 0 1 0 Agrobacterium radiobacter: 16 13 114 49 37 4 17 9 118 153 42 5 32 14 66 68 13 54 8 29 101 91 12 23 55 97 19 40 197 116 37 33 203 37 52 10 129 101 55 33 133 88 44 33 103 50 53 112 115 116 98 67 74 36 11 161 35 16 187 39 107 56 2 4 10 Agrobacterium rhizogenes: 49 149 235 195 164 81 136 134 300 326 276 85 241 148 167 205 148 215 120 156 234 171 120 175 171 251 158 279 409 345 294 225 344 192 189 131 286 240 207 256 305 269 199 240 301 161 185 420 486 321 441 152 224 138 64 298 277 119 311 243 337 136 19 11 19 Agrobacterium sp.: 1 0 11 3 10 0 0 1 13 17 2 0 1 0 7 3 0 6 0 1 9 7 2 0 8 16 2 5 25 17 6 0 24 10 9 1 13 12 4 1 15 9 9 0 8 5 12 11 16 11 22 14 8 6 0 19 3 0 14 2 16 13 0 0 1 Agrobacterium tumefaciens: 327 762 2637 1332 1243 494 621 500 2574 3259 1819 305 1265 680 1534 1827 650 1582 552 870 2139 1983 587 840 1077 2079 748 1907 3622 3161 1715 1180 3781 1049 1652 565 2925 1984 1689 1319 2561 1910 1340 1067 2539 908 1048 3072 2532 2888 2481 1005 1212 717 317 2435 1336 568 3786 1517 2545 1207 84 59 183 Agrobacterium vitis: 43 100 361 177 150 78 116 82 361 468 284 70 204 105 188 218 96 208 81 120 370 230 115 148 174 304 123 343 592 419 277 242 525 165 268 97 456 308 234 187 358 248 193 164 302 164 214 404 427 464 448 157 173 136 44 419 200 112 625 247 358 206 11 14 18 Alcaligenes: 1 3 14 2 1 0 0 0 10 24 0 0 1 0 3 3 0 2 0 0 16 2 0 0 4 5 0 1 12 3 0 1 17 3 6 2 5 12 1 4 11 8 2 1 8 12 1 9 13 19 4 9 3 6 0 16 3 0 10 2 9 5 0 0 1 Alcaligenes bronchisepticus: 2 0 22 8 2 0 2 0 4 40 4 0 8 0 4 10 2 14 2 0 10 18 2 2 16 10 0 6 30 36 0 8 30 12 2 2 10 30 4 0 4 4 2 4 4 0 2 12 10 16 10 4 6 8 0 14 0 2 12 2 12 2 0 0 2 Alcaligenes eutrophus: 103 114 1482 405 240 32 93 62 499 2262 195 25 296 67 359 676 60 526 92 101 996 534 112 144 534 1087 149 449 2027 1702 289 169 2200 380 288 138 936 1516 173 155 1057 802 245 226 1028 574 324 825 1198 1416 577 634 272 368 68 992 228 30 1396 284 927 456 18 15 70 Alcaligenes faecalis: 10 6 89 33 34 5 1 6 41 172 15 1 43 3 78 55 8 84 29 13 139 69 15 16 55 91 28 43 262 101 47 24 230 48 68 20 103 142 35 46 125 117 49 37 136 58 30 108 113 145 82 99 62 42 12 86 33 5 143 40 116 63 3 2 5 Alcaligenes hydrogenophilus: 6 12 105 26 26 5 15 13 59 115 29 3 34 15 29 64 5 36 11 18 61 48 11 24 39 72 17 44 83 134 23 22 125 45 45 10 67 90 32 27 77 49 42 24 76 26 50 66 88 87 68 32 34 39 14 53 32 10 89 41 73 46 1 2 3 Alcaligenes sp.: 25 52 228 123 80 16 34 23 155 427 66 4 156 35 98 107 29 149 38 40 208 141 33 59 92 188 36 116 354 329 97 71 337 110 98 46 219 282 85 85 227 139 74 94 213 112 75 232 247 218 173 121 65 81 14 193 80 13 234 142 189 117 4 4 17 Alcaligenes sp. SH-69: 2 0 20 1 3 0 1 1 8 31 0 0 3 0 3 16 1 12 0 4 19 7 2 1 12 8 2 16 49 21 10 1 52 4 15 2 19 32 3 6 31 21 5 4 19 9 1 20 8 24 7 6 2 8 0 11 3 0 30 8 25 10 2 0 0 Alcaligenes xylosoxydans: 14 20 227 56 66 5 14 10 70 347 26 5 49 7 54 119 13 80 22 17 155 110 10 18 81 161 18 86 360 251 46 23 303 37 47 28 113 252 30 26 109 90 26 36 149 69 30 130 159 195 74 67 38 38 3 134 24 6 195 38 130 55 2 2 10 Alicyclobacillus acidocaldarius: 3 8 58 31 10 3 7 4 54 50 28 4 42 11 26 61 12 37 15 15 42 102 3 12 26 79 25 17 72 112 26 46 110 53 32 13 63 95 16 22 46 74 45 41 78 23 13 42 65 97 74 78 49 6 2 58 30 3 67 35 48 62 1 0 2 Alicyclobacillus acidoterrestris: 1 5 15 1 15 1 0 1 14 8 7 2 23 3 5 10 4 3 8 3 7 11 7 13 2 19 4 13 9 31 2 8 28 12 17 4 21 12 5 12 19 7 6 14 13 7 5 20 17 18 23 10 15 7 3 6 13 1 9 16 14 26 1 0 0 Alteromonas: 1 0 4 0 8 1 0 13 1 6 5 9 8 24 1 3 15 16 14 16 11 4 10 15 1 7 3 31 9 12 15 0 25 1 42 12 7 9 25 14 4 21 33 18 4 2 5 7 7 14 24 9 20 3 7 8 6 1 12 11 4 4 1 0 0 Alteromonas atlantica: 3 18 12 2 9 9 1 16 11 9 13 22 14 13 7 3 18 10 18 15 18 10 15 15 17 7 17 28 12 23 26 12 24 6 31 11 20 8 26 47 25 29 36 38 20 10 18 38 16 18 41 14 27 3 3 5 37 22 21 34 38 27 2 1 0 Alteromonas carrageenovora: 2 4 3 0 6 4 1 10 1 0 13 24 1 13 1 3 12 10 17 23 6 11 17 14 2 5 16 27 4 9 12 7 22 10 15 19 8 10 23 44 12 17 31 29 5 9 11 22 9 11 21 11 16 0 5 5 20 11 5 17 16 15 1 0 1 Alteromonas haloplanktis: 2 0 14 2 17 1 0 11 3 7 10 42 15 14 1 10 10 7 8 18 13 8 15 17 2 6 12 31 13 21 27 5 27 10 38 28 3 10 20 37 13 19 21 23 10 6 24 35 22 11 38 22 18 3 5 10 55 8 4 61 27 14 2 0 0 Alteromonas sp.: 6 16 42 9 54 11 4 62 22 40 60 74 47 74 11 20 57 89 53 75 74 42 63 82 15 38 60 177 69 85 120 20 115 27 172 89 45 64 92 111 62 116 136 136 51 38 53 104 57 105 147 69 95 13 32 43 82 24 79 99 74 47 5 1 0 Amoeba proteus symbiotic bacterium: 3 4 9 3 24 3 1 5 3 17 11 23 12 9 2 1 20 3 6 12 9 1 24 10 0 1 11 29 7 4 48 5 32 3 42 9 2 6 57 56 11 17 21 24 6 6 12 66 15 23 32 6 10 2 1 7 20 8 27 25 40 2 3 0 0 Amphibacillus xylanus: 1 4 3 0 6 3 0 16 1 1 14 12 0 6 0 0 10 4 9 16 0 4 9 10 0 0 6 19 5 1 14 7 7 2 32 16 4 0 28 22 9 13 10 15 1 3 7 25 14 11 23 3 8 1 4 4 12 1 13 28 11 2 1 0 0 Amycolata autotrophica: 1 0 11 31 1 0 0 0 7 33 0 0 4 0 10 9 1 1 0 0 21 7 1 0 13 8 0 0 39 7 1 0 6 16 1 0 10 13 1 0 4 8 0 0 13 10 0 3 21 28 2 11 0 2 0 13 0 0 18 1 10 2 0 0 1 Amycolata sp.: 1 0 10 4 0 0 0 0 6 6 1 0 1 1 9 14 0 10 2 2 11 10 1 1 3 7 0 3 10 16 0 4 21 6 10 0 18 15 1 1 8 20 0 1 7 9 0 0 6 14 0 9 2 0 0 10 0 0 8 3 4 5 0 0 1 Amycolatopsis mediterranei: 1 1 19 10 1 0 0 0 11 20 0 0 1 0 8 2 0 6 0 0 13 5 0 0 6 12 1 2 34 24 0 0 28 3 1 0 20 10 0 0 7 11 0 0 12 13 0 6 19 26 0 6 0 3 0 15 0 0 14 0 11 7 0 0 1 Amycolatopsis methanolica: 3 7 37 37 8 1 2 2 43 43 9 0 7 3 6 10 1 11 0 7 39 18 3 6 8 32 2 8 67 85 7 2 60 20 9 4 49 36 4 1 22 16 1 4 24 17 3 14 61 55 10 12 2 5 0 27 1 0 32 3 13 13 0 1 2 Amycolatopsis orientalis: 6 9 42 96 16 0 7 0 45 136 12 0 29 1 27 54 1 35 5 4 63 60 4 8 55 139 4 23 180 166 15 12 128 44 28 4 84 142 13 5 36 34 3 2 64 45 10 46 105 131 23 52 13 19 9 73 4 0 79 8 41 26 2 0 4 Amycolatopsis sp.: 1 0 11 11 0 0 1 0 16 27 0 0 2 0 1 13 1 1 0 1 12 4 1 0 2 22 0 1 16 24 0 3 25 4 4 0 11 24 1 3 8 5 0 2 6 8 0 10 16 20 1 8 0 5 0 9 0 0 17 1 6 4 0 1 0 Anabaena: 2 1 1 1 4 2 1 2 1 3 1 4 9 5 2 0 7 1 2 4 0 2 10 2 2 0 2 6 5 2 9 4 6 1 14 7 3 2 7 15 6 3 8 8 2 1 0 20 1 5 18 3 5 0 1 3 9 1 3 10 3 4 1 1 0 Anabaena PCC7120: 71 109 251 164 304 187 63 237 217 222 171 565 424 209 172 65 309 215 285 405 345 91 335 325 257 70 295 424 314 200 634 262 287 160 691 389 258 246 422 735 297 402 459 700 223 178 182 1000 255 331 620 294 303 84 142 274 524 222 470 780 430 230 38 19 14 Anabaena azollae: 7 4 34 6 39 16 2 15 23 26 16 52 47 11 23 8 37 18 21 40 54 7 33 26 30 3 33 59 33 28 82 28 54 13 114 68 21 29 67 85 33 61 39 66 20 44 19 147 18 42 64 42 30 28 31 44 28 15 64 94 60 21 5 2 0 Anabaena cylindrica: 3 5 8 5 12 11 2 13 9 9 9 35 21 17 10 1 21 6 18 10 18 2 21 9 8 2 12 30 13 10 42 13 15 6 31 23 11 9 28 45 13 14 33 29 8 8 15 44 9 11 40 6 12 1 10 7 28 15 15 42 29 8 2 1 0 Anabaena flos-aquae: 12 8 9 16 23 21 3 23 17 22 22 59 44 37 28 4 31 11 43 39 33 3 22 21 7 3 27 59 20 12 75 9 10 6 27 25 12 17 61 55 25 13 37 88 42 9 17 129 29 24 50 12 22 1 6 26 40 11 36 71 33 10 10 2 0 Anabaena sp.: 137 219 605 303 671 352 107 603 420 562 315 1331 1017 359 390 174 648 421 564 751 707 180 779 619 515 154 640 986 740 537 1430 512 588 357 1414 875 510 586 905 1542 655 826 1036 1552 579 424 410 2087 625 696 1426 649 691 201 276 588 981 342 952 1546 866 554 70 37 30 Anabaena variabilis: 69 113 281 148 300 166 61 259 227 291 178 550 482 160 219 64 314 186 256 340 384 67 369 285 259 68 317 477 365 236 669 290 331 185 859 427 259 285 459 795 383 423 423 649 235 324 211 1174 295 425 712 320 366 132 199 326 502 126 501 834 450 330 35 21 13 Anaerobiospirillum succiniciproducens: 1 0 2 0 11 1 0 0 9 5 1 26 1 4 5 0 19 1 1 0 25 0 16 12 0 0 10 9 1 0 38 0 25 0 16 14 1 0 21 2 45 31 1 0 8 6 0 10 31 17 9 13 0 3 1 30 2 0 20 8 12 9 1 0 0 Anaerocellum thermophilum: 8 8 4 3 11 85 33 27 24 28 137 85 78 68 18 16 38 44 55 88 22 9 38 66 9 20 52 118 19 21 62 78 32 34 84 92 16 54 122 238 101 74 141 48 61 15 33 172 89 81 135 50 140 16 23 31 164 142 36 189 74 50 4 1 3 Anaeroplasma abactoclasticum: 1 0 0 0 10 6 0 1 0 0 1 15 0 2 0 0 3 2 1 6 0 0 4 3 0 0 6 16 0 0 14 2 3 0 12 13 0 0 12 8 25 5 6 9 0 1 2 20 2 2 5 1 6 0 0 5 0 1 4 12 2 3 1 0 0 Anaplasma centrale: 1 2 1 5 5 7 3 2 5 10 5 4 7 4 1 4 1 3 4 1 9 1 2 4 4 3 5 6 2 7 5 7 6 5 4 6 2 13 10 5 6 5 2 3 3 4 3 7 15 8 13 7 4 5 1 3 11 8 5 7 7 1 1 0 0 Anaplasma marginale: 9 13 18 18 50 29 45 39 27 79 88 45 64 83 46 76 100 105 177 65 65 36 81 21 25 25 47 153 121 160 258 59 128 100 184 81 56 136 124 47 155 41 50 126 156 31 34 119 148 98 155 53 49 15 43 63 88 47 56 71 89 26 6 3 0 Aneurinibacillus aneurinolyticus: 2 4 4 4 4 11 4 14 7 4 17 24 13 8 3 5 14 10 11 16 9 6 12 9 6 2 6 12 4 3 18 24 6 8 16 17 9 5 20 39 25 12 37 21 7 7 9 39 19 14 28 6 19 2 8 13 38 16 11 31 8 4 0 1 1 Antarctic bacterium DS2-3R: 1 3 7 4 3 0 2 1 11 18 3 0 1 1 12 6 1 4 0 1 13 5 3 3 5 8 2 6 22 12 7 5 5 5 7 1 13 6 4 6 12 13 5 2 7 5 6 17 14 9 11 9 3 1 1 9 5 2 9 4 15 4 0 0 1 Aphanocapsa sp.: 1 21 22 12 15 1 1 0 18 14 7 0 2 0 1 2 0 4 3 0 5 13 0 7 6 8 0 0 40 17 13 3 28 4 29 8 39 6 22 1 1 2 0 4 35 14 2 28 2 17 15 0 0 2 1 5 1 10 12 5 3 1 0 1 0 Aquifex pyrophilus: 6 1 5 2 4 69 85 21 91 32 95 30 8 30 46 10 18 36 12 43 57 52 18 15 69 13 18 63 36 56 46 109 29 37 54 59 25 26 124 85 173 86 33 21 63 32 8 131 173 101 54 74 34 14 5 58 54 166 25 53 57 17 3 0 3 Arcanobacterium haemolyticum: 1 2 5 2 5 3 0 3 5 5 7 1 1 1 0 1 0 1 6 2 6 9 7 6 0 1 1 9 3 6 15 9 9 2 8 0 8 2 3 7 17 9 10 9 5 4 2 13 1 9 15 8 4 1 4 7 7 0 5 13 6 8 0 0 1 Arcanobacterium pyogenes: 1 4 6 2 7 1 2 3 8 7 9 2 9 3 9 8 7 13 4 5 11 14 12 4 7 9 4 22 8 9 14 11 19 1 10 5 19 11 11 9 37 11 19 6 8 1 7 10 13 13 17 13 5 0 0 11 7 0 16 10 3 8 0 1 0 Archaeoglobus fulgidus: 2416 867 1627 740 566 14804 19812 3225 16314 17064 15719 3725 7213 6091 6174 4648 4232 12450 3040 6599 7902 7867 5362 5591 7662 7411 5095 13981 13254 11177 13855 16800 11808 10746 8928 7031 10096 14882 25817 16071 29681 14741 6643 1899 10005 7252 2821 18780 40535 17901 14697 18696 5605 6141 1703 18426 12119 15232 13952 18889 16884 6951 822 370 1224 Arthrobacter globiformis: 12 13 174 119 33 3 20 6 148 230 55 4 25 40 179 74 18 127 18 44 270 98 40 22 144 178 28 105 358 149 61 87 362 85 69 16 248 181 47 33 156 262 41 29 162 149 23 160 213 345 65 198 38 39 3 190 27 8 223 36 117 135 3 4 5 Arthrobacter luteus: 1 3 28 5 8 1 7 2 17 15 2 0 6 1 2 10 1 3 1 2 11 18 4 1 10 19 5 4 15 25 8 6 20 5 12 1 20 10 4 1 13 12 2 0 12 10 1 7 34 28 2 12 0 2 0 22 1 0 27 1 7 15 0 0 1 Arthrobacter nicotinovorans: 11 32 78 64 31 12 35 20 86 142 43 6 42 32 63 51 25 48 20 31 92 60 35 22 66 70 36 70 164 100 82 69 141 83 50 40 113 89 65 35 65 69 23 33 63 55 35 105 97 106 73 41 22 30 10 68 33 25 77 48 82 38 2 3 6 Arthrobacter oxidans: 3 11 25 28 15 7 7 21 35 33 20 3 19 19 17 17 6 13 13 13 28 17 7 7 24 36 18 36 42 50 20 31 53 28 29 7 42 34 29 8 21 35 18 12 16 21 13 36 45 62 34 21 12 7 7 32 17 6 44 19 20 29 0 0 3 Arthrobacter sp.: 23 70 264 186 104 23 50 46 269 364 97 32 110 69 183 134 43 165 44 89 297 190 60 80 215 267 72 149 499 299 128 127 442 168 145 60 326 243 121 86 220 316 77 77 258 218 71 288 377 475 184 245 69 73 21 303 85 22 300 108 170 213 8 6 9 Arthrobacter viscosus: 1 5 2 1 7 9 4 8 3 3 7 22 9 13 7 4 10 8 12 15 6 8 5 10 2 6 12 17 4 8 17 23 5 15 17 21 8 5 12 58 22 15 40 13 6 3 10 49 20 8 34 9 38 0 0 13 26 14 9 24 24 17 0 1 0 Azorhizobium caulinodans: 41 58 518 234 90 58 49 56 487 532 103 43 107 61 242 228 47 199 52 49 358 240 40 57 236 319 65 112 714 531 113 83 621 171 120 67 312 543 99 73 380 229 139 63 317 175 132 261 543 453 251 149 167 160 34 370 116 95 541 113 360 179 4 5 32 Azospirillum brasilense: 69 57 1155 396 152 18 51 28 485 1553 95 4 107 27 393 428 32 332 20 39 832 424 31 49 349 825 57 103 1529 987 99 100 1485 333 169 22 837 834 118 37 858 610 59 71 635 424 136 337 1130 1253 196 381 123 240 24 707 25 7 1094 75 586 241 13 4 52 Azospirillum lipoferum: 4 1 78 20 6 0 2 1 28 106 3 0 3 1 21 22 1 20 1 4 46 14 2 2 28 56 1 2 89 58 6 5 78 26 8 1 39 48 5 2 43 46 3 4 33 22 10 20 69 63 9 17 11 17 3 45 3 0 55 1 32 19 0 0 4 Azotobacter chroococcum: 42 11 527 144 69 4 22 7 299 874 16 1 26 5 134 142 4 211 12 9 391 67 18 22 154 404 14 49 763 348 43 22 815 71 72 13 360 431 25 32 381 288 29 31 366 236 67 229 625 549 90 267 33 197 19 389 20 4 543 30 286 157 3 0 39 Azotobacter vinelandii: 166 84 2340 605 506 28 130 62 1359 4012 130 16 345 26 911 618 53 1301 152 43 2175 357 124 85 831 1668 115 245 3830 1534 321 208 3812 447 666 170 1764 1824 199 269 1837 1616 217 270 1776 957 324 1508 2315 2761 784 1188 278 725 101 1816 104 47 2539 222 1321 664 28 9 129 Bacillus: 1 0 2 0 1 3 1 0 1 1 0 4 3 1 1 4 4 4 9 9 3 4 10 2 1 1 2 5 2 2 5 9 5 4 8 3 2 3 7 2 6 5 14 3 2 0 2 2 0 2 5 4 11 0 0 3 5 4 1 2 3 11 0 1 0 Bacillus TS-23: 1 5 3 3 5 1 0 2 2 2 8 19 3 9 3 5 8 8 6 33 8 9 5 9 1 4 12 10 11 9 13 29 7 5 6 10 11 8 9 37 3 15 30 21 1 2 7 15 5 17 23 14 25 1 0 6 24 3 4 24 11 24 1 0 0 Bacillus acidopullulyticus: 3 2 8 11 9 12 6 5 11 21 31 35 27 8 13 4 7 8 4 19 14 11 13 16 7 11 21 25 18 10 17 31 23 6 15 20 12 23 22 48 16 12 41 24 11 9 12 43 18 21 31 15 37 8 5 20 59 13 18 53 24 21 3 0 0 Bacillus alcalophilus: 4 0 12 1 14 6 1 8 10 13 38 31 14 18 10 15 25 45 14 23 3 22 23 31 0 7 19 62 26 24 50 30 28 29 44 48 23 17 39 41 9 39 36 25 19 5 20 71 30 26 26 12 17 3 2 11 19 0 30 51 27 8 4 0 0 Bacillus amyloliquefaciens: 27 27 55 42 53 75 36 28 69 126 144 150 96 118 69 24 115 110 50 182 70 145 85 39 27 120 94 126 140 144 120 185 207 72 130 108 140 123 138 513 139 236 214 139 120 54 107 327 127 188 251 159 171 22 33 115 184 62 186 205 147 99 18 4 5 Bacillus aneurinolyticus: 1 1 0 0 2 10 1 4 2 1 13 34 2 9 3 2 3 1 5 15 2 0 13 9 5 0 7 11 2 0 12 12 3 9 9 8 0 1 10 34 11 5 28 12 0 0 8 36 4 7 28 3 15 1 6 5 17 19 3 25 9 8 0 1 0 Bacillus anthracis: 31 58 26 13 100 156 58 111 38 44 141 528 116 161 63 39 211 54 190 324 67 89 219 207 44 62 130 292 42 64 222 231 56 88 243 337 51 102 273 987 256 199 539 442 113 49 169 704 220 108 478 113 392 16 41 105 322 287 146 499 246 88 20 8 3 Bacillus badius: 1 1 6 0 1 4 1 1 3 6 10 3 4 1 6 1 7 3 1 8 3 7 6 3 0 5 2 10 9 10 6 7 22 2 7 7 5 7 9 19 6 11 3 8 7 3 4 23 5 6 19 6 7 4 2 7 9 1 7 15 13 1 1 0 0 Bacillus brevis: 16 60 93 50 112 118 56 103 82 175 217 291 263 117 100 69 159 128 96 250 119 155 230 199 28 104 151 279 108 113 286 241 149 109 232 352 103 165 329 612 256 250 387 367 227 78 212 738 310 259 500 173 340 34 49 197 351 163 264 457 286 126 12 3 1 Bacillus caldolyticus: 18 23 199 95 32 8 9 11 121 127 108 47 165 18 55 107 11 106 12 42 74 223 7 31 21 240 25 29 244 308 42 73 352 132 39 14 278 217 64 244 90 155 76 112 74 48 115 273 166 195 152 145 113 56 10 110 143 3 264 160 154 76 12 1 5 Bacillus caldotenax: 16 19 155 73 34 8 8 7 88 90 106 59 163 16 40 85 14 74 16 39 40 156 12 23 9 160 12 46 179 220 67 56 184 83 56 27 160 149 66 201 72 117 48 122 67 38 54 241 163 129 126 85 74 13 4 84 127 5 161 197 131 46 10 1 5 Bacillus caldovelox: 1 2 5 6 4 0 1 0 4 5 7 2 12 4 1 3 1 6 0 4 1 7 1 2 1 10 1 6 4 15 1 12 12 8 1 1 8 7 7 10 4 5 1 4 2 1 10 15 9 7 11 4 4 0 0 0 5 0 12 10 12 1 1 0 0 Bacillus cereus: 60 91 80 25 248 134 45 201 44 58 273 882 174 320 52 72 353 127 273 555 51 245 269 334 14 102 186 606 75 248 428 552 127 205 472 592 73 189 463 1125 310 305 785 525 143 78 292 863 317 168 807 183 592 28 67 245 559 303 189 876 444 252 42 14 4 Bacillus circulans: 22 33 137 122 109 52 21 36 161 377 170 72 148 87 271 144 89 291 89 210 323 352 112 116 76 261 144 259 341 318 243 292 531 186 236 209 237 286 173 346 306 466 426 194 298 94 159 337 254 366 478 261 397 47 26 336 254 44 368 259 262 321 15 2 5 Bacillus coagulans: 9 14 40 27 18 30 18 21 36 49 66 82 43 31 28 33 19 35 26 67 32 40 26 24 9 56 27 57 55 46 29 50 63 56 46 49 37 54 52 149 62 59 99 61 43 17 49 197 55 73 130 34 86 12 13 28 97 28 61 112 89 30 6 1 2 Bacillus firmus: 62 76 68 36 229 166 56 205 120 130 453 575 176 246 65 81 248 130 180 398 108 182 208 179 27 139 230 472 135 207 431 331 203 208 423 368 168 214 461 555 313 203 361 364 152 102 203 634 401 156 529 152 332 20 54 282 561 190 384 721 515 174 40 12 10 Bacillus intermedius: 4 8 13 13 7 9 2 6 16 21 28 31 10 21 10 8 15 16 12 30 6 21 9 14 2 17 10 29 20 21 28 23 20 13 15 13 16 24 17 26 24 13 28 19 16 6 14 25 21 14 39 12 25 3 11 12 35 1 20 40 31 17 3 1 0 Bacillus israeli: 2 1 11 1 7 9 0 1 3 8 16 20 9 6 7 1 11 3 1 19 5 9 9 9 0 8 13 29 5 14 20 32 16 7 14 17 9 14 22 54 3 14 16 15 3 4 3 51 17 11 23 9 14 2 0 7 17 4 14 46 18 6 1 1 0 Bacillus lautus: 2 2 10 7 5 10 3 6 14 36 15 7 16 9 28 21 12 33 9 9 24 52 14 9 5 26 8 19 20 43 29 21 44 13 18 20 23 17 15 31 36 48 46 23 35 7 14 21 32 31 46 24 30 2 0 34 21 6 29 27 20 31 1 1 0 Bacillus licheniformis: 76 97 251 215 172 229 126 89 313 588 485 355 514 353 314 237 281 409 128 521 290 524 212 123 123 430 224 509 496 580 473 579 682 345 311 311 561 420 503 1247 543 581 558 481 457 215 419 1189 484 612 798 408 595 104 53 392 667 161 836 737 621 317 43 16 17 Bacillus megaterium: 82 121 179 40 354 226 60 257 103 167 546 1026 263 398 104 118 441 289 253 623 136 314 265 324 49 158 342 812 157 294 755 679 368 202 632 786 182 287 674 1363 400 553 684 704 263 146 324 1471 425 401 923 284 548 44 68 300 724 204 426 1127 661 224 58 14 9 Bacillus methanolicus: 4 2 4 7 7 9 6 4 8 8 32 16 16 12 9 7 11 4 7 19 9 9 8 9 1 14 9 31 6 6 26 25 13 11 14 19 13 12 25 37 21 11 31 18 17 5 23 51 18 16 25 7 30 7 8 6 25 21 12 36 36 8 2 2 0 Bacillus mycoides: 1 3 1 1 4 3 1 5 0 0 7 10 2 5 0 1 5 0 6 11 2 3 7 3 0 2 4 12 1 5 14 15 2 3 5 5 2 3 8 24 5 5 10 6 3 0 5 13 8 5 12 1 6 1 0 2 7 6 5 13 5 3 0 0 1 Bacillus pasteurii: 7 10 6 4 31 17 3 20 6 7 35 26 21 20 10 5 16 10 11 44 4 22 20 30 2 10 14 40 6 14 27 34 19 8 61 33 9 11 40 65 21 37 33 28 7 22 11 92 24 38 53 15 25 2 12 18 25 9 48 64 47 15 4 1 2 Bacillus popilliae: 3 7 3 10 13 16 8 18 4 5 26 47 27 19 10 9 20 9 21 30 17 20 32 17 4 17 16 26 5 4 20 24 6 12 30 27 8 17 32 52 25 23 61 31 10 4 29 36 23 14 65 13 43 10 18 10 51 22 11 30 20 14 1 2 0 Bacillus psychrophilus: 1 6 1 2 10 4 2 5 2 5 16 7 10 11 4 5 8 3 6 9 2 18 4 9 0 7 4 19 8 12 14 19 10 3 23 19 13 3 19 25 6 13 16 14 3 2 11 37 9 5 26 3 7 2 3 2 4 10 14 32 19 1 1 0 0 Bacillus psychrosaccharolyticus: 1 1 3 0 5 4 0 5 4 2 2 10 4 2 0 0 2 2 7 6 4 5 4 8 1 0 1 6 8 2 10 8 4 6 9 4 5 2 9 14 4 3 18 8 0 0 5 21 3 4 14 0 12 0 3 8 5 5 5 21 7 3 1 0 0 Bacillus pumilus: 12 17 11 11 27 31 13 19 23 27 52 80 54 55 20 20 54 32 46 89 29 38 42 42 4 24 26 72 37 32 73 60 48 33 51 53 31 49 59 173 48 32 89 70 29 13 60 129 49 30 109 31 101 11 15 31 98 40 44 103 65 48 9 2 1 Bacillus schlegelii: 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 1 0 2 0 0 0 1 4 0 0 1 4 0 0 1 2 0 0 4 4 0 2 3 1 0 0 2 2 0 5 3 6 2 5 0 6 2 2 1 0 6 1 1 1 0 0 1 Bacillus smithii: 1 2 3 1 2 2 3 3 2 7 3 5 14 2 6 10 0 10 6 7 8 12 1 3 4 7 4 6 13 12 8 15 8 9 7 3 11 10 5 23 17 6 11 10 4 4 7 11 4 13 19 8 11 2 0 7 7 5 7 18 5 3 1 0 0 Bacillus sp.: 112 215 397 185 529 391 114 324 321 547 785 1188 648 597 452 323 636 562 466 1128 560 890 602 780 147 612 541 1342 715 794 1110 1322 1121 599 1066 972 710 818 1035 1774 805 1389 1584 1097 579 326 743 2189 940 1036 1910 732 1219 102 137 844 1260 339 969 1670 1157 856 69 17 26 Bacillus sp. L7: 1 3 10 21 1 4 3 3 8 25 10 6 9 1 12 15 5 23 3 4 15 17 4 1 6 23 1 9 21 12 18 20 24 22 11 10 18 8 12 18 14 11 18 12 16 6 16 27 20 18 27 12 19 0 1 16 7 5 20 11 18 20 0 0 1 Bacillus sp. MK 716: 1 2 9 4 1 1 3 3 6 8 7 5 9 2 6 6 2 9 3 9 14 9 6 4 5 12 3 4 19 4 9 15 19 12 2 3 14 9 6 25 6 16 8 13 5 6 6 16 1 19 21 15 18 2 0 11 16 0 12 9 11 21 1 0 0 Bacillus sp. NG-27: 1 4 4 0 5 8 0 5 3 1 4 17 3 2 0 1 3 2 4 12 0 4 3 10 2 5 4 13 2 8 11 15 6 4 5 8 4 6 12 13 5 7 16 16 2 3 7 29 4 11 22 4 10 0 0 5 15 0 5 14 6 11 1 0 0 Bacillus sp. PD498: 1 1 2 1 2 2 1 1 2 3 9 2 5 9 13 0 5 3 4 3 7 5 8 7 0 5 7 17 15 4 20 10 5 3 15 14 8 5 5 18 9 17 15 11 4 2 2 9 2 9 16 8 8 2 0 10 2 3 8 5 5 4 1 0 0 Bacillus sphaericus: 52 95 89 44 125 198 78 192 59 97 224 572 176 311 94 83 309 139 353 502 139 181 458 316 77 92 255 471 128 148 366 365 189 184 390 400 112 132 452 805 240 267 819 472 139 66 241 818 300 169 706 188 542 44 73 174 609 398 210 778 370 135 39 5 8 Bacillus stearothermophilus: 209 344 1539 852 620 294 135 327 1014 1150 1242 1235 1650 536 559 964 448 921 353 1074 717 1960 496 670 219 1873 439 1106 1798 2497 1063 1314 2363 1214 980 854 1842 1873 1244 3479 1268 1730 1385 1834 901 573 1191 3564 1735 1840 2359 1200 1663 346 196 1174 1957 339 2003 2569 1822 1022 128 30 47 Bacillus subtilis: 8747 10829 22794 17084 20231 28132 10336 12889 28469 60729 60963 50510 40352 39037 21326 16709 34308 37405 17344 59121 22718 38672 23122 18583 8548 42458 28023 57290 41655 53330 50233 57302 61819 29486 33817 35531 45646 46722 50939 130672 55458 45905 58687 52172 49488 19798 40180 129644 61106 49776 87530 31747 59789 11422 9465 37357 79738 24581 71258 97443 71280 27086 5402 1253 2088 Bacillus thermocatenulatus: 1 3 12 9 3 1 0 1 9 7 7 2 14 2 4 8 1 8 3 3 3 15 3 2 3 12 3 3 12 16 3 16 17 7 3 2 11 14 5 8 5 10 9 8 4 2 11 12 8 11 12 6 12 3 1 6 12 0 8 3 9 10 1 0 0 Bacillus thermoglucosidasius: 1 1 16 6 8 2 0 1 3 6 6 10 13 4 2 11 3 6 2 10 3 8 2 9 0 19 4 6 0 8 2 17 11 5 4 4 10 12 8 36 6 13 15 11 3 1 10 40 10 15 30 9 30 0 0 4 13 2 9 23 23 17 1 0 0 Bacillus thermoproteolyticus: 1 0 3 0 7 2 0 3 4 6 6 14 7 7 6 7 6 8 3 15 4 17 4 8 0 4 5 15 8 10 13 19 7 9 17 9 8 13 11 28 9 16 20 23 3 3 8 15 6 9 28 12 24 0 0 4 19 1 5 18 7 5 1 0 0 Bacillus thiaminolyticus: 1 0 5 6 2 1 1 3 5 18 6 3 11 3 8 7 1 10 1 1 2 9 0 1 5 15 8 2 13 19 4 3 14 8 2 3 14 10 4 8 13 5 6 9 15 1 4 7 11 11 20 10 12 1 0 9 5 2 6 11 11 4 1 0 0 Bacillus thuringiensis: 170 913 359 208 1327 2360 590 1318 409 536 1714 4438 1066 1708 811 573 2077 732 2065 3229 813 1345 2108 2173 190 674 1408 2441 654 1050 2021 2774 766 1223 2035 2822 770 1237 2195 3966 1148 1824 5814 3846 844 374 1820 5440 2020 1199 4816 1021 4180 386 836 1245 3575 1998 1261 3882 1524 1488 105 49 16 Bacillus thuringiensis israelensis: 4 8 1 6 18 14 4 6 3 3 15 34 22 9 3 5 43 5 21 24 3 10 15 47 22 3 31 24 3 10 20 15 7 6 45 92 4 19 32 94 34 7 76 39 7 7 13 74 31 5 48 6 41 1 10 4 45 24 7 53 23 10 2 0 2 Bacillus thuringiensis kurstaki: 2 20 6 2 36 62 20 34 12 16 30 80 16 36 28 24 32 12 50 52 24 32 26 52 4 22 28 34 16 30 52 66 16 34 48 66 18 34 50 46 22 48 122 78 12 8 36 144 38 30 92 22 92 12 20 23 85 36 34 78 20 38 0 2 0 Bacteriophage lambda: 2 3 13 6 3 4 1 1 6 25 6 2 10 1 3 1 1 6 5 0 15 2 2 6 3 4 1 2 24 10 5 2 17 3 13 1 7 9 2 9 11 9 8 13 19 7 12 9 16 9 12 6 1 3 0 9 8 1 15 8 18 6 2 0 0 Bacteroides forsythus: 1 3 4 3 4 8 3 3 3 4 4 3 14 4 5 4 8 6 8 7 4 8 5 4 1 3 2 9 10 3 9 9 7 4 5 8 11 6 4 21 17 10 12 13 6 1 2 13 8 9 19 2 10 0 5 7 8 4 11 12 13 10 1 0 0 Bacteroides fragilis: 54 81 173 126 270 161 106 101 174 436 330 249 371 165 184 149 220 191 223 329 256 162 269 122 134 232 192 331 427 157 314 409 255 177 350 370 204 314 256 886 572 437 534 380 384 142 290 955 424 500 610 276 471 116 135 401 435 385 517 517 524 191 32 9 13 Bacteroides ovatus: 4 3 16 2 43 8 1 3 12 44 35 15 42 10 21 9 25 13 20 24 26 16 28 9 13 41 23 31 35 12 42 60 32 10 45 51 14 34 23 97 52 35 64 28 23 20 31 88 32 41 82 25 71 14 9 28 50 14 41 41 55 43 4 0 0 Bacteroides sp.: 2 9 4 1 8 11 8 5 4 15 15 18 12 6 9 6 4 9 7 9 13 3 11 5 7 6 8 13 12 1 12 11 4 6 12 9 11 5 14 46 30 14 21 22 20 7 17 44 17 13 18 2 10 4 4 15 25 17 15 21 17 11 0 2 0 Bacteroides thetaiotaomicron: 19 35 90 41 144 61 28 35 88 272 115 85 145 86 140 56 106 120 73 166 173 95 129 35 75 132 88 193 226 70 161 206 181 47 209 180 97 138 99 387 232 281 258 144 178 65 101 423 144 332 253 175 269 69 47 259 156 162 243 169 273 134 14 2 3 Bacteroides uniformis: 3 12 13 8 14 21 14 8 13 27 19 12 22 6 16 4 5 18 11 20 27 11 10 7 13 13 10 19 32 7 15 22 12 5 12 23 12 10 12 68 49 33 28 27 21 14 13 73 26 43 33 13 28 7 6 34 16 34 36 22 34 15 1 0 2 Bacteroides vulgatus: 8 3 33 28 34 22 34 7 23 54 50 20 26 32 17 13 13 30 33 38 30 20 22 10 10 29 21 35 54 23 31 33 25 21 34 32 25 40 28 87 116 56 55 34 63 25 32 103 72 72 65 19 58 15 14 52 52 64 46 36 66 18 3 1 4 Bartonella bacilliformis: 14 26 51 18 160 21 12 24 29 21 141 122 116 85 17 12 167 35 51 116 30 42 85 53 14 15 92 154 35 68 229 108 53 57 205 70 30 65 255 246 103 44 189 150 76 12 80 297 77 53 272 27 83 2 29 35 150 62 79 259 144 35 11 1 2 Bartonella henselae: 6 9 14 2 45 11 3 8 20 15 60 37 32 28 9 12 48 13 14 59 19 23 35 33 3 4 34 87 22 19 77 40 29 8 79 21 23 32 73 132 39 19 76 66 29 9 21 114 23 25 114 13 43 6 8 13 61 18 35 89 48 14 3 2 1 Bartonella quintana: 1 0 9 1 13 1 0 1 9 1 11 3 18 1 3 3 8 2 0 11 4 5 10 7 0 0 9 23 7 8 35 11 11 5 28 6 3 15 30 33 10 5 20 10 7 1 0 43 3 7 24 2 3 0 0 5 5 0 17 23 17 0 1 0 0 Bifidobacterium asteroides: 1 4 7 4 3 4 2 1 4 13 1 1 6 3 4 3 3 9 0 7 7 10 5 4 4 5 4 4 8 3 1 2 5 4 1 2 2 12 2 6 6 9 4 2 14 2 0 7 8 8 7 9 7 3 0 12 1 1 14 1 5 7 1 0 0 Bifidobacterium breve: 1 1 23 1 3 0 2 0 17 17 6 0 0 1 3 6 1 8 0 0 9 18 0 0 5 17 2 0 16 22 0 3 30 8 4 0 4 23 1 1 11 14 1 0 8 12 4 12 12 32 10 18 5 7 0 18 0 0 20 1 12 11 0 0 1 Bifidobacterium longum: 3 1 32 2 11 1 4 2 20 27 5 1 3 1 18 8 3 10 0 2 27 11 2 1 12 22 1 8 43 16 17 4 22 4 13 2 21 19 5 5 31 28 0 3 21 20 5 18 34 37 8 12 5 10 0 13 1 0 34 7 22 16 1 0 2 Blastochloris viridis: 1 0 20 11 2 0 0 0 17 22 3 0 1 1 2 18 0 3 0 0 20 7 1 0 9 19 0 0 19 21 2 0 38 4 2 0 14 24 1 0 9 17 0 1 14 9 0 8 21 28 5 10 5 7 0 16 3 0 20 1 9 13 0 0 1 Bordetella avium: 2 0 25 2 9 0 0 1 9 40 3 1 8 0 11 14 4 7 1 0 18 10 3 2 10 15 1 4 46 22 10 1 33 5 9 1 16 19 4 4 18 13 8 10 13 4 11 14 13 21 12 4 10 6 0 15 6 0 19 2 13 10 1 0 1 Bordetella bronchiseptica: 28 36 570 172 75 8 47 16 201 919 70 2 173 21 177 260 23 300 44 29 424 288 36 41 232 338 38 89 829 607 94 83 951 182 80 50 364 464 52 70 315 378 105 113 463 161 125 270 378 598 239 284 156 88 5 356 73 34 477 82 283 174 4 2 22 Bordetella parapertussis: 6 14 154 60 14 5 17 5 48 238 14 0 47 5 35 55 5 86 11 6 98 73 8 17 67 97 9 25 213 172 19 14 214 44 23 19 103 104 21 19 81 68 23 34 140 37 21 61 87 136 40 55 33 24 4 77 8 14 112 20 62 50 1 1 4 Bordetella pertussis: 94 101 2008 639 299 32 134 31 649 3091 195 16 477 47 626 986 53 1134 107 68 1322 1154 123 106 785 1164 143 320 3205 2447 301 290 3572 698 386 226 1553 1798 259 215 1549 1175 410 349 1695 529 365 955 1214 1843 838 794 444 251 36 1031 142 86 1549 244 814 504 20 19 55 Borrelia afzelii: 26 1 4 1 18 81 4 77 3 9 152 214 100 117 13 10 154 56 100 186 55 2 171 37 7 0 52 191 31 47 196 113 38 48 150 128 14 31 165 603 113 70 316 122 31 4 29 355 91 84 239 23 68 7 30 27 120 177 7 144 82 19 25 1 0 Borrelia andersonii: 1 0 2 0 1 8 1 1 0 0 3 3 2 2 0 0 4 0 1 2 0 0 1 2 0 0 1 0 0 0 3 1 1 1 3 1 1 1 6 6 5 0 9 2 0 0 2 4 3 1 4 1 2 0 1 0 7 3 0 4 1 1 1 0 0 Borrelia anserina: 1 0 0 0 1 12 1 1 0 0 10 6 3 10 2 0 11 2 3 11 0 2 6 7 0 0 2 19 0 0 33 8 1 1 10 9 0 3 7 8 4 5 26 22 4 0 3 12 7 0 13 0 7 0 0 2 1 4 1 22 11 1 0 1 0 Borrelia burgdorferi: 451 205 120 43 271 2546 575 1072 224 267 3722 4717 1860 2370 421 241 3287 1180 2016 3037 718 243 2517 1034 344 149 1265 2622 527 441 3466 2697 1018 982 2252 2059 288 731 4005 10457 2786 1558 6651 2988 593 296 868 6831 2530 1575 5398 825 2933 201 550 651 4436 3954 633 5885 2316 490 313 92 45 Borrelia coriaceae: 1 3 0 0 1 13 2 15 2 0 10 15 2 14 4 1 8 1 4 20 5 0 13 13 2 0 9 13 2 1 12 13 5 5 5 13 1 3 7 30 5 8 25 23 1 2 6 28 7 9 19 9 20 0 1 7 16 24 5 17 7 8 0 0 0 Borrelia crocidurae: 2 0 0 0 3 28 0 0 0 0 19 9 10 23 4 1 24 4 4 28 0 2 8 12 0 0 4 35 0 4 62 11 0 6 22 15 1 6 24 18 4 10 48 42 8 1 12 25 16 1 25 0 12 0 0 2 3 10 4 35 22 2 2 0 0 Borrelia garinii: 62 7 4 4 34 195 16 200 35 39 464 677 184 363 66 6 410 245 275 686 127 21 451 78 9 11 171 572 80 110 478 350 138 90 389 353 28 119 427 1757 300 225 760 311 66 20 87 941 278 288 715 95 173 2 73 79 321 455 50 407 184 56 61 1 0 Borrelia hermsii: 36 10 1 2 11 135 31 98 17 20 200 342 112 198 24 5 153 73 242 284 47 19 259 103 11 2 73 716 64 80 617 352 65 109 304 325 23 89 289 759 393 98 537 214 39 16 54 442 224 115 531 24 94 4 35 34 222 369 31 329 200 19 27 6 3 Borrelia japonica: 5 0 0 0 15 40 0 4 0 1 15 15 10 10 0 5 15 0 0 10 0 0 5 10 0 0 5 0 0 9 6 5 10 5 15 0 0 10 35 36 24 4 41 10 0 0 10 20 15 6 19 5 10 0 5 5 30 15 0 20 5 5 5 0 0 Borrelia miyamotoi: 3 0 0 0 1 12 0 2 0 0 25 18 20 16 2 0 17 3 21 23 3 1 25 6 0 2 6 36 8 2 57 20 3 12 27 23 1 10 17 41 30 10 44 22 9 0 7 22 22 3 40 2 7 0 2 0 7 25 3 29 23 1 2 1 0 Borrelia parkeri: 1 0 1 0 2 5 1 0 0 0 5 3 0 2 0 0 3 0 2 2 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 3 0 1 1 5 2 0 0 7 12 0 1 9 2 1 0 2 2 5 1 5 0 3 0 1 0 7 3 0 3 1 1 1 0 0 Borrelia turicatae: 3 1 1 0 3 8 2 2 1 0 18 31 2 13 4 0 19 2 13 15 5 2 33 1 1 0 7 29 4 8 57 16 4 7 21 7 1 2 31 54 25 6 29 6 5 0 4 21 13 5 46 0 6 0 3 3 16 11 3 39 8 1 3 0 0 Bradyrhizobium elkanii: 5 15 41 27 13 10 11 13 36 38 29 3 20 7 13 21 5 27 6 12 18 27 6 17 24 28 14 23 28 54 15 19 33 12 8 6 30 26 19 4 15 14 10 12 17 18 15 27 53 16 42 11 7 14 3 36 16 11 35 21 42 14 0 1 4 Bradyrhizobium japonicum: 180 309 2204 906 451 126 278 153 1859 2655 484 65 501 208 795 1203 159 871 168 219 1559 1025 160 225 726 1808 216 610 2862 2947 492 446 3233 551 586 172 2109 1705 441 370 1917 1182 527 374 1498 736 616 1106 2208 2129 1157 760 560 572 115 1817 419 108 2577 421 1569 875 27 33 120 Bradyrhizobium sp.: 10 26 128 73 26 17 25 28 82 118 57 5 48 20 30 44 16 39 14 17 66 43 16 23 45 99 21 43 94 104 35 20 93 31 29 20 81 71 28 16 53 46 31 20 74 35 37 70 109 78 76 20 17 22 5 86 28 22 99 34 76 29 3 1 6 Brevibacillus borstelensis: 2 1 2 6 6 3 7 0 3 10 5 3 12 2 1 7 5 1 9 1 0 4 4 2 1 2 4 4 6 5 7 2 5 11 11 3 5 9 8 9 21 6 10 4 13 0 6 12 18 6 25 5 14 1 2 7 9 4 5 12 14 3 1 1 0 Brevibacillus brevis: 14 121 298 146 138 144 48 87 248 760 298 237 597 106 207 213 164 324 108 332 303 446 188 231 68 432 192 398 426 484 348 339 460 222 246 357 445 418 328 712 441 415 410 566 570 191 324 993 696 477 660 380 457 97 28 363 511 131 612 582 508 183 6 3 5 Brevibacillus laterosporus: 1 4 8 1 4 6 0 5 0 6 15 14 6 10 3 0 8 8 3 20 7 12 12 13 0 12 10 8 4 5 15 15 15 9 9 9 4 10 12 27 23 13 21 9 12 2 12 31 13 11 39 9 24 0 0 4 17 4 6 24 15 16 1 0 0 Brevibacterium epidermidis: 1 1 1 0 2 10 1 6 1 1 6 18 5 5 2 2 9 3 4 5 0 1 10 13 1 0 5 9 3 1 12 6 8 4 10 9 3 1 13 28 4 3 26 14 2 0 11 17 7 4 18 1 16 1 3 5 19 3 7 18 2 3 0 0 1 Brevibacterium fuscum: 1 0 25 1 0 0 0 0 2 26 0 0 0 0 8 5 0 1 0 0 22 0 0 2 1 12 2 4 15 3 1 0 28 0 1 1 15 9 1 0 14 15 0 0 10 15 1 6 21 29 4 18 0 3 0 16 0 0 18 0 5 5 0 1 0 Brevibacterium linens: 7 15 60 25 20 6 12 6 78 67 15 4 26 16 41 40 13 32 17 17 81 31 17 14 36 39 13 50 106 64 30 34 66 38 35 20 81 51 25 16 45 45 14 13 42 42 6 38 76 78 29 47 10 8 6 49 8 3 79 13 50 47 0 2 5 Brevibacterium sp.: 3 15 33 20 8 3 4 3 30 42 5 0 12 5 24 14 3 11 6 12 35 21 7 11 16 40 3 33 58 41 11 28 45 13 23 8 54 30 9 7 29 31 7 9 27 19 11 29 35 71 18 29 7 10 3 31 7 2 59 3 26 11 1 1 1 Brevibacterium sterolicum: 1 1 16 7 3 1 0 0 14 17 1 0 3 1 9 17 0 10 1 1 30 10 2 0 8 14 1 5 29 15 4 4 46 4 9 0 31 10 1 0 31 28 2 1 18 4 0 2 17 24 6 19 0 1 0 22 1 0 26 0 16 9 0 0 1 Brevundimonas diminuta: 3 9 38 20 18 2 6 2 22 54 9 1 22 2 17 19 5 17 7 2 18 26 6 7 30 33 9 18 89 74 10 9 65 25 11 8 41 69 12 5 33 21 9 11 65 26 9 23 37 45 20 22 7 20 3 25 14 2 53 6 30 16 0 0 3 Brucella abortus: 43 40 412 61 183 17 22 7 275 412 263 7 86 50 216 226 47 220 28 58 378 262 66 58 101 336 82 242 596 343 368 76 885 99 366 93 399 288 396 109 563 300 218 56 394 66 146 563 191 429 399 128 201 73 15 375 127 44 548 195 262 147 17 4 22 Brucella abortus 1: 3 0 22 3 6 0 0 0 16 13 11 0 1 4 11 19 2 8 1 5 17 11 0 0 6 20 4 12 26 11 11 4 31 3 11 1 10 5 10 4 7 12 15 5 19 0 2 7 4 7 11 4 6 8 1 10 1 2 13 5 8 5 1 0 2 Brucella canis: 4 12 23 4 20 1 3 0 20 37 21 1 2 2 15 22 3 38 2 2 62 21 5 13 7 14 4 19 56 16 60 10 87 2 63 22 42 5 53 9 39 53 9 2 38 5 10 51 14 52 37 39 22 10 0 50 11 9 41 10 13 28 3 0 1 Brucella melitensis: 12 13 88 13 31 4 7 6 76 80 52 1 21 11 46 50 10 65 10 16 103 48 11 20 24 47 20 59 153 60 109 18 165 14 95 35 83 41 94 30 112 95 49 6 84 18 23 136 45 103 74 50 43 16 1 82 26 11 100 37 67 45 9 1 2 Brucella neotomae: 4 11 25 4 17 1 3 0 20 35 21 1 2 2 16 21 3 35 2 2 64 20 5 12 5 14 6 23 53 17 56 10 88 2 65 23 40 5 56 8 38 53 12 2 35 5 9 54 14 53 37 41 19 13 0 52 10 7 41 12 13 28 3 0 1 Brucella ovis: 11 22 88 24 56 7 10 3 48 113 71 5 16 9 56 80 11 53 5 14 136 63 12 23 26 78 14 53 167 75 97 28 229 14 116 25 86 58 94 33 191 88 41 11 126 19 27 168 59 135 116 57 57 35 9 101 40 13 141 38 68 40 5 3 3 Brucella suis: 5 11 40 6 22 1 3 0 25 49 24 1 3 3 19 26 3 43 3 4 68 23 5 13 7 16 7 22 60 23 62 11 99 6 68 24 45 12 62 10 45 55 12 2 42 5 15 63 19 64 48 41 29 11 0 54 10 9 48 16 23 30 3 0 2 Buchnera aphidicola: 66 142 31 21 259 402 42 184 29 41 272 1417 212 423 69 63 674 60 273 400 46 48 427 272 74 58 272 473 58 71 455 498 65 76 536 440 65 82 482 1914 196 215 1183 602 76 66 388 1139 121 118 819 104 615 59 229 96 965 795 171 1289 542 133 54 7 5 Buchnera sp.: 2 1 2 0 18 22 1 18 1 2 12 37 4 20 6 1 18 1 10 31 7 3 20 12 1 4 17 37 2 4 22 42 6 4 29 24 3 6 24 98 8 8 55 44 4 3 12 70 8 11 59 5 17 3 9 1 31 26 9 44 16 1 2 0 0 Burkholderia caryophylli: 1 2 16 5 7 3 4 2 9 26 9 0 4 0 6 9 2 7 0 7 10 12 2 1 7 19 9 9 15 12 5 4 24 5 6 1 10 5 4 4 11 9 7 3 13 6 16 23 10 16 23 11 9 5 3 20 8 2 14 6 10 7 0 0 1 Burkholderia cepacia: 72 234 921 364 274 54 76 79 659 939 157 35 226 111 172 561 56 358 84 98 405 683 84 96 239 699 121 370 785 1348 262 192 1147 282 270 110 633 733 176 181 652 528 154 250 649 316 199 606 609 847 437 408 196 186 67 633 165 50 834 198 530 322 21 7 44 Burkholderia pickettii: 1 9 10 7 7 2 6 5 20 17 12 0 2 9 6 12 10 9 6 7 15 17 5 3 8 11 4 11 27 37 16 11 18 12 9 8 10 11 13 1 18 13 3 10 8 13 12 13 35 36 17 9 6 9 0 9 5 2 12 5 14 19 0 0 1 Burkholderia pseudomallei: 11 20 106 54 23 11 14 4 118 168 9 1 22 3 40 149 18 82 8 12 65 142 11 20 29 81 8 34 98 247 40 14 196 30 15 20 98 93 13 22 75 132 20 75 125 44 20 54 77 113 38 37 19 19 5 66 20 6 144 20 82 42 5 0 6 Burkholderia solanacearum: 40 25 597 197 57 6 16 9 273 1072 40 3 78 14 158 337 9 293 24 21 394 301 7 22 201 453 20 108 794 713 48 35 739 121 98 21 367 610 31 34 350 350 62 59 479 203 78 228 448 479 215 201 81 108 9 324 51 3 556 46 328 148 7 3 30 Burkholderia sp.: 11 34 134 59 38 4 13 7 69 151 33 3 35 7 43 37 13 67 21 15 92 63 8 15 70 66 22 41 144 105 36 37 193 46 35 18 119 96 31 39 81 90 24 40 80 63 41 113 122 161 59 71 28 45 6 105 40 5 119 25 77 62 3 2 6 Burkholderia sp. LB400: 6 8 56 35 11 6 4 1 23 85 17 3 23 10 17 21 5 20 11 5 43 24 4 10 17 34 7 16 95 47 9 6 80 24 18 2 39 58 13 12 30 28 18 7 54 28 13 42 59 50 34 23 15 16 7 33 22 2 55 17 41 35 0 1 5 Butyrivibrio fibrisolvens: 19 11 23 2 53 181 32 36 82 51 363 86 52 188 47 13 146 113 56 335 58 15 143 127 18 38 123 312 93 33 265 266 177 25 207 216 46 42 236 207 406 207 254 41 209 75 87 369 326 157 466 158 237 56 54 154 190 78 169 247 211 128 13 6 0 Caedibacter taeniospiralis: 10 9 5 3 11 18 2 8 3 10 23 28 7 35 2 4 31 16 13 32 18 20 34 9 2 0 17 42 29 24 61 8 16 10 32 20 10 14 32 51 11 18 58 72 17 4 20 37 24 15 44 10 16 9 14 12 23 18 12 35 73 15 8 2 0 Caldicellulosiruptor saccharolyticus: 13 26 6 4 13 152 69 47 35 47 178 171 104 132 24 23 91 84 89 205 41 19 90 156 22 48 85 228 34 37 116 146 97 79 179 194 36 83 237 431 267 156 269 99 87 33 88 322 161 157 299 146 260 19 41 88 340 269 81 275 145 160 9 4 0 Caldocellum saccharolyticum: 10 20 6 2 11 92 76 37 8 45 87 131 113 95 11 30 64 121 127 283 38 93 66 152 16 109 96 215 21 85 92 162 42 74 167 169 16 82 135 248 186 132 252 77 113 33 72 209 146 120 260 98 255 21 36 59 194 206 26 169 111 206 7 1 2 Caldococcus noboribetus: 1 0 1 0 0 0 20 2 9 14 5 0 1 4 2 1 1 7 1 2 11 8 3 7 11 4 5 5 14 6 9 5 28 4 3 2 13 11 10 0 27 16 2 0 11 9 0 2 30 22 3 16 2 3 0 9 2 27 1 3 10 9 0 1 0 Calothrix PCC7601: 5 1 19 7 17 2 1 12 10 7 12 31 29 5 13 3 11 21 7 15 14 4 15 8 13 5 16 42 13 10 65 7 17 7 37 20 6 16 37 29 16 17 25 41 17 5 9 47 7 13 42 18 13 6 6 9 12 5 21 36 20 8 2 3 0 Calothrix sp.: 5 2 19 2 21 19 7 26 11 12 15 30 27 15 12 6 33 20 14 27 26 6 27 20 20 2 24 50 20 3 50 22 19 6 60 39 5 11 34 76 44 44 28 43 12 15 14 66 13 35 51 40 20 12 10 31 24 22 35 33 33 24 2 3 0 Campylobacter coli: 27 13 34 3 63 203 33 73 35 9 294 340 105 206 23 37 253 152 202 200 104 28 268 48 16 17 103 316 81 46 389 207 126 70 339 204 22 82 194 584 108 156 552 391 80 36 87 390 123 60 454 64 251 29 27 64 436 289 257 300 201 54 19 7 1 Campylobacter fetus: 6 9 14 1 17 36 7 55 5 5 129 186 46 66 5 15 69 122 145 151 32 37 298 24 1 11 19 156 58 43 286 146 104 23 178 167 22 29 167 287 103 86 281 59 14 6 21 109 99 82 368 15 65 3 5 40 100 213 65 108 79 13 5 1 0 Campylobacter hyoilei: 2 1 1 0 5 14 3 3 2 0 21 37 16 3 1 1 5 5 16 3 4 1 5 5 1 0 9 10 2 6 19 10 6 2 15 13 1 12 20 45 14 3 31 12 3 1 6 22 14 1 27 3 18 2 4 3 33 11 12 19 8 6 0 0 2 Campylobacter hyointestinalis: 1 0 1 0 0 11 1 5 0 0 5 16 1 4 0 1 1 7 4 10 1 2 4 4 0 1 0 12 1 2 4 3 4 2 2 2 1 1 4 44 6 6 12 19 1 0 1 26 6 3 10 4 9 1 3 1 16 23 7 9 10 3 1 0 0 Campylobacter jejuni: 70 25 77 12 167 402 66 142 50 25 689 1032 326 335 46 44 449 247 536 378 180 66 570 211 24 27 345 660 138 122 918 560 204 128 636 473 47 203 618 1831 260 252 1302 778 104 50 276 1319 310 105 1276 91 624 79 143 94 1112 559 364 956 527 142 52 9 9 Campylobacter rectus: 1 0 3 0 0 24 3 17 10 5 35 10 12 19 9 3 19 31 7 27 46 23 39 1 1 7 8 24 23 19 48 25 65 0 53 36 22 15 25 88 29 54 62 27 7 7 11 32 35 51 77 11 12 0 0 13 32 22 41 15 16 5 1 0 0 Campylobacter sp.: 1 0 0 0 4 16 0 3 1 1 16 16 9 19 1 0 20 5 14 17 7 0 22 2 0 0 0 31 5 7 31 15 7 7 39 11 2 10 15 26 3 15 34 32 5 0 3 19 6 2 28 1 9 0 0 2 19 14 25 15 17 0 1 0 0 Campylobacter upsaliensis: 1 0 0 0 1 3 0 1 2 0 7 8 2 1 2 0 3 3 0 4 1 3 1 2 0 0 2 0 3 1 1 3 2 1 1 2 2 1 2 14 2 3 4 4 1 3 6 14 2 4 2 4 4 2 2 0 3 3 4 4 6 0 1 0 0 Capnocytophaga ochracea: 1 2 7 1 7 2 0 5 2 7 9 5 5 2 3 1 3 2 5 4 4 7 5 6 3 3 2 9 8 4 8 4 4 5 8 5 2 2 6 7 6 5 3 5 4 3 4 11 7 5 11 3 1 2 1 1 9 5 6 6 10 4 1 0 0 Carnobacterium divergens: 4 0 0 0 0 8 0 2 0 3 12 23 7 6 1 0 13 1 6 11 2 0 5 3 0 1 3 8 1 1 10 14 1 3 14 7 1 3 11 26 5 6 15 11 3 0 3 11 1 0 5 4 12 0 4 3 24 28 2 26 8 5 2 1 1 Carnobacterium piscicola: 21 13 5 3 19 27 15 45 7 12 45 165 41 68 17 9 71 24 71 70 10 14 63 27 9 6 34 64 16 10 74 83 20 35 65 67 19 23 80 239 46 36 149 142 25 11 28 165 37 28 84 31 104 7 31 23 151 112 30 173 80 26 18 1 2 Caulobacter crescentus: 89 92 1352 366 231 13 34 34 474 2188 134 0 133 35 258 777 37 450 23 24 1128 508 35 27 470 821 75 66 2545 1110 288 70 1960 233 287 30 1294 928 162 81 1148 721 124 112 914 368 96 620 1374 1468 337 292 199 166 17 816 76 8 1483 73 777 219 24 17 48 Cellulomonas fimi: 11 20 203 131 27 2 13 2 322 218 3 0 1 8 160 283 3 181 1 4 437 522 1 4 167 332 9 40 459 619 21 18 706 125 45 5 463 240 4 0 206 303 0 7 312 129 4 10 278 516 1 295 1 59 1 249 1 0 179 0 75 235 0 0 11 Cellulomonas uda: 1 1 10 7 7 2 2 0 4 24 2 2 4 1 3 3 3 7 3 3 7 10 3 1 5 18 0 2 21 17 5 0 11 5 1 2 2 14 2 6 7 12 4 3 12 3 2 4 6 9 10 3 5 2 0 6 4 1 10 3 14 19 1 0 0 Cellvibrio gilvus: 1 0 39 0 2 0 1 0 12 50 0 0 5 0 17 13 0 9 0 1 30 7 0 3 6 41 3 7 64 32 3 3 62 4 9 0 22 35 1 5 30 22 3 2 28 9 4 14 24 28 10 13 4 2 0 25 1 0 16 2 15 14 0 0 1 Cellvibrio mixtus: 4 3 43 7 11 2 1 7 24 43 12 8 19 14 31 16 11 96 42 19 107 23 24 13 32 22 10 51 108 51 23 8 144 9 86 27 32 73 27 65 23 106 65 53 44 28 19 50 29 47 60 52 30 20 6 40 38 3 68 42 33 61 3 1 0 Chelatobacter heintzii: 7 34 94 30 30 7 11 15 53 82 42 10 30 16 30 36 14 53 14 17 48 47 14 13 27 55 17 35 78 70 60 35 87 27 31 18 57 58 32 34 63 34 38 21 77 40 38 74 105 96 51 41 31 16 3 83 34 18 66 22 38 28 3 0 4 Chlamydia pneumoniae: 12 18 24 1 62 70 5 75 61 18 68 145 41 48 48 20 144 47 38 122 34 16 143 63 23 5 122 178 72 39 233 161 69 24 117 126 57 38 157 280 78 92 113 116 55 19 31 247 67 85 192 45 62 44 53 91 74 38 133 134 82 54 9 3 0 Chlamydia psittaci: 61 75 115 29 213 284 69 328 217 119 420 720 289 358 249 128 615 237 212 552 281 180 504 238 123 66 489 513 229 151 908 531 259 230 489 433 213 188 512 1069 388 460 659 578 216 123 263 820 316 269 792 262 389 203 273 419 549 310 439 644 384 294 43 12 6 Chlamydia sp.: 10 14 5 1 14 60 17 33 13 18 34 96 40 57 14 15 83 10 33 70 17 11 46 32 4 5 23 37 13 10 59 47 13 12 25 42 10 20 46 153 42 49 86 49 23 9 35 127 25 31 77 24 55 8 22 35 69 83 31 97 39 20 7 1 2 Chlamydia trachomatis: 167 364 352 175 708 789 150 495 376 381 952 1484 1025 400 528 282 1622 490 455 1178 366 361 1190 503 188 134 1125 1270 436 423 2181 1470 455 591 726 1120 444 630 1596 2690 1016 695 1385 1309 551 247 540 2185 1028 720 1764 536 771 391 589 816 1288 584 935 1637 1069 501 101 42 27 Chlorante-Aster yellows phytoplasma: 2 0 2 0 6 2 0 3 1 0 4 21 8 6 0 1 13 3 6 5 2 0 14 1 3 1 6 7 3 0 17 6 8 2 11 12 0 2 23 33 3 6 14 29 3 4 6 22 2 7 15 6 8 3 5 2 18 5 8 23 9 1 1 0 1 Chlorobium limicola: 15 16 102 36 50 18 34 7 160 168 91 4 61 39 64 98 38 81 19 22 156 59 17 42 77 151 47 70 193 93 87 64 216 41 83 23 134 107 87 113 166 108 46 27 130 72 32 118 115 129 111 86 41 46 10 179 61 11 190 96 132 98 8 1 6 Chlorobium tepidum: 9 4 29 1 18 10 13 1 47 40 29 3 12 12 27 29 12 28 6 10 42 11 13 4 12 22 11 25 55 24 31 23 61 8 48 11 44 29 37 38 63 56 15 1 43 15 4 43 41 50 30 25 11 6 0 39 23 3 62 28 35 17 4 0 5 Chlorobium vibrioforme: 21 22 222 30 81 31 41 2 278 258 123 5 41 51 88 157 31 144 24 40 258 90 37 32 80 189 56 100 262 168 122 60 347 34 157 48 250 192 119 193 299 214 49 35 224 106 50 262 304 294 162 138 57 56 12 218 46 10 366 121 238 55 8 1 12 Chloroflexus aurantiacus: 18 26 144 74 94 6 5 17 152 231 41 25 89 43 16 82 11 82 46 40 113 83 23 71 67 140 33 107 217 140 110 40 154 61 153 46 102 124 81 46 93 80 113 78 162 54 32 140 180 64 172 102 64 12 13 110 109 6 158 154 133 107 4 9 5 Chlorogloeopsis sp.: 1 1 3 1 3 1 0 1 0 0 3 0 1 1 0 1 2 1 1 3 0 0 1 0 1 0 1 4 0 1 4 4 2 1 8 3 0 1 5 3 2 2 2 0 1 0 0 8 2 2 4 2 3 0 0 0 4 0 0 1 3 1 1 0 0 Chromatium vinosum: 32 12 316 68 117 7 5 5 232 477 17 1 27 12 131 167 8 127 23 12 349 95 14 10 150 256 15 39 569 242 53 39 517 66 176 5 386 241 15 38 410 277 48 20 261 152 68 150 429 371 169 154 111 103 22 311 20 1 483 20 312 143 6 1 25 Chromobacterium violaceum: 1 5 17 5 2 0 1 4 2 20 6 0 3 0 2 0 1 1 0 0 8 1 0 1 4 12 3 3 14 10 6 6 13 2 1 2 6 12 1 0 8 5 4 6 8 10 7 6 7 19 8 6 0 2 0 8 3 1 5 2 2 5 0 0 1 Chromohalobacter marismortui: 1 6 7 6 2 1 4 5 6 8 4 0 3 3 3 1 3 6 0 2 9 4 5 2 3 3 4 6 13 4 2 5 6 1 5 3 6 9 3 8 12 3 2 4 11 5 1 10 14 8 4 7 5 2 1 6 0 1 7 1 7 7 0 0 1 Chryseobacterium meningosepticum: 3 2 7 1 20 24 1 11 0 44 33 45 20 15 24 15 45 25 22 47 31 27 28 17 3 27 27 63 20 21 55 80 11 15 67 64 4 17 45 138 65 38 99 19 64 7 17 87 28 44 89 31 82 1 5 41 60 16 26 79 52 31 2 1 0 Citrobacter diversus: 3 5 18 7 22 3 1 3 11 50 16 10 9 6 1 7 1 9 11 9 24 36 6 4 10 14 4 21 42 24 21 6 27 10 18 6 17 16 15 37 7 10 20 16 32 6 5 26 25 11 34 7 6 3 2 5 27 0 18 19 23 14 3 0 0 Citrobacter freundii: 44 52 299 75 286 74 33 69 134 753 171 216 146 128 152 155 158 294 115 147 370 225 155 153 85 336 147 285 517 514 277 170 495 205 364 167 203 407 334 611 229 397 365 226 507 144 175 557 365 329 527 211 312 115 70 239 350 114 388 486 460 228 31 3 10 Citrus greening disease-associated bacterium: 4 2 2 4 13 7 5 2 1 0 19 10 9 7 3 11 28 4 13 6 0 6 16 3 4 3 15 13 2 15 33 11 5 14 28 11 4 11 43 31 28 0 19 8 12 0 3 27 16 3 28 1 4 1 5 4 17 11 6 38 22 1 2 2 0 Clavibacter xyli: 3 10 16 15 7 3 3 2 7 12 4 1 4 5 18 5 0 8 5 2 11 7 5 9 9 11 7 7 8 9 6 9 16 15 3 3 12 11 5 3 10 15 1 2 7 7 5 6 8 16 7 5 1 3 4 7 1 1 18 1 11 7 0 0 3 Cloning vector pCG1408: 2 2 8 2 9 3 0 6 3 14 11 8 4 5 4 4 3 2 9 4 11 10 8 6 5 6 4 11 16 7 10 5 9 7 10 6 5 7 13 13 10 9 9 11 11 8 11 17 15 9 19 7 8 3 5 11 19 8 8 10 19 8 2 0 0 Cloning vector pKSM715: 3 5 22 9 7 1 4 5 9 43 14 6 10 7 9 8 12 11 6 3 17 7 5 5 12 13 5 13 29 31 12 4 22 9 11 5 14 23 13 12 6 7 14 19 24 7 9 23 15 21 24 4 8 5 3 11 5 3 15 12 16 10 0 1 2 Clostridium MCF-1: 1 0 1 0 2 3 3 3 2 1 7 11 5 3 1 1 3 2 3 4 0 2 5 1 0 2 2 2 0 0 2 1 4 2 5 3 1 3 2 14 11 7 6 3 7 2 3 4 9 3 10 4 12 5 2 3 9 6 1 3 5 6 0 0 1 Clostridium acetobutylicum: 94 37 18 3 48 855 126 253 92 42 756 1113 192 639 116 58 389 214 416 759 169 73 663 434 42 43 364 1016 119 97 938 1149 214 113 741 897 66 131 1060 1832 757 401 1306 535 178 99 277 1590 409 269 1617 264 866 93 220 237 893 1436 201 889 783 206 68 22 4 Clostridium acidi-urici: 1 0 0 0 1 16 0 4 0 0 14 38 0 7 0 0 6 2 1 11 0 0 17 19 0 0 1 26 0 0 38 33 0 0 18 23 0 2 19 41 6 22 3 12 0 5 7 27 6 20 24 4 5 0 6 13 6 30 4 4 14 1 1 0 0 Clostridium barati: 1 1 0 0 1 37 3 9 2 1 17 74 9 25 2 2 34 11 34 30 5 3 37 15 0 1 16 23 2 0 20 25 2 6 24 30 2 1 30 77 12 9 157 33 3 0 11 52 11 4 63 9 66 3 6 6 52 66 5 57 18 14 1 0 0 Clostridium beijerinckii: 8 2 4 0 9 44 5 24 3 1 24 89 9 30 7 3 39 18 49 57 7 5 50 37 0 5 33 79 5 9 72 101 21 13 96 86 5 12 76 99 36 24 87 41 4 8 28 82 25 15 93 18 63 6 19 21 73 65 6 108 61 24 7 1 0 Clostridium bifermentans: 4 2 1 0 5 29 6 12 2 1 32 67 7 29 4 1 42 6 35 36 8 1 46 24 1 4 23 18 6 6 32 34 7 7 19 25 3 6 32 94 18 30 134 33 3 7 24 75 14 19 81 16 80 2 13 12 69 76 4 71 22 20 4 0 0 Clostridium botulinum: 59 51 13 12 107 907 152 397 34 28 497 2491 397 1013 137 66 1042 219 1129 1012 132 100 1075 588 91 43 626 675 84 58 621 910 117 180 586 979 46 146 951 2762 640 537 4820 1249 190 39 267 2156 453 271 2438 248 2523 73 304 257 2075 2419 222 2039 706 537 44 14 1 Clostridium botulinum A: 1 2 0 0 1 22 1 10 0 0 8 76 14 24 4 0 41 4 36 23 2 1 23 18 2 2 14 18 4 1 14 22 3 6 14 20 0 6 23 64 22 18 134 31 4 1 4 59 13 5 67 6 70 0 12 11 52 62 7 56 21 15 1 0 0 Clostridium botulinum B: 2 0 1 0 1 9 0 9 2 1 6 23 1 16 1 0 13 2 9 12 2 0 10 4 1 0 6 8 3 2 9 6 2 0 9 10 0 2 10 21 3 8 50 15 3 1 1 13 0 5 18 6 24 2 2 2 18 15 8 14 7 11 1 0 1 Clostridium botulinum C: 1 3 1 0 1 32 9 12 2 0 16 68 6 26 2 1 28 6 40 28 3 7 37 11 5 3 24 28 1 2 11 26 1 5 21 30 2 5 30 79 15 14 120 28 6 0 10 57 19 7 75 7 67 2 7 3 62 72 4 58 20 15 1 0 0 Clostridium butyricum: 14 5 2 1 12 108 27 39 10 5 92 265 40 99 10 13 95 25 118 109 15 5 118 62 10 5 64 79 11 4 79 137 7 16 76 86 7 18 119 411 112 56 487 143 30 8 47 315 54 25 282 36 272 9 46 31 232 247 21 262 96 64 11 3 0 Clostridium cellobioparum: 2 0 6 4 7 7 2 1 2 14 1 4 8 3 6 5 1 3 0 3 13 4 3 2 4 4 1 6 8 13 5 15 15 7 7 11 3 10 6 10 13 5 2 2 7 2 0 10 13 12 12 5 6 4 2 5 4 2 12 17 16 0 2 0 0 Clostridium cellulolyticum: 8 3 3 1 32 70 10 20 13 27 76 81 54 89 31 9 54 45 66 117 24 12 95 63 7 23 68 166 19 12 130 136 31 13 129 108 16 17 97 143 121 93 218 68 83 20 48 142 29 78 213 61 157 12 33 59 125 95 38 129 111 105 6 2 0 Clostridium cellulovorans: 6 9 4 4 13 38 9 30 5 7 51 176 13 112 4 9 68 61 61 293 16 17 129 104 0 13 44 214 18 16 143 161 23 20 94 230 11 15 132 179 44 91 205 92 12 11 28 111 24 33 176 27 88 2 13 55 104 109 50 78 70 64 3 2 1 Clostridium cochlearium: 4 0 0 0 0 34 6 11 0 0 25 62 5 19 2 0 10 4 8 37 5 0 23 35 0 1 11 47 2 8 47 73 4 2 35 31 4 8 49 65 34 13 46 35 3 5 15 90 11 13 57 6 31 3 14 6 32 61 7 26 32 7 3 1 0 Clostridium cylindrosporum: 1 0 0 0 0 15 0 20 0 0 31 1 0 16 0 0 2 3 0 18 0 0 13 17 0 0 5 22 0 1 42 30 0 0 22 15 0 1 32 4 40 25 5 13 0 5 3 33 1 14 19 7 2 1 7 14 4 7 20 7 17 2 1 0 0 Clostridium difficile: 33 29 8 2 48 391 38 213 26 43 267 1162 221 505 39 14 579 104 522 459 59 40 677 256 4 10 295 479 51 21 499 632 84 72 570 552 50 106 473 1473 364 265 1609 471 91 73 191 1229 316 208 1196 234 950 22 105 224 1013 1244 141 833 440 179 23 8 2 Clostridium histolyticum: 2 0 2 0 3 34 9 8 1 0 24 72 8 28 5 0 28 9 43 38 7 1 49 30 2 1 25 35 6 2 32 59 3 7 40 43 0 5 35 103 40 20 99 31 4 3 23 91 15 21 94 17 90 4 7 17 40 54 7 22 33 18 2 0 0 Clostridium hungatei: 2 4 12 11 13 1 1 1 7 29 1 1 8 1 14 5 0 10 3 3 16 3 5 5 9 15 2 3 30 4 1 5 22 5 23 3 10 16 6 12 31 18 4 8 12 14 13 27 23 24 16 18 10 9 7 17 1 0 39 4 19 13 1 0 1 Clostridium innocuum: 1 0 5 1 4 3 0 0 2 20 3 1 2 0 4 0 1 5 3 8 4 2 0 1 1 3 1 9 5 1 0 3 6 2 1 2 5 9 3 4 18 8 10 0 8 5 5 8 12 3 16 3 8 0 3 4 3 4 16 9 9 1 0 1 0 Clostridium josui: 5 8 4 4 16 52 14 15 14 44 71 48 32 61 16 10 28 36 54 82 29 12 39 29 11 9 48 84 31 18 88 87 31 16 57 68 13 15 61 132 67 47 138 26 37 8 30 119 44 39 116 33 67 13 19 32 70 89 28 106 57 32 3 1 1 Clostridium kluyveri: 5 1 0 0 1 46 7 12 6 9 47 55 28 41 13 0 35 12 30 42 8 2 57 33 2 2 44 85 11 7 72 85 21 12 42 99 2 25 72 127 58 21 96 16 23 3 29 113 40 14 77 10 71 4 21 19 56 127 6 59 58 7 4 1 0 Clostridium limosum: 1 0 0 0 1 14 1 1 0 0 5 12 2 4 0 0 5 2 5 5 3 0 8 1 0 1 9 10 1 3 6 11 1 0 6 4 0 3 6 18 5 0 17 9 0 0 0 12 0 1 11 1 8 0 2 2 10 8 0 12 3 1 1 0 0 Clostridium litorale: 4 0 0 0 1 32 0 16 2 1 39 5 1 16 0 1 17 6 2 35 0 2 21 24 1 2 13 54 7 6 47 73 12 0 11 43 5 5 46 31 41 27 2 8 9 8 2 59 38 46 14 19 10 7 5 35 6 61 4 2 31 3 4 0 2 Clostridium longisporum: 7 1 0 0 4 60 3 15 2 2 50 126 6 50 1 0 38 16 31 67 7 0 78 53 2 2 29 76 3 1 72 83 12 11 60 77 4 9 88 145 64 33 113 45 10 7 29 165 17 18 124 17 85 3 17 30 77 118 14 86 50 29 6 1 0 Clostridium magnum: 6 4 2 0 3 59 10 24 7 13 40 93 24 43 9 2 37 13 42 68 15 4 54 43 3 10 30 96 16 9 85 119 21 18 58 79 8 24 103 152 89 27 119 38 12 8 37 167 57 19 125 14 49 9 27 14 66 124 18 119 69 16 4 2 0 Clostridium novyi: 2 5 0 0 2 42 6 17 4 7 38 133 28 61 6 3 53 11 55 54 5 5 59 31 1 2 25 49 3 6 38 95 3 5 52 60 3 9 52 184 42 22 249 68 13 5 27 115 28 16 136 21 147 1 13 14 109 148 6 110 37 37 2 0 0 Clostridium pasteurianum: 39 6 2 1 25 345 29 65 10 22 261 425 87 176 37 9 153 58 144 232 27 17 276 187 10 15 131 309 56 23 362 458 52 39 331 355 18 40 356 652 218 106 470 197 68 41 113 703 112 99 549 49 359 28 161 102 290 569 97 312 324 53 24 14 1 Clostridium perfringens: 105 51 31 7 110 806 103 277 35 81 503 1650 165 854 96 56 568 216 669 931 107 73 1026 553 19 36 425 853 122 88 1037 1283 124 182 648 898 64 126 961 2213 837 558 1864 801 143 140 403 1796 512 335 1843 300 1436 90 193 381 1075 1434 225 1047 826 472 87 15 3 Clostridium purinolyticum: 1 0 0 0 0 2 1 4 0 1 2 3 0 7 0 0 0 0 0 4 0 0 2 3 0 0 1 8 0 0 10 16 0 0 1 5 1 0 9 6 2 0 2 4 0 1 0 15 3 4 7 1 2 1 2 1 2 5 3 2 6 0 1 0 1 Clostridium septicum: 3 0 0 0 10 58 4 7 1 0 22 98 6 55 4 0 38 10 46 77 0 6 58 32 0 5 21 50 3 2 54 103 4 9 52 56 0 8 41 131 19 14 137 40 3 0 19 107 25 9 105 13 67 3 7 5 66 80 1 63 24 22 3 0 0 Clostridium sordellii: 7 5 1 0 17 82 11 42 4 5 40 206 38 113 11 2 138 20 91 117 15 10 118 58 3 1 51 111 16 1 65 166 9 19 107 104 4 6 100 282 37 59 340 85 15 3 35 204 40 40 287 35 206 6 26 30 168 227 31 172 100 53 7 0 0 Clostridium sp.: 1 0 1 0 0 10 9 4 2 7 20 16 4 11 4 8 6 9 15 16 2 5 11 11 0 6 9 32 5 8 8 20 11 6 16 17 5 4 13 35 23 9 38 11 6 1 9 27 17 9 43 13 33 0 3 2 14 28 5 17 14 14 1 0 0 Clostridium spiroforme: 2 4 0 1 7 23 2 8 0 0 25 66 6 22 7 1 34 8 40 48 1 3 38 21 4 4 21 34 5 5 30 36 8 0 30 28 3 4 23 106 23 14 103 28 12 0 6 81 15 3 85 5 73 0 4 5 42 48 6 48 20 11 0 1 1 Clostridium stercorarium: 9 12 22 36 33 108 90 9 37 125 123 45 62 58 74 48 41 89 67 102 139 66 69 45 65 91 81 107 101 97 80 166 143 80 119 122 41 101 119 198 118 145 186 46 124 36 73 287 113 184 189 136 226 55 26 109 149 144 76 166 130 139 6 0 3 Clostridium sticklandii: 1 0 0 0 1 4 0 2 0 0 5 2 0 2 0 0 0 2 1 3 0 0 4 1 0 0 5 3 1 1 13 5 2 1 5 1 1 1 10 6 2 3 1 4 1 1 0 16 3 4 7 0 1 1 3 2 7 4 4 5 6 0 1 0 1 Clostridium symbiosum: 2 0 6 0 27 22 1 0 4 18 31 32 0 1 29 0 9 9 1 48 11 2 8 13 0 30 11 50 17 3 51 20 60 0 40 36 3 4 57 36 51 39 6 1 42 8 13 54 67 33 39 31 12 12 1 47 10 0 50 17 57 10 1 1 0 Clostridium tertium: 1 0 0 0 5 14 3 10 0 1 8 34 7 28 1 1 21 6 24 27 2 2 29 12 0 1 8 23 3 1 14 41 2 7 14 21 1 2 14 39 14 9 57 13 2 1 6 28 10 6 37 1 48 0 2 2 22 29 3 36 12 9 1 0 0 Clostridium tetani: 2 2 0 0 4 48 22 34 2 10 24 138 20 50 10 4 66 26 42 70 22 4 50 60 8 4 34 48 10 4 42 62 22 6 36 66 2 10 48 196 18 44 198 72 14 4 24 118 22 16 160 22 136 6 14 14 98 150 6 112 50 26 2 0 0 Clostridium tetanomorphum: 6 0 0 0 0 85 1 14 0 0 47 104 6 41 6 0 11 7 7 57 2 0 55 67 2 0 11 89 4 0 88 112 15 5 68 67 1 4 99 123 43 42 54 21 36 9 24 173 9 25 95 22 39 6 31 27 45 77 20 41 67 15 5 0 1 Clostridium thermocellum: 33 13 45 38 69 426 198 31 105 285 519 231 462 407 252 167 220 274 235 678 296 229 427 246 123 534 416 704 276 285 413 792 346 112 525 539 136 284 594 947 551 655 733 222 389 125 201 1089 496 752 841 395 780 74 83 317 565 664 206 632 446 449 19 5 9 Comamonas acidovorans: 1 0 7 2 1 0 0 0 2 23 0 0 1 0 9 8 0 18 3 2 34 18 1 2 10 3 3 10 46 16 7 1 39 7 3 0 11 25 2 1 14 31 3 2 14 7 1 4 1 15 2 18 8 8 3 9 2 0 11 3 14 9 1 0 0 Comamonas sp.: 1 1 7 2 0 1 2 1 6 19 0 0 1 0 4 10 2 38 3 0 24 15 1 1 6 9 4 6 42 22 7 2 38 7 7 1 5 18 3 0 11 27 18 4 22 1 4 1 1 13 6 12 17 10 0 9 2 1 15 3 11 10 0 0 1 Comamonas testosteroni: 25 25 307 67 54 13 33 20 145 409 34 8 74 25 82 132 24 184 25 38 221 101 27 33 181 140 45 91 469 256 93 60 473 92 113 40 161 368 51 49 254 196 107 78 231 104 63 160 248 288 119 139 88 83 20 217 63 14 228 91 237 150 1 3 21 Corynebacterium ammoniagenes: 8 21 258 27 116 6 7 45 123 252 63 32 200 39 176 105 99 46 13 31 327 74 62 155 58 115 74 281 343 247 247 57 377 44 221 91 251 213 144 65 170 156 90 92 178 135 32 304 246 250 245 110 35 24 17 117 102 2 200 184 144 117 3 3 2 Corynebacterium diphtheriae: 14 16 91 25 68 11 17 34 98 54 65 25 41 29 49 26 50 38 21 51 84 37 67 60 38 38 24 78 87 57 90 80 79 32 60 44 92 47 104 66 72 72 34 57 57 77 33 168 82 127 135 45 20 20 8 62 43 15 102 86 68 33 11 1 2 Corynebacterium diphtheriae virus: 1 2 1 1 6 3 4 8 4 4 10 8 6 7 4 10 15 11 7 7 6 5 12 6 3 5 9 9 5 12 19 10 6 13 17 15 6 9 17 29 11 6 24 14 2 7 10 22 15 8 20 5 13 2 2 4 15 14 9 13 8 5 0 0 1 Corynebacterium flavescens: 2 0 22 1 15 1 0 2 13 22 16 0 13 2 22 3 16 1 3 1 35 5 8 14 2 5 6 31 12 9 41 10 32 0 21 6 28 21 34 4 27 19 9 1 22 7 2 33 24 32 21 7 4 5 1 16 3 0 17 22 14 2 2 0 0 Corynebacterium glutamicum: 147 260 1594 174 894 78 104 257 1165 1682 871 146 864 306 1320 287 580 494 141 312 1984 340 575 1092 340 417 570 2007 1317 1018 1658 818 2202 188 1342 365 1313 1343 1422 513 1583 1549 427 464 1280 868 237 1837 1750 1749 1577 957 277 243 106 1423 430 48 2038 1047 1231 584 104 24 19 Corynebacterium lactofermentum: 1 0 4 0 4 0 0 0 1 6 3 0 4 1 5 0 3 0 0 1 10 0 0 2 0 0 1 7 3 2 7 2 8 0 4 1 7 6 6 2 6 5 1 0 6 1 1 10 5 9 6 1 1 1 0 4 0 0 6 4 4 1 1 0 0 Corynebacterium liquefaciens: 1 1 28 5 3 0 0 0 10 29 2 0 2 0 8 12 1 3 0 1 22 3 0 2 4 9 3 10 28 11 3 4 23 2 1 0 12 17 0 3 4 7 2 4 13 5 0 18 16 13 8 6 0 1 0 9 1 1 13 5 11 4 0 0 1 Corynebacterium nephridii: 3 0 1 0 7 1 0 2 1 6 10 9 5 7 0 0 2 1 5 2 1 3 11 10 1 1 9 25 3 9 8 1 5 0 7 5 5 8 18 20 1 9 15 15 7 0 3 22 2 6 14 3 4 3 9 7 9 0 8 14 9 7 3 0 0 Corynebacterium pseudotuberculosis: 6 15 21 15 29 5 15 13 22 26 39 23 23 15 17 9 23 14 8 23 45 15 31 17 5 18 23 64 29 44 68 44 37 38 45 33 21 38 33 65 58 30 53 23 34 20 25 50 46 55 83 19 37 9 5 25 40 14 57 50 35 30 2 1 3 Corynebacterium renale: 1 3 2 4 9 1 3 0 5 4 1 5 2 5 2 4 4 2 0 1 4 3 5 2 8 5 6 6 7 6 10 6 2 4 7 5 8 3 9 1 3 4 2 5 10 3 2 1 6 2 4 4 3 6 4 4 5 6 3 5 1 1 1 0 0 Corynebacterium sp.: 9 6 122 31 19 1 4 2 70 173 11 0 8 3 57 47 0 42 3 3 134 34 7 2 32 98 8 32 213 114 16 27 175 35 20 4 110 140 14 3 75 91 4 1 95 83 8 78 136 134 39 68 6 19 0 97 3 0 127 8 51 50 1 5 3 Corynebacterium striatum: 3 19 24 21 21 4 11 7 42 31 22 5 9 8 10 14 5 18 6 14 34 19 14 15 15 16 8 38 31 43 21 21 48 16 20 9 48 24 15 15 19 23 6 8 17 26 11 25 25 21 16 14 5 6 4 27 7 3 42 13 24 23 0 1 2 Corynebacterium ulcerans: 1 2 7 2 2 0 0 1 5 6 2 4 1 1 4 0 3 2 2 5 7 6 7 1 2 3 4 13 5 10 5 9 7 6 7 7 2 4 6 12 10 6 8 4 3 4 7 5 2 16 13 4 6 3 1 5 8 1 11 7 3 8 0 0 1 Corynebacterium xerosis: 6 18 69 25 11 8 10 10 45 49 19 7 11 12 24 12 4 27 4 15 102 22 14 30 25 27 17 32 84 58 11 23 68 20 25 16 50 43 13 54 22 53 7 43 27 59 15 48 29 64 25 36 2 39 4 22 17 5 82 20 33 50 4 0 2 Cowdria ruminantium: 12 1 1 1 10 34 9 37 2 0 42 125 11 114 16 3 97 34 51 100 12 4 104 86 1 6 38 113 8 8 85 91 35 15 141 105 10 37 76 187 49 51 164 44 20 13 39 129 25 29 146 40 87 18 39 37 149 109 38 125 95 10 11 1 0 Coxiella burnetii: 153 435 503 262 503 283 138 345 395 412 637 1399 852 502 411 374 514 415 403 444 662 523 476 378 463 408 508 804 801 825 936 632 872 351 685 474 583 648 866 2457 641 668 1369 1758 456 375 564 2112 687 626 1373 437 925 215 283 532 1190 548 744 1435 812 376 102 24 27 Curtobacterium albidum: 2 2 12 18 8 1 0 4 10 28 4 0 6 4 5 9 3 6 2 3 10 8 3 2 5 23 3 3 18 28 7 1 13 11 9 2 16 24 3 1 17 13 5 2 20 13 4 4 27 28 10 14 3 4 0 16 2 0 13 1 10 19 0 2 0 Cyanobacteria: 1 6 6 6 7 6 1 6 4 8 8 26 12 5 7 1 10 9 9 7 8 1 9 4 5 2 11 8 12 3 12 14 9 12 16 10 4 5 22 29 6 11 25 26 8 6 6 23 9 13 26 4 15 2 4 9 27 4 10 44 15 5 0 1 0 Cyanothece ATCC51142: 5 2 14 10 60 3 0 7 21 10 17 92 9 10 34 2 47 11 8 9 68 6 32 1 23 4 53 29 15 13 91 45 20 15 92 37 11 12 68 57 34 56 17 44 18 36 10 113 30 37 47 50 22 1 20 59 31 4 75 49 62 27 4 1 0 Cyanothece PCC 8801: 12 13 35 18 48 14 5 24 49 31 30 142 38 19 35 21 39 22 53 26 95 32 41 15 51 21 48 49 91 37 76 86 40 49 52 23 49 43 92 124 51 44 74 99 32 29 46 190 37 41 123 31 57 20 51 28 81 12 45 131 65 24 11 1 0 Cyanothece PCC8801: 1 0 0 0 1 0 0 2 2 0 0 1 2 0 3 0 3 0 0 1 3 1 4 0 2 0 1 2 1 2 6 2 0 0 4 2 0 1 4 2 1 2 0 6 0 1 0 8 1 2 8 3 1 1 4 1 1 0 5 1 1 0 1 0 0 Cycloclasticus oligotrophus: 5 11 20 7 19 8 1 15 3 12 20 50 18 24 7 5 19 16 11 21 27 13 18 20 11 7 30 37 18 19 40 14 38 12 48 22 16 25 46 53 17 36 30 34 14 17 26 58 43 25 62 15 29 6 8 19 54 9 20 68 35 33 4 0 1 Cytophaga heparina: 5 3 23 19 31 20 32 11 6 79 58 38 45 19 24 27 23 44 29 30 64 22 40 34 33 34 41 63 95 21 51 63 56 32 63 66 12 44 55 164 90 84 91 39 84 29 31 112 32 65 118 58 106 7 12 36 115 43 53 78 66 58 1 3 1 Cytophaga lytica: 2 0 0 0 28 15 0 1 0 0 17 48 9 6 2 0 37 1 5 28 2 3 24 24 0 2 9 36 1 5 26 20 1 2 72 42 0 2 31 35 13 15 11 17 7 18 1 44 26 5 56 10 8 0 3 11 20 9 14 42 30 3 1 1 0 Cytophaga sp.: 1 4 2 1 3 16 1 4 0 4 22 38 6 38 1 8 20 16 12 59 16 21 72 18 2 6 18 47 19 13 51 54 25 4 33 33 3 2 40 54 5 40 66 25 6 4 11 31 7 19 46 32 40 5 7 13 43 9 12 41 16 18 1 0 0 Dactylococcopsis salina: 1 5 0 0 2 11 3 5 3 1 1 20 2 5 1 0 6 1 4 5 2 1 5 4 2 1 7 4 4 2 7 8 1 4 11 4 2 2 12 22 10 4 11 22 4 0 6 17 7 3 17 2 9 1 4 4 18 7 4 12 6 3 0 1 0 Dactylosporangium sp.: 1 1 15 6 1 0 0 0 9 23 0 0 1 0 2 5 0 1 0 0 9 4 0 0 2 21 0 0 17 15 1 0 20 2 0 0 13 7 0 0 4 6 0 0 9 10 0 0 11 22 1 6 1 3 0 6 0 0 9 0 5 4 0 1 0 Deinococcus proteolyticus: 1 4 11 13 2 1 1 0 3 21 4 1 1 2 2 5 0 8 3 0 9 1 0 4 8 6 1 4 10 5 4 2 24 11 6 1 6 12 5 6 6 5 0 1 14 3 1 11 8 14 8 7 2 0 0 6 2 0 6 1 3 2 1 0 0 Deinococcus radiodurans: 21 11 406 109 75 8 24 6 290 530 22 1 49 9 91 115 18 236 26 15 375 171 37 21 267 177 30 35 534 352 74 41 541 122 80 8 221 408 38 89 292 248 22 43 293 153 11 263 339 464 39 199 30 50 6 211 66 3 290 81 157 74 6 2 13 Desulfoarculus baarsii: 2 0 1 0 0 0 1 0 2 4 1 0 2 0 1 0 0 1 1 0 2 1 0 0 5 5 0 0 14 2 2 3 10 1 0 0 9 5 5 3 13 7 0 2 5 4 1 7 10 5 6 8 0 8 2 4 0 0 6 2 5 3 1 1 0 Desulfomicrobium baculatus: 2 2 50 23 14 1 5 1 30 87 12 0 9 3 23 16 4 10 0 1 37 23 2 2 17 22 4 4 68 23 1 9 56 24 10 3 39 49 3 7 35 13 5 0 31 14 14 33 51 42 17 10 8 7 3 23 19 0 42 6 30 2 0 1 1 Desulfomonile tiedjei: 1 6 3 3 6 6 2 2 13 10 12 1 7 0 6 2 5 2 4 7 5 5 7 3 8 11 14 8 11 2 10 7 12 5 6 3 9 8 9 15 20 11 6 3 18 5 8 17 15 17 10 3 7 3 3 18 11 4 11 7 12 2 1 0 0 Desulfovibrio africanus: 3 1 35 2 4 1 2 0 35 58 4 1 7 0 41 22 1 25 1 3 41 31 6 1 42 19 9 5 119 34 20 9 96 2 20 1 42 45 4 8 105 49 2 3 58 33 8 30 54 61 25 39 4 28 6 66 3 3 58 1 52 14 0 3 0 Desulfovibrio baculatus: 1 0 3 1 3 2 0 0 1 16 5 0 3 0 8 0 2 4 2 0 10 1 3 0 11 9 1 6 16 3 3 7 10 2 10 3 11 9 2 5 12 11 2 0 3 4 8 18 7 7 8 4 4 6 7 8 5 0 10 6 8 5 1 0 0 Desulfovibrio desulfuricans: 6 2 31 5 8 5 13 3 24 58 36 5 6 4 21 10 4 31 5 7 46 15 3 3 21 10 12 13 87 28 15 7 72 12 15 16 25 45 15 23 73 27 14 7 35 21 16 60 17 54 19 26 10 24 6 28 23 3 38 13 33 12 5 0 1 Desulfovibrio fructosovorans: 8 1 67 26 8 1 5 1 77 117 13 1 4 2 72 22 0 22 2 2 131 37 3 3 84 65 5 6 216 43 5 4 227 11 7 2 128 77 11 40 163 77 7 7 66 49 12 66 105 123 30 73 13 87 5 92 10 4 141 7 86 23 7 1 0 Desulfovibrio gigas: 8 17 59 16 25 2 10 5 46 106 14 0 14 7 48 13 18 31 5 6 99 25 10 14 87 42 21 27 165 40 22 19 188 25 24 7 50 124 13 21 116 64 9 27 55 49 21 108 40 100 34 58 11 55 14 57 8 1 88 13 62 37 4 3 1 Desulfovibrio salexigens: 1 0 1 0 0 0 0 1 5 2 1 0 1 2 3 0 3 2 1 1 2 0 4 0 1 1 0 2 5 2 1 4 6 1 4 3 4 3 3 7 3 3 2 0 1 0 0 15 1 8 8 5 1 3 0 3 2 2 5 4 2 2 1 0 0 Desulfovibrio vulgaris: 58 26 428 97 123 29 55 16 321 515 136 16 75 31 207 205 51 153 31 56 511 178 34 33 394 241 60 150 872 314 126 85 721 148 239 62 363 515 112 85 750 362 70 47 341 276 89 546 352 648 144 399 80 315 64 473 65 56 555 76 429 193 12 34 12 Desulfovibrio vulgaris vulgaris: 1 1 3 0 1 0 2 0 4 0 2 0 2 0 0 1 2 4 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 5 0 1 0 4 0 1 0 2 1 1 3 9 3 1 2 1 0 0 7 3 1 3 2 0 1 0 2 1 0 4 2 3 1 0 0 1 Desulfurococcus: 1 0 7 0 0 1 13 0 36 2 5 0 0 1 0 0 0 11 0 0 21 0 4 1 2 14 2 2 46 5 12 8 19 0 12 2 38 2 13 0 52 12 0 0 18 7 0 1 62 37 2 7 0 1 0 7 0 10 23 12 15 0 0 0 1 Desulfurococcus mobilis: 5 0 6 1 5 14 44 20 49 34 16 19 22 17 24 27 17 21 13 14 22 32 19 14 24 23 23 34 41 19 37 8 36 28 23 17 32 54 39 11 68 34 5 2 33 14 7 15 63 35 20 30 9 8 6 48 6 59 43 10 56 20 1 3 1 Desulfurococcus sp.: 1 1 2 4 1 4 9 0 17 3 5 0 0 0 1 0 0 5 0 0 3 5 2 0 3 8 2 4 11 5 2 7 8 5 0 1 9 5 3 3 13 4 1 0 3 3 0 6 14 12 0 5 0 1 1 3 1 11 8 3 7 1 0 0 1 Desulfurococcus sp. SY: 8 3 36 0 19 14 108 0 148 42 32 9 10 9 19 24 2 47 4 5 78 24 3 11 34 56 3 20 105 50 19 45 42 11 54 5 104 19 64 14 153 61 0 4 59 30 0 40 231 112 17 71 7 4 0 73 13 75 75 33 70 19 0 0 8 Desulfurolobus ambivalens: 8 1 2 0 5 79 25 47 5 12 37 108 18 44 7 6 40 15 22 37 5 4 64 45 4 12 30 58 17 5 49 74 19 10 37 89 14 6 69 111 85 30 59 52 21 8 22 132 59 37 83 37 48 4 8 43 52 114 17 66 63 19 6 1 1 Dichelobacter nodosus: 95 131 460 169 310 107 56 114 273 450 277 649 585 235 164 177 285 348 208 284 467 205 313 232 171 370 223 611 586 506 658 289 651 165 676 284 260 388 614 1135 440 460 590 694 325 243 262 1031 421 499 937 297 454 145 139 375 647 98 684 813 522 339 44 21 30 Dichelobacter nodosus H1: 1 1 2 0 2 0 0 0 1 0 0 3 4 3 0 0 1 2 2 9 3 0 7 2 0 1 1 9 4 1 6 3 0 0 12 1 0 0 7 9 1 1 3 8 0 0 0 8 1 2 4 3 0 2 2 2 3 0 7 7 4 3 0 1 0 Dictyoglomus thermophilum: 3 1 0 1 3 27 10 9 10 2 26 31 6 11 3 3 16 6 21 31 11 4 30 20 5 1 25 27 5 1 29 37 4 7 32 32 6 8 27 48 30 18 54 22 10 8 13 41 20 9 52 19 47 1 7 11 39 27 8 36 19 43 2 1 0 Drosophila melanogaster: 2 13 42 18 22 3 8 14 30 94 19 10 23 12 22 26 6 36 15 16 41 32 9 19 18 54 12 15 64 37 13 16 62 15 33 15 32 52 17 25 23 49 27 24 65 22 24 53 40 36 49 28 23 21 8 40 36 4 36 36 39 49 1 1 0 Ectothiorhodospira halophila: 2 0 4 0 0 0 0 0 8 4 2 0 0 0 2 2 0 6 0 0 6 6 2 0 2 6 0 0 16 2 0 0 22 2 2 2 8 8 0 0 22 12 0 2 8 4 0 4 10 22 2 10 0 2 0 18 0 0 10 0 10 2 0 2 0 Ectothiorhodospira shaposhnikovii: 5 2 16 6 22 5 1 4 11 79 13 0 10 2 18 7 6 12 3 5 36 25 3 3 16 35 11 19 48 21 18 4 33 10 54 6 20 27 12 8 13 34 10 2 29 19 10 28 21 20 10 20 14 10 4 49 13 1 45 9 43 52 2 0 3 Ectothiorhodospira vacuolata: 1 0 3 0 8 0 1 0 1 29 1 0 2 1 9 0 9 8 2 1 16 1 3 0 3 3 0 2 31 1 11 0 14 1 35 2 5 14 4 2 9 14 9 2 13 3 2 6 3 17 16 11 8 0 0 15 4 0 5 2 11 1 1 0 0 Edwardsiella ictaluri: 1 0 21 1 7 0 0 2 2 38 0 1 2 1 3 1 4 5 1 0 20 3 2 0 1 17 0 3 18 9 5 0 25 2 20 7 13 18 12 9 10 12 2 1 5 4 4 18 14 12 15 8 9 3 1 9 2 1 11 8 6 4 1 0 0 Edwardsiella tarda: 6 11 89 37 28 8 7 18 20 152 10 32 20 19 21 29 15 147 25 17 64 80 14 5 15 30 7 25 103 115 23 31 142 69 45 25 58 81 26 44 56 72 59 36 149 30 30 35 92 53 107 25 37 5 2 16 29 14 56 42 22 23 3 2 1 Ehrlichia chaffeensis: 5 1 2 2 15 18 2 13 1 3 20 64 28 48 8 1 64 4 65 35 2 2 51 36 0 2 43 33 5 10 64 44 6 10 51 54 3 20 110 111 21 15 65 70 29 4 40 206 41 8 109 7 27 5 27 3 49 64 9 76 46 2 4 1 0 Ehrlichia risticii: 2 1 7 2 9 12 5 10 12 8 25 8 13 10 15 5 21 14 23 17 8 14 28 10 3 7 15 17 12 12 49 14 19 9 60 15 16 17 36 42 36 25 30 11 11 6 6 33 27 14 48 16 16 4 4 18 15 16 17 25 21 2 2 0 0 Ehrlichia sennetsu: 2 0 4 1 6 7 6 5 6 2 20 4 9 8 4 2 16 5 9 11 4 3 15 5 0 4 11 16 6 7 31 7 12 3 40 12 14 11 34 27 31 11 10 6 11 2 4 29 25 9 30 5 7 1 1 5 4 16 9 22 20 1 2 0 0 Eikenella corrodens: 9 5 37 33 22 21 10 3 25 41 18 8 60 13 8 8 32 52 22 13 64 37 40 11 9 31 11 27 79 52 73 14 77 9 51 36 31 52 35 54 16 57 52 57 45 34 44 58 21 21 63 39 25 21 12 69 71 15 50 45 42 15 6 2 1 Enterobacter aerogenes: 92 109 871 357 227 31 80 69 395 1234 185 74 269 81 237 381 89 519 84 91 630 449 84 110 309 694 119 297 1507 1058 251 135 1279 237 218 128 515 737 209 308 828 597 128 235 998 373 150 551 936 890 425 465 178 169 39 619 202 46 849 254 569 370 39 13 40 Enterobacter agglomerans: 44 30 366 147 236 30 37 23 180 799 116 103 171 119 137 155 84 211 120 67 336 197 55 61 85 383 85 213 522 536 146 107 490 200 247 60 237 409 141 344 168 251 207 166 473 163 178 549 277 313 383 161 185 158 87 208 260 34 332 282 375 191 11 5 28 Enterobacter cloacae: 47 51 327 121 194 64 17 51 157 717 149 117 145 103 132 129 131 205 86 112 356 246 99 93 125 330 111 222 501 517 216 96 455 168 301 106 199 357 218 351 238 300 192 110 403 145 164 427 350 326 379 198 193 102 52 286 235 62 354 312 346 240 23 6 18 Enterobacteriaceae: 48 70 197 127 106 61 55 54 113 374 179 125 129 133 121 104 89 131 85 139 174 179 109 69 86 168 79 247 325 231 165 148 282 122 164 93 182 186 195 324 255 184 206 164 257 90 118 342 297 229 287 137 126 52 32 175 169 128 228 210 215 136 17 9 18 Enterococcus casseliflavus: 2 4 4 3 6 3 0 12 7 12 8 16 23 19 7 2 9 5 10 10 12 16 13 14 2 5 9 27 19 18 19 15 23 15 20 10 21 7 11 43 9 15 17 35 11 3 9 54 10 20 25 15 15 3 3 12 23 1 37 21 23 16 1 0 1 Enterococcus faecalis: 158 296 173 134 508 433 114 453 135 332 666 1749 738 675 199 194 686 334 708 1188 429 536 607 752 135 209 499 1122 466 512 855 834 549 388 887 875 468 626 1127 2976 738 705 1623 1553 436 191 505 2774 645 654 1667 468 1218 103 201 500 1307 612 739 1841 994 371 94 35 29 Enterococcus faecium: 30 86 55 44 119 85 19 80 41 88 143 262 163 133 58 48 134 97 105 243 98 144 114 144 36 57 85 246 109 140 205 192 150 107 185 193 109 136 185 674 180 216 322 312 97 46 118 527 141 185 382 118 251 29 52 96 219 101 254 310 183 85 19 2 9 Enterococcus gallinarum: 2 7 4 1 4 3 4 7 8 14 13 15 21 8 7 2 8 4 7 8 7 8 13 9 5 6 9 14 10 11 14 14 13 8 13 7 14 8 10 19 8 12 16 23 9 6 6 22 17 10 31 9 18 3 5 9 21 8 22 15 16 6 1 0 1 Enterococcus hirae: 53 121 62 55 181 129 18 187 67 132 186 622 425 223 64 89 255 104 284 324 137 254 263 249 39 78 195 471 176 203 380 417 210 212 355 258 242 195 342 929 243 205 521 616 158 61 180 963 229 174 572 137 437 10 64 187 526 88 631 641 491 145 35 11 7 Enterococcus sp.: 2 2 1 0 5 0 2 5 2 5 2 11 8 2 0 2 5 2 7 5 6 5 7 3 0 0 3 2 1 2 1 2 0 4 1 7 4 1 7 28 3 9 9 12 6 4 6 10 1 2 8 5 8 1 0 4 9 5 1 13 4 2 2 0 0 Erwinia amylovora: 54 33 369 109 264 36 47 79 136 972 210 179 217 172 139 153 117 315 154 81 348 221 112 102 110 337 100 255 424 403 201 131 496 167 283 176 241 378 242 458 240 315 297 214 622 134 212 496 293 328 460 153 245 97 66 231 318 102 429 410 411 196 19 9 26 Erwinia ananas: 1 3 13 2 3 3 2 6 12 48 7 6 7 20 10 15 6 93 60 18 91 75 10 0 3 5 4 26 70 49 10 21 118 13 68 3 4 6 7 10 15 15 13 9 58 9 3 23 19 31 27 53 30 3 4 1 5 3 28 28 13 5 1 0 0 Erwinia carotovora: 71 105 378 133 425 62 47 124 216 912 169 231 302 243 239 207 228 477 228 165 519 517 191 204 137 358 207 414 515 639 332 201 712 286 546 230 412 550 355 867 387 727 559 287 625 216 203 693 408 481 811 285 427 114 84 366 378 88 635 561 502 382 36 16 19 Erwinia carotovora subsp. betavasculorum: 2 3 1 1 5 3 3 6 7 9 9 7 7 8 1 5 8 9 5 2 7 6 8 3 2 1 10 1 5 2 6 4 6 2 7 9 3 4 12 30 10 8 19 8 7 5 5 20 11 7 20 2 18 1 2 6 19 11 11 21 14 6 1 1 0 Erwinia carotovora subsp. carotovora: 5 9 45 21 54 10 5 22 43 185 19 23 50 16 23 37 15 70 31 32 82 74 14 13 26 65 21 40 83 80 24 15 68 36 58 18 39 61 34 83 33 75 76 47 107 39 43 85 56 70 104 46 36 19 3 53 27 13 105 88 74 39 5 0 0 Erwinia chrysanthemi: 110 108 855 324 644 62 41 74 247 2266 182 229 634 241 525 551 263 1018 330 181 1323 684 197 148 236 934 157 424 1301 1407 400 247 1722 443 746 352 665 1273 362 1090 479 1195 796 456 1319 341 380 1069 557 952 1192 611 645 176 93 753 655 107 1062 799 882 597 55 11 45 Erwinia cypripedii: 3 1 25 6 22 1 3 0 8 74 3 3 6 11 12 15 1 34 3 2 50 19 7 8 12 52 6 27 36 64 11 6 64 12 47 4 14 57 5 40 15 42 12 9 54 21 11 26 20 38 44 26 27 8 2 30 22 0 29 13 33 23 2 0 1 Erwinia herbicola: 51 64 384 182 232 48 50 85 261 997 219 166 141 151 114 168 111 358 196 128 460 304 103 111 183 305 158 299 681 605 260 189 614 205 330 158 227 390 244 360 182 253 248 145 675 233 231 415 421 348 496 273 268 128 92 248 410 100 371 416 453 231 26 5 20 Erwinia herbicola pv. gypsophilae: 1 1 12 11 1 5 13 0 12 26 5 1 0 4 12 6 2 13 2 2 12 6 1 3 13 18 4 9 26 18 5 6 21 11 6 2 5 6 1 8 2 14 2 1 14 5 6 4 12 25 6 5 4 1 1 7 7 4 3 4 6 7 0 0 1 Erwinia stewartii: 5 8 26 8 22 10 3 6 14 57 29 24 11 20 15 6 20 19 20 10 22 33 15 9 9 20 11 14 25 17 22 18 19 7 21 10 26 19 20 47 26 34 27 21 36 19 10 50 31 20 34 19 21 8 6 14 39 8 33 61 31 11 0 2 3 Erwinia uredovora: 7 8 64 27 48 12 4 10 38 144 38 43 39 40 16 28 21 98 62 27 98 99 22 5 35 42 28 70 131 121 42 41 154 33 87 11 39 38 50 51 36 25 42 37 131 43 57 84 43 62 98 65 57 16 20 22 69 9 53 70 73 36 4 1 2 Erysipelothrix rhusiopathiae: 4 4 5 0 43 3 0 5 6 1 30 51 12 42 7 7 12 7 18 60 8 10 8 21 2 3 21 63 11 14 32 39 15 12 68 43 10 12 65 104 19 30 35 61 4 6 19 104 14 28 90 7 26 0 10 14 37 4 27 70 35 6 1 1 2 Erythrobacter longus: 2 1 46 10 5 1 2 4 14 25 22 0 18 7 6 20 1 21 2 4 24 12 1 6 19 19 5 14 31 37 9 9 53 16 14 3 30 21 11 20 28 16 9 14 8 24 8 33 22 39 25 19 16 4 3 24 21 2 33 10 22 17 1 0 1 Erythrobacter sp.: 4 0 13 2 7 1 0 0 17 41 9 1 10 1 8 8 2 8 2 8 13 14 3 2 12 13 6 16 16 27 6 10 45 11 15 0 15 24 3 3 7 15 5 4 13 13 7 16 13 14 7 15 18 2 4 46 13 1 44 5 26 36 2 0 2 Escherichia coli: 13072 14840 89273 22863 87231 10308 6187 16037 44222 215124 46043 55668 54643 31373 36837 35956 37853 64855 36659 31251 95516 57972 38882 34969 21911 94446 29133 84710 104443 136084 66685 34211 120933 45434 104815 46362 61866 106900 78582 142438 46368 90373 74518 60825 120069 40584 52374 165473 76174 80896 132981 51250 67212 26465 21246 69271 90028 20161 103951 123311 113629 59768 8199 1045 3920 Escherichia fergusonii: 2 4 16 10 27 2 0 5 8 36 15 26 17 8 5 5 14 20 6 12 22 16 11 11 3 15 13 34 20 23 23 7 20 15 26 12 11 17 10 40 9 7 31 18 27 9 20 47 23 13 38 12 23 7 4 8 19 5 15 26 18 13 2 0 0 Escherichia intermedia: 1 0 14 0 10 1 1 0 2 22 4 4 0 0 1 2 5 6 4 1 7 2 10 2 1 9 1 10 15 11 5 3 18 5 11 5 5 13 9 20 7 8 10 4 13 9 5 23 13 12 13 11 12 4 2 13 8 0 11 18 20 1 1 0 0 Eubacterium acidaminophilum: 8 1 3 0 2 52 12 38 4 10 80 10 8 45 1 11 27 31 3 63 2 5 46 54 2 9 17 113 27 19 89 110 63 6 41 97 11 17 83 65 93 65 20 18 36 29 6 117 79 100 38 49 22 20 3 57 27 119 26 20 82 6 6 1 3 Eubacterium barkeri: 1 2 6 19 2 2 0 2 10 21 0 4 4 1 10 2 1 7 4 3 17 2 1 2 10 13 1 8 37 7 15 10 18 16 17 1 16 24 8 14 19 9 13 5 11 10 9 31 19 8 33 9 6 3 4 13 7 2 29 14 17 6 1 0 0 Eubacterium ruminantium: 1 0 0 0 2 17 0 0 8 0 31 3 0 25 3 3 12 12 8 43 1 0 7 5 1 5 16 40 4 5 23 27 5 1 34 19 5 2 38 11 40 8 28 0 25 1 8 43 27 15 63 13 30 5 4 14 13 9 17 21 11 16 1 0 0 Eubacterium sp. VPI 12708: 12 5 38 9 37 61 26 2 19 151 93 26 17 29 65 8 36 65 7 75 69 68 23 48 7 84 38 164 64 85 67 180 170 26 19 150 49 59 69 87 155 72 95 4 96 22 44 155 134 107 97 48 89 57 16 105 57 31 222 62 158 36 6 4 2 Ewingella americana: 1 0 3 0 2 0 0 0 0 17 3 2 4 1 7 4 3 11 2 1 15 2 5 8 0 6 2 6 14 13 1 0 7 0 12 4 2 4 7 11 7 17 3 2 16 0 0 3 2 14 6 10 4 1 0 8 5 0 8 7 9 5 1 0 0 Exiguobacterium acetylicum: 2 5 3 1 9 0 0 7 5 5 5 7 15 6 5 10 2 2 2 9 1 13 2 5 0 6 4 12 6 11 7 16 6 4 14 5 19 7 7 13 9 6 11 8 4 3 6 33 11 6 20 2 6 0 3 9 8 1 16 13 11 3 1 0 1 Fervidobacterium islandicum: 3 9 6 2 4 31 16 9 20 14 24 12 25 20 8 6 10 11 22 16 12 13 9 11 3 7 12 20 4 16 17 26 15 10 26 24 22 19 30 71 61 31 23 21 16 11 16 74 38 32 47 31 13 5 6 21 26 37 26 29 22 11 2 0 1 Fibrobacter intestinalis: 1 3 9 0 5 0 0 1 15 4 11 2 5 0 25 8 14 10 3 6 20 14 7 2 0 18 2 14 19 8 15 3 25 1 11 8 17 11 9 10 26 31 4 5 10 8 3 31 1 37 19 26 8 2 0 17 6 1 29 9 13 16 1 0 0 Fibrobacter succinogenes: 16 7 124 2 96 21 12 9 276 61 126 13 141 21 158 80 164 164 48 62 206 177 113 20 29 282 49 170 233 78 284 44 377 23 294 44 194 176 172 98 604 345 137 61 214 98 61 454 18 397 243 291 127 41 12 272 124 8 282 150 192 219 13 0 3 Fischerella PCC7605: 4 2 5 2 5 2 1 9 4 6 10 16 9 2 5 1 9 5 7 12 7 1 6 7 10 3 16 8 11 3 28 6 4 2 25 7 4 2 8 12 6 11 8 15 4 4 2 25 3 7 14 6 8 5 2 8 19 5 5 29 6 8 4 0 0 Fischerella sp.: 18 36 123 31 81 18 4 39 46 54 41 87 102 31 43 13 72 80 35 46 92 10 72 37 59 11 79 114 89 30 205 51 60 4 192 104 46 39 99 143 86 138 77 144 33 62 24 251 56 107 128 127 72 36 25 76 93 34 122 151 94 43 8 7 2 Fischerella sp. PCC 7605: 3 4 10 6 11 2 1 4 4 8 9 13 15 1 4 0 5 13 3 9 14 2 15 9 11 4 6 10 12 5 15 10 13 5 12 5 7 11 7 19 5 11 9 21 9 3 5 23 14 12 13 7 7 10 5 2 10 7 8 19 11 6 1 2 0 Flavobacterium ATCC21588: 5 2 103 26 11 2 7 1 11 140 15 0 5 0 17 39 1 28 2 4 36 33 2 3 41 40 2 15 96 94 3 5 87 40 16 1 61 38 6 4 24 16 4 6 47 23 30 17 50 75 46 17 28 15 0 51 3 1 72 5 49 27 0 2 3 Flavobacterium aquatile: 1 3 0 0 5 4 3 5 1 0 5 8 6 8 1 1 2 4 5 4 0 1 3 10 0 1 6 9 1 1 7 7 3 1 10 10 2 1 15 29 6 2 19 11 3 4 1 19 3 9 12 3 7 1 6 3 21 6 0 15 8 2 1 0 0 Flavobacterium ferrugineum: 1 0 6 0 12 0 1 0 8 18 2 1 1 2 2 0 3 3 0 9 10 2 10 3 2 4 11 5 6 2 15 3 7 0 30 11 0 3 23 25 3 11 2 3 6 9 1 23 14 20 3 5 3 1 0 10 2 0 22 4 12 1 1 0 0 Flavobacterium johnsoniae: 3 2 1 0 6 5 0 5 2 4 13 23 9 8 0 2 20 9 8 19 3 1 17 8 0 5 4 18 8 2 19 30 3 5 24 15 3 4 20 52 6 22 30 16 9 1 7 26 11 13 24 14 17 2 0 12 35 5 12 27 16 3 2 1 0 Flavobacterium meningosepticum: 10 3 15 5 39 55 8 22 3 76 73 73 46 42 36 19 76 41 67 147 53 41 82 40 9 54 67 130 52 31 103 146 34 19 114 130 10 42 69 251 90 78 208 55 82 19 41 166 32 67 172 49 162 10 30 66 121 37 54 143 91 63 6 4 0 Flavobacterium odoratum: 1 2 5 0 5 2 0 3 0 0 4 26 17 9 2 2 2 3 13 16 7 14 1 10 0 4 5 15 4 10 14 28 1 7 7 18 0 8 7 33 13 9 26 22 4 1 8 24 5 5 32 5 23 2 1 10 16 7 9 27 8 8 1 0 0 Flavobacterium okeanokoites: 4 22 0 4 22 44 4 24 2 12 52 96 57 32 6 12 50 18 41 50 10 8 44 18 4 8 40 30 8 6 54 64 28 22 47 46 22 26 37 168 58 42 138 56 12 12 58 168 34 30 76 28 108 2 12 18 101 64 28 116 33 24 2 0 2 Flavobacterium sp.: 17 27 242 106 48 14 19 9 223 235 27 20 44 18 93 123 13 131 24 30 249 103 19 25 140 160 17 55 341 343 55 61 392 98 76 33 235 189 31 40 131 198 42 24 170 122 34 118 232 345 95 168 45 56 7 181 24 13 252 42 137 120 2 6 9 Flavobacterium sp. (ATCC 39723): 2 3 22 16 4 3 3 0 10 31 5 0 7 1 13 10 2 9 0 3 13 16 1 2 14 24 6 6 19 35 6 8 26 9 5 1 20 16 6 2 10 12 6 4 21 5 15 14 28 22 6 8 8 9 3 18 2 6 31 3 12 6 0 0 2 Francisella tularensis: 11 3 4 1 24 53 6 44 2 6 50 92 18 34 4 3 65 16 47 65 4 9 114 51 0 4 44 86 3 27 175 30 34 6 179 76 11 13 100 176 64 42 107 87 18 3 37 136 83 26 169 16 51 7 35 22 57 65 49 87 77 13 8 2 1 Francisella tularensis (var. novicida): 3 1 0 3 4 26 5 21 4 7 19 43 16 34 1 3 23 8 30 35 4 6 42 26 0 3 21 34 5 7 52 21 20 5 57 27 11 10 45 82 23 23 78 43 20 5 23 34 24 9 73 20 41 5 5 13 56 52 15 49 24 12 3 0 0 Frankia alni: 14 14 121 105 18 0 6 0 135 165 10 0 10 4 64 58 2 60 3 4 164 74 6 5 68 136 6 14 249 185 12 8 217 49 48 3 177 101 5 2 169 97 0 1 105 99 4 22 264 237 14 91 4 56 3 126 3 1 189 3 86 46 0 2 12 Frankia sp.: 14 22 148 108 43 6 17 4 155 176 19 3 11 5 102 74 6 65 10 10 190 84 12 14 71 144 14 10 248 190 22 18 285 66 92 7 221 102 25 22 205 142 6 9 167 118 14 35 323 252 31 132 10 67 12 154 15 2 266 12 166 55 1 1 12 Fremyella diplosiphon: 42 68 192 102 189 91 27 143 87 138 93 310 246 99 124 34 207 173 143 182 199 29 207 129 107 40 161 335 125 101 488 135 141 54 318 213 82 117 269 320 134 221 214 451 158 50 103 532 151 151 373 213 203 50 56 140 244 52 249 366 191 95 19 18 5 Fusobacterium mortiferum: 1 0 0 0 0 17 0 1 0 0 5 25 2 8 0 1 6 1 5 14 0 0 4 14 0 1 7 17 0 1 14 27 0 0 4 16 0 0 16 30 3 4 18 15 0 1 7 25 8 5 20 4 14 2 4 2 13 19 0 15 19 7 1 0 0 Fusobacterium nucleatum: 4 0 0 0 0 63 0 7 0 0 11 94 1 32 0 1 34 1 12 38 0 1 46 39 0 1 23 57 1 1 70 84 3 4 38 48 0 0 69 119 18 36 57 37 0 8 18 99 0 11 69 20 65 0 3 28 38 25 4 22 26 27 3 1 0 Fusobacterium periodonticum: 1 0 0 0 0 25 0 1 0 0 0 26 0 7 0 0 10 2 1 7 0 0 20 10 0 0 5 10 0 0 19 25 0 0 5 15 0 0 15 24 4 12 12 7 0 2 4 25 0 5 18 9 13 0 0 8 9 1 2 1 5 8 1 0 0 Gardnerella vaginalis: 2 10 3 6 17 15 4 14 2 9 39 52 23 20 5 7 21 11 28 31 12 21 17 15 4 15 22 29 4 6 14 40 6 13 15 23 6 17 33 66 17 15 47 31 24 5 17 79 26 12 42 10 54 5 17 14 26 32 20 57 25 8 0 2 0 Gluconobacter oxydans: 4 3 34 28 31 1 4 1 19 76 28 3 3 6 33 26 11 26 7 8 26 51 4 4 20 37 10 24 43 67 24 27 74 32 41 8 55 36 31 21 49 39 19 1 47 12 18 47 49 40 54 12 16 8 12 52 14 2 62 25 48 20 1 1 2 Gluconobacter suboxydans: 6 10 73 19 33 4 4 5 53 86 14 2 1 6 50 17 10 40 5 16 49 70 7 4 36 101 19 49 110 32 34 19 141 7 64 5 73 36 24 17 106 87 13 9 64 37 20 50 33 100 58 44 32 19 4 69 14 2 93 7 75 60 3 1 2 Haemophilus actinomycetemcomitans: 36 28 104 30 175 118 17 118 67 109 225 540 294 130 100 67 225 104 146 150 151 104 184 93 24 124 126 276 181 188 188 156 207 97 310 179 88 242 250 718 164 164 480 338 136 81 160 527 137 141 495 130 405 37 55 158 479 135 189 540 232 158 27 8 1 Haemophilus aegyptius: 1 1 1 1 4 8 1 1 0 0 6 12 5 6 0 0 6 0 6 6 0 0 1 8 2 1 6 8 1 1 9 12 3 3 7 3 2 2 8 24 5 1 22 12 1 2 6 15 2 1 17 1 14 2 5 3 16 7 3 20 6 4 1 0 0 Haemophilus ducreyi: 35 35 82 10 233 82 20 62 26 29 116 618 124 170 22 55 184 107 161 233 94 98 226 163 22 40 154 369 90 143 269 112 204 73 419 261 60 129 254 770 123 139 564 400 80 90 191 560 102 99 555 56 357 20 95 94 324 140 136 492 209 75 29 4 2 Haemophilus haemolyticus: 2 4 2 1 4 12 1 1 3 1 10 23 8 5 1 2 10 6 2 14 6 2 4 7 1 7 9 11 0 4 9 14 7 10 12 10 4 5 16 42 5 4 27 23 4 6 5 24 13 7 26 1 21 5 4 5 27 5 2 31 14 6 1 1 0 Haemophilus influenzae: 1954 3234 6040 764 14169 2641 346 4206 3170 2678 12095 30267 10791 8025 2796 2496 10512 5589 7982 10466 7240 5490 10615 10279 1802 2932 7703 20233 6640 10036 13209 6996 12236 4526 18184 11770 3990 12480 12972 35893 4514 8181 24073 23711 4565 4357 8169 32796 6511 4826 26196 4467 15900 2060 4043 7648 20020 3962 8649 30206 14056 6804 1469 268 208 Haemophilus influenzae biogroup aegyptius: 8 18 26 11 42 31 2 22 16 17 53 128 46 50 10 14 55 53 54 62 32 22 71 47 16 14 54 73 52 28 54 37 86 27 71 52 20 54 51 192 18 44 181 107 15 11 33 114 27 34 128 26 94 14 13 32 129 38 20 123 50 22 8 0 0 Haemophilus paragallinarum: 5 8 2 0 18 51 11 22 5 2 35 114 15 28 6 4 49 8 42 35 1 4 33 54 4 8 40 40 4 5 41 39 10 16 34 24 1 12 37 136 16 11 122 51 8 8 41 85 34 9 93 9 75 1 12 13 68 67 24 129 40 20 2 0 3 Haemophilus parahaemolyticus: 3 12 6 3 19 15 4 19 1 3 16 41 26 16 2 8 19 12 8 13 8 5 18 16 0 4 18 17 10 8 14 16 13 5 19 22 3 13 19 58 23 16 66 30 14 5 22 61 16 13 46 13 50 3 11 12 54 10 18 41 26 8 3 0 0 Haemophilus parainfluenzae: 8 10 3 6 26 45 9 21 8 5 22 106 19 23 8 1 33 16 40 30 10 10 48 33 4 6 48 47 11 6 44 53 11 17 63 45 3 11 39 137 36 22 118 47 18 13 44 102 33 17 114 12 80 7 17 15 95 45 11 110 39 24 4 1 3 Haemophilus somnus: 22 32 52 7 90 48 5 36 24 19 61 226 91 86 24 21 71 53 68 127 67 56 80 47 15 56 64 168 65 72 101 83 57 36 121 96 35 42 127 373 64 96 196 234 60 31 56 284 86 66 188 43 121 15 28 45 154 57 91 214 125 51 13 3 4 Hafnia alvei: 2 5 28 2 22 1 2 6 14 46 6 24 21 9 3 18 8 26 9 5 32 21 8 18 9 27 9 18 20 27 15 7 33 16 24 7 11 33 15 40 17 34 20 14 26 14 21 45 35 21 45 13 37 4 6 30 19 3 34 31 36 16 2 0 0 Haloarcula: 1 1 2 4 1 1 0 0 15 24 0 1 4 0 1 8 1 5 2 0 8 10 0 0 1 4 0 3 10 13 0 2 14 4 9 1 13 5 0 0 3 4 0 0 6 1 0 5 5 10 0 10 0 0 0 13 0 1 14 0 8 8 0 0 1 Haloarcula argentinensis: 1 3 1 2 3 0 1 1 12 15 2 2 6 0 1 3 0 6 5 2 7 10 4 3 2 2 1 6 8 9 0 2 12 9 7 0 10 8 0 0 3 2 1 1 0 2 0 4 6 10 1 8 0 0 0 13 0 2 16 0 6 10 1 0 0 Haloarcula marismortui: 51 94 316 111 105 10 5 17 378 248 63 7 12 21 142 137 22 112 32 53 220 224 38 47 131 241 23 134 448 239 98 70 479 135 190 38 591 166 83 87 293 290 17 30 336 192 18 372 699 801 101 196 9 18 21 250 11 8 377 47 192 70 27 6 18 Haloarcula vallismortis: 6 5 30 21 8 0 1 4 83 78 21 5 14 10 19 34 2 25 8 15 44 50 9 10 10 32 2 31 74 75 14 15 83 42 26 6 111 43 21 10 20 32 2 2 32 20 2 32 69 112 14 54 8 2 3 66 7 9 66 16 43 32 3 1 2 Halobacteriaceae: 1 7 1 8 4 3 5 2 5 11 0 1 3 1 0 5 1 7 0 1 1 18 0 3 0 16 1 5 1 22 9 4 4 15 4 3 9 11 1 0 4 6 0 1 10 7 2 8 33 21 2 10 1 0 0 9 0 1 6 1 8 6 1 0 0 Halobacterium: 1 0 4 3 4 0 0 4 16 17 3 0 1 0 2 3 0 5 1 2 12 10 0 0 2 6 0 1 13 19 1 4 7 6 7 0 12 7 1 0 5 2 0 0 1 0 0 1 11 12 0 10 1 0 0 13 0 1 16 1 5 7 0 0 0 Halobacterium cutirubrum: 10 7 81 40 8 1 1 0 126 60 3 0 9 1 37 38 1 48 6 8 64 79 2 9 33 67 7 22 116 130 16 10 157 61 31 7 119 81 12 19 46 79 1 12 97 44 4 64 226 272 13 57 1 2 9 71 1 1 109 6 43 22 5 3 2 Halobacterium halobium: 77 181 526 307 177 26 27 54 762 535 132 44 141 74 329 391 45 270 100 141 552 599 95 109 231 454 62 246 738 833 166 153 762 379 220 84 861 583 158 201 357 518 63 138 568 366 52 541 1261 1440 334 445 58 48 44 550 42 19 874 95 445 211 28 9 40 Halobacterium salinarium: 45 97 388 255 83 15 17 16 464 392 42 10 85 44 188 256 17 247 39 81 486 445 36 81 190 255 13 163 780 647 89 71 499 263 85 33 661 375 99 99 174 301 13 68 404 216 31 319 863 1172 171 232 30 32 23 298 19 12 584 35 284 93 9 7 29 Halobacterium salinarum: 20 59 227 110 42 11 11 7 325 242 38 8 53 35 150 165 11 160 28 53 313 271 36 22 74 119 14 100 514 469 57 53 295 130 62 16 413 209 62 64 106 191 13 65 335 126 19 249 614 682 97 122 16 13 18 191 16 14 355 30 175 58 5 5 10 Halobacterium sp.: 9 9 41 37 13 4 8 6 115 116 12 2 19 2 21 44 4 54 8 4 49 85 3 11 19 71 4 19 92 151 11 17 117 60 27 5 89 78 18 10 23 43 0 5 33 42 7 25 139 130 9 89 4 6 1 92 4 6 98 2 64 68 3 0 6 Halococcus morrhuae: 5 9 33 21 7 0 1 0 42 22 1 0 1 1 7 23 1 12 1 1 25 42 2 1 16 14 0 7 49 39 8 4 48 11 9 2 64 22 3 14 27 34 3 1 33 15 3 18 85 58 17 13 4 1 4 18 1 0 55 1 20 6 0 1 4 Haloferax: 1 2 43 13 0 1 0 1 45 13 0 0 0 1 19 22 1 3 2 0 26 21 0 1 7 19 0 3 39 31 0 3 45 8 9 2 56 19 1 5 23 33 1 1 19 18 1 31 54 91 3 19 3 2 1 17 0 0 51 5 23 1 1 0 0 Haloferax alicantei: 9 59 99 48 23 5 6 1 139 63 16 10 10 9 44 92 14 36 13 12 81 104 16 14 27 81 6 30 114 153 36 35 141 42 44 15 153 56 22 24 52 86 6 22 55 69 6 100 169 235 32 95 10 19 14 90 17 7 85 23 51 59 5 1 3 Haloferax mediterranei: 22 68 75 79 40 20 14 20 158 91 40 27 45 38 64 128 28 67 56 54 112 167 40 37 65 91 22 83 129 140 43 74 97 71 99 37 175 93 63 75 82 129 39 63 106 67 10 225 215 326 104 107 20 9 17 108 24 23 127 57 82 36 6 2 14 Haloferax volcanii: 35 54 435 110 53 12 8 3 733 201 47 4 13 5 257 261 21 150 24 21 334 361 28 10 247 248 7 93 655 551 66 57 795 118 166 11 892 215 53 43 235 336 6 40 274 198 12 418 774 1103 31 270 10 35 17 322 11 11 521 49 229 87 14 3 18 Halorubrum sodomense: 1 0 6 3 0 1 0 3 19 15 0 1 3 0 3 3 0 5 0 0 10 13 0 0 2 5 1 2 8 19 0 4 14 6 3 0 17 4 1 0 4 1 0 0 1 1 0 3 7 14 0 11 0 1 0 11 0 1 17 1 7 7 0 0 1 Halorubrum vacuolatum: 6 20 13 20 20 11 3 12 20 21 16 9 10 11 16 19 11 17 20 20 25 23 17 10 5 13 4 39 24 36 32 24 22 14 15 17 28 26 38 30 25 24 13 37 34 14 9 107 91 60 69 18 19 1 1 33 17 8 42 26 18 5 2 0 4 Helicobacter felis: 6 1 53 6 13 7 6 34 45 11 30 57 72 5 7 7 35 54 39 20 46 13 34 8 42 8 30 42 49 60 68 35 79 68 28 25 30 113 28 123 55 34 71 51 21 23 27 95 67 51 75 23 36 13 9 26 89 8 62 100 76 13 3 2 1 Helicobacter heilmannii: 2 1 22 0 1 1 2 11 14 3 10 6 13 3 4 0 13 11 0 7 34 1 13 0 14 0 16 5 26 14 24 7 48 12 12 5 9 29 5 61 6 35 4 18 1 25 6 50 4 29 23 11 10 7 1 16 12 0 40 22 21 4 1 1 0 Helicobacter mustelae: 2 3 11 1 5 27 10 32 25 9 34 10 28 16 11 4 44 44 45 67 32 18 68 20 4 1 10 93 28 31 60 72 44 54 79 41 18 53 15 49 31 74 167 73 27 6 10 34 23 18 61 15 32 0 1 36 52 7 66 38 34 12 1 0 1 Helicobacter pylori: 1758 1426 4716 574 2744 5332 4856 4546 5513 2416 9253 24303 16795 3561 3138 2114 9096 15288 5655 4017 7958 5467 7754 2787 4838 1790 9023 4367 7833 11475 15506 3674 11719 12114 5733 3406 4405 15489 8820 39122 11589 14397 19364 17990 3139 3747 8220 28531 10265 7470 19910 6352 14401 3956 2119 6610 23776 5273 15288 20168 12743 3953 978 292 489 Heliobacillus mobilis: 2 3 10 19 14 0 0 1 24 41 7 7 9 5 17 1 14 10 1 1 23 7 14 2 14 11 10 9 25 14 51 9 30 3 23 14 18 14 24 28 20 18 4 16 11 16 13 42 24 24 19 11 11 7 1 57 12 1 42 14 33 19 2 0 0 Herbaspirillum seropedicae: 4 0 54 10 17 2 0 1 23 71 1 1 15 3 30 29 0 13 7 1 51 10 5 2 15 35 2 4 83 15 8 4 90 11 17 8 42 66 4 11 80 32 10 16 48 20 9 70 44 52 22 30 17 13 5 44 4 2 80 14 44 13 0 0 4 Herpetosiphon aurantiacus: 17 60 93 55 83 24 6 48 25 50 97 173 117 99 23 47 63 65 78 74 94 33 85 121 32 27 79 133 80 45 137 73 121 56 135 66 51 59 153 194 95 50 226 247 57 31 90 247 107 56 267 34 153 14 49 55 229 76 97 329 113 45 9 7 1 Holospora obtusa: 3 4 9 4 9 7 0 3 2 5 12 8 20 10 3 1 24 7 7 13 2 5 12 7 1 5 7 20 5 11 25 35 9 7 18 28 10 12 29 44 14 4 14 15 5 1 3 46 16 14 37 6 8 4 4 4 11 6 6 37 21 2 3 0 0 Hydrogenobacter thermophilus: 1 0 0 0 0 1 0 0 1 4 2 1 0 0 1 0 2 0 0 0 2 0 0 0 1 0 3 3 3 2 7 2 4 1 3 4 0 3 2 2 13 0 2 2 3 1 0 2 0 0 5 1 2 1 1 0 2 4 0 0 3 2 1 0 0 Hydrogenovibrio marinus: 5 2 8 0 65 7 1 36 1 7 35 4 45 27 0 3 30 6 4 23 4 15 50 53 0 3 21 43 4 25 74 11 8 4 139 36 2 2 63 49 33 55 7 35 7 40 9 78 34 62 49 38 23 6 19 65 17 1 61 14 54 28 3 0 2 Hyphomicrobium methylovorum: 10 6 101 25 43 5 2 1 114 91 36 2 37 10 32 90 19 43 1 13 44 103 14 7 32 97 24 69 96 121 86 20 193 10 66 12 86 61 89 42 170 107 25 20 85 54 26 115 84 129 100 67 34 31 6 115 28 3 133 43 97 53 4 3 3 Hyphomicrobium sp.: 1 1 45 3 6 1 0 0 23 18 6 0 0 1 2 14 2 8 0 3 13 25 3 2 8 23 5 6 27 25 4 3 49 3 13 2 26 12 6 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1577 164 38 87 Klebsiella pneumoniae ozaenae: 1 2 15 5 3 0 0 2 2 23 5 1 3 0 2 3 0 13 0 0 12 3 2 0 3 9 0 3 23 9 1 3 13 2 2 3 6 8 0 4 3 3 4 4 10 4 0 8 7 8 8 1 3 2 1 0 4 1 8 7 10 5 1 0 0 Klebsiella sp.: 4 0 30 1 30 1 1 4 15 49 7 8 11 13 21 10 18 15 2 5 55 15 18 17 5 25 6 31 32 38 21 5 50 14 40 13 29 35 31 69 26 27 13 16 25 19 12 55 21 38 56 29 17 9 2 29 26 4 47 27 35 15 4 0 0 Klebsiella terrigena: 4 2 44 24 18 2 1 2 20 77 8 4 7 7 15 13 7 38 6 2 36 17 3 6 10 45 7 7 82 68 12 4 64 20 12 9 41 38 19 17 22 33 12 11 62 25 14 22 41 40 32 17 13 10 7 30 23 3 48 25 33 12 1 1 2 Kluyvera cryocrescens: 2 2 33 12 22 1 1 0 15 71 10 7 6 8 10 11 7 20 5 1 38 19 13 8 6 40 3 10 42 53 13 9 46 11 21 6 20 26 17 41 20 40 17 11 48 8 7 41 33 27 57 20 22 1 2 17 24 4 29 23 24 30 2 0 0 Kryptophanaron alfredi symbiont: 1 1 4 2 1 3 1 3 1 1 9 9 5 10 4 1 5 3 4 2 4 4 8 5 0 0 7 8 3 2 8 6 1 1 15 3 2 2 13 19 4 9 16 12 1 4 9 10 11 5 19 4 10 1 7 3 13 6 7 11 9 6 0 1 0 Kurthia zopfii: 1 0 6 1 3 1 0 1 7 21 8 4 6 4 17 8 8 14 4 22 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Lactobacillus fermentum: 12 9 12 18 36 15 9 31 17 23 49 75 51 34 10 10 36 16 43 49 33 24 58 53 8 20 27 53 51 24 64 45 28 22 84 33 28 18 87 127 96 50 95 66 37 34 31 117 27 36 110 38 66 4 15 22 66 24 34 129 74 31 9 1 2 Lactobacillus gasseri: 3 0 5 1 14 7 1 0 1 0 13 31 12 25 3 0 13 2 3 9 5 0 51 10 0 0 15 36 9 4 49 18 18 3 30 20 4 1 34 26 34 18 28 48 0 13 5 39 3 26 26 34 13 3 1 10 20 0 10 28 19 19 2 1 0 Lactobacillus helveticus: 34 26 77 14 216 103 24 45 46 75 310 368 288 228 37 19 143 141 114 98 139 51 456 260 16 33 137 315 117 52 489 69 244 19 457 189 100 70 530 421 676 368 368 432 88 166 147 743 89 378 578 336 213 39 31 241 312 60 286 539 316 189 23 8 3 Lactobacillus helveticus subsp. jugurti: 1 5 2 0 1 8 0 6 1 1 4 14 3 7 2 0 6 2 6 4 5 2 8 4 3 0 4 4 3 1 9 10 2 1 2 5 1 0 4 24 12 12 24 8 7 2 4 12 7 6 24 10 8 2 0 3 10 1 9 11 12 5 1 0 0 Lactobacillus johnsonii: 1 1 1 1 2 1 3 1 1 2 4 9 0 2 1 1 5 0 3 3 1 0 6 2 0 0 3 0 2 1 8 2 0 1 3 3 1 4 4 18 13 1 8 4 2 1 4 13 0 1 3 3 8 0 1 1 2 1 0 7 1 3 1 0 0 Lactobacillus lactis: 2 7 11 16 5 6 1 6 19 36 12 23 24 11 13 1 16 26 10 10 37 16 23 16 7 15 10 21 39 7 27 5 37 25 3 6 34 13 23 52 51 30 26 24 32 17 6 79 19 54 17 39 20 5 1 23 29 7 25 19 22 19 1 0 1 Lactobacillus leichmannii: 8 6 37 47 10 25 8 7 30 103 33 44 72 33 47 7 35 57 35 26 78 28 48 51 13 28 25 41 111 28 76 24 105 66 55 20 71 42 73 69 146 84 65 61 77 36 25 170 29 128 77 80 42 16 5 38 73 18 102 75 72 21 4 2 2 Lactobacillus paracasei: 2 3 8 6 8 1 3 16 14 28 25 29 43 30 16 19 24 33 40 63 65 68 71 35 5 20 12 63 69 51 70 15 63 28 61 11 33 32 72 95 86 55 70 69 47 5 18 49 13 70 108 30 53 0 1 27 35 1 33 50 25 8 1 1 0 Lactobacillus pentosus: 6 23 16 35 29 9 2 27 4 29 13 94 87 54 8 22 32 25 39 48 21 63 44 48 9 18 19 62 32 66 66 43 53 31 85 33 44 43 88 81 84 41 90 104 40 14 57 123 43 43 133 32 96 7 14 49 86 7 48 127 59 55 5 1 0 Lactobacillus plantarum: 61 93 82 124 135 94 34 169 88 146 158 590 422 205 54 100 145 146 299 241 170 304 305 203 70 129 109 309 274 301 393 184 250 187 359 171 232 237 479 541 391 232 549 442 236 115 225 629 191 269 637 175 420 38 66 178 446 166 287 718 398 157 35 12 14 Lactobacillus reuteri: 6 9 3 5 10 6 6 21 5 10 22 45 20 16 8 8 27 9 22 26 12 11 29 10 2 6 10 16 6 7 21 16 10 10 21 22 8 8 28 84 44 28 47 30 10 5 19 31 18 9 49 17 39 3 5 12 42 18 7 49 18 16 4 0 2 Lactobacillus sake: 45 72 67 88 79 116 35 181 80 63 173 643 213 261 56 65 169 80 234 303 120 148 218 172 42 46 99 275 137 136 276 169 147 116 300 182 126 128 346 625 226 228 558 474 131 65 172 601 118 134 483 145 370 25 65 151 451 259 232 668 311 95 24 15 6 Lactobacillus sp.: 7 2 9 2 33 10 2 7 6 12 23 81 42 35 4 2 31 13 23 39 1 20 48 37 2 3 22 57 11 19 80 35 31 10 78 46 8 19 64 79 82 58 54 64 11 18 26 118 22 35 73 61 72 4 15 50 38 19 40 58 39 23 4 2 1 Lactobacillus zeae: 2 0 9 3 9 0 0 1 1 9 7 8 25 3 6 0 8 4 4 11 20 5 8 9 0 3 5 17 18 9 32 2 27 4 26 5 6 6 47 19 34 12 15 15 7 4 1 45 6 25 22 7 5 0 0 3 2 0 15 27 15 1 2 0 0 Lactococcus lactis: 368 672 412 270 1640 1252 300 991 844 586 3008 3656 2500 2441 384 465 2058 789 1771 2484 876 797 2449 1771 294 300 1377 2806 1139 722 3457 2687 893 897 2820 1857 1142 1028 3633 7868 2018 1683 4853 3723 866 636 1615 7076 1608 1943 5003 1367 3668 149 558 1495 4219 1436 1976 5597 2793 1162 239 39 89 Lactococcus lactis cremoris: 46 108 67 33 145 134 41 171 124 97 270 473 257 301 61 85 290 121 275 375 206 199 385 212 47 63 164 291 191 161 380 290 190 120 344 186 163 124 420 945 358 252 658 447 160 55 203 643 173 254 657 163 546 17 68 191 560 264 218 766 292 128 36 6 4 Lactococcus lactis lactis: 15 25 9 10 35 81 19 63 37 22 99 229 79 100 28 23 98 28 99 110 27 24 86 47 16 18 56 58 18 26 72 106 35 39 75 72 29 35 111 403 105 76 307 169 39 26 63 278 74 69 177 42 199 10 49 50 254 178 76 261 110 43 9 2 4 Legionella adelaidensis: 1 1 1 0 2 1 0 0 1 2 3 10 5 1 1 0 3 3 2 3 9 1 10 2 0 3 4 2 3 2 11 5 6 2 9 3 3 4 1 17 7 3 13 8 2 0 1 13 1 0 12 2 3 0 0 1 6 3 2 8 11 2 0 0 1 Legionella anisa: 1 0 1 0 1 0 0 0 0 3 1 9 6 4 0 1 8 2 3 6 0 2 11 4 1 1 4 5 3 3 10 4 3 1 14 7 2 1 6 22 3 2 7 10 0 0 1 9 2 4 9 1 4 0 0 4 3 1 1 10 10 2 1 0 0 Legionella birminghamensis: 1 1 0 0 0 2 0 0 3 5 0 6 4 2 4 0 5 7 3 3 6 0 8 4 2 1 3 5 0 4 12 1 10 2 10 5 3 1 3 20 5 4 4 2 8 0 1 11 2 4 8 4 1 0 0 4 3 1 1 12 11 2 1 0 0 Legionella bozemanii: 1 0 1 0 1 0 0 0 0 2 1 8 8 4 0 2 8 3 2 5 0 1 13 4 1 1 4 5 5 2 8 3 5 2 12 9 2 1 5 23 2 3 6 10 0 0 1 10 2 3 9 1 4 0 0 4 3 1 1 11 9 2 1 0 0 Legionella brunensis: 1 0 1 0 1 1 0 1 0 4 0 7 8 6 0 0 5 2 6 9 2 1 7 4 0 0 9 9 5 1 14 0 3 2 17 4 2 1 8 19 7 1 7 10 2 0 1 9 1 5 11 2 3 0 0 2 5 2 3 8 9 2 1 0 0 Legionella cherrii: 1 0 1 0 1 0 0 0 0 2 1 9 7 5 1 1 5 3 2 5 1 1 11 5 0 1 4 6 5 3 11 4 2 1 15 7 1 0 6 21 4 3 5 9 1 0 1 9 2 3 10 0 4 0 0 6 2 1 2 11 10 2 1 0 0 Legionella cincinnatiensis: 1 0 0 0 2 0 0 0 0 3 1 9 6 2 0 2 7 1 5 6 0 1 12 6 0 0 5 9 3 1 12 4 0 3 15 7 1 1 4 18 7 2 5 8 1 0 1 10 2 4 9 0 5 0 0 2 5 2 2 10 10 2 1 0 0 Legionella dumoffii: 1 0 0 0 2 0 0 0 0 4 1 7 7 5 1 1 7 2 4 3 1 1 11 3 1 1 5 9 4 1 11 3 3 2 14 6 2 4 3 22 3 4 5 8 2 0 1 10 2 1 10 2 3 0 0 6 1 0 2 11 10 2 1 0 0 Legionella erythra: 1 1 1 0 1 0 0 0 0 9 0 5 6 0 2 1 7 3 5 5 9 4 8 5 3 1 4 6 5 3 11 1 10 2 8 3 4 4 5 21 6 4 2 6 4 0 1 12 2 4 7 3 2 0 0 4 4 1 4 8 7 2 1 0 0 Legionella fairfieldensis: 1 1 0 0 2 1 0 1 1 2 1 8 7 2 0 2 6 4 5 7 3 1 7 3 2 1 5 10 3 2 10 5 9 1 5 4 3 3 5 20 6 2 7 4 5 0 1 10 3 3 11 1 4 0 0 2 5 3 2 7 11 2 1 0 0 Legionella feeleii: 1 1 1 0 0 1 0 1 0 4 1 8 4 3 0 0 4 4 6 5 0 3 9 4 0 1 5 6 4 5 13 2 8 1 11 2 5 0 7 17 9 0 7 8 4 0 1 12 0 6 6 1 4 0 0 4 3 2 5 6 11 2 1 0 0 Legionella gormanii: 1 0 1 0 1 0 0 1 0 3 1 5 9 4 0 1 8 2 4 7 1 2 9 5 1 2 2 7 3 1 10 3 3 2 14 7 1 2 5 22 3 3 5 9 1 0 1 9 3 1 11 1 4 0 0 3 4 1 1 11 10 2 1 0 0 Legionella gratiana: 1 0 1 0 1 0 0 0 0 2 1 7 9 3 0 1 6 2 4 6 0 0 11 7 2 0 2 10 4 1 11 3 1 3 15 7 2 1 5 16 9 2 6 7 2 0 1 12 1 2 11 0 5 0 0 4 3 1 0 11 10 2 1 0 0 Legionella hackeliae: 1 1 1 0 1 1 0 1 0 3 0 10 7 5 0 0 5 2 6 5 1 2 11 4 0 0 8 7 3 1 19 0 9 0 13 4 2 1 7 18 7 1 8 10 2 0 1 7 0 4 15 2 3 0 0 4 3 1 4 8 9 2 1 0 0 Legionella israelensis: 1 1 0 0 2 2 0 0 1 4 2 7 5 2 3 1 5 2 4 6 2 3 6 2 2 0 6 6 4 3 10 6 4 2 9 2 3 1 8 23 5 1 8 8 4 0 1 10 5 4 10 1 4 0 0 2 5 3 3 8 9 2 1 0 0 Legionella jordanis: 1 0 2 0 0 2 0 0 1 5 0 11 3 4 4 0 4 6 3 8 3 3 4 3 1 0 7 11 3 1 13 1 8 3 9 3 3 3 7 19 7 3 10 8 3 0 1 10 1 4 11 4 1 0 0 5 2 0 5 6 10 2 1 0 0 Legionella lansingensis: 1 1 0 0 1 2 0 1 1 5 1 7 6 4 0 0 4 4 4 8 2 5 7 6 1 0 6 11 3 1 13 1 8 1 12 4 3 1 6 20 6 5 8 8 2 0 1 9 4 4 7 0 5 0 0 3 4 2 1 9 9 2 1 0 0 Legionella longbeachae: 3 2 2 0 11 1 1 4 2 4 7 30 21 14 2 5 31 11 19 19 5 2 33 21 4 0 13 36 13 6 44 15 16 6 50 29 8 2 29 66 17 10 31 32 10 3 16 33 10 18 48 9 36 2 3 10 24 7 7 31 43 11 3 0 0 Legionella maceachernii: 1 0 3 0 0 1 0 0 1 3 2 7 7 5 0 0 5 5 3 7 2 1 10 5 0 1 5 10 2 1 14 5 5 1 11 0 4 5 4 17 9 0 8 8 1 0 1 9 5 5 9 3 2 0 0 3 4 2 2 9 10 2 1 0 0 Legionella micdadei: 2 2 6 2 8 4 0 8 3 8 11 17 14 16 7 2 15 15 9 21 22 5 24 6 1 1 8 37 14 11 34 12 15 3 40 6 8 9 11 17 15 20 26 36 9 0 1 21 5 13 23 4 3 0 0 9 8 6 14 28 22 2 1 0 0 Legionella moravica: 1 1 0 0 2 0 0 0 0 3 1 6 10 3 3 2 3 1 6 8 4 0 8 6 1 0 4 9 3 2 7 6 6 1 9 6 2 0 7 21 4 2 6 8 2 0 1 11 1 5 7 1 4 0 0 3 4 1 3 8 9 2 1 0 0 Legionella nautarum: 1 1 1 0 1 1 0 1 1 2 1 10 6 7 0 0 7 4 5 2 1 4 11 4 0 0 7 8 4 3 8 4 4 3 10 1 2 1 8 18 9 1 7 5 4 0 1 13 1 3 10 4 1 0 0 5 2 1 4 7 10 2 1 0 0 Legionella oakridgensis: 1 0 1 2 2 0 0 0 1 9 2 4 5 5 2 0 3 0 7 2 2 7 5 3 3 2 1 8 1 1 7 5 8 3 5 3 3 5 5 22 4 1 8 13 0 0 1 14 2 6 7 1 5 0 0 0 6 0 2 10 8 2 1 0 0 Legionella parisiensis: 1 0 1 0 1 0 0 0 0 2 1 9 7 4 0 2 8 3 2 5 1 1 13 6 0 1 3 3 3 2 12 3 2 2 15 8 2 2 4 19 6 2 7 10 0 0 1 8 3 3 10 1 4 0 0 3 4 2 3 7 10 2 1 0 0 Legionella pneumophila: 57 110 148 40 275 179 57 128 123 220 245 602 490 249 171 78 308 201 240 273 260 124 388 239 125 96 319 483 319 213 566 308 320 213 573 325 212 263 506 922 269 275 633 641 234 88 314 872 346 220 775 156 434 64 113 170 560 269 281 746 563 166 35 10 12 Legionella quateirensis: 1 1 0 0 2 0 0 0 0 2 1 8 9 5 2 1 4 1 5 6 4 0 10 5 1 0 5 8 2 3 8 7 3 1 11 8 2 0 5 22 3 3 5 7 3 0 1 11 1 2 10 1 4 0 0 3 4 1 1 10 9 2 1 0 0 Legionella quinlivanii: 1 2 0 0 0 0 0 1 0 5 1 6 5 1 7 0 4 5 4 2 8 1 5 3 1 2 4 5 4 2 12 3 5 1 11 3 2 5 4 21 6 2 7 5 5 0 1 10 3 2 10 4 1 0 0 3 4 0 1 11 11 2 1 0 0 Legionella rubrilucens: 1 1 1 0 1 0 0 0 0 8 0 6 6 0 3 1 6 5 4 5 9 5 5 5 2 1 5 8 7 2 8 1 13 1 6 1 5 5 5 18 9 3 5 5 5 0 1 10 2 6 8 3 2 0 0 3 5 1 3 9 7 2 1 0 0 Legionella sainthelensi: 1 0 0 0 2 0 0 0 0 1 1 9 8 3 0 1 7 1 5 7 0 1 10 5 1 1 4 8 2 5 10 4 4 1 13 8 1 1 4 21 4 3 4 7 2 0 1 10 1 5 9 0 5 0 0 2 5 2 1 11 10 2 1 0 0 Legionella santicrucis: 1 0 0 0 2 0 0 1 0 2 1 9 6 5 0 1 7 1 5 4 0 2 12 5 0 0 5 10 4 1 10 3 2 1 16 5 2 2 4 20 5 1 6 8 1 0 1 10 1 3 11 0 5 0 0 3 4 2 1 11 10 2 1 0 0 Legionella shakespearei: 1 0 2 0 1 0 0 0 0 3 0 9 8 7 0 0 4 3 2 5 2 1 13 6 1 0 4 7 2 3 9 7 7 0 9 3 3 3 6 22 3 1 6 7 3 0 1 11 0 3 11 3 2 0 0 4 3 0 2 11 9 2 1 0 0 Legionella spiritensis: 1 2 1 0 0 2 0 0 2 4 1 4 7 3 1 0 4 5 4 3 6 8 4 3 1 4 1 6 7 3 5 4 10 3 5 3 4 3 5 22 3 4 4 2 8 0 2 9 2 5 10 1 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36 21 32 40 110 50 30 48 42 28 10 25 120 53 43 59 13 47 4 12 24 56 19 57 68 54 16 4 3 1 Leptospira interrogans: 30 48 13 38 89 164 42 79 92 59 217 223 128 91 151 73 302 55 104 120 100 114 188 75 31 80 154 193 75 121 171 318 69 60 217 193 78 103 261 624 152 176 304 195 57 34 102 537 117 116 337 94 227 13 65 108 329 102 242 348 185 100 14 5 11 Leptospira interrogans serovar lai: 3 8 2 3 5 22 1 9 8 12 19 20 15 9 7 7 22 8 8 12 9 2 24 16 2 6 16 16 3 7 22 34 5 2 25 23 5 6 21 74 9 17 42 31 4 4 10 45 8 22 43 18 38 0 7 11 32 11 20 36 15 20 2 1 0 Leptospira kirschneri: 2 1 0 0 7 14 0 5 9 4 13 15 11 3 5 2 17 5 14 9 10 3 19 8 1 3 13 29 8 13 26 33 4 2 28 19 5 4 19 50 6 15 13 10 3 3 1 37 5 17 15 9 18 2 3 10 15 2 17 23 13 7 2 0 0 Leptospira meyeri: 2 6 1 3 9 7 1 7 11 4 23 18 12 7 15 6 19 4 11 14 13 4 14 19 4 9 10 21 12 8 20 36 9 5 30 16 9 16 13 39 9 15 24 23 6 7 16 42 8 12 26 11 17 2 2 10 35 2 19 26 15 9 0 0 2 Leptospira noguchii: 1 2 1 0 2 3 0 0 2 1 1 4 9 2 8 3 1 1 3 2 0 0 0 1 0 0 0 2 1 3 1 1 0 0 2 1 1 0 4 9 5 3 1 6 1 1 0 9 1 3 5 1 5 0 2 3 7 0 1 3 3 2 0 1 0 Leptospira santarosai: 1 2 1 0 1 3 0 1 3 0 2 3 5 3 1 4 3 0 3 1 0 0 0 0 0 0 1 3 1 1 0 4 0 0 3 1 0 0 2 9 1 2 2 3 0 0 1 6 3 0 6 1 4 1 1 1 8 1 3 3 2 2 0 1 0 Leptospira weilii: 3 2 2 1 3 10 5 6 4 3 3 16 10 7 12 4 13 9 5 1 1 0 1 2 0 0 2 13 3 4 6 4 2 0 7 1 0 1 7 22 10 6 7 10 9 1 2 26 6 5 11 7 9 0 7 9 18 5 6 12 7 6 1 1 1 Leptothrix discophora: 1 1 44 4 15 0 1 0 14 84 0 0 6 0 8 41 3 51 1 1 109 53 1 0 18 94 5 13 126 49 12 0 132 6 33 0 74 69 3 1 53 79 7 2 55 29 1 16 38 65 20 42 3 5 1 48 6 0 65 1 26 28 0 0 1 Leuconostoc carnosum: 2 2 0 0 1 4 0 1 2 0 1 5 7 3 1 0 4 1 2 3 1 1 0 0 0 0 0 2 1 2 7 7 1 1 7 7 2 0 2 11 3 8 9 3 4 0 2 6 1 3 10 2 7 1 2 1 6 3 2 7 3 2 2 0 0 Leuconostoc gelidum: 4 4 5 1 17 9 1 20 13 17 9 57 26 25 9 5 17 13 34 25 29 18 20 15 7 6 8 15 28 16 37 17 17 10 34 16 17 16 31 77 19 21 62 71 14 3 15 44 13 17 61 12 42 1 3 7 46 9 29 86 26 6 3 1 0 Leuconostoc lactis: 10 21 27 17 55 11 8 36 29 26 30 63 98 73 9 14 36 29 39 62 44 44 48 60 12 17 26 82 43 33 89 51 43 38 96 39 54 38 117 91 76 67 82 93 17 45 40 131 28 77 101 55 66 4 4 61 103 22 73 149 80 43 7 2 1 Leuconostoc mesenteroides: 15 32 32 14 104 13 5 68 34 31 66 158 165 137 30 22 65 36 86 130 53 79 111 100 23 21 44 130 104 67 179 76 87 49 198 67 65 74 180 259 157 135 238 218 58 44 75 228 52 112 290 102 181 6 14 90 176 38 90 309 152 61 11 2 2 Leuconostoc mesenteroides cremoris: 6 10 8 4 21 6 3 25 7 7 15 50 50 34 7 13 19 4 15 41 18 22 24 29 6 10 17 55 16 30 58 31 17 21 59 36 15 19 68 65 45 20 61 69 18 13 24 84 24 26 75 20 35 4 7 13 58 23 25 69 47 12 4 0 2 Liberobacter africanum: 2 2 0 2 4 2 1 1 1 2 12 4 7 4 1 4 13 4 8 0 0 2 6 0 0 0 6 5 1 8 19 4 1 3 8 5 1 6 20 17 14 0 10 7 3 1 0 19 5 2 11 0 2 0 0 1 9 3 4 19 2 1 1 1 0 Listeria grayi: 2 0 2 0 4 4 0 10 2 2 14 10 7 4 11 10 41 21 10 47 9 14 25 28 0 8 17 53 8 7 82 16 22 4 28 35 18 10 40 97 9 26 35 41 2 9 3 28 1 16 18 8 21 2 0 14 6 5 36 1 6 16 2 0 0 Listeria innocua: 3 5 5 1 2 3 0 6 1 1 12 16 7 8 7 5 18 13 5 45 3 9 45 19 0 3 11 38 1 14 38 19 9 10 29 21 2 3 31 81 9 27 35 31 1 5 5 28 9 16 18 15 17 3 2 9 13 1 10 27 16 20 3 0 0 Listeria ivanovii: 6 13 11 0 22 37 24 41 26 7 61 102 46 76 24 42 76 56 84 102 27 29 106 115 4 38 60 85 25 53 106 77 22 29 64 76 11 17 63 215 58 51 145 101 36 12 23 246 80 35 106 20 43 9 11 42 47 42 28 84 72 22 6 0 0 Listeria monocytogenes: 76 123 131 76 327 246 34 360 116 96 501 985 384 353 191 174 375 292 451 857 198 334 638 545 62 148 326 790 190 364 745 533 331 201 622 643 208 319 678 1948 331 601 1293 924 156 125 278 1556 327 404 1159 305 714 45 101 345 646 328 509 1149 585 310 57 8 11 Listeria seeligeri: 8 11 15 2 28 32 8 40 14 6 47 115 46 53 20 25 75 38 63 109 24 34 101 76 4 36 44 101 22 37 89 66 50 34 72 89 22 48 121 242 57 74 172 106 17 20 33 197 61 49 154 38 114 5 16 31 108 65 49 132 51 48 7 1 0 Listeria welshimeri: 2 0 2 0 4 2 0 10 0 0 12 18 0 16 9 0 39 23 20 67 1 2 75 24 0 2 20 46 3 14 67 22 20 4 38 36 2 14 40 91 2 31 49 40 0 4 4 37 4 8 22 6 20 0 2 6 10 2 13 23 8 14 2 0 0 Lysobacter: 1 0 35 7 2 0 0 0 18 35 1 0 6 0 10 11 0 12 0 0 20 10 1 0 10 30 0 1 28 38 0 3 52 2 1 0 18 37 0 1 17 11 2 2 16 16 3 12 23 32 10 18 3 6 1 17 0 0 24 3 11 15 0 0 1 Lysobacter enzymogenes: 3 0 65 5 4 0 0 2 30 60 1 0 4 0 15 40 0 78 1 0 76 17 1 0 8 30 3 1 94 76 5 0 143 3 9 2 52 56 3 6 38 53 5 2 64 12 3 16 16 47 14 39 2 22 1 41 0 0 35 0 15 18 0 0 3 Lysobacter lactamgenus: 6 3 312 99 16 1 6 3 120 412 3 0 30 2 56 121 0 148 6 1 183 51 1 1 83 210 2 10 337 302 9 21 335 31 7 2 202 160 4 21 112 141 16 28 175 108 33 139 184 303 66 151 30 56 4 232 11 4 214 8 96 62 0 2 4 Magnetospirillum magnetotacticum: 2 0 19 5 5 3 4 1 8 32 5 0 4 2 12 8 3 7 0 0 17 3 1 3 7 9 3 3 39 17 6 2 42 3 2 3 20 28 4 2 34 13 6 1 15 6 1 12 20 22 14 7 7 4 0 15 1 0 32 2 18 2 1 0 1 Magnetospirillum sp.: 3 1 38 17 8 0 3 1 11 110 6 0 3 1 18 22 2 9 0 0 30 16 1 0 24 15 1 0 91 22 4 5 62 10 3 1 18 59 3 2 32 9 6 3 15 12 10 18 34 39 8 3 9 7 2 32 3 0 49 2 30 12 1 0 2 Malonomonas rubra: 14 22 16 21 34 24 19 32 42 65 108 51 83 43 29 31 59 34 39 53 45 29 51 45 24 22 48 114 59 47 86 79 74 80 80 39 61 46 136 113 89 32 76 53 48 18 31 146 81 49 95 38 51 24 22 44 126 33 92 144 116 31 7 4 3 Marinococcus halophilus: 8 21 8 25 27 17 8 4 20 29 44 38 25 8 21 15 18 21 12 21 23 25 22 15 6 20 18 25 23 23 20 37 34 16 31 30 18 25 28 111 60 34 70 33 44 15 21 131 45 42 75 18 56 5 14 41 69 13 34 54 59 23 6 1 1 Megasphaera elsdenii: 1 0 4 0 4 1 0 0 14 2 1 4 9 0 8 2 0 4 0 4 11 6 7 0 1 7 1 6 1 0 35 0 33 0 8 3 4 0 16 21 10 10 0 1 16 3 2 27 0 16 9 11 3 3 0 16 2 0 13 11 12 1 1 0 0 Melittangium lichenicola: 1 2 33 6 2 0 1 0 12 33 0 0 1 0 10 8 0 5 0 0 11 20 0 1 14 10 1 0 28 37 3 1 30 3 0 0 11 25 0 1 39 11 0 0 11 14 0 9 24 20 1 4 0 1 0 14 0 0 9 0 6 9 0 1 0 Mesoplasma florum: 1 1 0 0 7 12 0 1 0 0 2 13 0 6 0 0 3 1 1 8 0 0 5 3 0 0 3 8 0 0 11 12 0 2 6 6 0 2 15 23 0 9 7 10 0 0 1 14 0 2 10 2 4 0 0 1 1 0 10 11 3 0 1 0 5 Mesorhizobium loti: 1 3 13 8 6 0 1 0 12 17 5 1 9 1 4 6 2 6 0 3 7 6 2 5 1 8 4 4 4 17 3 4 20 5 1 2 9 9 3 2 9 5 3 3 8 4 3 10 19 10 5 1 4 6 1 8 1 0 11 5 9 1 0 0 1 Methanobacteriaceae: 4 3 1 7 4 9 47 9 37 22 11 16 19 35 16 4 13 3 17 23 16 0 11 20 15 2 15 13 16 6 9 12 14 32 25 6 15 17 15 47 36 18 31 12 10 17 15 31 58 26 49 23 19 2 2 19 8 23 40 15 22 10 0 0 3 Methanobacterium bryantii: 2 1 1 0 1 9 6 4 4 9 18 13 8 12 4 1 9 3 4 17 5 2 19 11 3 4 11 23 4 1 24 30 7 7 11 22 5 14 21 46 12 19 24 11 16 7 1 32 11 13 34 9 17 3 3 7 12 24 8 12 18 4 1 1 0 Methanobacterium formicicum: 6 16 2 4 2 28 5 15 15 38 9 25 5 10 16 3 8 7 9 10 49 1 18 30 19 2 26 69 60 4 49 72 12 6 40 33 26 32 35 89 17 46 12 8 15 25 0 118 12 62 27 35 6 17 25 38 17 44 35 27 60 21 4 1 1 Methanobacterium ivanovii: 5 3 2 1 5 15 14 3 4 10 25 17 5 5 5 3 14 5 10 18 8 3 20 12 3 2 18 35 7 5 20 47 5 10 37 31 7 16 39 59 16 13 27 9 10 2 10 74 11 21 42 6 20 7 12 11 24 26 21 45 40 1 3 0 2 Methanobacterium thermoautotrophicum: 2016 631 2106 2628 2648 7025 23239 2636 19863 13190 14072 2372 1356 11794 7558 1556 3064 6347 4287 12011 10931 2644 2666 6619 9124 3622 5288 16638 15412 3790 6214 11901 9456 9919 14305 5842 11727 12975 13493 10024 16203 12705 6064 745 10140 6249 4516 18548 28074 16517 17354 12833 5449 4435 2712 14804 5892 24379 12590 6726 16852 4750 617 466 934 Methanobacterium thermoformicicum: 37 25 56 31 52 137 303 87 210 168 300 137 90 122 84 43 126 101 108 187 181 64 111 113 123 33 184 256 173 107 138 164 158 139 254 132 202 176 297 412 341 336 265 93 193 85 94 488 283 304 331 194 182 67 56 190 253 341 169 206 246 122 15 11 11 Methanobrevibacter smithii: 6 2 5 0 8 39 4 15 10 14 39 59 18 37 11 4 35 17 22 47 17 5 38 29 8 10 27 46 13 0 35 61 9 6 21 45 7 1 57 157 13 27 94 39 14 12 27 107 12 40 67 19 37 14 19 16 57 83 23 95 35 4 5 0 1 Methanococcus aeolicus: 2 5 0 1 0 14 5 7 3 1 14 34 4 11 11 2 7 4 12 16 8 1 13 18 7 5 8 24 14 0 14 33 5 7 13 20 3 9 19 55 7 5 36 23 4 2 14 38 5 9 34 3 14 1 13 10 13 45 8 32 21 4 2 0 0 Methanococcus igneus: 1 0 0 0 0 7 3 0 0 0 0 11 6 3 0 0 0 1 2 11 2 0 2 3 0 1 1 10 0 0 1 9 1 1 3 2 1 1 16 9 9 5 2 5 0 2 0 10 8 2 11 3 0 0 1 1 2 7 1 7 8 1 1 0 0 Methanococcus jannaschii: 1737 178 38 57 159 13822 4962 4269 1621 1084 4662 26147 9524 7204 1377 386 5257 2603 5530 9911 2122 862 7315 11182 648 699 4252 11236 2718 1171 12200 17883 2116 5135 6526 7478 2328 2879 21570 36422 15477 7745 18649 4626 2634 2045 5112 25956 17380 4854 22788 4976 16783 2019 4333 4380 16679 22682 5311 24186 10991 3636 1350 166 222 Methanococcus maripaludis: 29 6 5 11 16 146 45 32 51 22 108 311 74 120 42 27 89 42 57 162 61 31 96 109 33 22 85 192 27 37 67 214 41 47 125 159 19 37 166 562 82 143 234 99 49 67 37 459 72 135 214 146 125 37 70 106 228 222 94 271 169 45 21 3 5 Methanococcus thermolithotrophicus: 8 1 1 0 1 50 17 11 8 8 30 67 23 28 9 1 9 8 11 53 20 4 29 59 2 3 31 87 13 5 51 92 7 25 52 54 12 26 91 147 31 42 41 18 19 24 5 155 29 37 92 36 32 18 26 31 29 70 38 71 70 10 6 0 2 Methanococcus vannielii: 49 22 2 15 9 388 132 56 76 15 222 469 114 275 49 21 88 54 130 223 91 62 194 249 28 40 177 542 35 45 301 421 112 92 375 379 50 39 562 904 159 279 213 192 137 136 78 889 70 274 345 215 135 37 87 150 251 191 226 519 331 53 41 5 3 Methanococcus voltae: 42 20 3 7 21 293 65 53 49 12 150 565 125 286 47 27 108 61 132 294 117 50 174 226 23 30 220 393 41 44 389 265 97 57 440 373 34 69 433 799 117 254 323 241 64 131 71 804 125 298 442 225 214 60 183 152 223 283 196 424 319 65 37 4 2 Methanopyrus kandleri: 36 99 159 143 115 47 119 95 302 407 41 34 85 34 168 106 23 93 32 36 272 233 40 38 183 335 47 67 508 419 121 231 284 127 337 161 479 489 94 78 467 244 21 33 192 177 31 297 941 587 141 337 19 120 69 361 7 79 571 49 298 124 19 4 14 Methanosaeta concilii: 4 2 16 3 7 14 35 3 36 53 9 2 13 8 26 8 7 18 1 14 48 14 8 16 46 26 11 44 61 20 30 38 85 10 10 18 45 39 27 17 126 38 21 2 45 28 11 21 95 65 53 41 26 32 9 51 10 23 78 19 69 46 0 1 3 Methanosarcina acetivorans: 4 7 5 12 12 31 16 10 7 9 33 27 18 12 9 7 26 8 11 28 8 5 20 13 11 14 21 19 8 5 27 19 13 17 19 14 4 12 18 58 36 25 35 25 12 9 24 61 16 23 38 22 36 12 22 26 35 26 19 27 21 19 2 0 2 Methanosarcina barkeri: 64 56 103 79 143 219 228 64 377 335 547 126 127 206 255 89 218 174 135 287 340 113 314 219 154 167 330 704 369 131 463 530 375 237 408 377 338 270 434 704 549 390 331 112 457 182 124 995 427 548 498 299 274 213 145 330 305 254 493 617 566 186 35 3 26 Methanosarcina frisia: 4 0 18 0 10 24 23 7 54 38 54 8 3 19 38 5 10 18 5 24 53 2 21 31 21 23 17 90 51 5 33 52 38 25 52 30 37 10 33 47 94 63 12 1 46 27 7 108 38 82 35 46 17 22 34 43 10 14 82 56 64 23 2 0 2 Methanosarcina mazeii: 37 14 57 39 57 148 177 32 193 276 349 84 75 209 159 79 131 159 80 273 183 95 146 96 113 154 187 401 157 85 209 380 176 179 163 233 171 135 232 396 265 265 221 41 239 100 90 456 238 318 232 183 189 89 62 215 212 215 232 325 264 113 18 2 18 Methanosarcina thermophila: 15 6 21 3 19 62 61 14 104 98 122 21 15 58 68 15 33 43 18 77 103 9 44 61 46 35 65 213 108 22 94 123 91 57 117 106 85 52 108 137 192 115 54 8 102 55 15 246 104 183 139 88 44 31 42 101 57 61 154 124 153 41 12 1 2 Methanothermus fervidus: 21 19 2 1 17 217 40 63 16 14 89 234 63 119 22 6 66 18 68 193 29 14 108 166 16 4 108 301 28 11 187 297 52 27 179 206 42 55 226 432 83 70 229 112 31 30 97 436 94 94 290 62 186 18 94 62 173 284 53 235 163 40 14 2 5 Methanothermus sociabilis: 2 0 0 1 3 15 11 9 2 2 6 29 6 19 4 0 18 4 15 30 7 2 21 25 1 2 6 25 5 1 19 47 6 2 19 26 9 6 19 69 8 23 57 8 2 0 5 45 10 9 37 17 34 3 8 7 18 55 12 37 19 8 1 0 1 Methylobacillus flagellatum: 3 1 23 7 6 0 3 3 12 29 10 2 15 2 10 3 1 11 4 1 16 11 6 5 15 18 3 15 29 23 5 2 34 9 10 3 13 24 9 7 18 17 14 7 20 6 11 17 19 23 20 9 14 8 2 18 8 2 22 16 21 5 2 1 0 Methylobacillus glycogenes: 3 17 47 8 28 4 5 7 15 48 14 5 24 4 18 13 4 23 4 2 42 12 11 11 12 22 14 28 54 53 23 4 69 4 24 14 26 44 13 12 46 16 25 15 26 17 19 35 35 41 45 17 17 11 8 32 10 1 48 34 31 11 2 0 1 Methylobacillus sp.: 7 5 47 7 21 7 8 8 17 53 22 11 29 11 31 11 18 24 15 20 40 33 18 17 18 25 10 34 56 34 27 13 82 13 32 13 36 45 12 27 49 43 24 21 37 17 24 52 44 56 43 28 18 21 10 39 20 10 57 25 51 23 5 1 1 Methylobacter capsulatus: 3 2 33 14 8 0 2 0 14 48 3 1 13 0 16 21 0 14 3 0 37 9 1 3 11 33 2 11 41 22 8 4 42 9 16 3 24 29 8 7 35 35 8 3 35 15 6 42 43 34 17 25 12 17 3 39 8 0 35 2 23 29 0 0 3 Methylobacter marinus: 1 1 13 2 1 0 2 1 3 14 6 1 7 4 3 3 4 4 2 5 10 6 3 3 5 12 4 3 14 15 3 5 22 10 5 5 11 11 9 9 11 3 2 6 5 2 9 9 15 8 25 5 10 11 4 7 6 2 10 13 17 3 0 0 1 Methylobacterium extorquens: 69 43 856 395 105 18 28 25 893 833 98 6 71 31 264 398 21 289 13 34 631 357 25 33 378 649 49 114 1410 930 128 90 1308 197 162 20 703 620 74 65 647 417 60 49 473 255 114 227 859 783 343 342 101 189 18 570 49 7 813 53 442 297 12 9 48 Methylobacterium organophilum: 1 0 11 4 3 0 1 0 28 21 0 0 1 0 8 12 0 6 0 1 32 10 0 0 9 24 0 1 35 16 1 1 66 0 5 0 28 16 0 0 45 28 4 0 17 10 2 2 17 45 6 27 6 4 0 19 1 0 18 0 16 19 1 0 0 Methylobacterium sp.: 7 17 85 61 25 14 15 17 53 61 35 7 28 10 26 35 8 51 8 17 57 57 9 18 18 41 22 34 90 96 26 24 89 29 27 20 54 49 31 42 64 40 24 32 51 33 30 49 90 74 76 28 30 14 7 63 21 13 78 23 42 63 0 3 4 Methylobacterium specialis: 2 0 5 1 1 0 0 1 13 9 2 0 0 0 7 3 0 0 1 0 11 8 1 0 8 10 0 1 22 6 0 1 26 3 0 1 6 5 0 0 29 12 4 2 9 5 0 4 14 12 4 7 2 6 0 8 0 0 10 2 7 4 0 0 2 Methylococcus capsulatus: 10 8 82 40 59 3 4 0 33 227 5 3 25 4 61 68 6 49 9 7 157 47 6 4 27 140 9 35 150 109 28 22 152 18 82 26 83 132 19 38 103 110 15 6 89 53 17 116 102 142 44 112 43 25 9 199 11 3 171 16 115 123 5 0 5 Methylocystis sp. M: 6 2 70 5 13 1 4 1 63 56 6 0 10 5 19 41 6 18 3 3 47 39 3 2 14 47 7 3 86 78 14 12 86 7 8 1 61 38 10 17 72 32 24 11 53 23 19 33 89 66 43 26 45 16 2 65 6 0 67 15 27 42 0 1 5 Methylomicrobium album: 3 10 11 8 3 6 3 0 5 17 2 3 12 6 15 4 4 7 5 3 19 10 8 5 8 18 5 6 21 15 10 10 27 4 12 5 18 4 7 13 9 22 9 9 8 6 4 9 5 15 12 9 4 6 0 11 15 3 17 15 13 11 2 1 0 Methylomonas aminofaciens: 1 0 1 0 1 0 0 0 0 16 1 1 2 1 1 0 0 0 0 3 2 0 11 3 0 0 4 7 0 2 30 0 9 0 12 5 1 1 11 2 15 5 1 5 1 4 0 7 1 9 6 4 0 1 0 4 1 0 14 2 2 0 1 0 0 Methylomonas clara: 1 0 6 0 9 1 0 0 3 15 1 0 11 5 10 1 3 4 1 2 9 2 3 4 0 5 1 8 10 11 4 0 18 1 17 1 4 13 3 13 11 8 6 4 8 0 1 17 9 12 10 5 1 0 0 4 4 0 14 16 12 1 1 0 0 Methylophilus methylotrophus: 16 7 83 7 107 10 5 11 27 197 14 28 147 66 57 25 52 72 53 47 130 56 61 92 20 75 67 107 164 113 99 11 196 40 210 61 60 169 47 198 93 117 66 80 84 51 59 126 98 133 149 105 64 39 49 111 105 14 128 131 158 87 12 2 2 Methylophilus methylotrophus W3A1: 2 1 10 0 11 2 0 1 2 16 6 4 8 15 7 6 10 5 4 2 12 4 2 5 1 10 6 19 14 15 14 4 22 4 18 9 13 32 13 15 17 7 11 9 11 1 5 31 11 15 28 6 8 5 0 8 7 3 15 26 15 4 0 2 0 Methylophilus sp.: 1 1 0 0 6 5 0 4 1 2 7 5 0 3 0 2 4 1 6 5 2 2 8 3 0 0 6 7 3 2 2 3 7 0 8 3 1 0 11 13 0 4 6 9 2 2 9 13 4 0 20 3 15 2 2 7 5 0 4 11 7 9 1 0 0 Methylosinus trichosporium: 6 8 72 13 21 6 2 2 64 56 8 0 8 4 17 46 3 19 1 1 47 45 3 0 19 42 4 3 72 71 20 10 91 3 6 0 55 40 9 14 74 27 24 9 52 25 19 27 88 70 42 22 39 15 3 67 4 3 73 10 29 41 0 1 5 Microbacterium ammoniaphilum: 3 16 22 12 5 2 6 8 35 29 18 0 10 4 8 12 5 15 4 5 15 11 10 7 14 21 3 17 23 19 13 13 29 17 11 10 20 21 9 1 8 13 6 6 17 9 5 12 30 48 15 15 4 4 1 23 5 0 15 8 10 7 0 1 2 Microbispora bispora: 2 5 46 65 3 0 9 0 69 61 3 2 0 1 18 20 1 20 0 1 73 35 0 0 30 49 3 2 96 64 3 8 82 39 8 4 67 49 0 0 38 42 2 0 36 35 2 2 63 109 4 50 3 2 0 39 0 1 53 0 13 29 0 0 2 Micrococcus luteus: 25 5 394 119 71 12 12 4 234 348 11 18 11 12 207 91 15 32 9 10 279 157 22 9 129 192 25 21 414 198 21 16 460 75 70 12 280 332 13 39 329 200 41 13 264 124 15 32 498 368 48 156 23 30 1 213 15 21 329 15 157 38 2 2 21 Micrococcus rubens: 1 1 19 13 0 0 0 0 22 24 0 0 1 0 19 7 0 3 0 0 24 6 0 0 7 14 0 0 35 17 0 0 36 13 1 0 22 22 0 0 6 5 0 1 14 18 0 0 38 27 1 15 0 2 0 14 0 0 14 0 8 9 0 0 1 Micrococcus sp.: 1 6 7 6 12 5 2 5 4 2 18 30 22 13 0 12 19 5 9 25 9 34 11 14 2 13 8 33 10 36 14 29 30 15 23 17 12 37 25 48 13 24 34 22 9 8 9 61 11 35 66 25 24 0 2 9 35 8 13 37 17 20 0 1 0 Micrococcus varians: 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 2 0 0 1 1 0 1 3 0 0 1 0 0 2 2 0 0 0 2 1 1 0 1 1 1 0 0 2 0 0 2 2 0 1 2 3 0 0 0 3 0 3 1 0 2 1 2 0 0 0 1 Microcystis aeruginosa: 12 42 77 41 72 30 15 47 57 65 53 115 34 19 40 27 59 38 24 22 91 21 45 23 51 29 34 33 88 37 94 43 36 43 83 35 30 47 37 171 72 59 85 70 53 40 27 208 101 46 167 52 59 24 8 70 63 35 129 100 67 45 8 3 1 Micromonospora cellulolyticum: 1 0 14 6 2 0 1 0 12 9 1 0 0 1 11 10 1 11 1 1 36 14 0 0 9 19 0 1 47 19 2 2 40 4 5 0 18 12 1 1 4 35 0 1 20 2 0 1 6 19 1 9 0 4 1 14 0 0 19 0 1 9 0 0 1 Micromonospora chalcea: 2 8 19 11 3 1 1 2 26 19 4 2 5 0 5 5 2 6 3 2 14 5 0 4 13 12 4 8 33 14 6 10 22 5 6 1 12 15 8 5 4 10 5 3 11 15 6 12 30 34 11 13 2 6 1 14 6 0 14 3 12 12 0 2 0 Micromonospora griseorubida: 4 12 25 70 22 3 7 2 56 66 1 0 10 3 17 16 0 14 1 2 52 18 3 7 24 55 6 11 85 42 7 9 45 22 23 4 59 54 2 1 13 13 2 2 33 33 4 17 54 72 10 28 3 12 0 31 2 0 29 4 22 17 0 0 4 Micromonospora olivasterospora: 4 8 47 52 9 0 2 1 47 91 2 0 7 2 17 17 0 17 0 3 44 35 1 3 16 67 0 11 89 88 5 6 69 25 20 3 63 63 3 2 22 26 3 2 30 43 4 7 82 81 5 31 1 18 2 43 1 1 45 1 27 17 0 2 2 Micromonospora purpurea: 1 6 7 8 5 1 1 1 7 17 1 0 3 2 5 4 2 3 1 1 7 7 2 0 6 9 1 1 15 9 4 0 8 3 2 1 10 12 0 1 6 5 1 1 13 3 2 2 13 18 0 6 1 1 2 5 2 0 8 6 4 2 0 1 0 Micromonospora rosea: 1 5 9 7 5 1 1 1 6 15 3 0 3 1 6 5 2 3 2 2 6 9 1 1 4 8 1 1 15 7 2 0 8 4 2 1 7 14 2 1 6 6 0 1 10 7 0 2 13 19 0 6 1 1 2 4 3 0 7 6 6 3 0 1 0 Micromonospora viridifaciens: 2 3 23 26 2 2 5 0 25 25 3 0 3 2 19 17 0 25 1 3 38 22 3 3 21 27 3 10 51 28 3 5 50 10 9 2 25 17 6 0 10 22 1 2 35 14 0 9 21 44 6 23 1 3 0 19 1 0 32 2 9 14 0 0 2 Moorella thermoacetica: 20 22 165 232 78 13 70 27 161 490 76 68 88 17 121 37 24 97 39 36 273 68 61 25 187 154 59 75 582 86 127 93 308 122 212 169 257 156 131 190 191 167 96 44 244 73 70 345 304 226 183 101 125 74 31 133 123 51 273 188 200 64 7 6 8 Moraxella bovis: 19 12 25 3 60 23 6 91 5 17 43 95 93 52 19 14 96 30 63 49 74 8 157 48 18 6 52 72 69 18 203 25 71 15 204 68 31 45 74 247 60 90 167 128 23 22 51 144 39 71 140 33 111 19 28 31 160 42 134 174 77 59 17 1 1 Moraxella catarrhalis: 10 10 63 4 95 17 2 67 5 45 64 109 107 40 22 15 48 69 65 81 113 22 66 80 34 6 70 138 121 52 114 23 123 46 185 62 61 93 93 269 55 100 209 109 48 27 64 167 65 92 215 38 142 7 12 23 151 32 100 150 60 44 8 0 2 Moraxella lacunata: 3 6 18 10 20 3 5 17 14 17 23 22 25 14 8 10 15 15 20 26 14 15 10 9 11 11 13 25 22 13 20 17 22 14 20 15 25 14 20 47 18 23 22 41 14 5 35 44 27 24 40 17 54 7 4 17 33 9 24 49 30 23 2 0 1 Moraxella nonliquefaciens: 1 0 0 0 2 1 0 5 2 1 0 2 3 1 0 0 2 2 1 3 3 2 6 1 0 0 3 5 5 1 8 2 2 1 8 3 0 1 3 9 5 4 5 2 2 0 0 6 2 1 8 0 6 0 2 0 5 2 5 9 2 0 1 0 0 Moraxella sp.: 9 15 42 16 32 9 4 31 26 75 32 63 37 35 14 31 34 37 38 44 54 40 43 40 29 34 36 56 72 64 65 30 74 23 74 32 47 51 54 110 74 51 73 72 44 24 66 98 64 70 113 36 68 25 20 40 67 22 64 95 69 38 4 1 4 Morganella morganii: 9 3 41 11 40 3 1 1 14 132 9 24 13 23 45 11 27 34 20 18 52 11 22 13 8 69 16 80 66 57 45 12 54 27 71 21 41 59 52 129 27 55 45 20 80 26 24 86 36 55 97 37 55 19 7 51 35 4 94 54 66 29 6 0 3 Mycobacterium avium: 49 142 630 474 113 18 32 18 290 947 74 6 141 28 222 343 29 227 40 35 589 237 42 77 370 606 49 128 1021 775 124 123 868 296 210 64 537 709 71 74 347 369 48 118 492 318 96 200 510 786 195 266 57 118 23 417 30 17 644 40 285 255 8 13 28 Mycobacterium avium paratuberculosis: 8 26 122 41 27 4 10 3 79 161 27 2 26 7 66 63 9 55 9 8 145 41 8 21 61 93 7 21 259 174 31 21 273 49 94 21 190 105 29 14 143 90 10 37 142 54 23 43 176 177 56 55 9 19 3 69 13 3 160 13 47 21 2 0 6 Mycobacterium bovis: 55 149 564 376 138 25 67 59 380 811 76 21 199 62 240 397 33 299 56 65 706 290 70 124 363 571 75 275 1066 792 223 144 900 256 333 82 590 642 134 114 556 432 86 165 484 253 94 300 662 871 255 317 69 109 46 391 67 33 644 121 344 253 11 17 27 Mycobacterium bovis BCG: 18 21 144 110 47 5 13 19 55 156 13 2 44 13 32 72 6 62 10 13 130 64 18 13 47 97 9 40 185 129 34 21 151 45 66 14 117 120 30 34 173 85 19 27 93 67 23 64 167 171 48 68 24 22 3 104 13 4 141 30 80 34 2 8 8 Mycobacterium branderi: 1 2 29 6 2 0 2 1 13 22 1 2 8 0 10 4 2 8 0 3 19 7 0 3 10 7 1 2 26 20 4 2 13 6 5 1 9 18 3 4 6 7 1 5 8 8 0 9 14 14 12 5 4 3 0 7 4 0 19 0 6 8 1 0 0 Mycobacterium celatum: 1 3 25 8 3 0 1 1 15 22 3 0 5 0 8 5 2 7 0 5 27 3 1 4 7 5 2 2 23 19 5 3 17 4 1 3 13 12 7 4 5 4 4 4 10 7 1 7 18 17 8 7 3 4 0 7 4 0 15 1 6 8 1 0 0 Mycobacterium fortuitum: 13 42 151 115 56 11 18 9 101 269 23 12 68 22 54 124 8 81 15 25 167 71 16 17 104 171 27 73 289 205 53 51 254 60 83 11 150 135 23 25 126 125 32 25 120 98 32 78 165 193 84 100 23 36 13 151 13 5 175 22 116 137 3 2 8 Mycobacterium genavense: 1 7 8 9 8 3 1 2 1 3 2 0 1 2 0 3 1 3 1 2 8 1 2 8 5 3 3 6 3 4 2 6 6 3 5 3 1 1 3 2 1 5 0 4 5 6 6 3 2 2 5 0 4 4 0 3 1 0 5 1 1 0 0 0 1 Mycobacterium gordonae: 5 19 68 48 12 4 9 11 34 117 7 1 33 9 22 38 8 26 7 7 78 28 18 6 22 38 11 26 105 64 33 10 71 30 38 7 56 57 11 11 38 41 7 10 40 33 10 26 43 82 27 37 13 13 3 41 9 0 47 13 31 39 1 2 2 Mycobacterium haemophilum: 1 3 6 2 1 0 0 0 1 1 1 0 5 0 1 2 0 2 0 0 0 1 0 1 2 4 1 3 3 6 1 0 6 1 0 0 1 1 0 1 0 1 0 3 5 1 1 1 0 1 2 0 0 1 0 3 0 0 1 1 1 0 0 1 0 Mycobacterium intracellulare: 12 4 84 52 23 1 5 5 73 175 4 1 25 6 77 97 2 89 10 10 161 64 5 9 66 128 8 17 241 161 15 29 241 56 53 4 134 118 16 21 139 125 16 15 116 51 3 33 119 179 29 68 9 21 8 87 8 0 135 8 72 50 3 4 5 Mycobacterium kansasii: 3 3 15 9 3 0 0 0 11 36 3 0 9 3 16 24 1 17 8 5 35 11 2 2 12 24 2 4 49 30 5 12 45 7 15 1 24 19 4 2 17 24 5 7 23 11 2 5 20 41 7 22 4 9 0 16 0 0 25 2 13 15 1 0 2 Mycobacterium leprae: 1246 3153 7014 6275 4120 903 1367 2845 4670 11863 2856 1767 7455 2297 3675 5843 1757 4416 2216 2697 9011 4586 3449 3107 4079 7453 2282 5684 12522 10824 6718 3800 10556 4644 7479 3126 9279 11825 4719 3025 5642 5875 2684 3676 6990 4709 2769 6770 8887 11366 6823 4401 2578 2494 1426 6443 2900 1678 9829 3795 6331 4358 297 358 589 Mycobacterium marinum: 3 14 30 23 5 3 1 5 11 43 4 2 10 2 4 6 1 11 3 1 23 4 4 2 15 20 8 10 43 19 9 4 21 10 13 6 14 13 11 0 4 9 0 6 16 9 4 12 15 25 17 15 4 4 3 18 7 3 20 6 11 8 0 0 3 Mycobacterium scrofulaceum: 1 1 5 3 0 0 0 0 5 20 2 1 1 0 9 7 0 11 2 2 10 4 0 0 11 11 0 1 19 14 1 3 27 6 9 0 8 6 0 0 11 17 0 2 15 4 0 1 7 13 1 15 0 3 0 10 1 0 11 0 10 10 1 0 0 Mycobacterium smegmatis: 76 128 1203 492 353 17 75 19 793 1675 99 3 256 52 361 732 28 377 77 77 1139 602 56 48 561 946 85 213 1583 1515 151 164 1554 305 615 56 1174 1329 148 91 883 730 60 68 896 467 107 369 1351 1593 393 573 80 169 44 886 30 8 1345 34 614 446 9 13 54 Mycobacterium sp.: 1 5 11 6 2 0 1 2 19 16 5 0 2 2 4 4 0 7 1 2 17 8 1 3 5 10 1 15 22 19 7 1 22 8 5 1 17 16 2 0 7 5 0 3 8 12 3 4 18 29 5 2 0 3 0 11 1 0 15 2 8 4 0 1 0 Mycobacterium tuberculosis: 3149 7712 29942 25855 8960 1429 3510 4970 18282 51986 5903 1711 18326 3918 12020 20080 2394 15100 3707 4937 36671 16436 3889 6517 17812 32682 3643 13448 60443 49863 11380 10113 49982 19310 19051 5106 34211 41490 8520 5648 16755 20974 5373 8459 23748 16724 6794 17121 32537 44202 16600 15565 6437 7093 2440 24324 6456 2319 35220 6859 19316 15661 491 915 1737 Mycobacterium ulcerans: 1 3 9 6 7 0 3 3 5 11 2 1 11 2 3 3 1 7 3 3 16 5 6 0 8 7 2 6 21 11 8 5 6 1 2 1 10 10 2 3 7 6 3 7 4 9 2 3 7 11 4 3 2 5 0 7 2 2 16 1 7 6 0 0 1 Mycobacterium xenopi: 1 4 22 6 3 0 3 1 10 26 4 0 6 1 7 7 0 8 0 3 21 2 2 2 12 7 0 3 36 9 2 4 11 6 3 0 11 18 4 5 4 11 1 5 11 8 2 11 12 21 7 7 2 3 0 10 2 0 14 2 5 8 0 1 0 Mycoplana ramosa: 1 0 11 1 1 0 1 0 14 7 1 0 2 1 4 8 0 1 1 0 7 9 2 0 4 13 1 2 33 12 2 2 28 4 5 1 9 7 5 1 13 7 2 0 4 6 4 9 12 10 9 8 4 3 0 15 4 0 18 2 6 5 0 0 1 Mycoplasma arginini: 4 0 3 0 17 31 0 28 0 0 5 105 0 67 1 2 15 5 5 58 5 0 17 42 0 0 13 51 1 2 42 28 3 5 46 42 3 2 67 110 8 43 43 35 0 32 4 112 2 44 53 28 19 0 5 33 48 13 36 54 29 0 1 2 17 Mycoplasma arthritidis: 4 0 1 0 2 7 0 17 0 0 31 60 10 31 1 5 8 38 4 37 15 3 51 13 0 0 21 81 5 1 58 9 43 1 32 25 8 3 106 242 22 29 31 55 1 13 2 116 5 39 73 30 19 0 3 2 47 6 7 26 11 1 4 0 4 Mycoplasma bovis: 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 2 0 18 0 0 1 0 1 18 1 0 21 18 2 2 13 24 0 0 8 30 8 4 28 1 0 1 0 28 0 23 13 42 0 0 1 15 4 3 8 0 0 0 1 0 3 1 0 2 1 0 1 0 0 Mycoplasma capricolum: 70 5 10 0 108 411 8 148 5 7 109 1032 66 397 4 8 245 38 275 320 27 6 520 274 9 8 157 362 20 11 582 443 19 41 469 290 17 38 777 1515 152 183 869 582 19 60 165 947 72 80 742 78 434 13 92 56 623 256 108 1121 355 7 44 25 102 Mycoplasma fermentans: 12 2 5 0 37 74 4 32 4 2 75 188 37 132 4 7 51 20 69 127 10 3 75 53 4 2 40 96 9 2 153 70 25 8 112 47 5 2 160 436 37 87 146 112 7 25 29 250 14 56 133 52 91 4 12 73 154 50 47 256 77 1 10 1 37 Mycoplasma flocculare: 2 1 1 0 2 4 0 2 0 0 6 15 5 7 0 1 3 2 6 8 0 0 6 2 0 0 3 11 3 5 6 6 5 1 6 3 2 2 9 40 5 1 23 9 2 2 3 22 4 1 12 1 6 2 0 0 17 4 3 33 5 1 2 0 1 Mycoplasma gallisepticum: 27 35 14 33 87 210 8 189 15 37 165 690 85 344 11 45 246 72 332 384 124 79 538 324 20 47 249 330 65 67 572 230 42 117 528 248 49 134 452 756 268 401 660 504 50 66 68 602 107 119 555 155 358 2 36 156 362 74 297 511 307 15 17 9 98 Mycoplasma genitalium: 481 235 545 179 1242 2506 819 2228 890 772 3502 8772 2493 2909 721 199 2209 1186 4584 2932 1859 293 4485 1959 669 170 2616 3765 727 468 4845 2042 885 1229 4057 2327 617 1272 6657 12343 4306 5158 8063 6773 1576 981 1812 8005 1985 1216 7486 1467 4228 283 1140 1462 9217 2215 3163 9005 2679 604 352 129 1109 Mycoplasma hominis: 28 5 13 0 107 315 24 208 2 3 177 1065 229 765 15 29 295 96 152 530 119 10 442 198 15 8 143 706 99 24 499 272 80 17 272 223 25 33 561 1997 243 430 1167 805 4 80 84 1476 32 268 794 147 400 12 36 212 480 338 115 858 240 3 21 6 135 Mycoplasma hyopneumoniae: 23 28 28 9 36 119 23 167 38 25 272 441 91 214 63 40 141 83 177 221 69 9 200 173 30 30 139 260 100 52 215 177 64 72 154 131 47 27 244 1099 119 129 659 356 94 20 55 616 105 83 463 63 303 4 19 89 518 138 129 544 102 15 22 1 56 Mycoplasma hyorhinis: 16 8 3 0 16 91 5 84 17 7 94 380 53 288 33 22 168 42 110 233 28 2 232 135 2 9 50 150 12 10 125 210 19 15 128 116 13 31 196 598 39 115 456 358 15 40 56 514 51 54 262 57 123 28 118 44 333 161 39 334 54 6 15 1 73 Mycoplasma incognitus: 2 0 0 0 0 5 0 1 1 0 1 16 5 4 1 0 5 3 4 4 0 0 4 0 0 0 1 3 1 1 3 5 1 0 3 4 0 1 3 35 8 3 16 11 0 1 3 18 3 2 8 2 7 1 2 0 14 14 2 6 7 0 2 0 3 Mycoplasma iowae: 3 0 0 1 0 19 2 5 0 0 13 28 8 15 1 1 14 2 5 21 0 0 15 6 1 0 1 7 1 0 9 6 1 1 13 8 2 2 28 69 6 11 38 18 0 2 6 30 4 8 29 5 20 2 10 5 35 24 5 42 22 1 2 1 4 Mycoplasma mycoides: 8 3 1 0 7 45 0 44 1 0 15 164 6 55 0 0 33 3 32 47 3 0 71 33 0 1 25 27 1 0 68 58 2 5 55 35 3 5 85 258 16 23 140 105 1 2 36 182 10 7 127 8 86 1 8 4 101 39 12 153 64 2 5 3 21 Mycoplasma mycoides mycoides SC: 3 0 0 0 0 20 1 21 0 0 18 63 9 56 0 2 23 4 21 30 3 0 36 37 0 0 19 29 0 1 6 10 0 2 25 15 1 5 26 143 39 19 89 41 2 2 14 82 7 23 65 7 44 0 2 10 58 42 9 51 10 0 2 1 2 Mycoplasma penetrans: 2 0 0 0 0 4 0 5 1 1 8 41 5 19 1 1 19 2 15 43 2 1 32 7 0 0 6 28 0 0 25 22 1 4 29 19 0 2 27 56 9 14 39 15 0 2 1 27 1 5 45 6 13 0 5 2 14 15 3 25 7 1 1 1 5 Mycoplasma pirum: 5 7 2 1 12 27 1 5 1 0 18 143 28 60 1 11 69 8 52 81 2 4 66 52 6 3 23 61 8 5 66 60 18 5 62 41 3 9 90 218 9 33 201 76 3 3 18 107 12 8 121 14 100 5 18 7 101 76 13 142 34 1 5 0 29 Mycoplasma pneumoniae: 760 667 2968 1365 2638 1046 752 2814 3346 2565 2682 10414 5761 2323 2589 1731 2164 2853 5610 2827 5936 2157 5129 3111 2527 1811 2266 3695 4464 3063 6816 1709 3176 2436 7492 3715 2954 5066 5677 12183 10503 9972 6676 10295 4258 3166 1601 11283 3976 5154 8161 4821 3869 556 1395 3408 11406 1417 3844 12117 4155 1537 546 213 1583 Mycoplasma pulmonis: 17 13 5 0 21 156 12 84 18 4 177 373 87 248 24 14 219 50 200 232 35 2 272 118 7 7 159 155 33 7 160 228 32 12 203 91 23 23 219 899 115 118 580 304 16 28 85 572 82 99 411 42 329 4 27 64 464 259 88 484 124 5 12 5 62 Mycoplasma salivarium: 1 0 0 0 3 13 0 6 0 0 4 29 7 18 0 1 11 1 6 19 4 1 18 3 0 0 8 27 0 0 13 8 4 2 13 8 1 0 25 48 11 8 27 15 0 2 3 33 2 5 20 4 17 1 10 1 19 0 0 27 12 1 0 1 1 Mycoplasma sp.: 3 4 0 0 1 14 2 5 0 0 9 24 6 4 1 1 13 1 7 12 0 1 12 11 1 2 10 9 2 0 13 16 6 2 10 11 2 2 12 45 6 5 25 16 4 4 4 32 6 5 26 5 16 1 1 9 17 12 5 18 9 12 3 0 0 Mycoplasma-like organism: 7 3 12 0 24 23 0 12 1 0 13 74 6 15 3 2 27 4 15 36 13 0 32 13 3 3 18 24 10 3 41 25 18 3 27 18 6 5 41 153 6 40 64 41 1 11 12 62 3 14 32 8 17 2 7 9 34 26 15 66 23 9 7 0 0 Myxococcus xanthus: 106 123 1674 983 332 29 120 20 1286 2630 155 2 383 70 783 625 75 632 76 54 872 1112 71 113 924 1165 165 166 2007 2323 230 252 2120 691 377 36 1058 2114 122 35 1530 878 96 105 1292 637 119 431 2382 1725 317 729 114 286 64 1244 57 13 1206 211 805 412 9 25 72 Natrialba asiatica: 1 2 5 4 3 1 1 0 23 9 3 0 1 2 14 21 3 12 10 2 16 19 2 6 5 10 0 11 27 12 3 9 34 9 14 2 28 2 4 4 5 26 5 2 14 8 0 13 16 33 12 21 1 1 4 9 0 0 15 3 5 4 1 0 0 Natronobacterium pharaonis: 14 25 65 58 26 4 3 6 172 116 45 1 18 12 47 58 11 44 18 31 106 121 16 13 40 74 5 54 169 147 40 24 185 46 60 24 220 47 56 21 50 97 9 20 81 73 10 124 185 196 44 83 21 5 24 139 29 15 143 30 111 61 6 1 7 Natronococcus sp.: 1 6 9 10 1 1 0 0 21 15 2 0 0 0 4 9 0 6 1 0 16 9 1 0 16 16 1 2 31 13 2 3 26 10 3 2 35 4 2 2 1 10 3 1 10 17 2 12 42 52 8 16 1 1 2 13 0 0 14 0 10 10 0 0 1 Neisseria cinerea: 1 0 8 1 4 0 0 0 1 7 5 1 8 1 6 3 0 5 0 2 5 4 1 0 2 3 5 4 15 13 3 1 18 2 8 1 8 2 7 4 4 10 3 2 9 3 1 12 3 8 4 5 2 4 0 4 9 1 13 8 5 1 1 0 0 Neisseria flavescens: 1 0 9 2 3 0 0 0 1 7 5 0 11 1 2 2 1 4 0 2 6 4 1 0 3 5 3 4 17 12 2 1 19 1 8 2 6 2 8 7 2 9 3 2 7 3 3 13 3 10 4 6 0 3 0 6 7 0 11 10 5 1 1 0 0 Neisseria gonorrhoeae: 222 236 2205 547 780 277 323 115 858 2338 688 435 2178 416 1387 750 682 1438 387 563 2383 974 616 255 1124 1241 581 1526 3536 1833 809 697 4114 555 1455 950 1823 1252 1468 4267 874 2444 1385 2050 1195 1040 609 3701 846 2547 1763 1618 1121 451 168 1840 1341 349 2305 1495 1578 881 128 12 79 Neisseria lactamica: 7 4 33 16 17 16 13 6 9 43 20 37 64 13 26 25 20 23 15 23 35 21 19 8 29 27 16 47 54 42 28 27 96 16 43 28 29 26 47 154 32 50 54 67 26 21 16 110 16 49 85 41 50 12 11 46 59 15 54 68 29 23 5 1 1 Neisseria meningitidis: 212 216 2083 541 950 219 265 178 673 1984 743 693 2726 352 1127 753 841 1407 473 622 1992 1144 773 274 842 1370 685 1640 2652 2218 918 609 4100 547 1880 996 1460 1694 1620 4227 1134 2187 1918 1934 1272 906 801 3716 1092 2544 2388 1536 1516 389 198 1557 1716 447 2100 2012 1721 774 155 8 48 Neisseria meningitidis (group B): 5 5 32 8 22 9 8 13 5 26 15 39 39 13 16 10 29 18 13 17 19 17 18 20 11 17 17 31 30 28 32 16 49 14 34 18 31 19 22 67 19 26 43 34 13 16 26 82 19 25 51 16 30 16 8 17 37 9 38 69 36 9 3 1 1 Neisseria mucosa: 3 0 27 3 3 1 1 0 3 19 4 7 25 3 5 3 2 8 0 1 19 4 8 0 12 17 1 12 18 42 8 5 54 2 14 11 24 15 13 37 6 7 5 14 12 12 4 46 5 40 12 12 3 4 0 17 8 4 24 17 15 1 3 0 0 Neisseria pharyngis var. flava: 1 1 8 1 2 1 1 0 3 7 1 4 9 1 3 4 0 2 0 1 5 2 2 0 7 4 1 5 11 17 4 5 19 2 3 3 10 2 6 8 1 6 3 4 6 2 5 16 2 8 6 5 2 2 0 6 7 2 8 7 5 1 1 0 0 Neisseria polysaccharea: 1 0 9 1 3 0 0 0 1 7 5 1 9 1 3 2 0 3 1 2 6 5 0 0 3 4 4 7 16 8 4 1 19 1 9 2 9 3 5 7 2 10 3 3 8 3 3 10 3 10 4 6 0 3 0 5 8 0 10 11 5 1 1 0 0 Neisseria sicca: 2 0 19 11 18 1 4 0 4 34 5 1 36 1 10 7 20 18 3 4 18 12 20 2 12 18 8 19 27 20 22 5 37 3 44 17 13 19 29 56 13 34 11 17 15 12 8 42 12 32 18 18 11 0 0 19 18 2 18 15 18 8 2 0 0 Nitrobacter hamburgensis: 1 2 19 5 4 1 4 1 10 19 2 0 4 2 2 14 0 7 1 2 14 8 1 2 3 30 1 1 16 19 3 5 22 2 6 1 17 16 3 1 26 19 3 4 13 5 2 10 22 18 13 17 8 14 1 12 4 1 24 3 13 11 0 1 0 Nitrobacter vulgaris: 4 7 47 10 13 0 5 2 29 40 15 0 13 5 14 26 2 9 3 1 34 27 1 1 15 34 11 10 39 48 26 11 47 12 28 5 30 31 20 8 39 27 17 12 31 24 11 33 36 38 39 24 18 12 3 43 9 2 49 17 33 18 1 0 3 Nitrobacter winogradskyi: 3 0 19 16 4 0 0 1 13 80 9 0 6 4 9 31 2 6 1 4 28 34 0 2 7 48 5 5 40 89 6 9 76 12 13 1 21 56 23 3 28 23 5 2 23 19 15 5 22 22 14 25 10 5 0 70 20 2 68 10 54 28 1 2 0 Nitrosococcus oceanus: 1 0 3 3 2 1 0 1 0 5 6 4 9 1 3 3 2 1 1 1 5 6 1 0 5 5 2 4 3 6 12 2 3 4 8 9 5 5 9 4 4 3 3 2 1 4 2 2 5 6 3 9 3 0 0 9 15 1 2 6 13 10 1 0 0 Nitrosolobus multiformis: 6 4 15 15 12 9 3 3 9 64 9 2 10 6 15 9 0 9 3 12 44 9 0 4 18 19 12 18 22 33 0 21 48 22 15 21 21 29 12 6 27 18 6 23 13 20 3 27 15 27 6 39 9 15 6 39 27 9 30 12 45 45 3 0 3 Nitrosomonas europaea: 9 3 27 11 53 15 5 2 16 130 16 14 40 20 29 33 9 26 25 39 85 36 16 21 20 70 29 91 83 60 46 61 57 32 90 48 57 37 42 162 76 73 34 25 64 33 45 160 54 76 99 45 39 27 28 64 43 19 70 45 83 56 3 2 4 Nitrosomonas eutropha: 2 0 4 0 16 4 0 0 4 28 2 2 17 6 2 5 0 0 2 18 12 3 4 12 0 12 6 16 4 10 3 10 6 2 33 16 6 8 23 12 2 6 4 6 2 4 12 12 8 6 11 18 16 6 2 19 24 4 12 14 28 28 2 0 0 Nitrosospira briensis: 1 0 5 1 2 2 1 1 7 17 1 0 2 2 3 2 0 1 0 1 21 0 0 0 6 9 0 7 9 2 1 4 17 3 1 5 11 2 4 3 5 6 0 2 0 5 0 7 2 7 2 14 2 5 1 17 4 3 10 1 14 14 1 0 0 Nitrosospira sp. Np39-19: 2 0 10 2 6 2 2 4 9 38 0 0 3 0 6 8 0 4 0 2 27 8 2 2 7 16 5 8 16 10 2 2 40 4 4 16 14 10 3 10 6 10 0 4 0 12 0 14 4 19 0 25 6 10 2 24 18 8 23 5 28 28 2 0 0 Nitrosospira sp. NpAV: 9 0 75 33 18 3 8 4 32 191 9 8 29 7 26 36 1 52 7 18 135 42 5 0 29 127 11 35 83 76 11 30 187 24 21 53 75 64 20 58 55 87 4 35 11 47 16 81 22 116 13 89 39 19 9 106 55 30 104 41 120 114 8 0 1 Nitrosovibrio tenuis: 1 0 6 1 2 1 1 2 3 21 0 1 1 0 3 3 0 2 0 3 14 4 0 1 3 8 2 4 8 7 0 3 14 5 3 5 5 9 3 4 4 4 1 2 0 5 1 7 2 7 2 12 3 4 1 13 9 4 8 4 15 14 1 0 0 Nocardia aerocolonigenes: 3 10 23 23 11 3 8 0 24 34 8 0 12 3 4 11 2 10 6 3 15 12 8 7 15 19 9 17 23 32 22 10 25 20 26 7 27 28 8 8 32 24 1 6 32 18 8 11 43 45 18 11 3 7 2 29 3 2 27 2 20 19 0 2 1 Nocardia asteroides: 2 12 10 17 7 4 3 0 11 30 2 0 6 2 11 13 3 5 1 4 20 5 0 3 3 16 1 8 34 19 2 6 21 13 11 0 27 23 0 4 21 19 3 3 18 18 4 6 17 28 13 11 1 6 3 16 0 0 16 0 9 15 1 0 1 Nocardia corallina: 4 4 33 36 7 0 6 3 45 59 3 0 6 2 15 32 1 23 4 3 29 26 5 10 16 47 2 8 72 42 9 6 46 17 15 3 47 41 4 1 37 28 2 4 51 25 4 14 82 80 8 38 2 21 2 51 2 0 59 1 33 31 0 0 4 Nocardia farcinica: 1 2 11 6 1 0 0 1 7 17 0 0 1 0 6 4 0 6 0 0 26 5 0 0 7 5 0 1 28 23 0 0 25 1 3 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5 10 24 18 31 6 3 20 16 35 6 17 42 7 8 10 14 20 4 20 26 6 12 23 14 16 13 34 44 27 47 19 34 12 53 32 15 32 24 26 38 37 23 42 33 25 12 80 20 47 33 25 16 8 5 21 17 10 34 51 45 6 4 0 1 Nostoc punctiforme: 4 14 18 16 18 17 7 26 17 27 19 53 49 19 11 12 38 30 31 31 23 16 38 24 20 11 31 35 35 32 66 31 20 26 53 27 20 31 48 100 30 37 42 71 35 11 20 97 34 19 67 24 32 3 6 19 39 17 38 73 41 15 3 0 1 Nostoc sp.: 19 28 75 44 60 47 10 72 55 65 71 134 138 56 40 25 100 54 70 99 61 17 101 85 70 23 80 120 101 43 153 79 80 53 165 91 61 66 151 194 99 93 139 159 76 36 58 263 83 85 203 85 105 25 28 69 140 72 95 201 122 73 13 5 1 Ochrobactrum anthropi: 2 2 30 8 23 2 1 1 13 31 21 0 10 7 7 10 8 11 7 12 21 16 6 5 6 21 10 20 23 25 11 3 52 10 32 4 17 26 21 9 13 12 16 7 21 9 13 32 20 20 41 7 15 8 3 15 20 2 21 16 27 15 0 0 2 Oenococcus oeni: 21 24 24 14 55 103 26 57 19 31 96 174 108 63 29 26 85 48 88 96 32 30 84 58 17 37 48 101 76 32 121 96 82 18 72 73 50 26 151 346 150 87 232 160 72 34 81 271 57 103 246 49 153 9 3 45 185 115 53 192 90 41 11 7 3 Oerskovia xanthineolytica: 2 4 22 5 2 1 5 0 36 17 0 0 2 1 16 17 0 17 1 1 34 36 0 2 28 29 5 6 35 49 3 1 59 29 8 0 40 19 1 0 17 39 1 1 47 16 2 1 22 51 2 24 1 8 1 22 1 1 29 0 10 27 0 1 1 Oligotropha carboxidovorans: 6 10 71 20 27 1 5 6 58 76 22 5 27 12 21 50 3 14 6 23 79 40 10 14 22 87 13 40 99 113 37 17 134 14 41 10 74 61 26 47 76 55 31 16 56 32 44 79 82 72 70 42 45 36 12 58 19 6 110 35 76 35 1 2 3 Oscillatoria chalybea: 1 11 21 4 4 4 4 3 6 2 6 24 16 3 6 7 15 2 7 4 17 11 16 12 14 11 11 20 20 12 20 17 15 7 19 19 7 7 12 32 3 8 18 22 2 9 11 46 3 6 28 7 14 6 13 5 21 3 8 19 22 15 0 0 1 Oxalobacter formigenes: 3 0 8 0 37 8 0 0 8 82 8 2 18 1 35 5 11 11 4 8 42 7 13 42 0 12 16 47 28 6 71 10 54 0 85 9 18 3 76 61 16 44 19 14 32 11 6 57 2 51 24 26 11 11 7 58 10 0 60 26 60 23 2 0 1 Paenibacillus alvei: 1 0 4 1 1 7 1 1 5 8 4 7 9 9 10 4 4 13 12 11 4 10 7 6 4 5 7 14 5 5 17 9 9 2 5 15 2 8 17 21 12 14 25 15 6 3 4 13 9 9 20 8 13 1 0 5 13 3 13 18 6 8 1 0 0 Paenibacillus macerans: 17 26 44 31 32 4 6 35 37 115 41 37 99 46 66 77 56 60 76 93 128 185 27 47 15 110 24 32 103 150 85 135 228 135 72 48 98 114 84 175 113 189 188 58 69 16 73 135 69 155 141 118 187 40 14 123 157 17 99 137 138 146 15 2 0 Paenibacillus macquariensis: 1 1 2 0 11 6 0 5 1 3 8 5 4 4 1 0 8 2 7 10 2 3 1 4 0 1 2 11 0 5 10 11 8 2 15 11 4 1 11 8 7 4 9 9 2 0 6 14 5 1 20 0 7 1 3 5 4 3 8 15 11 0 1 0 0 Paenibacillus polymyxa: 13 29 45 24 58 22 11 36 42 128 59 40 82 51 89 44 69 96 65 93 85 94 72 55 34 66 75 102 119 69 99 136 158 73 131 104 68 104 67 156 135 155 197 105 93 50 81 159 139 135 217 105 149 10 20 96 127 23 125 181 123 121 6 5 2 Pantoea citrea: 1 0 4 11 16 3 3 4 7 44 4 9 8 15 4 3 17 3 8 11 18 4 9 15 6 32 13 12 21 20 11 11 18 15 31 5 12 15 19 21 6 14 17 10 23 3 11 12 9 18 23 10 14 6 4 15 21 9 20 17 20 22 1 0 0 Pantoea dispersa: 1 1 4 7 0 1 0 0 3 10 7 5 6 2 3 3 2 5 2 1 8 5 2 1 4 6 2 5 8 9 5 0 5 6 5 2 2 5 8 3 2 2 3 0 9 3 6 11 4 4 5 1 2 2 3 3 9 2 3 2 5 1 0 1 0 Paracoccus denitrificans: 147 76 1542 645 157 29 121 23 448 3031 345 5 229 36 356 960 35 526 18 52 1515 642 36 73 901 1287 83 285 2773 1951 167 121 2816 601 212 33 1451 1461 121 222 1120 931 178 191 1018 421 536 822 1552 1712 621 497 674 478 37 1522 231 24 2037 91 1354 845 18 22 107 Paracoccus versutus: 13 15 132 72 27 12 18 4 55 240 39 3 27 15 43 60 13 54 9 14 101 50 8 14 63 99 22 40 237 174 29 18 185 62 27 5 115 94 14 21 94 57 20 19 83 44 36 77 127 134 76 43 37 40 7 95 21 9 144 17 93 43 1 2 10 Pasteurella haemolytica: 52 106 200 66 296 113 24 187 114 178 300 1015 336 293 101 161 283 239 232 271 405 159 330 218 54 203 165 677 391 273 489 180 408 195 649 372 123 424 363 1418 189 422 762 732 245 184 212 1014 377 251 915 177 419 51 73 202 523 95 326 986 363 191 36 10 6 Pasteurella haemolytica serotype 1: 2 0 8 0 11 0 1 2 3 1 3 29 3 9 2 2 3 1 1 7 10 0 9 3 2 7 6 16 5 8 14 1 9 2 18 7 7 7 10 26 0 13 5 15 2 9 8 30 6 6 11 8 8 1 5 8 6 1 8 14 13 7 2 0 0 Pasteurella haemolytica-like sp.: 4 11 17 6 35 21 9 25 22 16 48 104 43 43 14 5 45 21 37 33 36 13 49 16 2 17 14 70 27 16 56 28 44 19 77 38 12 35 58 146 20 39 85 96 20 13 30 113 35 27 95 20 46 4 2 16 64 17 46 128 30 24 4 0 0 Pasteurella multocida: 25 79 129 24 210 96 15 120 88 105 228 538 127 163 82 72 194 123 166 237 157 98 150 149 39 72 228 325 179 174 266 193 150 129 304 202 103 197 204 574 118 188 401 428 116 48 151 683 156 136 505 89 329 24 64 153 373 162 190 456 295 136 18 3 4 Pectinatus frisingensis: 1 1 6 1 9 2 1 0 0 9 10 4 15 8 5 1 6 2 3 13 4 3 13 9 1 8 7 15 5 3 14 7 6 8 24 19 3 3 16 15 9 1 9 2 19 3 6 29 5 7 21 2 10 0 1 7 10 15 4 18 11 2 1 0 0 Pediococcus acidilactici: 12 11 15 13 36 9 7 49 15 11 51 120 65 34 9 17 53 19 35 40 46 20 100 45 6 6 34 79 36 13 108 34 29 25 94 47 27 12 115 147 77 57 107 114 37 26 60 140 21 60 104 53 60 12 14 38 85 33 71 142 70 32 3 9 0 Pediococcus halophilus: 2 6 2 1 2 20 1 3 2 2 13 21 5 8 1 4 6 6 8 8 3 3 9 6 1 4 6 11 5 1 6 3 6 3 9 2 3 1 15 40 14 3 21 21 9 2 2 34 5 4 27 4 12 0 0 4 20 8 3 15 9 6 2 0 0 Pediococcus pentosaceus: 21 90 78 72 105 27 8 128 88 108 99 361 172 163 46 67 79 82 127 137 136 176 232 173 83 103 73 198 187 161 264 88 173 105 335 92 194 104 269 293 166 166 305 333 185 97 174 315 104 162 382 117 295 21 43 134 308 37 215 376 239 132 14 4 3 Pelobacter carbinolicus: 12 4 60 22 56 4 8 4 58 148 32 2 46 14 84 24 16 32 18 6 138 28 20 0 68 68 38 42 202 56 132 24 186 32 160 32 94 106 110 90 152 62 34 12 78 36 40 196 116 120 114 48 42 44 32 100 20 4 180 36 150 22 6 0 6 Peptostreptococcus asaccharolyticus: 3 1 0 0 2 30 0 10 1 0 20 27 6 16 8 1 14 5 9 20 6 4 30 20 2 2 4 37 10 4 37 50 11 3 30 35 5 9 27 46 11 19 29 20 0 5 5 68 10 9 32 14 22 5 6 17 17 25 23 20 27 9 2 1 0 Peptostreptococcus magnus: 5 0 0 1 5 37 4 10 0 1 21 129 11 56 1 0 20 14 8 127 2 2 80 106 2 1 32 223 3 11 124 88 21 0 78 64 1 2 59 337 57 70 84 46 1 8 16 396 3 58 124 51 63 0 0 32 45 21 61 53 18 10 4 0 0 Phormidium foveolarum: 2 0 1 1 0 3 1 6 6 5 2 3 4 2 5 1 6 4 8 2 2 3 6 2 1 3 2 7 0 1 6 3 3 1 2 3 1 5 3 4 2 5 4 6 0 0 2 5 4 5 0 1 3 3 2 6 1 9 0 10 9 3 0 1 1 Phormidium laminosum: 9 19 77 28 22 8 10 35 50 132 13 9 35 10 27 40 25 48 19 5 54 48 13 17 73 60 32 45 104 80 50 23 116 41 48 19 44 105 37 49 83 70 40 36 77 30 13 90 55 81 64 35 20 24 10 47 56 2 93 77 71 43 2 3 4 Photobacterium damsela subsp. piscicida: 6 9 29 18 20 10 2 9 30 106 25 17 30 26 15 22 10 17 15 18 33 24 13 6 19 36 22 49 49 93 29 20 41 35 36 12 40 41 25 37 13 19 30 22 38 10 24 33 31 36 54 15 30 8 13 48 58 13 50 40 45 28 2 1 3 Photobacterium leiognathi: 18 38 30 11 111 24 3 89 40 33 82 190 54 134 16 26 76 66 81 100 75 50 89 75 10 28 60 122 40 64 105 54 68 36 167 98 60 59 145 270 56 109 215 160 54 55 103 284 82 71 279 79 117 18 53 92 154 60 117 278 148 55 14 4 0 Photobacterium phosphoreum: 13 19 25 4 80 13 3 44 16 11 75 155 30 78 6 12 54 18 74 84 33 33 86 46 2 20 38 69 27 31 99 43 44 14 119 75 34 24 136 171 44 48 194 84 46 20 72 187 67 27 208 32 89 19 34 42 111 41 44 192 95 28 10 1 2 Photobacterium sp.: 11 15 25 8 77 11 4 37 16 37 43 64 55 42 5 18 47 34 48 36 24 29 59 43 9 26 43 83 26 53 99 19 46 25 106 65 54 43 95 85 38 45 74 87 40 11 28 134 42 46 134 41 50 8 15 37 43 30 25 103 55 23 6 3 2 Photobacterium sp. SS9: 1 0 1 0 8 1 0 11 0 1 7 0 0 5 0 1 15 13 0 9 1 0 12 0 0 0 0 23 0 4 16 0 8 0 25 9 1 2 8 10 6 22 3 6 1 1 0 13 5 18 14 23 1 0 0 15 5 0 7 4 6 0 1 0 0 Photorhabdus luminescens: 4 2 16 3 49 3 0 5 1 47 10 14 30 15 0 2 23 15 11 17 10 7 25 16 4 9 9 31 10 23 37 4 24 8 50 24 9 21 48 49 13 11 21 16 22 5 19 63 24 12 60 6 20 0 5 16 17 2 27 54 32 5 3 1 0 Pimelobacter sp.: 1 0 23 16 3 0 1 0 23 31 0 0 0 0 7 9 0 5 2 0 14 15 0 0 18 26 0 0 11 17 0 0 37 10 2 1 23 18 0 0 7 20 0 0 17 15 0 1 39 49 2 23 1 3 0 32 0 0 22 0 15 15 0 0 1 Planobispora rosea: 3 1 20 8 18 0 1 0 31 28 0 0 1 0 6 8 0 8 0 0 53 17 5 0 17 34 0 0 32 20 15 3 45 2 16 0 54 25 2 0 62 27 1 0 25 26 2 2 75 58 0 16 2 5 0 24 0 1 66 3 29 2 0 2 1 Plasmid ColA: 6 8 9 19 19 7 8 5 13 47 19 8 6 11 10 9 13 22 15 10 19 17 8 7 2 12 10 36 33 32 37 21 15 23 25 8 13 24 23 37 24 31 38 10 45 6 9 37 36 17 32 5 10 1 4 7 13 7 19 21 40 15 3 1 2 Plasmid ColB2: 1 0 2 0 1 0 0 0 1 8 1 1 0 1 1 0 3 1 2 0 3 1 1 0 1 2 0 4 3 2 9 0 2 0 5 1 5 2 11 4 5 2 2 1 3 0 0 1 0 2 0 1 0 0 0 5 4 0 3 1 10 1 0 0 1 Plasmid ColB4: 2 2 1 1 6 7 3 0 3 2 9 1 1 4 1 1 3 3 5 4 1 3 1 1 0 1 2 3 3 2 1 4 1 1 2 3 3 5 5 11 4 6 5 0 5 0 3 12 11 2 11 0 5 0 1 2 7 4 3 5 6 0 1 1 0 Plasmid ColBM-Cl139: 5 3 10 11 5 12 7 0 11 34 22 11 1 7 8 5 9 13 11 24 6 16 11 11 6 19 12 18 27 16 19 10 16 7 27 10 20 11 25 36 14 14 20 7 28 12 15 33 18 14 30 18 25 3 4 9 23 6 16 26 32 16 4 0 1 Plasmid ColE1: 28 35 55 55 60 52 47 36 49 99 80 49 45 41 39 23 43 64 39 73 41 42 38 25 20 39 29 106 66 58 120 69 47 54 56 36 38 71 62 156 95 69 80 33 130 23 36 162 99 53 99 43 56 31 35 48 77 56 55 62 73 41 14 5 11 Plasmid ColE2: 3 8 9 5 7 5 4 0 1 10 10 12 3 18 5 5 3 6 16 9 7 8 7 14 3 10 9 26 6 12 28 12 13 8 45 13 5 9 22 36 22 9 31 7 21 3 11 29 12 10 46 0 9 0 2 3 18 5 3 24 11 9 2 0 1 Plasmid ColE3-CA38: 6 8 6 2 10 3 3 6 3 8 16 10 8 21 7 7 7 10 18 11 7 7 13 15 3 13 15 24 9 9 27 16 15 12 64 13 3 10 33 51 22 13 48 9 24 2 14 38 23 10 69 7 19 2 3 3 33 9 6 31 14 16 1 0 5 Plasmid ColE5-099: 2 0 0 0 1 1 1 1 0 4 4 6 4 7 3 0 0 0 1 4 1 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1072 721 184 420 633 802 1111 1071 315 1231 979 1006 261 1257 1010 449 729 1045 1064 1492 1113 1344 570 824 334 402 1622 959 995 1434 796 1202 230 248 1131 414 396 1247 761 920 537 50 8 14 Prevotella intermedia: 2 9 7 5 10 15 4 4 8 21 11 14 24 13 13 5 16 10 13 19 7 7 12 9 10 10 6 21 14 10 12 18 20 9 10 18 12 16 9 36 31 27 31 26 13 10 11 41 19 28 30 25 26 10 3 17 17 32 29 35 20 11 1 1 0 Prevotella loescheii: 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 2 0 1 1 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 1 1 4 2 2 0 2 1 0 0 1 7 1 2 3 1 2 1 0 0 1 0 1 2 1 0 1 0 0 Prevotella melaninogenica: 1 0 2 1 11 2 2 1 3 4 7 2 10 2 0 3 3 3 5 5 3 5 3 3 1 2 9 5 0 2 8 8 2 2 11 4 1 3 7 8 15 5 12 4 2 2 3 18 16 4 13 5 12 2 1 8 10 5 8 17 14 3 1 0 0 Prevotella ruminicola: 19 20 33 9 128 39 18 30 69 126 161 97 163 96 36 64 190 57 134 178 117 69 211 87 28 34 175 198 123 34 379 122 115 31 403 195 69 100 242 289 332 175 388 114 225 48 130 281 232 150 452 83 321 34 79 145 207 109 195 281 238 185 13 0 5 Prochlorococcus marinus: 14 30 16 3 30 92 23 51 12 10 111 120 69 82 21 12 97 29 65 66 37 8 79 73 17 4 84 135 36 15 141 87 64 36 108 66 28 23 113 146 66 47 148 98 35 21 58 141 59 40 136 25 93 11 31 50 122 80 35 156 88 70 7 3 4 Prochlorococcus sp.: 1 0 0 0 5 2 0 3 2 2 13 7 8 6 3 0 5 0 3 7 7 0 10 4 0 1 7 12 5 0 21 13 5 3 16 5 6 1 12 5 3 5 10 5 5 5 11 6 4 8 10 4 5 1 1 15 13 4 1 16 8 12 0 0 1 Prochloron didemni: 3 5 9 12 5 3 0 8 5 20 2 17 21 0 4 4 18 3 3 8 16 5 28 5 9 2 17 11 19 10 33 21 17 15 27 19 4 20 19 17 17 13 15 18 17 7 5 31 15 21 28 8 9 1 0 16 17 2 15 30 20 7 2 1 0 Prochlorothrix hollandica: 22 22 139 64 72 4 8 57 134 245 48 46 93 7 132 28 59 70 26 13 222 29 35 9 207 35 59 63 265 70 162 59 177 76 268 31 110 179 104 69 87 164 42 73 90 138 40 188 115 107 132 124 68 39 36 243 138 3 196 130 153 143 14 2 5 Prokaryota: 2 2 15 14 3 2 7 1 23 34 11 1 11 3 3 10 1 9 0 8 8 7 7 1 4 19 4 12 39 35 8 9 34 15 7 4 17 12 8 4 3 8 5 5 14 7 3 9 13 18 11 6 5 3 2 24 5 3 19 10 19 11 0 0 1 Propionibacterium acnes: 2 13 20 13 16 7 5 4 27 34 6 2 5 6 33 25 9 11 2 6 45 19 8 10 36 20 2 14 72 33 14 18 39 19 16 3 51 20 5 4 31 23 5 3 24 22 8 8 27 59 15 25 4 10 2 28 2 2 39 5 28 29 1 0 1 Propionibacterium freudenreichii: 13 27 175 72 43 2 5 1 127 344 15 0 42 8 81 88 0 71 15 3 176 87 10 14 132 131 7 44 459 185 34 36 272 92 53 8 147 263 21 1 87 54 24 16 111 90 25 26 163 245 80 57 20 24 6 151 3 0 190 1 122 73 1 3 9 Propionibacterium shermanii: 6 11 109 22 45 2 7 2 73 139 13 0 17 11 47 59 5 34 6 7 115 49 7 9 62 88 14 43 218 54 30 14 147 20 59 4 110 89 27 3 135 66 19 5 98 42 14 31 179 144 62 57 20 11 9 100 3 3 114 24 80 40 0 1 5 Propionigenium modestum: 18 0 0 0 3 98 14 68 11 39 122 105 24 78 7 10 40 15 33 74 12 15 81 52 2 40 57 154 59 33 105 143 11 64 68 115 11 42 117 216 81 54 70 83 42 13 14 179 107 55 97 58 58 4 5 95 144 95 136 101 159 16 6 5 7 Proteus mirabilis: 72 99 231 40 435 120 26 240 137 209 276 974 255 372 80 94 417 240 386 451 345 208 428 249 113 98 349 609 274 303 538 269 324 211 816 330 207 283 572 1025 168 399 909 875 208 103 353 818 335 202 987 150 530 59 136 168 609 202 369 843 440 203 53 8 11 Proteus vulgaris: 43 63 110 25 239 86 12 118 67 166 146 449 99 166 32 36 159 91 124 214 120 89 187 175 42 64 175 308 125 175 290 112 195 70 368 154 110 146 313 539 109 185 327 310 105 92 165 520 166 136 419 121 255 46 83 126 330 144 174 473 324 154 26 8 8 Providencia rettgeri: 2 4 2 0 12 1 1 6 5 6 10 24 10 5 4 3 4 6 5 8 8 8 10 12 2 6 10 26 5 14 8 0 8 11 17 5 5 14 19 42 5 8 20 22 13 5 10 27 13 11 32 4 17 3 4 6 17 5 6 25 15 8 2 0 0 Providencia stuartii: 12 29 44 10 98 24 12 67 40 54 86 189 91 69 24 29 65 37 55 49 50 39 64 58 30 25 64 97 68 86 132 33 74 53 123 70 56 59 116 181 35 51 125 150 55 28 54 175 81 41 158 36 102 12 23 59 131 49 97 188 102 56 10 1 1 Pseudanabaena sp.: 12 10 43 15 47 25 5 33 33 11 35 67 72 16 34 15 48 40 28 33 47 8 33 22 13 4 50 104 49 53 134 28 37 11 62 54 22 20 55 47 43 38 66 64 18 12 16 110 26 45 105 42 50 23 12 18 39 9 85 63 51 16 7 5 0 Pseudoalteromonas haloplanktis: 1 2 5 1 3 2 0 4 2 3 6 11 3 7 1 5 6 12 12 9 10 4 7 8 1 2 3 15 7 7 14 6 19 8 14 15 2 6 10 13 2 14 28 15 4 3 9 12 7 7 21 6 13 0 8 0 20 2 4 16 10 12 0 0 0 Pseudomonas: 4 4 47 18 11 2 1 1 56 61 7 1 9 3 11 43 0 34 3 5 37 58 0 0 12 56 0 22 71 112 6 4 99 20 21 4 34 62 7 6 49 42 9 12 63 18 9 28 28 61 29 33 20 10 1 37 6 0 49 10 35 18 2 0 2 Pseudomonas ADP: 1 2 15 10 7 3 2 0 9 11 7 1 8 4 2 6 1 8 2 4 5 10 2 5 7 3 3 4 19 22 8 12 8 9 6 2 11 28 7 1 8 11 6 6 10 11 9 9 18 13 17 8 6 2 2 6 5 1 15 9 21 6 0 1 0 Pseudomonas aeruginosa: 684 792 8909 2859 1944 244 576 534 4947 15116 1142 289 2447 377 2953 3114 483 5218 937 499 7407 1537 818 737 2575 6435 883 1685 12829 7666 1974 1169 11928 2095 2515 1137 6035 6956 1312 1522 6526 5450 1277 1691 8050 3034 1412 5388 7892 8746 2954 4236 1489 1718 321 6834 922 405 8160 1307 4685 2907 115 72 494 Pseudomonas alcaligenes: 14 58 230 111 68 13 20 27 84 310 43 11 54 21 29 65 7 127 17 18 103 73 19 51 69 133 41 78 256 146 64 25 206 49 51 34 96 143 28 51 134 98 35 66 191 106 53 102 175 153 73 92 28 53 11 86 24 8 120 25 86 69 4 2 8 Pseudomonas alginovora: 1 0 0 0 2 3 1 3 1 0 9 3 0 5 0 1 9 5 7 7 3 3 6 1 0 0 3 4 2 0 3 3 4 1 14 3 1 0 6 15 2 8 7 7 1 2 2 10 3 0 18 3 10 1 2 2 7 5 0 9 2 4 1 0 0 Pseudomonas amyloderamosa: 2 8 32 14 8 0 3 1 18 35 7 0 24 5 20 27 4 33 13 4 35 33 3 9 17 29 5 23 39 70 4 3 64 14 25 7 17 50 9 5 19 50 19 8 35 14 8 13 22 33 30 40 21 15 4 24 8 0 34 8 20 25 0 1 1 Pseudomonas aureofaciens: 11 12 128 39 32 4 7 6 42 189 15 12 38 12 32 39 7 90 21 9 104 34 16 18 67 85 18 18 176 88 24 14 156 37 36 19 71 109 17 43 58 73 31 42 101 58 44 113 103 114 53 54 30 27 14 81 42 3 128 29 87 50 3 3 5 Pseudomonas azelaica: 4 20 29 20 25 4 3 12 28 42 34 10 39 14 16 24 21 27 20 16 23 24 17 11 16 23 18 27 48 48 43 13 49 40 43 20 34 33 36 34 35 24 38 23 36 25 33 49 70 39 59 22 21 8 14 36 33 13 43 42 45 25 1 2 1 Pseudomonas chlororaphis: 4 7 46 12 7 1 3 2 32 70 10 4 26 5 17 16 3 28 7 9 40 22 4 11 23 33 8 22 58 50 10 9 73 14 17 1 48 39 13 18 19 28 5 23 42 26 15 42 34 51 31 35 10 15 2 25 15 2 37 13 33 24 0 0 4 Pseudomonas fluorescens: 158 239 1717 546 644 72 138 144 934 3268 357 133 989 287 810 757 250 1411 499 286 1894 612 397 365 710 1276 355 732 2870 1585 699 350 2832 576 1153 411 1189 1851 565 745 1235 1450 698 782 1569 820 486 1625 1321 1870 1181 1074 579 530 184 1448 586 126 1901 738 1258 958 61 13 84 Pseudomonas fragi: 7 6 45 8 29 3 3 1 23 105 13 4 36 8 22 35 5 35 4 3 48 16 16 9 12 51 14 33 108 50 33 6 117 11 59 16 44 62 35 46 61 59 24 26 50 38 12 64 39 70 34 25 13 21 2 55 21 2 89 24 66 13 3 1 3 Pseudomonas glumae: 2 0 31 11 2 1 4 0 34 28 3 0 5 0 4 18 0 14 0 0 26 22 1 0 11 24 1 2 48 92 1 2 48 12 2 0 16 31 0 0 10 14 2 5 41 6 6 4 16 31 10 8 7 3 2 15 0 0 18 0 11 8 0 1 1 Pseudomonas hydrogenothermophila: 3 2 36 6 10 0 0 0 40 12 6 0 8 1 8 13 3 9 1 2 35 7 2 2 14 28 2 2 22 50 5 5 33 17 9 2 31 20 6 35 15 23 0 14 10 16 6 40 21 48 7 29 7 12 3 29 3 1 50 1 29 17 2 0 1 Pseudomonas hydrogenovora: 9 13 63 33 31 5 9 4 61 97 15 1 14 11 14 63 6 21 9 9 44 46 3 14 15 109 10 31 71 92 17 15 115 15 33 16 59 85 14 6 47 32 34 22 56 38 29 43 71 76 55 39 23 23 19 57 14 7 92 21 55 48 2 2 5 Pseudomonas incognita: 1 4 11 5 11 1 1 1 5 23 10 0 6 2 5 5 5 2 4 0 7 6 6 5 1 10 9 8 6 7 7 4 9 7 8 3 7 9 14 4 8 13 6 1 14 5 4 17 15 12 11 2 5 2 2 12 6 0 8 11 8 6 0 0 1 Pseudomonas lemoignei: 7 6 46 6 24 5 0 0 33 91 14 2 36 11 49 65 13 80 17 13 167 81 46 14 28 71 19 54 132 94 48 12 206 17 49 17 81 81 19 20 77 93 54 38 68 21 30 39 23 56 56 61 61 40 10 64 12 2 78 22 65 39 6 0 1 Pseudomonas marginalis: 3 0 21 3 12 0 0 0 13 36 3 0 7 5 16 21 3 35 11 9 54 13 6 6 17 9 1 12 49 31 14 2 70 7 25 6 25 26 8 29 43 54 25 6 16 16 15 23 14 44 24 33 10 9 0 28 14 0 56 10 9 18 2 0 1 Pseudomonas mendocina: 7 7 29 15 37 5 5 16 19 59 26 14 30 14 17 17 10 31 20 17 36 13 18 24 23 33 15 41 46 34 34 17 37 16 39 25 29 31 23 37 39 32 32 24 53 30 27 80 58 44 62 30 29 17 9 44 33 7 39 34 58 45 3 1 3 Pseudomonas mevalonii: 3 1 50 12 11 0 3 0 17 71 2 0 16 0 12 14 2 26 6 1 29 7 2 1 12 28 2 18 96 31 13 0 77 6 18 14 24 47 6 4 9 31 9 15 26 16 9 36 22 28 15 17 4 16 0 25 4 1 34 7 20 7 0 0 3 Pseudomonas oleovorans: 11 23 84 29 48 19 22 32 42 161 95 38 69 37 30 42 52 83 55 49 68 35 45 67 32 102 48 91 125 93 88 39 129 47 116 48 71 102 91 90 116 103 99 44 90 67 54 108 116 104 121 68 63 29 22 80 70 39 102 100 96 86 5 2 4 Pseudomonas pseudoalcaligenes: 18 18 181 50 36 14 14 7 83 267 35 8 75 17 58 82 15 90 27 10 157 57 13 27 80 111 36 60 299 157 44 35 305 69 66 18 131 195 52 61 113 101 38 27 142 113 43 144 169 198 98 100 42 56 8 128 66 5 197 56 161 88 4 3 11 Pseudomonas putida: 361 506 3747 1179 1760 205 265 401 1841 6621 1012 254 1821 433 1233 1674 473 2389 668 544 3525 1160 779 890 1254 2786 805 1700 6008 3193 1679 717 5566 1357 2438 964 2750 3840 1315 1453 3176 2885 1035 1277 3729 1917 1113 3575 4029 4393 2402 2242 1111 1162 366 3356 960 314 4363 1427 3083 1605 84 39 238 Pseudomonas pyrrocinia: 1 0 5 6 1 0 0 0 7 12 0 0 2 0 0 9 0 2 0 0 5 7 1 1 2 11 0 3 6 22 0 0 21 1 4 0 10 13 2 1 12 8 2 0 12 4 8 6 4 19 5 6 3 0 0 12 1 0 10 1 6 5 1 0 0 Pseudomonas saccharophila: 1 0 24 4 3 0 0 0 9 19 1 0 2 0 5 9 1 32 0 0 12 5 0 0 9 14 2 3 30 16 2 0 60 5 6 2 14 21 3 1 11 29 4 2 26 9 3 5 10 37 5 16 4 6 0 18 3 0 17 1 8 23 0 0 1 Pseudomonas sp.: 167 352 1633 678 644 144 227 229 1090 2392 558 264 785 294 618 864 290 1099 361 343 1363 936 374 414 765 1234 429 865 2410 2027 800 605 2684 764 977 433 1384 1685 685 768 1378 1263 654 717 1433 817 600 1577 1660 1868 1340 1006 647 590 201 1436 614 210 1747 789 1361 859 45 24 98 Pseudomonas sp. 113: 1 2 6 4 7 1 1 2 7 3 6 1 8 1 2 5 0 1 3 5 2 5 2 6 1 9 2 10 11 11 5 7 4 8 5 3 5 3 5 2 12 6 3 3 6 6 4 6 15 9 12 6 2 1 0 6 7 1 9 9 5 8 0 0 1 Pseudomonas sp. ADP: 1 2 15 13 3 1 1 0 8 27 10 0 1 0 3 2 1 10 1 2 22 1 3 4 11 12 2 3 34 13 4 1 23 13 10 0 9 33 3 1 4 12 2 0 11 11 6 11 11 12 19 9 2 11 0 4 20 0 10 8 10 6 0 0 1 Pseudomonas sp. B13: 2 4 17 5 7 4 1 3 13 23 7 0 17 2 4 5 1 10 4 5 7 12 3 8 17 10 4 14 25 31 13 13 22 6 10 4 10 25 5 3 12 5 6 8 14 12 8 13 19 15 15 11 12 5 0 10 4 3 13 12 13 4 0 0 2 Pseudomonas sp. DJ77: 8 10 57 32 9 2 4 5 37 72 22 2 22 4 17 39 7 37 8 8 59 28 10 5 26 58 14 27 115 83 29 20 99 45 35 16 84 52 34 10 50 38 19 9 34 28 20 67 52 79 61 20 25 16 7 70 14 4 99 25 54 23 1 0 7 Pseudomonas sp. JR1: 7 15 35 24 25 4 14 12 15 60 27 12 47 12 22 14 21 27 16 14 31 29 26 17 20 27 18 38 68 33 44 25 50 39 56 30 42 51 37 33 36 25 32 16 40 23 22 58 65 53 61 30 26 12 18 43 29 12 42 43 51 38 2 0 5 Pseudomonas sp. MA-1: 1 2 15 3 5 0 2 0 14 20 5 0 0 1 8 6 2 5 1 1 8 5 1 1 3 14 0 7 17 15 5 1 19 3 9 1 21 0 3 3 14 11 4 2 6 6 2 10 15 11 12 4 4 5 0 8 2 1 12 2 10 12 1 0 0 Pseudomonas sp. PyR19: 5 13 28 12 19 5 11 6 24 28 16 8 20 19 11 17 6 17 7 11 20 17 9 14 16 15 18 24 35 20 22 13 20 12 21 11 31 13 21 24 17 24 13 20 28 18 17 23 24 22 20 19 13 10 7 18 17 4 25 21 30 21 1 0 4 Pseudomonas sp. VLB120: 5 9 21 13 26 3 3 4 29 79 24 2 19 3 21 18 10 32 7 4 30 20 21 11 26 30 7 34 41 43 29 15 60 15 37 10 31 39 33 12 36 29 20 13 38 21 20 34 59 31 37 23 7 14 5 56 13 5 47 20 40 18 0 0 5 Pseudomonas stutzeri: 44 34 468 119 175 9 14 37 265 964 79 7 142 22 174 169 19 315 60 33 471 125 56 69 156 390 58 147 703 457 147 49 765 102 269 90 357 472 94 89 431 367 95 79 443 250 117 353 424 519 256 262 109 137 26 434 78 22 544 92 364 260 8 3 33 Pseudomonas syringae: 127 322 963 415 505 228 199 185 680 1972 427 202 777 312 473 667 250 963 526 348 1042 691 372 336 450 698 353 743 1553 1117 666 397 1610 496 833 377 802 925 480 670 781 788 515 590 1176 527 462 1185 1021 1198 1005 589 444 322 160 771 558 245 1069 572 935 477 36 24 67 Pseudomonas syringae pv. glycinea: 6 11 33 19 16 18 16 29 35 49 32 22 59 22 20 15 15 34 29 10 26 21 33 15 29 18 14 26 47 42 31 17 30 12 40 11 26 36 15 44 18 33 58 31 41 28 23 53 42 25 53 20 7 10 13 17 36 25 55 40 28 19 1 3 2 Pseudomonas syringae pv. lachrymans: 1 0 6 3 4 1 2 1 2 11 2 1 4 1 4 7 6 13 7 1 17 7 2 1 3 8 3 5 19 5 4 2 23 5 12 3 13 7 6 11 13 15 10 2 4 6 5 9 5 13 11 7 6 1 2 4 2 2 12 9 2 7 0 0 1 Pseudomonas syringae pv. phaseolicola: 5 12 48 7 25 11 8 9 21 77 20 9 40 24 24 30 23 62 25 11 41 19 20 17 35 30 17 38 100 58 43 10 74 15 52 14 41 43 36 46 67 63 39 35 62 21 21 70 47 66 72 25 10 10 6 39 21 14 60 35 47 17 2 1 2 Pseudomonas syringae pv. syringae: 30 27 188 54 115 12 18 13 113 451 68 13 136 27 75 110 22 143 51 35 190 89 49 50 82 152 56 100 311 210 115 33 272 79 132 53 188 176 73 112 168 140 65 89 216 91 66 220 199 246 141 96 48 57 17 170 68 21 227 87 186 84 6 0 24 Pseudomonas syringae pv. tabaci: 2 1 9 7 12 1 1 2 3 29 5 1 11 2 7 8 0 7 6 1 15 11 3 4 3 8 4 12 21 18 13 3 18 8 14 5 11 15 7 6 13 6 4 2 9 9 6 13 13 16 13 6 1 4 1 10 10 1 14 8 17 5 0 0 2 Pseudomonas syringae pv. tomato: 2 8 16 13 11 4 4 2 9 20 6 0 8 10 10 13 3 31 4 4 17 11 8 12 17 17 5 13 19 11 10 7 20 1 5 3 9 10 6 24 12 16 6 15 21 21 9 15 14 24 12 3 3 3 0 9 5 3 7 9 7 4 1 0 1 Pseudomonas thermocarboxydovorans: 4 5 50 9 12 3 1 1 14 71 6 1 19 6 14 19 8 16 5 7 56 19 6 9 32 34 9 31 108 40 19 10 84 14 18 8 36 53 8 29 46 22 11 24 35 27 22 51 28 54 19 24 16 23 3 30 13 3 56 13 44 9 0 0 4 Pseudomonas tolaasii: 4 5 100 15 30 4 0 0 65 191 19 7 61 3 21 36 5 50 13 2 95 25 5 6 28 51 14 13 117 66 14 0 124 7 6 9 31 76 16 25 44 73 21 44 86 36 13 100 70 96 40 15 7 20 2 29 9 4 79 30 47 15 1 1 2 Pseudomonas viridiflava: 4 4 54 13 22 0 3 3 33 128 8 0 25 4 27 31 6 62 5 5 100 19 3 4 12 46 5 21 96 62 23 4 100 7 31 7 57 45 9 24 64 70 28 9 69 28 14 69 32 69 43 41 2 14 1 30 14 4 81 29 31 20 0 2 2 Pseudomonas wisconsinensis: 3 2 33 11 16 2 2 4 15 62 11 0 10 4 15 9 4 22 8 1 36 4 3 3 11 25 4 13 57 28 9 1 41 8 13 3 20 37 3 3 20 21 11 13 47 12 3 19 31 18 26 19 9 4 4 26 1 1 17 6 10 11 1 0 2 Psychrobacter immobilis: 2 1 9 2 4 3 1 7 8 19 7 22 11 11 1 6 10 12 10 9 16 13 6 8 6 8 11 15 14 25 12 3 19 3 18 8 17 9 5 39 15 12 33 18 12 2 8 20 18 12 23 7 29 2 1 4 19 7 21 16 25 6 1 1 0 Psychrobacter sp.: 1 2 2 1 2 11 2 13 0 1 8 17 1 2 1 3 7 3 5 7 3 2 8 9 1 1 12 11 8 3 12 6 5 5 13 9 1 4 13 20 13 7 9 6 7 1 3 22 12 6 16 9 10 2 3 5 13 8 5 10 9 6 1 0 0 Pyrobaculum aerophilum: 1 1 4 0 2 6 3 6 4 2 1 11 7 5 7 3 6 6 3 8 4 5 4 3 8 3 3 9 15 13 8 4 26 8 3 10 4 12 11 15 12 9 7 7 3 4 2 4 9 12 9 7 15 3 2 0 7 13 2 11 5 4 2 0 0 Pyrobaculum islandicum: 4 0 2 4 6 24 14 18 16 10 18 7 12 3 3 5 4 9 3 14 7 10 8 19 16 22 10 17 23 29 12 18 48 17 13 22 16 31 11 29 58 11 8 6 14 10 1 11 64 35 13 20 13 7 16 19 18 38 12 20 18 24 2 1 1 Pyrococcus abyssi: 3 0 2 0 2 24 49 15 32 12 22 18 15 5 4 3 5 22 6 10 15 18 10 23 13 11 7 20 28 12 18 29 12 22 16 14 19 17 51 37 83 18 13 6 15 12 12 50 85 28 33 37 22 4 5 21 20 76 8 14 19 11 0 1 2 Pyrococcus endeavori: 1 1 0 0 1 12 6 3 11 0 10 1 0 1 2 0 0 9 1 7 11 2 3 16 0 0 3 15 9 3 12 18 2 0 15 4 9 2 20 1 33 13 2 3 9 4 0 7 28 14 11 17 4 0 1 7 3 13 8 10 13 10 0 0 1 Pyrococcus furiosus: 43 6 16 2 16 535 358 314 344 117 407 232 173 165 75 33 103 250 186 331 172 88 281 522 161 53 167 590 295 102 481 765 191 180 362 342 245 236 735 466 1048 421 292 203 197 213 129 888 935 473 597 543 409 47 129 415 347 648 235 529 457 357 8 8 27 Pyrococcus sp.: 20 6 85 24 20 166 350 86 382 142 199 51 64 58 53 43 35 186 37 62 154 122 66 123 133 149 58 147 326 114 152 240 257 163 130 93 287 119 313 169 661 257 54 28 147 137 44 275 709 328 197 354 120 34 30 317 120 363 236 135 209 147 6 2 12 Pyrococcus woesei: 12 3 2 0 4 145 94 58 89 17 97 52 44 33 16 8 26 52 45 74 30 13 71 137 30 7 41 119 70 23 122 155 25 32 91 104 52 51 165 115 241 89 56 45 64 55 24 229 183 100 115 90 66 8 16 85 68 144 78 153 113 37 5 2 5 Pyrodictium abyssi: 1 0 10 5 3 1 9 4 17 20 6 0 0 0 2 4 2 5 0 0 1 2 1 2 3 5 5 1 3 8 9 2 19 17 4 4 5 15 8 0 2 5 0 0 4 6 5 1 26 7 4 9 3 4 0 8 1 0 4 0 4 7 0 1 0 Pyrodictium occultum: 2 2 29 14 26 11 48 32 41 48 27 5 4 6 16 10 8 39 10 13 20 19 11 17 32 26 18 23 33 28 32 9 52 28 19 29 33 71 33 11 111 28 14 4 30 12 14 12 122 60 45 56 36 7 0 52 18 82 16 5 36 24 0 2 0 Rahnella aquatilis: 2 0 16 2 6 0 1 1 5 30 1 2 6 1 5 5 3 5 2 1 11 5 2 3 2 14 5 5 17 19 4 2 20 4 7 3 5 12 1 20 6 13 10 9 18 6 5 26 9 16 10 7 5 7 5 15 11 0 16 11 15 8 1 0 1 Ralstonia eutropha: 57 114 866 316 173 29 67 30 430 1461 120 9 213 54 218 433 35 361 52 72 636 480 71 87 305 668 81 282 1221 1107 183 126 1316 263 230 86 600 924 124 87 666 486 159 138 684 388 218 516 682 830 333 379 171 191 30 650 133 26 840 146 508 315 10 11 36 Ralstonia pickettii: 17 14 216 50 33 6 13 1 86 250 27 2 29 6 39 71 3 85 9 15 149 109 8 14 81 136 11 72 229 189 33 16 291 44 40 10 123 155 25 20 111 141 23 29 159 90 49 103 154 216 64 111 37 51 6 162 34 2 174 25 117 104 3 3 11 Ralstonia solanacearum: 12 18 223 80 33 6 8 7 101 377 9 1 45 8 62 101 4 125 17 12 151 136 14 11 80 155 16 52 289 255 29 20 270 52 43 11 147 234 18 15 110 131 47 23 175 65 46 87 149 193 81 78 41 42 4 150 24 0 194 18 111 56 2 3 7 Rarobacter faecitabidus: 1 1 11 0 2 0 2 1 15 14 2 0 2 3 7 14 2 7 2 3 15 22 0 1 7 3 0 7 31 18 4 9 35 6 9 2 21 17 5 8 43 28 6 2 18 8 1 3 9 17 9 8 2 12 1 9 0 1 18 1 4 17 1 0 0 Rathayibacter rathayi: 2 12 52 64 18 4 2 8 76 74 8 0 40 0 14 30 4 20 10 14 56 30 8 8 20 48 12 20 80 78 24 32 48 50 34 4 60 130 12 10 12 16 10 8 38 22 18 18 68 64 62 8 8 12 2 14 16 0 48 14 20 16 0 0 2 Renibacterium salmoninarum: 4 13 22 21 16 5 2 9 16 29 28 11 35 12 24 37 23 29 12 19 43 25 51 17 14 33 19 61 53 43 73 37 86 18 66 28 34 37 46 36 56 56 32 22 45 14 8 59 41 62 57 23 13 9 7 39 21 8 47 33 24 27 3 1 0 Rhizobiaceae: 2 9 17 8 17 7 7 4 14 26 21 8 14 10 15 13 12 12 11 12 15 16 14 13 11 11 7 24 24 20 20 17 33 4 15 9 17 12 16 20 21 12 17 15 16 6 8 24 21 27 19 12 14 6 6 15 23 11 22 16 16 7 0 0 2 Rhizobium: 1 0 15 10 3 0 1 0 11 17 2 0 0 1 1 9 0 2 0 0 9 7 0 0 3 9 0 1 13 9 2 3 20 1 0 0 16 8 0 5 5 9 2 0 3 2 4 6 8 11 5 5 2 1 0 5 1 1 16 2 4 0 0 0 0 Rhizobium BR816: 2 3 40 23 3 1 5 1 29 34 12 0 7 1 14 24 2 10 1 1 22 28 0 3 13 28 0 7 45 42 4 3 45 11 2 2 40 26 7 6 32 23 10 4 22 13 9 17 45 48 9 14 7 3 1 35 10 1 43 4 28 9 0 0 2 Rhizobium etli: 35 76 485 165 130 38 67 41 405 535 243 19 165 45 187 255 48 171 37 62 338 286 46 70 169 391 80 202 640 502 162 123 676 138 136 49 518 300 147 136 396 231 173 97 336 113 164 438 447 379 311 149 168 102 31 364 121 50 544 155 380 185 7 9 19 Rhizobium fredii: 23 64 140 99 74 48 57 52 177 207 154 31 106 58 70 118 56 96 53 67 92 97 55 94 78 149 68 139 207 223 148 92 200 88 85 50 156 124 99 90 141 103 54 94 169 82 85 184 190 185 170 52 66 54 29 148 94 61 166 93 156 71 3 8 12 Rhizobium galegae: 7 33 47 27 31 12 9 18 39 66 64 24 53 19 36 35 20 23 20 17 29 41 20 32 32 35 23 52 64 54 36 26 50 29 24 20 40 41 37 30 35 26 27 21 25 21 23 55 53 65 49 19 18 21 9 44 44 28 63 35 73 26 0 6 1 Rhizobium hedysari: 2 7 13 14 6 6 7 2 15 20 6 0 8 5 5 10 1 5 0 6 23 13 2 4 11 13 7 6 24 13 12 4 27 5 18 4 33 11 8 11 19 12 10 9 10 11 12 13 21 16 10 5 12 2 2 16 5 2 22 5 17 11 0 0 2 Rhizobium leguminosarum: 184 354 1615 901 481 189 299 221 1738 1986 898 109 699 287 670 1127 231 844 231 349 1236 1148 315 311 658 1366 344 955 2540 2130 810 591 2759 553 721 257 2068 1239 739 571 1453 1019 714 441 1324 599 676 1485 1642 1844 1391 662 684 492 140 1594 602 261 2419 688 1406 774 43 22 116 Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli: 4 10 60 23 13 9 8 2 58 63 21 0 9 2 21 29 2 24 4 5 28 29 5 3 14 38 5 22 72 51 8 10 68 11 18 1 54 41 10 6 32 29 18 8 53 12 20 50 53 55 35 8 12 9 2 31 16 2 49 16 37 9 1 0 3 Rhizobium leguminosarum bv. trifolii: 7 9 116 51 35 10 24 2 96 138 62 1 27 9 41 51 7 47 12 17 68 52 8 4 43 88 14 42 166 150 29 28 140 24 31 3 108 53 26 25 42 38 23 16 75 29 44 89 86 107 74 19 35 23 2 75 21 9 118 34 72 33 1 1 5 Rhizobium leguminosarum bv. viciae: 16 33 134 68 34 18 31 20 114 165 76 11 60 23 61 72 16 87 23 27 100 89 21 29 63 94 25 112 190 133 59 50 188 48 48 20 162 98 62 58 106 83 55 49 106 41 60 103 138 142 114 60 66 35 5 130 66 22 174 62 133 87 3 2 11 Rhizobium loti: 7 17 37 21 14 9 10 13 40 47 31 12 29 6 12 27 17 26 9 18 24 26 13 14 19 34 11 32 36 47 16 19 32 11 24 13 38 29 24 16 21 25 11 21 32 16 10 23 29 25 36 24 18 16 6 45 30 16 31 32 40 27 0 3 4 Rhizobium meliloti: 276 488 3218 1496 825 289 510 294 3491 3204 1499 102 767 301 1383 1947 331 1417 220 455 2020 1962 374 432 1059 2395 445 1549 4637 3771 1140 928 4449 993 1057 428 3596 1990 986 763 2660 1770 929 560 2431 1061 921 2458 3163 3247 1775 990 1045 765 184 2883 701 391 3838 871 2406 1111 53 40 182 Rhizobium phaseoli: 7 3 61 26 22 1 8 9 77 69 24 2 13 10 52 42 6 16 4 4 44 33 3 6 14 51 4 30 113 69 11 7 128 22 26 3 75 58 14 26 71 42 26 17 64 17 20 58 79 92 43 20 27 17 5 35 17 1 115 15 62 9 4 1 2 Rhizobium sp.: 76 206 831 402 272 113 157 90 721 847 377 57 288 146 306 405 108 363 107 156 521 425 124 179 311 623 183 433 955 838 321 253 1058 302 277 139 762 538 283 239 555 464 237 188 528 341 253 654 837 844 512 316 241 268 76 627 278 124 862 269 599 287 12 9 55 Rhizobium sp. NGR234: 416 1188 3873 2240 1341 580 869 675 3713 4243 2183 392 1947 863 1523 2216 737 1961 658 989 2454 2332 726 1050 1549 2983 978 2395 5183 4689 2051 1572 4752 1558 1674 756 3803 2836 1659 1478 3089 2175 1457 1396 2956 1530 1476 3364 4254 3976 3059 1461 1571 1057 363 3220 1547 724 4279 1689 2906 1802 83 70 263 Rhizobium trifolii: 10 16 56 20 27 15 11 7 49 67 36 7 32 8 34 23 17 30 7 14 44 30 10 17 29 48 19 31 99 60 30 32 80 19 26 13 61 27 21 23 48 29 28 22 33 28 19 55 51 59 71 18 12 30 5 53 22 15 88 22 60 28 3 1 3 Rhizobium tropici: 20 62 311 91 97 25 31 33 242 291 172 28 98 33 120 156 30 119 24 33 174 143 30 66 107 227 44 143 347 249 87 58 309 63 74 43 273 146 95 84 221 135 111 79 163 81 115 270 246 265 222 85 117 72 20 269 119 36 321 96 242 99 6 3 11 Rhodobacter blasticus: 11 2 132 56 32 1 1 0 26 256 45 0 11 3 28 102 7 38 1 6 122 53 2 4 64 95 6 18 237 152 19 9 212 44 23 2 67 146 38 26 142 76 16 14 117 50 24 135 79 147 61 35 35 18 4 96 17 0 157 23 88 28 2 2 7 Rhodobacter capsulatus: 331 153 3543 2170 623 48 138 26 1502 6822 1470 17 587 74 805 2588 150 1057 96 109 3328 2033 138 68 2037 3246 173 438 6120 6713 497 262 6048 2125 752 39 3300 3868 562 1012 2830 1866 539 543 2300 1010 1214 2931 3316 3365 2239 1034 1101 979 182 3098 743 27 4851 432 3111 1529 64 18 250 Rhodobacter sphaeroides: 239 186 2963 1811 308 57 194 30 3060 3522 552 10 148 62 712 1789 102 958 73 99 2140 1548 101 77 1660 2146 188 443 4574 3936 365 379 4284 1269 408 57 2172 2819 259 288 1935 1426 281 176 2046 999 663 1127 3457 2916 1191 839 724 653 69 2508 180 40 3365 203 2086 1130 22 18 199 Rhodobacter sphaeroides f. sp. denitrificans: 1 28 18 17 9 2 2 12 8 8 8 0 0 0 4 0 3 1 0 1 0 0 0 8 5 9 8 7 6 5 11 11 19 12 6 0 6 2 6 1 0 1 0 10 4 5 8 11 2 8 21 0 0 2 0 2 1 0 0 2 1 0 0 0 1 Rhodococcus corallinus: 1 9 15 1 1 1 2 2 16 9 3 1 1 6 11 16 3 6 1 13 19 11 3 7 14 12 2 14 24 16 3 10 12 2 4 5 10 14 2 8 3 7 2 7 6 15 3 13 9 26 6 5 1 8 1 6 2 0 24 5 15 4 0 1 0 Rhodococcus equi: 7 18 32 29 26 13 16 13 46 40 41 16 36 14 23 31 28 39 25 32 27 38 28 22 14 31 20 45 77 55 42 30 72 41 39 18 65 34 38 47 37 41 27 35 55 32 16 69 45 66 37 38 29 11 11 55 39 9 46 40 33 28 3 2 2 Rhodococcus erythropolis: 66 192 546 418 244 40 68 36 662 706 120 13 237 59 297 432 53 239 89 124 576 343 91 76 305 581 81 336 872 877 224 269 667 291 389 69 790 611 176 89 407 358 98 95 436 379 106 438 766 944 334 369 89 135 41 533 54 20 709 115 381 261 6 17 43 Rhodococcus fascians: 10 54 62 39 33 17 23 23 102 99 33 19 47 27 53 78 13 39 25 30 105 48 20 40 47 52 20 72 127 95 51 74 92 43 58 51 108 77 45 24 28 70 20 43 58 53 32 81 67 139 67 42 22 24 15 91 24 29 99 37 88 38 2 1 7 Rhodococcus globerulus: 14 26 84 70 47 9 20 14 129 122 30 2 54 18 61 74 17 53 18 19 123 62 32 14 47 109 22 53 158 120 59 59 147 58 106 22 172 107 51 10 97 61 38 13 93 74 17 72 158 166 77 98 19 29 14 135 15 5 150 28 101 61 2 2 10 Rhodococcus opacus: 13 27 109 62 35 11 16 7 135 136 29 6 42 13 47 86 10 57 17 20 129 73 18 16 68 90 17 47 189 149 17 55 170 57 59 15 182 139 26 30 111 69 33 24 100 64 32 111 180 156 77 68 21 56 16 105 19 10 177 33 85 52 4 1 8 Rhodococcus rhodochrous: 24 86 170 126 71 9 18 16 240 234 35 2 97 35 117 122 24 81 30 47 214 97 36 23 120 173 43 111 319 227 57 108 264 85 112 47 274 167 52 36 127 139 24 36 156 150 40 155 272 295 115 178 32 44 13 215 17 10 271 35 149 130 3 6 15 Rhodococcus ruber: 3 3 28 21 6 0 2 0 32 40 0 0 6 0 10 25 0 16 1 2 36 16 1 0 18 32 3 5 67 53 4 1 38 9 9 0 31 29 0 0 29 29 1 1 26 14 2 5 45 50 10 23 2 1 2 23 0 0 26 1 21 16 0 0 3 Rhodococcus sp.: 37 107 308 179 97 21 36 32 372 451 87 4 126 53 160 174 26 172 50 79 401 166 60 81 234 287 73 222 565 395 108 186 488 195 238 82 457 296 128 64 219 220 64 99 277 237 71 341 428 567 215 267 72 76 24 363 48 21 409 62 222 207 4 9 24 Rhodococcus sp. M5: 9 47 93 88 54 7 34 18 131 140 43 4 48 22 62 69 15 61 22 22 86 61 25 17 33 86 25 60 160 156 79 52 126 75 80 24 148 111 43 7 71 47 23 19 82 83 19 58 193 164 70 59 16 27 12 108 17 8 127 27 94 62 2 1 6 Rhodopseudomonas acidophila: 8 0 4 0 0 0 0 0 21 30 2 0 1 0 6 3 3 1 0 0 22 4 1 0 5 14 0 1 19 24 15 0 30 1 1 1 22 14 12 4 15 8 1 5 8 18 2 5 9 6 2 3 4 0 0 18 2 0 23 1 13 13 4 0 4 Rhodopseudomonas palustris: 35 28 363 211 62 6 16 17 298 562 38 4 69 11 84 220 9 150 21 16 311 160 22 26 76 323 17 96 507 493 76 44 628 92 102 28 331 314 42 68 269 169 91 52 217 141 67 194 345 375 166 143 118 109 14 310 38 5 478 57 262 110 11 3 21 Rhodopseudomonas sp.: 2 1 41 6 7 0 0 1 18 45 2 0 1 0 13 26 2 8 0 0 51 14 2 2 7 29 0 2 59 40 5 4 73 1 23 2 43 24 2 7 73 21 5 1 46 6 4 40 36 61 11 14 2 12 1 38 1 0 46 6 23 2 1 0 1 Rhodopseudomonas viridis: 7 0 38 10 25 1 0 0 42 85 16 1 6 0 11 42 6 17 1 2 37 37 9 0 11 76 5 8 43 60 39 10 82 12 28 1 54 34 26 5 49 33 7 4 39 25 9 28 37 38 18 36 24 16 4 74 5 0 59 15 27 50 3 0 4 Rhodospirillum centenum: 5 1 79 31 4 1 1 0 41 135 10 0 4 0 41 29 1 33 3 0 64 40 1 1 27 76 7 10 116 62 9 7 93 26 12 1 68 78 12 3 81 39 4 1 71 21 10 27 94 90 25 14 6 13 2 60 0 0 108 2 51 12 0 0 5 Rhodospirillum molischianum: 11 1 35 10 14 5 0 0 38 98 9 0 13 2 21 30 5 34 1 0 75 13 6 1 16 61 4 1 94 86 23 4 92 19 25 2 68 59 18 2 63 36 20 3 37 28 13 32 34 37 22 37 20 16 1 90 7 0 86 13 35 65 7 1 3 Rhodospirillum rubrum: 68 49 675 269 139 9 28 26 299 1198 225 3 232 22 203 441 37 293 31 14 719 236 17 29 405 541 54 30 1763 639 147 104 1212 302 227 24 762 622 203 113 643 326 151 121 459 263 210 449 614 553 428 168 294 192 50 647 135 12 997 123 594 228 30 14 24 Rhodospirillum salexigens: 1 0 3 1 1 0 0 1 0 4 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 6 1 0 0 1 2 0 0 5 5 2 0 11 1 0 0 3 4 0 1 6 4 1 2 4 1 0 5 4 12 1 1 3 1 0 8 1 1 7 1 7 1 0 0 1 Rhodothermus marinus: 9 48 207 145 71 7 8 9 111 307 55 9 34 11 43 71 12 86 15 28 99 145 16 21 115 160 32 49 299 141 51 66 234 77 50 40 112 217 44 58 66 109 55 26 227 95 40 144 246 189 104 123 60 32 15 124 54 3 172 59 79 119 1 3 5 Rhodothermus obamensis: 1 4 60 33 13 0 1 4 23 76 8 0 9 2 7 13 1 20 2 1 19 27 2 1 22 26 3 4 58 14 5 3 29 8 8 4 19 30 1 3 5 14 3 2 53 18 9 25 52 34 13 25 4 4 2 20 7 0 43 7 19 14 0 1 0 Rhodovulum sulfidophilum: 4 7 21 5 3 0 3 0 19 53 6 0 2 1 9 24 4 7 2 0 28 9 2 1 9 17 2 2 43 47 5 2 47 12 4 1 28 26 6 4 18 12 3 4 12 6 4 21 13 15 6 5 5 3 0 33 4 0 33 4 29 17 3 0 1 Rhopalosiphum padi endosymbiont: 1 3 2 0 12 7 0 6 0 0 4 30 2 6 1 1 20 0 6 7 2 4 16 7 0 1 7 19 5 2 33 19 3 1 31 25 3 1 29 39 4 7 17 12 1 0 3 43 3 4 30 2 6 0 0 2 6 7 1 24 22 0 1 0 0 Rickettsia conorii: 3 2 3 1 10 25 4 24 8 6 54 145 7 39 4 15 37 29 70 112 57 73 116 17 4 19 51 153 44 50 100 81 42 27 175 114 19 37 67 151 56 49 269 86 26 5 13 90 33 27 140 13 38 2 3 18 69 119 23 85 40 6 1 0 2 Rickettsia japonica: 3 1 4 1 11 31 2 15 3 3 56 126 5 30 4 9 48 28 61 102 32 15 126 20 3 16 43 112 31 18 138 57 32 13 189 82 20 14 85 133 39 81 189 102 33 9 12 95 26 34 109 15 36 2 4 27 61 82 30 87 36 5 1 0 2 Rickettsia peacockii: 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 3 0 1 0 0 1 1 4 0 3 2 7 1 0 0 3 8 2 3 6 0 1 2 6 1 0 0 4 3 0 1 8 3 0 0 2 1 1 1 6 1 1 0 0 1 3 4 1 7 2 2 0 1 0 Rickettsia prowazekii: 57 45 37 11 222 333 65 198 33 59 372 961 148 304 43 68 359 108 344 349 111 83 539 176 10 76 303 576 81 100 591 262 150 145 688 530 100 130 441 1259 296 188 1053 450 131 57 344 912 285 99 880 86 585 44 163 121 736 787 220 959 433 123 38 11 8 Rickettsia rickettsii: 9 4 6 1 28 62 3 48 5 8 107 288 19 68 8 25 81 62 129 250 108 90 290 21 11 28 73 279 75 71 297 160 98 57 490 232 50 62 207 229 70 169 512 180 42 19 48 95 35 66 236 38 98 6 15 58 177 213 92 185 76 16 5 2 2 Rickettsia tsutsugamushi: 18 13 31 18 77 107 38 50 20 25 150 252 146 139 7 17 211 34 178 138 8 3 182 91 2 50 222 306 23 67 434 237 89 116 322 239 44 85 305 428 162 78 416 274 222 19 93 311 147 82 408 30 176 13 43 48 172 277 29 325 240 28 7 11 0 Rickettsia typhi: 3 1 3 0 10 24 3 20 1 3 48 104 9 23 6 3 61 12 54 78 12 4 109 15 0 2 28 73 9 6 110 58 21 14 170 75 9 14 72 89 31 39 195 72 16 8 21 47 13 12 106 7 39 4 3 15 64 66 24 100 30 5 2 0 1 Riftia pachyptila endosymbiont: 3 5 30 23 16 0 5 5 34 83 12 1 20 4 11 17 3 17 5 4 36 10 8 2 8 38 5 11 31 45 12 12 33 18 13 6 12 40 7 15 39 18 13 6 57 6 23 25 82 30 49 9 11 4 8 31 23 5 68 11 25 12 0 0 3 Roseburia cecicola: 1 0 0 0 8 5 0 0 1 1 5 16 1 4 3 0 22 4 1 9 6 0 8 0 0 0 0 15 0 2 18 5 3 0 10 6 0 0 5 7 4 20 8 0 26 2 0 1 14 1 11 3 1 0 1 4 1 0 13 7 11 0 1 0 0 Roseobacter denitrificans: 1 0 3 3 1 0 0 0 2 5 1 0 0 1 1 2 0 2 1 3 10 5 1 1 4 6 2 2 9 8 2 0 9 4 6 0 5 11 2 1 3 11 6 3 5 2 3 12 6 5 5 4 4 3 1 5 3 1 10 2 7 6 0 0 0 Rubrivivax gelatinosus: 24 11 192 54 47 7 6 3 102 337 17 3 14 2 44 111 12 58 23 1 121 154 5 3 56 247 12 41 302 236 56 18 328 49 82 1 215 141 36 9 157 119 10 24 129 130 18 63 141 185 32 120 25 74 5 220 6 0 219 15 149 176 10 2 12 Ruminococcus albus: 17 13 45 9 54 105 42 12 66 208 143 25 17 71 73 47 55 92 41 162 122 35 86 22 94 25 58 226 69 77 172 99 217 16 149 153 52 71 129 143 239 185 130 16 140 41 40 236 207 191 234 114 113 41 39 157 71 233 134 43 179 104 10 2 5 Ruminococcus flavefaciens: 13 61 116 87 79 67 27 34 164 87 124 17 21 120 98 85 81 127 31 224 104 56 136 28 117 87 107 186 86 103 204 120 239 51 173 122 92 75 143 71 264 332 208 52 319 111 37 136 226 344 217 165 135 45 31 130 48 73 190 54 140 179 3 1 9 Ruminococcus sp.: 1 0 4 0 8 8 1 0 21 7 12 2 0 23 6 2 8 31 3 32 14 5 15 7 15 5 15 23 6 1 20 18 58 0 15 18 7 4 20 8 39 38 14 2 23 4 1 17 20 30 14 24 10 7 1 28 2 7 27 4 25 10 1 0 0 Saccharopolyspora erythraea: 57 94 1219 998 130 11 149 12 973 1913 48 1 199 28 547 726 8 435 35 26 1070 461 51 31 590 1179 52 187 2042 2042 132 238 1812 671 432 35 1398 1505 67 14 485 539 14 48 841 742 45 344 1826 1924 170 496 18 280 24 921 8 8 848 10 453 491 4 9 43 Saccharopolyspora hirsuta: 7 1 41 54 2 0 2 2 44 94 2 0 1 2 23 33 1 30 0 0 78 26 0 0 23 77 2 9 93 115 5 7 86 52 15 1 74 76 1 0 35 33 0 2 38 43 0 7 111 92 1 34 0 16 0 47 1 0 57 0 30 20 0 0 7 Salmonella abony: 1 3 1 2 2 2 3 1 0 3 4 2 3 2 2 4 3 1 1 2 0 2 3 1 0 3 2 1 1 2 6 3 4 1 3 2 1 4 6 6 4 0 14 3 4 0 1 8 2 4 5 3 6 2 2 1 6 3 5 6 6 2 1 0 0 Salmonella abortus-equi: 4 13 5 9 20 8 6 4 1 41 15 16 8 8 15 11 23 11 12 17 27 6 27 10 1 6 5 19 18 34 44 11 25 8 29 18 10 16 24 43 15 32 42 13 39 3 8 37 10 23 40 11 25 4 5 9 18 8 30 30 18 5 4 0 0 Salmonella austin: 1 2 5 4 7 1 2 3 3 9 4 4 0 3 5 2 4 10 1 4 2 5 1 2 5 5 3 3 12 10 5 2 6 0 1 0 5 1 5 4 3 0 1 3 5 7 5 5 3 5 7 1 1 1 1 1 9 5 5 5 3 6 1 0 0 Salmonella banana: 1 0 3 0 11 0 0 0 1 20 4 4 6 6 9 1 22 6 9 11 15 4 18 3 0 1 1 12 8 16 23 1 9 7 19 9 5 6 19 29 6 28 19 8 20 0 0 14 3 10 29 1 7 0 0 3 8 0 12 18 4 0 1 0 0 Salmonella berta: 1 0 3 0 11 0 0 0 2 19 4 6 5 6 9 1 19 6 5 8 18 4 21 3 0 1 1 8 8 18 26 1 9 7 20 7 6 8 18 26 9 29 21 7 20 0 0 17 3 10 27 1 7 0 0 3 8 1 11 16 4 0 1 0 0 Salmonella choleraesuis: 16 15 48 23 110 28 15 18 38 334 45 63 38 51 107 35 102 82 48 120 207 53 135 38 26 64 44 142 119 211 224 34 142 24 209 88 61 77 125 263 64 267 142 70 273 23 42 183 81 146 238 64 112 13 16 55 91 56 152 115 78 35 12 2 1 Salmonella choleraesuis choleraesuis (serotype paratyphi A): 1 0 2 0 12 0 0 1 3 26 1 2 3 1 12 3 13 9 0 7 28 3 18 2 0 2 3 10 8 17 28 3 10 1 23 3 6 7 17 24 7 34 9 6 27 1 1 18 3 12 21 3 8 0 0 6 2 0 17 10 5 0 0 0 0 Salmonella derby: 2 0 2 0 26 0 0 0 4 40 8 12 8 10 18 2 40 12 10 16 34 12 36 4 0 4 0 26 14 32 48 2 16 10 48 16 10 14 34 54 16 56 44 14 40 0 0 32 8 22 52 2 14 0 0 6 16 2 20 36 7 0 2 0 0 Salmonella dublin: 12 8 39 12 65 9 1 22 42 142 55 74 49 39 43 27 68 57 31 42 84 63 56 19 21 43 23 87 92 136 100 33 106 50 93 55 55 64 88 184 64 108 108 65 121 16 33 139 77 55 138 19 68 13 14 42 88 26 81 129 100 32 6 1 5 Salmonella enterica: 196 269 1051 402 1174 303 170 472 496 2288 911 1890 1084 819 618 621 933 775 736 620 1064 689 732 486 355 993 561 991 1189 1747 1006 514 1338 685 1226 868 741 1143 1175 2790 937 948 1685 1062 1922 373 1001 2692 1689 958 2516 574 1624 306 429 754 2096 957 1097 2161 1403 792 133 3 60 Salmonella enteritidis: 34 34 87 68 129 81 33 48 78 296 109 123 104 123 97 63 147 138 125 146 187 114 162 90 46 100 105 191 179 163 195 104 152 123 219 131 106 125 185 345 118 214 304 157 263 38 85 273 154 144 281 95 205 38 42 119 211 119 134 234 167 73 16 4 14 Salmonella gallinarum: 12 11 39 26 68 6 3 13 28 187 38 57 43 33 54 17 71 47 30 39 92 78 54 16 16 76 23 61 86 131 84 29 112 60 98 49 65 68 79 149 37 100 98 43 120 30 25 116 65 66 147 26 69 13 15 44 89 28 79 103 83 37 8 1 3 Salmonella gallinarum/pullorum: 1 0 2 0 12 0 0 0 2 20 4 6 4 5 9 1 20 6 5 8 16 6 20 2 0 2 0 14 9 15 23 1 9 5 22 8 4 7 16 28 7 27 21 7 20 0 0 17 3 9 30 1 7 0 0 3 8 1 11 18 4 0 1 0 0 Salmonella infantis: 2 5 2 2 7 21 4 9 3 2 18 26 14 11 2 4 15 8 13 10 3 5 10 18 4 5 12 12 4 6 14 12 6 7 17 9 5 5 17 45 6 10 29 18 5 2 11 39 17 9 27 7 13 1 5 13 17 15 10 21 14 10 2 0 0 Salmonella muenchen: 3 0 9 5 20 3 0 3 7 37 13 14 4 5 16 8 14 16 6 14 24 13 25 1 0 9 4 13 18 27 24 3 19 6 25 13 9 11 21 38 18 39 22 10 35 8 9 24 16 19 36 6 17 4 7 10 9 3 23 25 9 5 0 1 1 Salmonella newmexico: 1 0 4 0 11 0 0 1 2 19 2 6 6 6 11 2 20 7 4 10 14 7 17 2 0 1 0 14 3 14 28 3 10 2 24 8 3 5 18 25 7 28 21 4 24 0 0 15 4 6 32 2 6 0 0 4 7 1 13 16 5 0 1 0 0 Salmonella oranienberg: 2 2 6 2 14 0 3 2 6 22 4 6 9 7 11 3 21 8 8 14 16 6 19 7 1 3 3 17 12 26 27 2 16 13 19 11 10 7 22 30 9 29 20 8 22 3 0 20 17 15 37 4 11 3 1 5 10 3 20 19 7 7 2 0 0 Salmonella ordonez: 2 0 9 8 5 4 0 2 5 72 6 6 6 8 5 3 2 8 6 8 14 7 4 0 2 19 5 21 19 41 6 8 14 16 14 5 12 17 3 14 3 4 9 2 21 1 9 14 11 11 13 5 7 3 2 4 27 3 20 17 13 9 0 0 2 Salmonella othmarschen: 1 0 2 0 12 0 0 0 2 20 4 6 4 5 9 1 20 7 5 8 16 6 20 2 0 2 0 14 9 15 23 1 8 5 22 8 4 7 16 28 7 27 21 7 20 0 0 17 3 9 30 1 7 0 0 3 8 1 11 18 4 0 1 0 0 Salmonella pensacola: 1 0 3 0 11 0 0 0 1 21 4 4 5 6 8 1 23 5 9 10 15 4 18 3 0 1 1 14 7 15 25 1 7 7 20 8 5 6 20 28 7 29 18 8 20 0 0 14 4 9 30 2 6 0 0 3 8 0 12 18 4 0 1 0 0 Salmonella potsdam: 1 2 8 1 9 6 2 4 7 11 7 14 5 10 3 2 8 7 10 11 7 2 4 6 0 3 6 11 16 6 10 7 8 5 8 4 8 4 4 30 6 10 22 11 8 0 5 20 6 5 15 2 8 2 2 5 14 10 11 19 3 3 0 0 1 Salmonella pullorum: 3 0 6 0 31 1 0 2 10 64 17 20 11 16 26 5 46 19 12 18 43 17 43 6 0 13 1 36 35 41 57 5 38 15 62 19 17 25 46 70 21 65 45 18 40 2 2 44 11 21 69 8 24 4 2 21 26 6 42 62 26 4 3 0 0 Salmonella rubislaw: 1 0 1 0 13 1 0 1 2 27 0 5 4 3 13 1 15 5 2 10 17 6 26 2 0 2 3 18 6 16 25 3 12 0 24 5 5 3 17 22 5 34 6 7 26 2 0 13 3 12 23 5 6 0 0 4 3 1 13 12 3 0 0 0 0 Salmonella senftenberg: 3 3 5 5 13 1 1 3 8 32 10 19 22 9 4 3 9 8 3 5 9 12 4 2 7 10 8 9 6 18 8 8 17 14 9 9 14 12 15 14 8 7 12 6 16 3 8 32 12 6 18 3 14 4 3 4 21 7 9 20 19 13 1 0 2 Salmonella typhi: 59 79 363 113 408 119 65 160 179 847 304 390 299 185 200 235 231 360 190 193 468 349 245 122 129 322 172 402 511 631 355 202 608 235 422 265 338 434 419 801 312 449 565 330 615 133 260 782 453 415 757 248 474 91 96 312 491 173 460 666 548 215 44 2 13 Salmonella typhimurium: 720 809 5091 1518 4299 614 404 1005 2378 11843 2526 3062 2722 1502 2457 2169 1814 3910 1665 1401 5482 3961 1653 1324 1492 5378 1643 2968 6348 9045 3121 1855 7911 2640 4042 2612 4005 5621 3445 7690 2729 4816 3964 2785 7143 2157 2645 8269 4775 4797 7064 2715 3610 1457 1027 3476 4873 1282 5485 6382 6027 2840 436 60 222 Salmonella typhisuis: 3 3 5 4 12 1 1 3 7 33 10 20 21 9 4 3 9 8 3 5 9 12 4 2 7 10 8 8 4 20 8 8 18 14 8 9 13 12 17 13 8 8 11 7 17 3 8 32 12 6 18 3 14 4 4 4 21 7 10 19 19 13 1 0 2 Sclerotinia sclerotiorum: 2 0 2 2 2 0 2 0 26 2 8 0 8 0 71 3 22 10 0 0 51 0 31 20 2 0 1 14 27 0 26 26 18 1 62 0 33 2 38 2 38 40 0 7 0 11 0 5 12 12 20 16 0 12 4 16 0 0 38 7 2 8 2 0 0 Selenomonas ruminantium: 7 15 12 24 18 18 29 12 20 36 23 17 31 15 10 16 12 28 13 26 20 15 19 14 12 18 11 33 34 15 33 14 30 17 22 15 13 35 27 56 57 25 31 31 27 20 21 61 47 31 32 19 35 27 20 41 43 33 18 27 39 22 3 1 3 Serpulina hyodysenteriae: 11 4 3 0 14 116 8 9 1 2 78 141 34 59 5 0 74 21 43 86 5 1 105 30 0 6 63 57 7 2 154 80 27 6 123 131 1 11 111 247 47 40 141 50 32 11 43 225 42 40 180 30 100 4 18 45 85 154 42 91 75 23 9 2 0 Serratia: 1 5 5 0 0 0 1 1 2 7 3 1 4 2 2 2 1 4 1 4 7 1 2 5 1 4 0 4 3 5 3 7 3 3 2 3 4 2 5 2 2 3 4 5 5 0 2 6 10 5 5 5 2 1 0 2 1 1 3 2 4 5 1 0 0 Serratia entomophila: 2 1 19 6 10 2 3 1 4 31 4 6 13 5 4 2 2 10 1 2 8 7 3 3 2 4 7 2 7 14 3 4 10 10 7 6 9 8 6 23 7 9 9 9 9 3 4 25 23 13 18 6 8 0 2 6 15 6 13 17 11 4 2 0 0 Serratia liquefaciens: 3 4 18 9 6 6 0 1 7 31 5 5 7 2 7 10 5 20 4 0 18 12 2 2 3 16 5 6 27 30 5 4 29 6 9 4 5 18 6 15 9 20 17 12 19 14 6 23 7 22 19 15 9 5 2 11 9 6 18 13 14 7 2 0 1 Serratia marcescens: 148 117 1592 396 546 113 98 95 417 3527 286 290 699 209 718 737 356 1335 225 185 1745 676 303 210 261 1444 242 452 2319 2213 595 271 3034 621 786 336 950 1849 550 1442 998 1846 696 607 1880 593 428 1404 1168 1660 1410 944 772 358 116 1287 546 151 1785 677 1114 643 86 8 54 Serratia proteamaculans: 1 1 4 1 6 3 2 0 1 10 1 2 5 0 2 7 0 9 4 1 8 5 3 2 1 4 0 6 11 13 5 1 16 5 6 2 1 5 6 4 3 3 6 4 11 2 4 5 3 8 10 4 5 0 1 3 3 1 5 4 4 3 0 0 1 Serratia sp.: 1 1 5 2 4 0 0 0 1 23 1 1 2 2 10 7 4 14 0 1 28 1 4 0 1 8 1 2 24 17 6 1 29 7 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F1A: 1 0 3 0 6 0 0 0 2 1 0 2 2 1 0 1 3 2 5 2 4 1 2 8 1 3 7 2 3 6 14 1 5 1 13 2 3 2 2 6 5 4 5 21 32 1 0 3 6 5 7 3 6 0 0 1 2 0 4 1 5 4 0 1 0 Shewanella sp. PT99: 1 0 2 0 6 0 0 0 1 1 2 2 2 2 0 1 4 1 6 1 3 2 2 7 1 2 4 6 3 8 8 1 4 1 13 2 3 2 2 8 5 2 6 23 27 1 1 3 7 5 8 3 5 0 0 2 1 0 3 3 5 4 0 1 0 Shewanella sp. SC2A: 1 0 1 0 9 0 0 0 0 0 1 5 2 1 0 1 4 2 3 1 3 0 5 10 0 2 8 7 6 7 12 2 6 2 15 1 1 2 3 6 4 8 9 29 10 1 0 6 4 4 7 5 5 0 0 3 1 1 1 4 8 4 1 0 0 Shewanella sp. SCRC-2738: 9 21 113 9 122 26 4 183 61 104 192 208 90 153 14 53 121 204 114 119 159 61 204 179 13 74 122 325 186 178 303 30 267 29 270 130 81 141 206 283 168 228 204 337 120 81 83 323 214 176 329 130 120 24 57 109 215 42 164 254 214 60 6 2 1 Shigella boydii: 12 16 48 22 62 10 18 20 22 123 34 43 25 38 31 25 47 42 36 54 56 36 51 19 9 30 27 87 59 74 76 37 57 38 71 34 47 58 58 132 53 79 88 45 113 25 27 116 63 52 101 27 65 13 9 28 58 29 55 102 76 44 8 3 1 Shigella dysenteriae: 29 37 90 31 119 90 44 77 59 202 154 281 149 163 77 54 182 96 152 173 126 91 193 78 32 84 56 217 104 105 196 154 126 99 168 107 74 123 209 429 128 197 328 167 162 40 108 290 139 129 310 69 228 27 41 102 286 219 142 328 199 82 18 2 9 Shigella flexneri: 113 142 323 158 471 315 157 225 283 950 588 792 499 500 293 205 629 362 496 499 455 338 510 313 144 382 274 741 483 465 732 454 500 365 773 490 366 436 828 1416 493 609 1159 523 708 223 431 1271 624 542 1177 331 808 133 219 468 978 630 533 1270 733 331 76 11 26 Shigella flexneri 2a: 1 1 2 0 2 4 1 3 3 4 7 5 1 2 4 1 7 3 15 6 7 2 8 2 3 1 4 9 0 3 4 7 4 6 11 4 1 1 6 24 3 7 17 4 5 1 6 9 7 5 9 8 13 1 1 6 9 8 3 14 4 8 0 0 1 Shigella sonnei: 51 80 101 73 189 176 76 107 76 249 261 419 226 236 75 84 328 137 209 229 106 117 199 126 39 93 124 280 165 166 297 199 117 140 300 213 118 158 390 617 271 211 558 212 250 82 178 484 303 166 545 140 391 55 110 171 450 356 187 549 291 145 29 9 13 Shigella sp.: 1 4 6 3 8 3 2 0 6 9 7 3 2 5 1 4 2 6 1 2 1 3 3 3 4 10 4 9 10 11 8 2 6 5 1 4 3 5 3 14 5 7 5 2 7 4 3 10 4 5 9 13 2 2 5 6 2 0 6 7 2 8 0 0 1 Sinorhizobium fredii: 1 3 10 7 2 4 2 7 12 10 6 1 4 5 6 3 2 4 5 1 8 4 3 5 7 11 4 7 8 14 3 1 2 2 3 2 6 7 4 2 4 4 2 4 7 5 4 12 10 5 9 0 2 3 0 13 9 2 9 4 12 4 1 0 0 Sinorhizobium meliloti: 90 150 1218 617 284 96 205 46 1290 1230 537 21 221 94 528 768 87 592 85 120 714 747 77 105 462 993 142 486 1775 1453 379 306 1846 373 394 147 1306 702 328 233 846 689 315 199 935 342 327 876 1156 1275 660 333 387 219 33 973 223 105 1482 241 767 360 15 14 61 Sitobion avenae endosymbiont: 1 5 1 0 15 2 0 3 1 1 4 30 2 7 2 0 22 2 3 13 2 1 12 10 0 1 5 28 4 1 23 15 4 2 33 24 2 2 29 40 2 6 16 13 3 1 3 44 1 5 29 0 8 0 2 2 6 8 3 23 22 0 1 0 0 Sphingomonas HV3: 1 0 11 4 5 0 1 1 5 6 4 1 4 1 1 5 0 5 2 1 9 3 1 1 4 6 1 2 17 8 1 0 13 5 7 2 13 5 2 1 8 11 2 0 7 7 5 9 8 12 17 7 4 1 1 14 6 1 13 7 6 3 0 0 1 Sphingomonas S88: 23 18 398 132 45 2 6 8 301 555 48 0 37 4 92 207 4 182 9 14 302 219 15 7 151 253 18 83 452 497 34 39 536 96 55 34 330 333 34 14 230 171 77 34 319 97 64 137 242 271 133 77 115 43 5 325 24 5 425 47 170 114 2 0 21 Sphingomonas chlorophenolica: 1 1 22 9 1 0 4 0 6 32 4 0 6 0 8 7 0 12 0 2 17 11 0 1 10 12 1 4 20 23 3 3 37 3 2 1 13 17 1 2 14 16 6 1 21 4 9 22 13 32 7 6 12 7 0 16 0 1 26 3 16 11 0 0 1 Sphingomonas paucimobilis: 21 22 178 102 47 6 15 12 176 219 51 3 29 7 59 88 12 107 13 12 148 86 19 14 125 186 23 66 270 250 51 49 347 101 56 21 165 165 24 44 200 123 66 25 162 74 74 145 224 247 137 58 111 60 9 231 39 7 232 67 152 116 4 1 16 Sphingomonas sp.: 14 21 128 51 35 9 8 18 96 140 48 8 45 10 39 56 14 69 17 23 86 55 19 13 57 90 33 80 170 157 50 43 177 66 57 26 140 85 53 16 89 75 32 33 80 52 39 100 100 109 125 46 39 46 9 124 41 9 159 38 87 57 5 2 7 Sphingomonas yanoikuyae: 4 2 70 13 6 0 4 1 37 63 6 0 9 1 8 31 1 21 1 3 53 13 1 3 28 28 4 9 75 45 8 11 82 16 13 5 54 37 8 4 59 29 18 1 39 24 15 53 39 71 36 19 37 13 1 60 9 1 66 13 38 25 0 0 4 Spirochaeta aurantia: 3 7 26 20 1 0 11 1 54 23 3 0 8 0 11 21 4 13 2 1 27 5 4 1 40 6 2 3 75 7 14 12 38 9 14 1 31 32 6 5 42 29 1 6 29 13 1 25 34 60 4 37 0 5 0 30 10 0 42 6 16 6 1 1 1 Spiroplasma citri: 44 107 36 27 173 124 6 48 5 10 73 931 97 336 10 34 104 22 268 481 45 24 290 280 21 23 116 487 50 49 291 318 46 89 329 274 43 72 626 1202 118 141 823 511 30 23 153 827 91 92 667 46 475 14 83 47 561 208 46 1046 264 13 37 7 148 Spiroplasma kunkelii: 1 0 0 0 0 3 0 0 0 0 2 11 0 8 0 1 1 0 5 13 1 0 11 2 0 0 3 16 2 1 3 3 0 0 6 20 0 1 17 29 1 6 11 5 0 0 0 19 1 2 10 0 5 0 1 1 3 3 1 11 1 0 1 0 0 Spiroplasma phoeniceum: 1 0 0 0 0 2 0 0 0 0 2 10 0 8 0 1 0 0 3 13 1 0 9 4 0 0 3 26 1 0 5 4 1 1 7 16 0 2 16 25 1 6 11 8 0 0 0 12 0 3 11 0 5 0 1 1 4 2 1 10 1 0 1 0 0 Spiroplasma sp.: 1 0 0 0 0 16 0 3 1 1 7 16 9 15 1 0 9 2 3 6 1 0 8 4 0 0 4 5 2 1 9 8 1 2 13 7 1 0 11 39 8 3 27 11 1 2 1 31 3 6 13 3 13 0 2 2 13 11 2 17 7 1 1 0 4 Spirulina platensis: 21 38 127 78 106 22 24 69 72 159 60 110 151 51 84 36 101 44 69 50 156 37 149 36 95 66 79 102 118 88 263 95 90 79 198 104 83 128 188 202 107 107 132 158 113 72 73 303 141 110 255 85 139 24 36 77 149 38 166 240 180 86 10 7 4 Sporosarcina halophila: 1 0 0 0 2 0 0 1 0 0 2 1 0 1 1 0 2 0 1 0 0 0 2 0 0 0 1 0 0 0 6 4 0 0 5 4 0 0 2 2 1 4 1 8 5 0 0 4 1 0 2 2 0 0 0 2 0 0 2 0 3 0 1 0 0 Sporosarcina sp.: 1 5 9 6 10 0 2 3 11 9 6 0 8 1 3 3 4 3 2 1 11 8 1 2 8 3 4 5 12 17 7 6 4 6 4 2 4 9 8 0 12 8 5 5 5 3 3 7 18 15 10 12 7 2 2 8 1 0 12 4 11 5 0 1 0 Sporosarcina ureae: 3 5 5 0 9 0 1 5 6 3 10 8 6 12 5 3 1 5 4 13 2 7 8 5 1 3 6 15 7 8 11 20 15 2 16 13 10 8 7 19 13 28 7 18 14 1 8 23 7 14 14 6 9 0 5 9 8 0 17 13 16 1 3 0 0 Staphylococcus aureus: 471 704 429 103 2073 2127 329 1280 276 370 1778 7658 1986 3189 299 595 2292 990 2802 4530 428 1270 2896 2462 160 579 1940 4042 660 1105 3040 2463 1415 674 4962 3605 1001 1396 4180 11043 2509 2750 7431 5037 774 722 2564 8943 1789 2124 7220 1442 5291 197 642 1784 5024 3188 2038 7484 3678 1329 316 92 59 Staphylococcus capitis: 3 4 1 0 6 27 1 5 1 2 6 44 7 13 5 4 13 4 19 29 2 2 18 17 4 3 10 35 6 4 19 26 8 2 20 18 5 5 26 77 8 14 61 43 4 3 14 50 7 6 32 6 43 1 1 8 34 15 6 21 19 10 0 0 3 Staphylococcus carnosus: 19 9 28 1 124 42 1 41 7 31 73 344 115 150 4 23 87 45 62 211 12 48 130 115 4 61 112 283 44 78 207 100 100 28 302 190 79 59 203 479 84 161 205 238 42 28 103 489 52 129 281 57 125 7 15 175 153 37 197 318 200 33 15 3 1 Staphylococcus chromogenes: 2 0 2 0 2 10 2 4 3 0 7 24 2 6 2 0 6 3 8 14 1 1 4 1 0 0 4 7 1 0 4 8 5 2 2 6 3 3 8 39 7 13 23 12 4 4 6 21 5 7 14 4 13 1 1 7 15 23 7 9 11 1 1 1 0 Staphylococcus epidermidis: 74 84 36 8 210 239 60 199 86 53 271 1078 203 396 52 68 366 120 429 505 79 129 406 221 32 32 220 411 86 89 367 320 148 97 439 398 113 131 435 1557 328 347 1153 746 85 91 343 927 198 215 826 236 844 50 114 198 706 607 277 1004 415 223 53 13 8 Staphylococcus equorum: 2 0 2 0 0 6 1 0 0 0 5 15 2 6 2 0 2 3 6 5 1 1 3 2 0 0 4 3 1 0 2 2 3 1 1 3 0 2 8 28 5 10 18 7 1 3 7 10 2 2 10 2 9 1 1 5 14 15 5 9 6 1 2 0 0 Staphylococcus gallinarum: 4 3 1 0 1 21 4 21 1 1 24 83 30 21 5 1 33 10 26 20 9 2 29 8 1 1 14 15 2 2 19 22 3 4 24 24 7 7 22 79 17 16 73 31 5 2 12 44 11 12 34 10 40 5 8 15 56 69 13 63 17 7 3 1 0 Staphylococcus haemolyticus: 9 14 7 2 17 46 3 10 3 1 23 86 20 33 6 4 28 6 29 51 5 15 38 32 3 3 29 35 8 9 35 26 16 16 45 44 8 16 64 137 46 35 102 60 9 12 48 135 24 31 100 22 74 4 16 27 69 56 28 103 53 23 8 0 1 Staphylococcus hominis: 6 5 2 1 5 16 2 8 7 2 16 72 10 21 3 4 13 9 21 31 6 4 21 13 4 0 12 19 4 2 18 18 10 6 24 24 10 2 35 111 15 23 59 33 7 6 23 55 12 6 56 4 47 1 5 19 59 32 16 78 33 9 6 0 0 Staphylococcus hyicus: 5 4 5 1 23 10 7 15 4 4 27 69 17 45 7 16 25 15 24 78 10 24 17 23 3 11 34 49 10 20 25 40 16 20 42 36 21 14 47 117 18 27 73 56 8 13 43 84 18 19 68 13 47 1 5 13 63 28 21 71 45 17 5 0 0 Staphylococcus intermedius: 5 2 3 0 7 20 0 6 3 1 9 36 12 26 4 1 12 11 17 28 5 8 25 18 0 4 20 23 9 0 20 14 18 6 22 18 7 9 18 82 18 27 61 31 6 4 13 52 7 11 45 7 48 0 1 7 48 14 19 51 17 17 4 1 0 Staphylococcus lentus: 3 3 2 0 4 0 3 10 2 6 2 13 9 2 2 2 5 2 8 6 6 6 7 3 0 0 4 2 1 3 2 3 0 6 2 7 4 1 9 31 7 10 9 12 6 5 7 10 2 2 9 5 9 1 1 4 11 6 1 13 5 2 3 0 0 Staphylococcus lugdunensis: 8 4 1 1 10 16 3 8 3 1 12 68 21 14 1 3 13 6 17 15 4 8 16 11 3 3 3 36 3 3 31 14 6 2 24 17 5 10 23 64 21 11 32 31 3 6 12 45 13 20 45 9 27 4 12 15 54 23 10 67 31 15 7 0 1 Staphylococcus mutans: 1 1 2 6 6 7 7 5 5 8 11 18 15 9 4 2 10 6 7 22 4 7 5 8 4 9 10 17 3 3 8 15 6 14 5 13 6 9 14 27 11 10 14 10 21 5 9 34 19 9 20 3 27 5 6 6 15 19 9 29 16 4 1 0 0 Staphylococcus saprophyticus: 1 2 2 0 3 8 1 1 2 1 5 18 3 1 1 0 4 0 6 7 0 4 7 6 0 3 3 15 2 3 9 2 1 0 19 12 3 2 9 36 11 3 26 10 1 2 10 27 3 4 28 4 24 0 1 7 21 11 0 14 10 2 1 0 0 Staphylococcus sciuri: 2 4 2 0 4 9 1 3 8 0 15 36 6 22 3 5 6 5 9 23 2 8 11 11 0 2 6 13 11 1 9 9 11 2 24 9 12 6 21 76 25 19 41 40 5 1 6 39 7 19 49 16 24 0 2 8 10 12 18 37 18 10 2 0 0 Staphylococcus simulans: 7 3 9 0 18 39 2 15 4 7 16 86 17 51 3 1 26 15 27 92 5 13 52 33 0 19 21 42 15 10 76 50 19 8 60 73 19 18 40 173 28 41 120 69 10 12 45 138 40 24 70 32 84 2 5 32 65 44 19 54 52 21 3 2 2 Staphylococcus simulans bv. staphylolyticus: 1 0 0 0 1 7 0 2 0 2 2 8 3 23 0 0 5 5 5 31 0 3 21 15 2 5 5 7 6 0 31 15 3 1 19 33 2 2 9 33 3 3 31 11 1 2 8 33 15 1 7 5 14 0 0 3 5 7 2 8 7 8 0 0 1 Staphylococcus sp.: 3 0 2 0 3 12 1 4 0 1 7 37 6 13 3 7 5 2 14 14 4 4 12 5 0 3 3 11 3 1 9 8 4 4 11 6 6 3 13 54 7 8 30 20 0 2 11 37 5 7 22 6 23 0 6 7 17 22 5 27 10 11 3 0 0 Staphylococcus xylosus: 29 28 31 3 116 96 19 99 34 21 124 481 102 204 28 32 143 46 160 291 33 87 205 139 15 21 173 278 58 71 250 158 155 53 373 273 67 71 247 559 136 202 507 357 52 58 204 588 104 164 457 106 331 14 45 120 324 229 144 477 228 99 18 4 7 Staphylothermus marinus: 3 2 4 1 14 75 14 118 22 18 35 139 20 78 16 8 26 55 47 159 39 20 84 99 22 26 31 114 21 16 82 147 47 16 69 173 29 36 105 99 70 114 126 41 30 18 19 114 66 78 138 78 123 6 4 92 42 174 45 82 65 51 3 0 0 Stenotrophomonas maltophilia: 9 19 110 28 63 14 8 10 34 240 30 4 22 14 33 56 23 95 23 10 167 30 22 20 29 123 15 72 201 133 70 23 231 29 88 36 61 147 61 68 96 102 29 11 125 49 34 113 57 148 79 79 28 27 11 90 17 14 116 30 91 69 3 0 6 Stigmatella aurantiaca: 15 13 227 118 45 5 17 2 162 254 19 1 30 9 111 78 13 80 15 5 150 133 12 17 139 137 20 27 316 223 19 51 262 92 35 9 137 293 22 11 312 142 16 19 185 96 13 57 395 238 66 87 20 18 6 160 17 0 235 19 137 74 3 5 7 Streptoalloteichus hindustanus: 2 1 6 9 0 1 0 1 7 18 0 0 1 0 4 3 0 2 1 0 10 1 0 0 7 14 4 2 17 13 1 6 16 4 2 1 7 17 1 0 5 5 0 0 4 5 0 1 18 15 0 2 0 2 0 9 0 0 3 0 6 8 0 0 2 Streptococcus: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 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1 3 11 4 14 15 13 5 12 12 1 2 6 14 7 3 21 8 3 1 14 6 12 7 18 46 14 18 34 9 3 1 4 35 7 13 21 7 15 1 0 3 13 1 15 21 10 7 0 1 0 Streptococcus crista: 2 0 1 0 3 1 0 3 2 5 5 5 9 2 1 1 8 7 5 4 3 1 10 7 0 1 5 4 4 2 13 5 4 4 6 4 5 6 7 35 14 11 13 7 1 1 2 30 4 11 6 9 6 2 1 9 4 0 13 11 6 3 2 0 0 Streptococcus downei: 1 2 15 8 14 2 6 8 21 18 13 7 27 17 11 5 25 10 24 16 41 14 16 16 3 5 15 14 51 14 42 14 38 9 55 8 34 12 26 26 63 37 85 66 29 4 8 25 9 40 75 29 51 0 0 22 22 0 8 39 23 28 1 0 0 Streptococcus dysgalactiae: 4 3 4 4 30 27 8 35 12 7 54 74 35 54 10 10 72 16 44 96 37 17 152 67 7 16 56 112 22 35 99 52 38 24 89 57 16 43 113 247 82 44 115 89 31 8 16 237 69 64 171 35 62 0 1 32 76 39 37 114 37 32 4 0 0 Streptococcus equi: 4 6 6 1 15 27 3 37 9 5 44 37 25 55 1 5 31 14 27 45 23 8 31 59 1 4 52 111 19 14 113 36 25 12 48 23 10 10 40 129 88 28 33 64 11 1 13 122 69 34 74 15 23 1 2 14 25 9 26 30 33 5 4 0 0 Streptococcus equisimilis: 17 34 43 18 122 60 9 90 50 54 133 164 139 141 30 19 122 69 88 167 114 50 160 119 27 24 103 151 75 43 273 122 94 65 184 96 94 98 256 441 187 186 225 212 80 54 76 380 169 198 321 114 188 4 22 68 207 49 130 250 132 80 12 4 1 Streptococcus ferus: 1 3 1 1 1 2 2 3 2 1 6 10 5 4 2 3 2 2 4 3 1 3 5 0 0 0 0 0 1 0 7 3 1 3 1 5 2 1 6 17 3 1 13 9 5 1 2 20 7 3 3 0 5 0 0 1 4 6 0 7 5 4 0 0 1 Streptococcus gordonii: 34 76 93 34 166 93 21 135 106 144 195 269 249 184 58 52 248 138 204 354 211 113 385 367 30 57 144 270 166 108 421 228 172 91 385 267 190 169 402 656 416 216 485 435 202 53 118 690 271 264 569 182 376 20 29 201 422 113 234 537 263 97 18 6 10 Streptococcus iniae: 3 3 3 1 16 8 5 12 6 1 26 48 26 24 3 4 17 6 17 25 13 6 23 23 5 0 19 34 15 8 30 29 19 15 35 23 12 6 45 54 7 14 27 25 5 4 13 29 8 7 28 4 25 7 3 12 59 15 18 69 29 14 2 1 0 Streptococcus intermedius: 2 4 2 0 3 7 1 3 1 5 6 31 10 7 1 3 12 0 10 9 1 4 5 2 0 0 2 8 0 1 6 7 0 2 11 11 1 6 19 36 11 2 23 14 4 1 6 25 6 0 24 4 21 1 2 5 37 15 4 32 12 3 2 0 0 Streptococcus milleri: 2 3 3 0 4 9 2 4 0 5 6 34 7 12 1 1 11 2 9 9 3 4 7 1 0 0 4 7 2 1 3 10 0 1 10 7 2 5 15 32 10 0 23 12 5 0 5 27 5 0 25 6 19 1 3 5 37 13 5 40 10 2 1 1 0 Streptococcus mitis: 9 25 15 2 28 44 12 77 29 39 47 102 105 60 25 13 48 28 71 76 44 34 54 56 6 9 34 48 46 13 93 76 39 23 67 62 64 30 90 181 112 61 128 80 72 12 63 179 87 63 123 69 120 1 6 54 140 31 61 134 66 11 5 0 4 Streptococcus mutans: 90 90 269 70 658 202 63 208 270 288 887 837 733 609 174 111 643 282 539 1043 392 321 975 609 122 242 554 1019 567 294 1757 586 527 221 1190 457 529 366 1415 1989 952 558 1790 1189 494 178 502 2019 491 525 2034 406 1324 42 95 420 1111 160 575 1740 824 394 51 17 22 Streptococcus mutans serotype c: 1 0 3 0 6 0 0 0 4 0 15 5 2 10 0 0 4 0 1 3 0 0 10 5 2 0 3 10 8 2 26 1 6 0 19 6 4 0 16 19 2 6 10 13 1 0 6 21 0 7 13 2 7 0 1 9 8 2 12 13 3 2 1 0 0 Streptococcus oralis: 6 19 18 2 39 35 9 56 52 45 59 48 104 70 28 14 58 42 75 96 66 36 72 88 10 23 41 69 83 32 123 92 58 28 99 57 92 44 75 199 160 79 114 126 87 25 47 197 107 73 140 75 134 1 2 40 93 7 90 97 55 17 3 2 1 Streptococcus parasanguis: 4 4 3 3 4 1 1 12 37 19 26 13 20 7 15 5 20 19 5 12 25 3 11 10 11 4 4 17 35 5 28 25 14 19 12 8 40 12 11 43 31 18 19 24 14 13 9 37 11 25 25 18 12 5 4 23 24 2 59 27 22 8 3 0 1 Streptococcus pneumoniae: 251 371 458 173 1328 811 196 1047 818 742 1552 1950 2455 1500 573 415 1708 757 1470 1968 1137 605 1856 1429 261 337 1164 1735 1294 712 2656 1991 801 839 2262 1477 1239 1056 2467 4441 2301 1383 3416 2340 1245 443 1063 4387 1904 1464 3535 1253 2821 113 270 1097 2890 905 1809 3703 2046 927 139 76 36 Streptococcus pyogenes: 200 283 317 64 1083 846 128 1037 405 278 1478 2348 1142 1501 231 179 1465 927 990 1628 752 402 1444 1191 164 159 984 2395 659 429 2667 1270 909 389 1970 1107 606 447 2042 5450 1408 2159 2090 3075 574 361 786 4490 1328 1383 2288 1080 1537 72 211 708 1847 420 1252 2170 1239 487 122 60 14 Streptococcus salivarius: 30 36 75 4 396 65 11 89 148 36 433 105 384 465 35 29 286 163 184 584 131 123 489 343 14 31 152 412 228 142 659 220 137 77 888 290 187 165 646 748 452 459 664 564 128 137 137 783 206 340 835 407 457 13 34 329 329 37 354 494 347 204 21 5 4 Streptococcus sanguis: 13 73 43 23 105 218 59 168 107 197 248 343 352 250 72 93 343 170 299 297 171 175 393 210 57 119 229 340 190 183 485 315 290 134 350 268 365 216 441 801 541 350 832 491 151 83 135 881 434 270 704 275 583 4 4 179 375 184 309 408 227 104 5 1 7 Streptococcus sobrinus: 11 13 70 31 157 23 17 63 172 171 141 77 171 191 69 31 241 217 120 241 379 83 321 276 46 58 124 302 368 112 609 129 205 59 507 145 222 150 378 377 600 375 471 599 178 62 55 521 197 412 593 383 294 4 6 218 203 19 226 210 191 149 9 2 0 Streptococcus sp.: 7 12 16 2 77 32 2 46 12 15 107 105 49 63 5 8 23 40 35 87 25 6 84 49 4 5 30 177 21 39 178 48 18 15 70 40 22 10 79 308 95 87 86 143 16 18 16 296 80 92 109 25 45 0 0 22 27 6 34 60 34 8 7 0 0 Streptococcus sp. GX7805: 1 0 0 0 6 2 0 4 0 3 12 16 8 14 1 0 4 1 5 23 4 2 35 12 0 1 7 31 9 15 38 5 6 3 17 13 5 6 23 52 14 15 12 9 0 1 0 51 3 21 25 11 7 0 0 9 6 1 8 10 3 4 1 0 0 Streptococcus suis: 4 9 15 12 39 23 8 26 24 17 62 31 76 95 18 13 52 30 31 176 52 51 149 126 6 21 58 203 64 64 208 64 52 22 135 92 37 38 172 266 145 119 150 89 27 16 19 258 94 108 245 71 77 4 1 47 58 15 61 159 35 28 2 2 0 Streptococcus thermophilus: 101 191 112 35 410 303 76 305 175 135 621 557 542 550 76 108 440 263 433 651 208 222 612 424 48 75 273 603 236 177 880 528 238 188 916 486 303 262 894 1500 609 544 957 759 246 171 262 1242 523 511 1115 370 804 67 134 427 828 307 610 1078 633 344 66 21 14 Streptococcus uberis: 1 0 1 0 0 5 0 4 0 0 6 12 2 9 2 1 2 0 6 7 2 3 8 4 1 0 2 10 1 1 9 4 0 1 2 5 2 4 13 16 3 0 17 18 5 1 2 15 1 4 8 1 5 0 0 1 5 1 4 17 2 1 1 0 0 Streptococcus zooepidemicus: 2 0 0 1 4 8 3 8 0 1 17 18 7 11 2 0 7 5 9 35 10 6 26 18 1 5 9 36 14 5 53 19 4 4 24 14 10 8 29 20 21 7 31 16 11 3 6 19 17 15 24 7 13 1 1 8 15 5 10 16 8 9 2 0 0 Streptomyces: 1 1 13 11 1 0 1 1 7 23 0 0 1 0 10 3 0 2 0 0 21 3 0 1 11 19 0 0 28 18 0 3 24 8 3 0 11 20 0 0 9 4 1 0 10 14 3 0 26 18 1 10 1 4 0 16 0 0 15 0 8 5 0 0 1 Streptomyces K15: 1 0 6 3 1 1 1 0 10 12 0 0 0 0 5 9 0 8 0 0 26 13 1 0 4 3 0 0 25 14 3 1 23 2 2 0 14 6 0 0 22 14 0 0 5 4 0 0 2 10 0 12 0 2 0 6 0 0 13 0 7 1 0 1 0 Streptomyces achromogenes: 2 10 19 10 11 0 8 4 10 23 19 0 8 0 6 14 8 16 7 3 14 15 8 10 7 13 14 6 22 22 19 10 14 12 11 7 25 23 19 4 23 12 5 6 18 11 2 19 42 25 21 12 9 4 5 27 6 3 20 7 10 10 0 1 1 Streptomyces actuosus: 4 3 39 38 4 3 4 0 20 62 2 0 0 1 14 12 1 16 0 1 21 21 1 0 21 32 0 6 89 57 1 7 49 16 5 3 43 43 0 1 21 9 1 0 23 22 3 7 55 55 0 11 0 8 0 19 0 0 34 0 15 14 0 0 4 Streptomyces akiyoshiensis: 1 0 12 1 3 0 2 0 10 22 0 0 0 0 16 2 0 1 1 0 8 11 0 0 6 13 0 0 21 22 0 3 24 1 2 1 24 12 0 0 15 13 0 0 9 6 0 1 22 20 0 4 0 2 0 8 0 0 16 0 3 1 0 1 0 Streptomyces albogriseolus: 5 0 44 27 2 2 2 0 51 68 0 0 1 4 72 44 2 50 2 0 133 54 2 4 28 60 0 4 159 99 4 4 199 21 19 0 122 58 1 0 108 60 0 1 49 26 0 2 66 104 3 53 0 14 2 48 0 1 54 0 17 24 0 4 1 Streptomyces albus: 12 18 151 57 24 5 12 16 148 166 20 0 21 6 91 54 9 48 7 13 186 66 13 21 68 95 13 33 316 110 24 24 238 40 55 13 200 88 9 14 156 108 9 10 117 65 10 37 205 228 29 90 11 27 4 82 7 3 151 14 63 52 1 3 8 Streptomyces albus G: 1 0 21 6 0 0 0 0 12 14 0 0 0 0 6 2 0 5 0 1 11 2 0 0 14 4 0 0 42 4 0 2 17 4 0 0 9 0 0 0 0 2 0 1 6 3 0 5 8 13 0 1 0 0 0 2 0 0 3 0 1 3 0 0 1 Streptomyces ambofaciens: 23 31 266 153 33 3 21 3 278 286 13 2 20 11 128 59 4 64 6 21 244 86 11 15 145 152 11 28 468 186 41 56 287 70 52 22 294 174 15 10 132 86 3 16 155 156 6 92 252 329 15 107 2 46 3 125 1 2 174 7 87 66 3 5 15 Streptomyces antibioticus: 19 18 268 300 125 6 19 7 290 532 47 3 132 11 203 186 15 92 28 21 330 176 25 9 213 345 40 58 624 488 137 59 492 201 238 19 379 477 54 8 193 144 28 17 285 177 50 88 522 497 124 148 20 50 19 256 17 9 232 10 164 170 2 2 15 Streptomyces anulatus: 11 5 164 140 16 5 11 1 178 251 7 2 7 4 67 56 3 59 1 7 199 71 3 3 133 108 8 22 324 167 10 42 234 69 22 12 178 120 2 6 67 64 3 10 86 114 12 57 194 231 19 96 10 35 2 139 3 5 115 2 58 49 0 0 11 Streptomyces arenae: 3 2 44 43 1 0 3 0 33 55 0 0 1 2 23 24 1 10 1 0 39 26 3 2 21 33 1 5 76 50 3 5 61 15 3 1 54 31 0 0 28 34 0 0 21 26 0 4 57 73 1 25 1 13 0 33 0 0 46 0 16 27 0 1 2 Streptomyces argillaceus: 10 4 112 96 18 0 12 1 110 169 1 0 2 5 67 37 2 48 13 5 132 49 3 1 51 75 3 16 226 99 3 13 153 49 31 7 149 104 7 4 48 40 3 4 61 68 7 29 146 187 6 66 3 15 4 81 0 0 110 1 44 38 0 0 10 Streptomyces aureofaciens: 24 14 419 239 44 7 33 2 352 531 9 1 27 9 190 138 4 117 9 5 384 141 10 7 224 311 15 32 721 374 19 48 514 169 59 13 387 286 6 7 254 161 4 7 265 198 6 70 528 549 17 213 3 52 5 268 4 2 292 10 144 137 3 2 19 Streptomyces avermitilis: 8 8 100 44 16 1 1 2 88 106 4 0 5 2 43 31 0 26 1 3 108 52 3 2 57 91 5 15 199 117 5 24 162 33 26 5 149 62 6 2 91 61 1 4 88 67 11 18 161 160 7 73 4 17 0 78 0 1 104 2 58 30 2 1 5 Streptomyces avidinii: 1 0 3 0 1 0 1 0 3 6 0 0 0 0 7 6 0 5 0 0 17 5 0 0 1 3 0 2 23 5 1 1 15 0 2 0 8 3 3 0 9 9 1 0 6 2 0 0 5 8 0 6 0 0 0 2 0 0 6 1 1 6 0 1 0 Streptomyces badius: 1 1 11 9 1 0 2 0 8 21 0 0 0 0 12 5 1 6 0 0 17 9 0 1 9 9 1 2 21 17 0 1 9 5 5 0 13 13 0 0 14 6 0 0 3 6 1 2 15 25 1 8 0 2 0 6 0 0 8 0 3 4 0 1 0 Streptomyces bambergiensis: 6 4 54 51 14 3 7 5 32 86 4 3 6 9 19 19 4 23 3 1 26 29 5 7 20 48 5 14 74 73 3 12 57 31 13 2 43 41 6 3 35 21 2 4 32 22 3 13 50 39 6 14 0 18 3 15 1 1 21 4 24 18 1 3 2 Streptomyces bikiniensis: 2 3 15 5 8 0 1 1 5 11 1 0 1 0 2 0 0 6 0 0 5 3 0 0 4 4 2 3 11 8 2 2 5 3 6 3 5 7 0 0 5 4 1 0 4 5 0 0 3 6 1 0 0 1 0 4 0 0 1 0 1 0 0 0 2 Streptomyces cacaoi: 9 3 130 106 22 4 11 0 126 142 3 0 5 4 73 48 0 69 3 9 124 56 3 1 91 80 1 10 240 137 4 11 163 44 18 9 134 69 5 2 58 46 3 4 72 59 1 43 128 175 13 46 1 30 1 57 0 4 50 1 45 42 0 1 8 Streptomyces caelestis: 5 37 420 392 99 3 33 12 581 829 25 2 51 21 241 200 8 161 20 51 724 212 20 35 494 399 32 114 1208 672 71 127 695 273 159 39 487 396 29 21 81 146 6 126 271 419 72 220 467 803 64 161 11 83 12 287 5 8 303 2 147 194 0 0 5 Streptomyces capreolus: 7 5 126 89 12 0 7 0 50 184 5 0 11 3 28 43 2 35 1 2 103 32 1 0 52 64 3 5 161 121 7 4 140 50 12 2 117 130 3 2 36 42 0 3 63 56 4 21 135 159 8 42 2 19 0 48 1 1 64 0 27 30 0 2 5 Streptomyces carbophilus: 1 0 24 7 2 0 1 1 18 26 0 1 2 0 8 6 0 5 3 3 18 9 0 1 14 11 0 2 27 15 0 4 12 7 2 0 15 15 0 2 6 5 0 1 12 12 2 8 17 26 4 6 0 2 1 15 0 0 20 1 9 2 0 0 1 Streptomyces carzinostaticus: 2 2 6 0 0 0 2 0 10 6 0 0 0 0 16 8 0 2 0 0 16 10 2 0 2 10 0 0 18 28 4 2 20 6 8 4 14 20 2 0 4 8 2 0 8 0 0 0 4 16 0 2 0 8 0 12 0 0 6 2 0 4 0 0 2 Streptomyces cattleya: 2 3 14 15 1 2 6 0 13 14 0 0 1 1 18 15 1 5 0 0 19 18 0 0 6 22 2 2 16 6 2 0 15 9 2 0 15 10 0 0 9 23 0 2 11 14 3 5 30 25 1 20 0 6 0 18 0 0 13 0 14 8 0 0 2 Streptomyces cellulosae: 1 2 19 4 2 1 0 0 21 20 0 0 0 2 12 1 0 3 0 0 24 12 1 0 7 12 0 0 29 12 0 5 17 1 2 2 9 4 0 0 8 9 0 0 3 7 0 3 8 19 0 5 0 4 0 5 0 0 9 0 3 4 0 0 1 Streptomyces chrysomallus: 4 1 15 5 5 0 0 0 22 32 4 0 1 0 23 5 1 13 0 1 41 13 0 0 17 26 0 3 43 17 1 2 76 5 10 0 51 22 0 0 52 24 2 0 31 9 0 0 40 53 2 13 1 2 0 36 0 0 37 1 9 9 1 0 3 Streptomyces cinnamonensis: 9 9 155 63 19 2 9 1 105 186 6 0 1 3 71 49 1 52 4 6 140 65 3 7 75 106 9 23 285 192 8 12 235 41 34 7 165 107 4 4 66 59 2 6 90 85 4 37 170 211 7 69 9 26 3 96 0 5 115 3 54 38 1 1 7 Streptomyces cinnamoneus: 4 0 33 17 18 1 1 0 70 77 1 0 1 0 26 24 0 10 1 1 55 28 3 0 28 51 1 2 79 70 6 4 93 12 35 0 93 45 4 1 53 30 0 0 36 25 2 2 72 71 2 28 2 11 0 53 0 0 62 1 34 15 1 1 2 Streptomyces clavuligerus: 30 29 305 361 54 5 39 2 316 564 22 1 18 16 187 154 5 112 14 24 349 194 3 14 241 318 16 57 627 476 37 42 483 217 71 17 389 308 23 10 218 176 17 6 283 201 40 53 509 562 61 178 28 93 8 270 11 10 305 12 167 119 3 2 25 Streptomyces coelicolor: 241 170 3227 2077 459 48 249 24 2897 4630 127 7 153 53 1768 1248 40 905 101 97 3153 1531 94 76 1826 2612 88 374 6054 3690 192 511 5042 1236 792 204 4053 2693 128 66 2340 1610 53 100 2383 1625 104 604 4515 4785 200 1662 73 463 56 2208 21 60 2739 55 1380 1008 20 38 180 Streptomyces collinus: 5 3 80 46 17 0 3 1 65 112 1 0 0 2 39 41 0 11 1 3 89 40 2 1 39 67 4 6 128 94 4 7 132 18 32 3 118 68 1 2 76 65 1 2 85 53 0 8 159 116 6 54 0 15 1 70 0 3 105 2 57 26 0 0 5 Streptomyces cyaneus: 13 13 130 95 28 3 20 1 126 148 5 0 9 2 69 55 3 57 10 8 120 52 4 5 88 109 11 27 241 142 11 31 175 65 40 16 180 112 5 5 61 52 3 5 69 80 11 42 179 205 16 64 2 38 2 94 5 13 119 4 76 31 2 1 10 Streptomyces diastaticus: 1 0 18 7 4 0 0 0 18 20 0 0 0 0 5 2 0 2 0 0 12 5 1 0 7 16 0 0 30 19 1 1 36 3 0 0 11 6 0 0 12 8 0 0 13 10 0 0 26 36 0 9 0 1 0 22 1 0 12 0 8 6 0 1 0 Streptomyces diastatochromogenes: 1 0 6 5 3 0 0 0 13 14 0 0 0 0 10 2 0 5 0 1 15 4 1 0 13 8 3 3 27 6 5 3 27 2 2 1 14 5 3 0 9 9 1 1 13 6 1 8 8 25 0 9 0 6 0 8 0 0 14 0 4 3 0 0 1 Streptomyces exfoliatus: 1 0 3 2 1 1 4 0 15 12 1 0 2 1 15 10 1 14 2 1 37 18 0 0 6 16 1 1 46 16 5 3 38 4 8 0 27 9 1 0 12 25 0 1 18 6 1 0 6 22 1 27 0 9 1 9 0 0 7 0 14 8 0 0 1 Streptomyces flavopersicus: 3 3 21 36 9 4 7 2 25 36 5 1 9 3 20 13 1 14 4 4 25 19 1 2 16 30 2 12 31 37 6 6 25 17 10 6 21 32 2 2 8 8 1 0 17 24 4 16 41 36 4 5 2 8 0 18 2 2 14 0 9 12 2 0 1 Streptomyces fradiae: 34 56 766 935 178 11 78 4 762 1377 30 5 193 22 442 335 32 252 61 50 870 380 19 32 602 794 39 130 1840 1321 131 194 1322 599 404 53 789 984 70 12 236 291 39 22 446 455 132 280 1154 1148 170 318 69 141 41 495 29 18 415 28 303 347 0 4 30 Streptomyces galbus: 6 6 46 21 8 2 2 1 36 65 0 0 3 0 23 23 1 13 1 2 58 39 4 0 26 47 4 5 87 51 9 12 73 11 21 4 72 47 4 1 47 45 2 0 48 25 0 13 67 73 4 37 3 3 2 52 0 1 67 2 27 29 0 0 6 Streptomyces galilaeus: 1 0 10 8 0 0 2 0 7 10 0 0 2 0 3 5 0 4 0 1 11 6 0 1 3 5 0 2 21 10 1 2 22 5 5 2 18 9 0 0 6 8 0 0 5 3 1 2 15 13 0 4 1 5 0 6 0 0 10 0 5 2 0 0 1 Streptomyces ghanaensis: 1 1 22 12 2 1 0 1 13 14 2 0 3 0 5 3 0 2 0 0 12 9 0 1 3 10 0 1 23 14 1 5 37 4 3 1 19 5 0 0 15 9 0 0 9 10 0 3 18 25 1 12 0 6 1 10 0 0 12 0 6 12 0 0 1 Streptomyces glaucescens: 36 16 409 427 42 4 42 1 427 692 8 4 12 7 224 141 0 162 15 15 469 173 5 5 318 339 8 66 896 493 16 130 678 191 90 16 597 389 15 15 181 203 7 7 243 286 17 137 542 697 24 221 9 80 9 341 3 10 358 8 182 172 0 3 31 Streptomyces globisporus: 3 0 15 5 5 1 2 0 14 13 0 2 0 0 27 16 1 21 3 0 26 17 0 0 15 14 0 5 53 32 6 4 48 9 8 0 31 14 0 0 9 22 0 0 14 9 0 2 7 24 0 18 0 8 2 23 0 0 14 0 10 11 0 0 3 Streptomyces griseolus: 4 3 41 34 3 0 1 0 43 59 0 1 4 1 15 3 0 13 3 0 46 25 1 0 33 27 0 2 73 36 2 3 52 4 4 0 46 32 1 1 9 15 0 1 28 23 2 11 49 71 2 12 0 12 3 27 0 1 39 0 20 5 0 2 2 Streptomyces griseosporeus: 1 0 2 5 1 0 0 0 2 3 0 0 0 1 3 1 0 1 0 0 6 2 1 0 2 3 1 0 7 9 2 0 7 3 0 0 7 8 0 0 1 4 0 0 0 2 0 0 4 9 0 5 0 4 3 4 0 0 3 1 2 1 0 0 1 Streptomyces griseus: 128 116 1554 1423 310 46 158 5 1531 2202 86 10 90 46 873 610 30 589 63 44 1584 772 40 42 1015 1392 82 208 3133 1946 152 343 2448 782 401 103 1893 1333 89 36 878 749 36 37 993 896 80 391 2071 2477 182 822 59 313 46 1067 20 33 1175 26 644 542 3 18 107 Streptomyces halstedii: 9 5 82 83 17 4 9 1 83 121 3 1 1 3 69 56 4 61 9 14 142 63 6 3 76 93 4 18 224 149 17 34 208 41 35 6 134 103 3 3 48 97 5 5 77 64 5 20 104 163 4 75 3 41 2 92 1 2 72 0 51 50 1 1 7 Streptomyces hygroscopicus: 52 187 1188 1631 434 24 136 64 1503 3186 168 8 510 124 875 1009 54 696 201 218 2231 911 148 138 1117 1489 157 492 3360 2565 438 371 2333 821 1016 247 1792 2227 259 92 533 706 87 247 1338 1069 266 698 2163 2589 715 672 135 277 75 1299 74 68 1291 102 741 784 2 7 43 Streptomyces jumonjinensis: 1 0 4 10 1 0 1 0 7 18 2 0 0 0 9 8 0 3 0 0 7 8 0 0 3 18 0 0 7 15 1 1 9 6 3 1 8 13 1 1 15 18 0 0 12 11 2 2 21 23 0 14 2 3 0 16 0 1 13 1 8 2 0 0 1 Streptomyces kasugaensis: 1 0 7 5 2 0 0 1 4 2 0 0 0 1 3 2 0 1 1 0 6 2 0 0 5 3 1 1 7 5 0 0 4 1 2 0 5 4 0 0 1 1 0 0 0 3 0 1 9 9 1 6 0 0 0 3 0 0 4 0 2 0 0 0 1 Streptomyces lactamdurans: 14 12 287 265 19 2 34 4 267 569 8 2 20 10 99 150 0 152 7 4 380 93 5 8 133 327 4 20 410 421 11 10 430 158 66 8 253 388 6 12 153 186 5 7 222 222 2 129 388 497 29 225 1 75 4 332 1 1 229 1 128 117 0 3 11 Streptomyces laurentii: 1 1 11 9 4 0 0 0 13 11 2 0 0 0 8 7 0 5 0 0 7 4 0 0 5 8 0 0 19 9 0 2 18 3 3 0 15 16 3 0 10 4 2 0 3 1 1 1 14 14 3 2 0 1 0 11 0 0 16 2 2 0 0 0 1 Streptomyces lavendulae: 10 5 96 82 21 1 9 1 98 134 3 1 7 3 49 28 3 37 3 6 105 63 5 3 66 82 2 16 203 125 7 21 173 45 22 5 101 81 3 4 48 53 2 4 49 63 9 35 117 164 9 64 1 22 2 73 1 0 71 4 46 42 1 1 8 Streptomyces limosus: 2 0 39 15 3 1 1 1 39 33 0 0 0 0 25 10 0 16 0 1 56 7 0 0 26 22 0 0 102 25 1 4 79 12 6 1 58 14 0 0 22 30 0 0 35 20 0 6 32 56 0 31 0 11 0 26 0 0 22 0 11 17 0 0 2 Streptomyces lincolnensis: 39 50 519 425 72 10 57 4 560 677 38 3 54 17 217 168 14 182 32 27 473 238 20 22 378 352 31 72 954 633 38 85 729 221 83 51 540 449 33 15 135 175 17 27 273 346 44 117 551 704 55 215 17 142 26 357 16 11 273 8 149 223 2 5 32 Streptomyces lividans: 109 100 1473 921 242 48 170 16 1309 2125 79 3 85 46 969 666 23 613 66 65 1947 961 50 54 851 1175 62 203 3118 1805 125 239 2853 498 405 73 2018 1180 64 40 1227 1156 27 61 1308 759 37 258 2004 2533 89 1046 37 326 34 1146 18 26 1307 34 663 608 11 19 79 Streptomyces longisporoflavus: 2 2 26 21 3 0 5 0 35 49 0 0 1 1 20 9 0 12 0 3 33 12 0 1 11 13 0 4 48 33 3 8 39 10 7 1 36 15 0 0 12 9 0 0 9 19 2 4 21 30 1 9 1 1 1 15 0 0 20 0 14 8 0 0 2 Streptomyces longisporus: 1 1 3 3 0 0 0 0 8 6 0 0 0 0 4 2 0 2 0 1 10 3 0 0 3 6 0 1 20 6 2 3 7 2 1 0 10 3 0 0 4 5 0 0 1 1 1 1 1 6 0 4 0 5 0 3 0 0 2 0 1 2 0 0 1 Streptomyces macromomyceticus: 1 0 2 0 1 0 0 0 2 3 2 0 1 0 5 2 1 3 0 0 10 8 0 1 2 3 0 0 18 5 0 1 13 3 3 0 12 6 0 0 3 4 0 1 5 2 0 0 2 5 1 1 0 2 2 4 0 0 3 0 1 1 0 1 0 Streptomyces mauvecolor: 1 0 2 3 1 0 0 0 1 3 1 0 1 0 3 2 0 5 1 0 0 6 0 0 3 4 1 0 15 16 0 1 4 1 2 0 7 4 0 0 8 4 1 0 4 6 1 0 1 7 0 3 0 0 0 2 0 0 5 1 4 1 0 0 1 Streptomyces mycarofaciens: 5 12 44 38 11 0 7 2 46 108 6 1 5 2 24 19 3 25 4 2 43 23 5 1 29 43 5 16 85 52 13 8 67 23 18 7 59 57 7 2 16 17 3 4 29 21 3 11 40 53 7 27 5 17 6 58 3 3 45 9 35 35 1 1 3 Streptomyces nigrescens: 1 0 3 4 1 0 0 0 7 4 0 1 0 0 2 5 0 3 0 1 8 3 0 0 4 6 0 0 12 7 1 0 9 7 1 0 6 5 0 0 5 1 0 0 4 1 0 0 1 4 0 4 0 2 2 4 0 0 1 0 2 0 0 1 0 Streptomyces nitrosporeus: 1 0 3 0 0 0 0 0 3 0 1 0 0 0 4 2 0 2 0 0 9 6 0 0 5 2 0 2 10 8 2 1 5 1 0 0 7 2 0 0 2 5 0 0 3 1 0 0 3 2 1 4 0 3 1 2 0 0 1 1 3 3 1 0 0 Streptomyces nogalater: 9 15 102 127 28 4 11 2 74 181 6 1 15 6 49 43 1 51 4 12 97 77 5 8 76 98 12 23 156 146 13 43 148 72 29 12 113 108 6 8 33 38 3 4 61 72 7 44 134 143 23 45 9 26 6 91 3 6 66 2 47 34 0 0 9 Streptomyces noursei: 2 0 9 17 0 0 0 0 8 16 2 0 2 0 5 9 0 2 2 0 28 6 2 0 8 12 0 4 17 15 2 0 18 22 0 0 21 8 0 0 2 6 0 0 2 8 0 4 22 43 2 14 0 4 0 16 0 0 7 0 10 4 0 1 1 Streptomyces olivaceoviridis: 2 0 19 7 2 1 3 0 27 30 0 0 2 0 24 11 0 19 2 1 66 24 1 1 17 28 0 4 54 35 0 7 75 5 6 0 37 17 0 2 20 26 0 1 30 18 0 2 12 48 1 28 0 10 0 29 0 0 19 0 11 16 0 0 2 Streptomyces peucetius: 31 37 353 393 75 5 41 4 389 658 28 1 33 13 201 157 8 172 24 36 335 228 10 14 244 374 22 65 738 465 61 90 515 265 106 24 458 462 14 11 140 164 16 22 243 257 39 122 500 586 54 193 17 75 8 290 4 9 322 16 201 148 0 3 28 Streptomyces phaeochromogenes: 11 14 122 77 35 0 13 0 178 87 9 0 7 6 55 44 9 26 5 5 119 37 6 2 59 100 10 20 270 141 37 22 161 38 29 4 167 68 8 8 106 46 5 2 121 39 7 36 170 172 17 66 3 32 0 55 3 2 81 6 64 53 0 1 10 Streptomyces pilosus: 1 1 10 8 1 0 0 0 6 18 0 0 1 0 2 4 0 6 0 0 2 10 1 0 4 8 0 0 14 6 0 1 13 3 4 0 11 15 0 0 4 1 0 0 6 6 0 1 29 10 1 2 1 1 1 2 0 0 7 0 8 2 0 0 1 Streptomyces platensis: 1 0 2 4 2 0 1 0 4 8 0 0 0 0 0 2 0 5 0 1 11 4 1 0 1 6 0 2 11 9 2 0 9 3 1 0 7 5 0 0 2 6 0 1 5 1 0 2 2 5 0 4 0 3 1 4 0 1 2 0 3 2 0 0 1 Streptomyces plicatus: 2 0 16 5 1 2 2 0 24 22 3 1 2 4 26 18 0 20 1 0 62 19 1 0 19 29 0 5 69 43 4 2 91 5 7 1 42 17 1 2 42 46 1 1 25 11 0 2 22 64 1 39 1 7 1 34 0 1 25 0 11 23 0 2 0 Streptomyces pristinaespiralis: 14 13 1121 405 59 1 18 2 1008 1242 12 0 14 12 282 94 3 201 9 23 1165 147 5 11 897 443 4 135 2179 536 19 80 1318 129 39 40 945 410 5 32 164 234 1 33 425 563 15 310 655 1308 11 382 9 87 6 549 2 11 444 0 193 214 0 1 13 Streptomyces purpurascens: 6 2 59 67 7 0 9 1 73 110 1 0 1 1 28 24 3 18 3 3 51 28 3 2 37 57 2 7 143 89 3 13 110 57 13 1 92 59 3 1 24 15 2 1 35 47 6 17 100 120 8 33 3 10 1 57 0 0 44 1 35 24 0 1 5 Streptomyces ramocissimus: 3 1 28 31 14 0 4 0 37 45 1 0 5 0 13 8 0 2 1 1 68 31 2 0 17 44 3 2 46 44 3 6 67 22 16 3 82 48 7 2 45 26 0 0 35 32 4 7 92 72 2 24 3 2 0 34 0 1 65 2 30 3 1 1 1 Streptomyces reticuli: 5 2 69 51 8 0 4 0 67 84 2 0 1 0 48 21 0 24 1 1 81 35 3 2 42 50 3 3 161 79 3 6 108 18 14 0 97 52 0 1 52 51 2 1 82 36 2 8 91 120 3 51 1 10 0 35 0 0 49 0 24 20 1 0 4 Streptomyces rimosus: 9 2 81 86 17 1 19 0 86 167 3 0 11 3 51 47 0 44 5 1 110 50 2 4 46 86 4 11 142 169 10 25 158 71 35 8 91 116 8 5 59 42 3 1 54 46 7 23 140 159 7 40 1 24 4 84 1 0 99 2 53 41 0 1 8 Streptomyces rochei: 2 0 22 17 2 0 0 0 15 25 0 1 0 0 17 17 0 20 0 0 52 12 0 2 23 26 1 2 67 36 2 1 53 11 8 2 37 20 0 0 8 33 0 0 26 19 0 6 26 44 1 24 0 7 2 28 0 0 31 0 12 24 0 0 2 Streptomyces roseofulvus: 6 3 78 47 4 0 8 0 104 54 0 0 2 0 29 22 0 35 1 3 101 30 1 0 57 46 1 11 172 85 4 10 125 32 8 7 93 52 1 3 15 22 0 1 26 42 0 15 85 103 1 32 1 9 0 46 0 0 33 0 16 20 0 0 6 Streptomyces roseosporus: 5 2 51 26 17 1 1 0 41 59 3 0 3 0 32 24 2 9 2 0 37 24 1 2 18 40 4 3 75 49 5 2 59 7 17 0 56 34 3 1 58 42 1 0 38 26 0 11 79 63 1 40 1 3 0 41 0 0 59 0 23 9 2 1 2 Streptomyces rubiginosus: 2 1 34 25 6 0 4 0 26 71 0 0 0 1 15 9 0 7 1 1 36 17 0 0 19 26 2 3 71 45 1 4 70 16 6 1 24 36 0 0 15 14 0 0 26 21 1 5 53 65 1 13 1 6 0 28 0 0 15 0 10 17 0 0 2 Streptomyces scabies: 3 1 16 22 5 0 3 0 43 72 0 0 1 0 15 10 5 18 0 3 43 24 0 0 32 34 0 4 69 49 7 10 69 10 24 5 40 25 1 0 50 28 5 2 57 8 0 5 41 68 3 25 3 12 4 52 0 0 69 1 16 14 2 0 1 Streptomyces setonii: 2 1 27 35 8 0 3 0 28 49 3 0 1 0 12 14 1 9 1 0 30 14 1 2 19 22 6 8 32 39 7 6 37 19 8 3 35 25 1 1 8 12 0 0 23 16 6 7 43 39 7 14 1 3 0 30 0 1 23 2 19 6 0 0 2 Streptomyces sp.: 57 84 914 849 213 23 93 20 1163 1404 70 9 82 45 555 374 15 344 49 90 1139 534 28 47 814 883 65 196 2156 1311 111 224 1564 516 278 80 1134 826 48 32 311 454 17 78 656 679 90 338 1090 1497 141 490 34 205 26 733 13 19 690 21 379 422 2 8 46 Streptomyces sp. C5: 6 8 62 77 8 1 11 0 61 98 4 1 4 2 31 20 1 29 4 7 57 50 4 3 43 62 4 12 125 75 6 19 82 36 17 5 70 88 1 2 14 33 2 5 39 43 3 16 78 91 14 24 2 16 0 41 0 0 45 8 33 34 0 1 5 Streptomyces sp. TH1: 1 0 10 10 1 0 1 0 9 15 1 0 1 0 8 4 0 7 0 0 8 6 0 0 7 7 0 3 12 9 1 0 6 2 1 0 9 11 1 1 10 7 0 0 7 12 0 4 22 22 2 9 0 1 0 18 0 1 13 1 5 5 1 0 0 Streptomyces spheroides: 2 1 57 31 9 0 4 1 34 73 2 0 3 1 31 28 2 6 2 2 50 43 4 2 11 27 0 2 63 57 2 4 85 16 19 6 59 46 1 6 55 43 4 0 41 33 8 18 83 102 2 33 3 4 0 44 0 0 66 3 18 11 0 0 2 Streptomyces tendae: 1 1 3 2 0 0 0 0 4 3 3 0 0 1 3 1 1 1 0 0 5 3 0 0 3 2 0 4 9 4 1 0 8 1 1 1 5 4 0 0 1 1 0 0 4 2 0 1 2 5 0 6 0 3 1 0 0 0 2 0 1 1 0 1 0 Streptomyces tenebrarius: 2 1 18 10 4 0 6 0 20 27 0 0 1 0 10 6 0 8 2 0 13 7 0 0 16 22 1 2 21 27 1 1 13 14 1 0 18 15 0 0 12 7 1 0 6 11 1 3 27 24 1 9 1 8 0 12 0 0 8 0 10 8 0 0 2 Streptomyces thermoviolaceus: 6 9 77 41 7 5 9 3 53 92 3 0 2 4 48 31 1 55 3 5 138 46 0 9 42 55 6 18 184 68 15 15 195 22 37 2 84 59 7 2 59 104 2 5 87 46 5 18 64 140 6 84 4 33 4 58 0 1 69 2 40 65 0 0 6 Streptomyces toyocaensis: 3 4 23 32 11 2 7 0 45 63 2 0 7 2 19 20 2 18 5 2 41 24 3 3 19 27 0 6 83 44 8 16 57 23 13 6 55 51 8 2 22 21 1 0 18 18 10 27 44 65 9 19 3 13 3 19 2 0 39 2 19 6 0 1 2 Streptomyces venezuelae: 18 11 205 170 20 8 15 0 283 207 7 1 5 3 146 74 6 89 3 5 265 103 1 6 150 145 10 23 511 242 9 39 420 79 40 9 314 151 1 1 129 143 2 3 133 112 6 34 306 327 6 119 1 47 2 167 1 1 209 1 101 76 0 3 15 Streptomyces verticillus: 9 3 96 84 12 1 11 2 112 118 1 0 7 2 45 13 1 22 0 7 101 53 1 5 60 80 5 13 204 108 2 21 121 40 11 10 110 71 2 3 15 30 1 5 34 70 4 50 105 151 13 41 2 22 0 65 1 1 54 1 30 44 0 1 8 Streptomyces vinaceus: 1 3 9 6 3 1 1 0 15 18 1 0 1 0 4 2 0 6 0 0 7 6 0 0 5 10 0 2 19 15 3 5 21 7 1 0 9 13 0 0 1 3 0 0 8 5 2 3 23 19 2 5 0 1 0 5 1 0 7 2 3 4 0 1 0 Streptomyces violaceoniger: 2 0 46 10 4 0 2 0 25 55 0 0 0 0 6 6 0 4 0 0 30 8 2 0 16 24 2 2 68 34 0 4 58 2 8 0 18 16 0 0 24 16 0 0 26 18 0 2 54 70 0 18 0 2 0 48 0 0 22 0 14 14 0 0 2 Streptomyces violaceoruber: 16 20 184 127 38 2 15 1 203 236 5 0 3 6 107 71 2 79 5 7 214 108 5 4 100 150 14 25 406 245 11 36 296 89 38 6 264 186 8 3 70 98 6 6 102 104 7 32 242 279 9 107 4 39 4 135 0 3 166 0 90 61 0 2 14 Streptomyces violaceus: 3 0 31 8 6 0 1 0 23 26 0 0 0 0 20 22 0 14 0 0 56 19 1 0 7 31 0 3 71 32 1 3 68 2 6 1 38 14 5 0 34 41 2 0 31 21 0 0 40 53 1 27 0 0 0 31 0 0 28 3 6 22 0 2 1 Streptomyces virginiae: 14 6 103 51 26 1 6 0 110 142 14 1 2 1 66 44 4 27 4 2 124 50 5 3 73 92 9 17 274 131 37 6 154 28 42 4 201 86 10 3 165 78 1 0 92 57 1 38 232 178 13 58 0 20 3 93 3 1 128 9 57 24 1 2 11 Streptomyces viridifaciens: 3 4 44 20 11 0 3 3 29 65 4 0 5 0 20 21 2 16 2 3 27 17 4 3 20 16 5 11 54 27 16 6 42 13 8 6 33 27 5 2 19 10 3 3 30 12 7 11 55 52 8 10 1 4 0 24 1 0 37 1 13 9 0 1 2 Streptomyces viridochromogenes: 13 11 160 132 44 4 20 1 145 274 5 1 8 3 108 87 3 51 7 5 152 84 8 6 122 193 1 20 362 234 13 30 262 88 56 13 224 190 7 2 89 102 8 5 125 114 8 44 256 288 15 107 3 34 6 122 0 5 155 3 60 73 0 1 12 Streptomyces wedmorensis: 10 10 108 92 12 4 12 0 156 145 11 0 4 2 67 60 6 56 7 0 106 65 4 5 96 83 3 15 194 116 12 34 198 42 13 5 170 92 6 1 84 59 4 1 79 96 2 35 166 195 5 79 2 21 3 107 0 3 107 4 68 44 1 1 8 Streptoverticillium baldaccii: 1 0 3 3 0 0 0 0 3 4 0 0 0 0 2 2 0 5 0 0 6 3 0 0 2 6 0 0 19 9 3 1 2 3 1 0 5 6 2 0 11 3 0 0 2 4 1 0 1 9 0 3 0 0 0 1 0 0 5 0 3 1 0 0 1 Streptoverticillium griseocarneum: 2 2 17 11 3 0 0 0 10 27 2 0 4 0 9 6 0 5 1 0 12 6 0 0 8 6 2 1 24 19 2 4 12 3 3 0 16 8 1 3 10 3 1 1 11 6 0 9 33 17 2 9 0 3 1 9 0 0 13 1 5 4 0 0 2 Streptoverticillium griseoverticillatum: 1 0 2 0 0 0 0 0 0 2 3 0 0 0 4 0 0 2 0 0 4 2 0 0 3 1 0 0 10 4 2 0 3 0 0 0 2 2 0 0 2 2 0 0 5 0 0 1 2 6 0 0 0 3 0 7 0 0 1 1 1 1 1 0 0 Streptoverticillium sp.: 1 0 5 8 1 0 0 0 2 9 1 0 5 0 1 2 0 3 0 0 2 3 0 1 2 5 0 0 6 10 0 0 5 8 1 0 2 8 0 0 1 1 0 1 5 2 1 1 9 5 0 3 2 2 0 3 0 0 4 0 2 4 0 0 1 Sulfolobus acidocaldarius: 91 37 7 4 32 931 376 433 129 162 397 1106 342 440 149 75 384 166 442 489 166 102 511 444 135 71 488 651 173 133 592 820 170 168 743 806 191 297 713 1171 913 344 864 476 322 128 249 1035 702 380 1005 358 846 33 120 414 636 1426 205 813 628 279 43 6 42 Sulfolobus islandicus: 12 7 4 6 23 64 32 50 32 37 28 86 43 30 16 8 35 20 42 49 18 37 37 35 20 19 22 29 22 14 34 41 30 29 19 41 16 43 45 146 120 56 74 52 29 22 28 139 84 43 83 38 66 18 27 65 95 72 43 74 43 45 7 1 4 Sulfolobus metallicus: 1 0 0 0 0 2 4 5 2 4 2 1 4 2 1 1 1 1 2 4 2 1 2 7 0 3 5 5 3 0 6 5 3 0 3 7 4 2 8 4 16 6 0 4 5 2 0 5 6 8 7 5 5 1 0 13 2 11 1 2 5 4 1 0 0 Sulfolobus shibatae: 13 7 0 1 12 181 100 115 26 29 78 259 87 97 46 21 100 50 109 87 34 27 121 100 23 15 79 156 43 42 163 131 31 46 147 170 31 56 142 272 249 80 201 101 34 25 42 257 165 85 253 88 163 18 19 83 112 286 65 206 92 56 8 1 4 Sulfolobus solfataricus: 242 93 47 33 113 1988 1162 1375 419 358 1047 2973 948 1110 508 328 1003 493 1187 961 449 373 1424 1282 377 292 930 1511 486 528 1688 1865 471 694 1602 2108 521 810 1867 2953 2581 1063 2341 1097 396 343 647 2886 2097 918 2673 1090 2133 115 264 1136 1874 3489 737 2388 1443 699 124 48 70 Sulfolobus sp.: 14 0 2 2 4 121 27 64 25 11 41 159 37 54 8 3 41 18 47 57 25 8 88 72 29 14 34 140 31 28 131 122 29 20 98 151 38 35 101 166 141 63 85 64 18 11 36 182 77 50 156 28 98 9 12 48 46 155 43 108 84 27 8 1 5 Sulfur-oxidizing endosymbiont of Riftia pachyptila: 1 2 10 4 10 4 1 2 8 14 2 2 2 1 9 6 5 6 4 0 12 3 6 5 7 12 7 4 19 10 8 3 11 2 16 8 14 11 3 5 11 10 1 6 9 11 3 10 18 8 15 5 3 5 2 12 4 0 16 2 22 6 1 0 0 Sym plasmid: 4 11 31 17 19 4 7 10 31 38 24 5 27 4 13 25 5 23 4 15 19 17 12 28 13 25 13 27 28 35 22 11 22 13 23 4 32 28 17 10 14 20 8 15 16 18 10 29 36 32 31 14 14 15 5 27 20 16 26 25 27 17 0 1 3 Symbiobacterium sp. SC-1: 1 1 18 18 1 0 0 0 5 24 1 0 0 0 6 4 0 3 0 0 11 10 0 0 12 9 2 1 23 16 1 2 23 7 4 0 11 20 1 0 17 12 1 0 19 11 2 3 32 25 2 21 1 3 0 18 0 0 33 0 19 5 1 0 0 Symbiobacterium thermophilum: 3 3 38 58 2 0 3 0 25 80 2 0 2 0 21 9 2 13 2 0 42 23 3 1 36 31 2 4 65 50 3 2 94 15 6 3 35 60 1 1 48 37 1 0 45 32 6 9 95 65 9 61 1 7 0 63 3 0 79 3 51 12 0 3 0 Synechococcus: 9 21 51 42 19 10 7 25 25 92 26 13 33 17 16 28 18 59 17 15 42 31 17 21 24 38 31 62 75 72 63 16 74 30 28 11 43 41 37 10 49 39 13 41 56 25 15 54 73 55 54 19 10 21 6 31 15 1 90 16 34 35 3 3 3 Synechococcus PCC6301: 76 121 563 267 299 15 11 122 424 797 123 76 499 75 173 317 126 331 157 73 527 276 160 112 316 320 190 411 593 492 626 89 730 162 566 72 482 486 369 374 299 429 212 508 456 270 127 732 503 527 539 457 195 133 88 510 294 4 637 430 376 281 30 32 13 Synechococcus PCC7002: 36 40 139 120 134 24 14 102 261 164 116 134 227 34 105 58 127 113 101 77 266 114 121 77 187 128 94 152 317 221 239 87 236 172 274 81 153 197 190 266 143 168 177 239 165 129 120 330 153 169 324 160 187 57 64 202 259 14 250 338 210 148 28 8 0 Synechococcus PCC7002 PR-6: 5 4 21 6 25 4 1 7 40 22 14 11 10 4 10 6 19 10 6 6 36 7 28 10 26 10 16 13 24 19 26 6 11 3 39 11 9 5 28 19 29 27 10 32 23 19 2 70 11 24 30 20 11 6 8 32 15 2 33 11 24 12 4 0 1 Synechococcus PCC7942: 100 244 821 410 254 43 33 286 775 1138 249 212 741 140 228 315 151 458 290 178 549 410 277 272 492 430 277 526 915 795 720 229 867 333 556 130 614 645 427 409 376 364 378 867 960 319 261 975 708 532 901 380 286 194 134 437 492 33 783 686 502 418 39 34 27 Synechococcus PCC8801: 1 0 2 1 2 0 0 3 1 4 3 2 2 1 4 0 7 4 4 6 6 1 6 0 9 0 7 5 7 1 9 8 2 2 6 2 3 7 11 6 6 5 6 9 4 0 2 8 2 1 11 7 2 0 2 4 2 0 4 5 6 2 0 1 0 Synechococcus WH7803: 4 15 46 9 10 11 5 3 49 71 30 3 17 12 21 12 10 24 12 6 35 19 6 9 22 18 10 14 50 21 18 29 48 10 16 1 22 41 21 17 25 26 24 22 34 19 10 44 45 42 36 21 9 11 1 29 13 0 51 15 25 19 1 0 3 Synechococcus elongatus: 22 14 211 106 99 6 4 40 127 189 61 33 137 19 92 40 55 102 62 41 182 72 46 39 168 56 55 74 333 117 134 34 165 81 149 22 109 235 62 100 88 157 77 185 109 61 36 212 141 84 178 146 98 40 21 125 137 1 155 201 120 72 12 9 1 Synechococcus lividus: 1 3 8 2 13 0 0 4 9 11 4 1 13 1 6 12 6 10 5 2 21 7 19 0 5 4 9 12 6 7 30 1 23 1 28 3 15 5 13 10 8 31 11 15 9 0 0 10 9 15 13 17 4 2 0 25 10 0 8 9 1 5 0 1 0 Synechococcus sp.: 243 446 1861 911 934 118 88 621 1683 2280 685 576 1441 374 715 726 593 1047 598 474 1692 841 746 513 1217 863 688 1377 2349 1419 1862 554 2252 795 1789 350 1560 1679 1346 1463 1223 1381 970 1665 1582 730 448 2486 1657 1528 2074 1098 680 415 246 1324 1225 73 2098 1864 1353 980 102 85 55 Synechococcus vulcanus: 13 4 59 34 32 7 3 39 85 126 34 16 90 14 45 32 38 49 30 25 115 52 36 23 105 27 37 66 182 54 87 18 150 60 131 18 71 153 48 81 52 87 58 82 45 105 45 83 74 48 102 72 46 30 12 115 97 7 117 142 118 106 3 9 1 Synechocystis: 9 12 37 49 13 6 12 19 38 48 18 28 50 8 48 7 18 14 16 8 40 14 27 14 63 15 9 12 72 25 23 21 43 37 36 19 20 60 20 52 26 26 32 50 36 12 24 82 32 41 61 27 20 17 11 17 46 4 37 67 45 26 3 1 5 Synechocystis PCC6714: 5 4 35 38 27 1 1 11 28 31 8 17 36 3 51 1 21 28 18 3 57 10 14 3 54 7 11 8 70 13 59 4 43 14 75 21 18 37 37 43 23 47 29 54 24 14 2 83 19 29 30 57 21 5 6 52 32 0 60 41 43 14 2 3 0 Synechocystis PCC6803: 67 66 223 288 220 56 61 178 325 419 164 360 640 46 391 61 181 185 220 82 634 151 257 82 480 149 201 136 828 293 529 193 494 312 560 250 241 590 344 552 251 368 380 571 386 226 175 866 305 384 565 306 265 68 105 373 530 35 459 749 458 310 33 27 6 Synechocystis sp.: 3337 5580 13545 14862 11185 4675 5089 15031 15384 22209 10665 28094 32087 4214 17673 4318 9384 11237 16198 7097 29164 8562 14938 8453 27652 9101 10625 11326 42252 16893 21886 13793 25159 19521 22001 11478 12306 31777 17959 32148 13498 16650 27229 36779 22950 7904 12458 48836 16794 19653 34934 13242 18475 4167 6820 11697 31891 4781 19632 43849 21501 16870 1466 1220 651 TOL plasmid: 6 17 56 27 32 9 16 21 46 86 34 25 49 8 20 19 20 37 26 16 38 20 15 17 21 45 22 32 53 42 32 26 75 37 42 16 45 48 30 41 53 36 36 27 51 34 35 68 95 59 54 31 52 30 19 58 40 17 60 35 55 28 0 2 4 Taxeobacter ocellatus: 1 0 10 1 11 0 0 0 8 19 1 0 0 0 2 12 0 0 0 0 18 8 2 0 5 12 2 0 4 0 25 0 18 1 21 18 0 10 12 9 9 16 1 3 6 10 0 17 13 24 0 7 0 2 0 13 1 0 22 5 15 2 1 0 0 Thauera T1: 2 20 24 18 13 11 8 7 14 30 37 8 37 8 17 21 12 12 17 9 17 11 8 7 6 8 15 28 27 28 28 16 25 23 18 6 27 28 34 16 33 9 34 17 32 2 16 42 47 22 56 3 20 10 7 12 22 13 29 40 24 8 0 1 1 Thauera aromatica: 4 5 57 17 8 1 2 0 41 86 6 0 5 1 19 24 0 17 2 2 77 18 3 3 29 30 1 9 133 44 2 3 101 13 10 1 53 56 2 10 57 34 1 4 35 28 5 46 41 59 16 29 6 18 3 25 4 0 68 2 36 12 1 1 2 Thermoactinomyces intermedius: 2 1 15 12 12 4 3 0 9 18 3 5 21 2 5 9 1 5 2 5 18 5 4 0 4 13 3 11 24 15 15 22 27 14 8 2 11 34 7 43 7 15 14 13 5 5 11 39 17 25 26 11 15 11 5 8 17 0 28 22 24 2 2 0 0 Thermoactinomyces sp.: 2 7 7 1 6 1 0 4 4 7 6 10 13 5 19 9 6 24 5 11 20 5 8 3 10 8 9 12 29 6 25 34 13 7 14 2 16 17 25 23 8 21 19 24 5 5 10 24 13 14 22 13 13 4 2 6 9 3 20 19 12 8 2 0 0 Thermoactinomyces thalpophilus: 2 0 6 0 3 1 0 1 0 4 0 0 1 0 7 2 1 5 0 0 8 3 3 1 0 0 0 7 2 2 9 2 3 0 10 2 1 0 5 4 1 12 3 30 2 0 0 5 4 1 1 0 0 0 0 4 4 0 2 1 4 0 2 0 0 Thermoactinomyces vulgaris: 5 13 42 33 25 16 6 6 34 48 29 14 60 22 44 27 27 49 19 33 91 41 25 20 36 46 21 38 66 46 43 44 89 46 25 12 47 75 24 85 44 88 79 70 38 24 36 69 40 90 82 80 66 12 10 39 88 8 71 43 52 65 1 1 3 Thermoanaerobacter brockii: 8 6 11 12 29 64 23 33 17 19 72 108 37 41 15 14 37 19 34 81 18 16 49 59 13 16 62 105 27 25 121 108 47 40 101 126 19 33 102 182 59 25 92 54 31 19 33 185 76 58 110 24 105 10 9 27 105 119 29 148 96 46 5 2 1 Thermoanaerobacter ethanolicus: 5 6 2 0 8 57 13 18 7 9 43 66 34 30 5 4 17 16 24 54 10 7 30 37 8 12 37 66 21 16 48 74 41 20 51 93 9 18 61 131 37 32 87 28 13 20 45 128 42 40 100 26 74 6 13 11 96 85 12 61 64 32 3 0 2 Thermoanaerobacter kivui: 1 0 0 0 2 10 2 2 9 7 13 19 11 15 3 0 8 6 6 47 4 4 17 9 1 3 3 34 1 9 26 15 9 2 26 55 4 13 24 44 16 19 44 14 5 1 2 19 6 16 43 14 31 0 0 5 18 15 4 17 6 4 1 0 0 Thermoanaerobacter thermohydrosulfuricus: 4 3 6 1 4 76 36 15 16 9 74 93 34 58 12 8 60 20 49 136 30 18 74 79 11 19 79 114 28 28 70 119 48 39 88 120 21 52 96 212 68 62 212 81 36 16 51 146 63 101 237 75 168 4 4 39 152 140 8 93 74 83 1 1 2 Thermoanaerobacterium saccharolyticum: 4 6 3 1 4 59 23 12 8 15 53 84 46 62 13 19 59 39 42 109 21 34 75 65 6 16 53 108 17 19 72 95 49 21 85 94 13 30 93 131 76 51 213 77 30 17 38 129 49 73 224 46 139 5 3 33 129 119 24 87 71 71 3 0 1 Thermoanaerobacterium sp.: 2 3 3 1 2 32 11 5 7 9 31 37 24 35 4 8 31 21 21 66 8 17 39 26 5 11 25 79 13 10 39 43 31 17 32 52 10 24 38 75 38 31 102 37 21 13 17 66 34 43 96 22 56 5 2 21 52 62 14 39 40 31 1 0 1 Thermoanaerobacterium sp. 'JW/SL YS485': 2 2 1 0 1 19 17 6 2 2 17 18 10 9 2 8 10 7 2 12 4 9 9 16 2 8 15 10 7 11 14 29 13 8 9 16 6 17 19 34 22 13 27 14 5 3 16 40 20 20 43 17 30 4 5 10 39 31 5 17 24 14 1 0 1 Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum: 15 2 7 8 18 149 33 41 22 18 134 150 72 130 7 17 35 33 54 174 16 34 71 93 7 45 70 253 31 35 175 171 98 22 158 169 44 57 135 340 102 54 237 89 50 18 60 288 102 77 247 47 120 24 24 42 154 286 46 192 177 17 7 3 5 Thermoanaerobacterium thermosulfurigenes: 15 10 9 4 16 153 92 45 23 49 206 238 150 178 23 46 158 132 154 367 50 95 194 149 9 48 132 303 52 77 203 261 137 68 247 277 82 125 209 395 178 142 585 198 119 27 100 298 133 176 485 135 343 17 15 75 380 440 75 258 232 155 9 3 3 Thermococcus JDF-3: 1 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 1 0 0 0 0 3 0 0 6 1 2 1 1 1 0 0 3 0 5 0 3 2 0 0 2 0 0 0 9 5 1 1 0 4 2 0 1 1 4 1 2 1 0 0 1 Thermococcus celer: 16 2 78 11 21 38 205 9 251 61 47 3 9 5 51 25 6 92 3 16 132 52 5 15 71 123 17 21 212 61 19 85 98 48 117 12 190 58 97 40 311 148 4 1 119 99 4 44 357 182 50 118 15 28 6 116 12 141 181 22 131 32 2 1 13 Thermococcus litoralis: 8 7 18 10 9 115 101 36 95 36 140 63 53 39 23 8 22 79 36 71 42 30 47 100 46 46 30 120 78 26 81 115 98 38 82 83 60 61 148 232 243 122 63 42 43 39 35 267 218 126 139 130 131 15 16 92 116 171 82 111 110 86 1 2 5 Thermococcus sp.: 12 7 58 25 24 72 232 33 314 90 137 28 35 36 31 27 20 124 14 47 179 60 43 50 72 145 36 93 310 83 108 138 197 68 138 52 274 78 191 155 476 159 37 21 142 98 17 181 547 318 117 228 61 25 6 164 66 211 221 126 162 64 2 1 9 Thermococcus sp. AN1: 2 0 1 0 0 9 14 0 21 3 8 1 3 1 2 1 1 5 0 2 6 3 1 1 4 4 0 4 25 8 9 7 10 8 6 4 11 9 14 12 30 6 0 1 7 6 0 14 34 17 8 5 0 0 0 13 0 17 7 6 5 2 0 0 2 Thermococcus sp. Rt3: 1 0 5 0 1 1 5 1 15 7 6 0 1 5 6 3 0 15 2 4 11 2 1 5 6 6 3 2 26 8 7 7 21 6 11 2 19 2 13 4 23 23 1 0 9 7 1 3 14 24 6 30 5 3 1 17 3 16 12 2 6 24 0 0 1 Thermofilum pendens: 2 2 9 1 6 6 21 7 12 11 5 3 7 1 11 7 2 7 1 3 5 9 4 1 6 4 7 2 5 13 6 7 10 15 10 7 20 21 26 4 21 4 0 3 1 7 0 12 27 20 10 11 1 0 1 14 3 9 7 4 11 1 1 0 1 Thermomicrobium roseum: 1 9 30 9 3 0 0 1 18 30 0 0 1 1 3 12 0 4 0 6 22 20 1 4 5 25 2 5 23 28 5 6 21 10 17 2 23 21 4 0 30 16 1 2 27 7 1 12 45 31 4 10 1 0 0 14 0 0 48 0 11 0 0 0 1 Thermomonospora alba: 1 1 16 6 2 1 0 0 16 18 0 0 0 0 15 9 0 11 1 0 19 6 1 0 6 15 3 1 25 9 9 3 29 1 20 0 14 15 1 0 8 32 1 0 28 11 0 8 14 24 0 18 0 4 0 13 0 0 26 1 7 14 0 0 1 Thermomonospora curvata: 3 3 60 43 7 4 2 2 62 82 2 0 8 3 43 19 2 52 3 5 81 30 3 4 83 62 10 19 104 71 12 17 106 41 11 5 75 59 6 12 22 42 2 11 40 57 2 47 55 134 4 49 2 16 2 58 0 2 58 3 21 51 1 1 1 Thermomonospora fusca: 7 4 88 51 15 6 5 3 103 107 7 0 10 3 160 58 8 96 8 10 247 59 16 4 144 120 24 14 272 124 27 51 272 39 51 3 144 102 13 19 71 217 2 9 117 71 2 65 113 250 9 162 0 44 0 124 0 0 137 1 66 123 2 1 4 Thermoplasma acidophilum: 29 16 74 25 38 165 404 53 220 310 194 15 34 136 148 105 64 165 37 152 162 174 73 152 72 175 94 236 223 151 133 244 286 99 225 158 248 242 248 167 660 296 146 18 283 121 92 306 575 294 443 281 124 65 8 298 103 631 228 112 352 65 8 5 16 Thermoproteus tenax: 1 0 5 1 0 4 5 3 34 13 3 3 16 2 10 5 1 4 0 2 0 5 4 3 6 9 1 6 32 15 13 6 28 13 2 1 14 10 4 1 5 5 3 2 3 0 1 2 4 6 1 12 6 0 1 9 1 9 6 1 6 6 0 1 0 Thermotoga maritima: 91 88 59 54 102 1123 592 57 1136 713 669 61 296 203 430 243 360 321 207 486 379 460 220 315 436 386 372 520 497 547 489 1165 288 232 713 327 609 1077 894 1487 1381 1000 343 129 602 430 172 2102 1158 896 1028 941 285 75 124 1068 452 981 996 418 816 450 28 2 61 Thermotoga neapolitana: 13 4 6 9 19 153 129 11 163 123 168 10 34 44 80 34 74 53 45 101 97 99 29 88 67 68 66 144 74 86 60 226 77 54 118 46 108 213 136 238 212 222 52 21 117 81 25 343 227 179 192 222 61 22 19 216 113 121 193 54 132 151 2 1 10 Thermotoga sp.: 2 3 0 1 0 14 15 1 9 11 10 5 7 6 3 3 6 2 7 6 4 5 1 3 7 5 6 13 6 7 5 13 3 7 13 7 5 12 9 26 22 23 3 4 9 7 8 31 20 8 12 19 10 1 4 18 8 13 20 15 14 23 2 0 0 Thermus aquaticus: 56 29 449 529 35 30 288 71 791 765 253 25 119 8 292 62 26 231 21 30 542 172 19 46 696 206 94 36 1429 338 88 106 703 668 60 47 418 847 70 99 831 358 17 64 379 322 42 225 1330 670 49 437 42 57 8 429 162 25 570 85 307 210 14 17 25 Thermus aquaticus caldophilus: 2 0 34 43 0 1 16 3 88 44 18 1 10 0 20 6 0 19 1 0 30 13 0 2 47 17 0 2 105 28 1 3 32 48 2 2 33 62 2 2 48 19 1 4 26 25 2 12 95 51 1 27 2 1 0 30 6 3 21 2 19 14 0 2 0 Thermus aquaticus flavus: 10 3 97 106 3 2 25 3 137 146 57 0 33 0 57 8 1 27 0 3 109 31 2 1 126 40 14 6 307 95 14 17 153 122 3 6 90 197 10 6 160 73 0 4 95 55 4 21 274 159 7 76 4 7 0 86 23 3 159 10 76 43 2 1 7 Thermus aquaticus thermophilus: 86 40 777 880 51 41 405 91 1673 1003 380 26 257 5 483 124 22 382 11 14 887 357 18 42 1248 344 118 48 2110 734 85 117 1073 1246 101 46 802 1498 80 96 1328 581 19 85 626 559 23 276 2279 1120 45 874 45 123 10 909 222 56 960 147 547 383 22 19 45 Thermus scotoductus: 1 1 27 21 0 2 17 1 32 33 16 2 5 0 9 1 0 12 0 0 23 6 1 0 21 9 3 4 33 6 5 4 18 35 1 1 14 37 1 2 39 12 2 1 10 10 1 17 73 17 7 20 1 3 1 13 7 2 14 8 7 6 0 1 0 Thermus sp.: 3 5 52 80 7 2 28 6 95 67 32 4 26 1 41 5 2 25 2 1 63 11 2 4 70 29 14 5 157 44 7 14 51 84 6 2 32 68 6 2 38 30 1 8 30 31 6 32 113 43 8 48 3 5 0 33 14 2 26 2 18 24 0 2 1 Thermus sp. SM32: 1 6 7 2 2 2 4 7 10 3 5 5 1 2 3 1 3 3 1 1 9 2 0 0 5 3 5 3 9 4 3 2 2 2 3 2 4 3 2 7 7 5 5 7 8 3 4 14 11 4 5 9 3 2 1 8 8 4 6 2 1 8 0 0 1 Thermus sp. Tok6A1: 1 1 4 5 4 4 1 3 5 7 6 3 4 2 7 0 2 7 0 1 5 5 1 0 4 8 3 4 8 3 4 3 3 2 3 3 8 6 1 6 14 6 1 6 7 1 2 15 11 5 3 8 7 3 0 5 8 3 3 1 2 9 1 0 0 Thermus sp. YS45: 1 2 4 5 4 1 9 5 16 12 8 2 3 3 5 0 1 0 0 2 16 3 1 4 12 2 3 2 21 3 7 3 8 10 2 1 14 10 4 7 11 9 2 4 6 4 2 7 15 13 7 9 2 0 1 7 3 1 7 4 5 7 0 0 1 Thermus thermophilus: 62 18 762 894 26 31 407 56 1498 978 345 18 189 8 386 93 16 298 8 9 723 227 14 39 1193 270 73 37 1998 572 60 103 926 1013 54 27 631 1180 49 60 1010 403 3 68 581 437 18 252 2174 972 27 662 17 96 0 725 172 34 668 72 389 281 16 21 25 Thiobacillus cuprinus: 5 6 61 16 25 2 2 3 24 48 18 1 16 2 32 18 12 13 2 4 63 31 8 7 43 18 14 14 77 48 12 9 100 20 31 7 65 65 19 30 90 30 21 16 39 32 11 76 75 61 31 31 16 12 4 43 14 0 85 28 62 7 5 0 0 Thiobacillus denitrificans: 3 0 34 7 19 1 0 0 23 49 0 0 0 0 13 18 1 13 0 1 42 11 2 0 23 22 2 7 63 27 7 2 78 1 20 2 38 24 7 5 51 32 0 1 24 29 2 32 32 68 6 41 4 8 5 46 0 0 45 1 39 20 2 1 0 Thiobacillus ferrooxidans: 83 165 849 520 441 75 127 96 496 1213 229 95 481 95 356 250 130 381 199 121 698 386 154 175 456 506 190 366 1196 975 328 295 969 374 538 232 584 892 248 366 632 428 302 328 798 384 349 860 862 754 733 335 354 216 109 544 364 126 875 393 704 358 22 17 44 Thiobacillus intermedius: 1 1 15 6 3 1 2 2 8 10 2 0 3 3 5 4 1 9 0 1 9 11 1 0 11 9 3 4 16 9 2 1 13 4 2 0 7 10 0 1 13 8 2 1 8 11 3 3 11 14 2 11 3 5 2 9 2 0 7 2 6 8 0 1 0 Thiobacillus neapolitanus: 4 3 4 1 17 0 0 1 1 12 2 2 7 3 3 0 2 4 1 7 6 2 4 5 5 1 4 10 19 20 19 2 18 0 21 8 15 6 20 7 4 10 4 9 2 6 3 27 5 5 10 7 6 2 3 4 3 0 10 15 15 4 4 0 0 Thiobacillus sp.: 2 0 22 3 6 0 0 0 7 33 0 0 1 0 7 8 1 7 0 0 30 1 1 0 11 17 0 2 37 14 1 0 44 0 7 1 14 23 0 5 29 18 0 2 9 23 3 12 36 34 2 21 2 9 0 25 2 0 32 1 16 13 1 0 1 Thiobacillus thiooxidans: 1 2 9 2 14 0 2 1 11 7 11 0 5 5 9 9 8 1 1 0 8 2 5 1 12 7 8 4 10 1 9 1 9 2 12 2 13 2 5 7 8 2 3 5 5 5 2 5 12 11 12 7 3 0 2 14 9 1 8 3 6 10 0 0 1 Thiocapsa roseopersicina: 9 37 135 70 37 1 6 4 116 156 22 1 35 6 41 37 3 58 9 16 102 51 9 11 64 97 11 28 164 119 13 32 144 70 36 7 133 72 14 19 66 74 21 35 85 69 39 23 182 139 63 49 47 35 14 88 18 2 174 19 72 60 1 1 7 Thiocystis violacea: 8 6 136 27 27 2 18 0 138 168 20 0 36 4 49 50 4 80 8 6 138 68 6 12 56 88 8 30 186 174 12 20 179 34 38 2 136 68 16 24 144 84 28 26 166 33 18 46 157 173 56 54 26 24 10 101 10 2 158 18 148 54 0 0 8 Transposon Tn: 1 1 13 0 1 0 0 0 2 10 4 0 2 0 6 2 0 4 0 1 3 5 2 0 6 6 1 2 14 2 0 2 14 2 1 3 3 1 0 10 1 6 2 4 3 2 1 10 1 10 3 6 3 2 0 5 2 3 6 4 3 3 1 0 0 Transposon Tn-cam204: 1 0 1 1 2 1 0 1 1 6 2 3 0 3 1 2 0 0 4 0 8 3 2 0 3 3 1 2 8 3 2 1 5 2 2 1 2 5 8 7 5 4 6 6 7 5 7 6 6 4 8 4 7 1 4 9 11 3 1 5 9 5 1 0 0 Transposon Tn10: 6 19 11 7 22 8 5 26 18 27 38 74 37 27 3 13 21 20 26 31 22 15 24 14 9 9 16 39 21 25 41 16 24 18 31 20 13 17 23 72 22 22 40 48 26 19 33 50 35 16 41 14 30 9 10 18 54 16 34 51 35 31 2 1 3 Transposon Tn1331: 4 11 21 8 7 3 9 8 12 26 16 7 24 6 13 14 8 13 9 12 25 14 6 12 6 17 4 19 18 18 21 19 24 10 12 17 16 20 21 24 23 12 12 18 26 3 12 40 29 26 30 14 11 3 1 9 15 6 27 22 19 19 2 0 2 Transposon Tn1525: 3 4 22 18 15 2 2 1 9 26 9 1 1 2 11 2 2 8 5 0 5 14 4 12 4 13 4 9 16 18 10 8 18 2 9 12 12 13 13 26 13 20 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Tn4351: 5 12 15 7 7 16 13 6 6 19 23 35 32 11 12 10 12 11 17 17 10 12 13 15 9 8 23 30 16 6 19 20 11 9 25 17 11 8 27 65 30 25 44 27 18 10 15 44 19 20 31 9 22 7 5 13 56 30 14 41 29 14 2 1 2 Transposon Tn4399: 2 6 3 10 6 7 5 1 7 8 4 6 11 4 7 4 3 7 5 7 7 5 4 2 4 2 1 10 12 5 4 8 10 3 9 7 5 8 3 16 26 19 8 4 16 4 7 20 17 12 14 10 3 6 0 11 7 9 11 5 13 3 2 0 0 Transposon Tn4521: 1 1 5 5 2 1 2 1 3 2 3 3 0 2 2 4 1 3 3 2 3 4 3 0 0 2 2 3 5 3 8 3 3 2 3 0 2 5 3 6 4 2 1 2 10 2 0 5 4 0 2 3 1 3 0 1 2 1 1 2 3 5 0 0 1 Transposon Tn4551: 4 8 13 7 6 15 24 5 5 21 28 30 18 14 8 14 10 17 16 17 12 11 14 12 5 13 11 21 15 11 13 16 11 9 16 11 13 15 25 82 38 24 31 19 14 16 10 55 27 18 36 15 26 5 9 14 44 33 23 48 26 18 2 1 1 Transposon Tn4556: 8 28 132 99 39 8 23 2 83 142 26 0 9 11 62 51 9 65 6 7 74 41 13 25 47 98 21 40 145 123 49 34 112 40 43 17 95 78 16 7 52 35 5 14 93 65 22 22 97 116 34 43 6 30 6 49 8 2 59 8 42 30 0 3 5 Transposon Tn501: 5 2 41 14 8 1 2 2 17 53 5 0 18 3 16 14 1 27 2 9 36 17 11 6 12 26 1 9 68 56 10 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9 31 81 43 11 66 15 55 5 10 16 54 45 13 66 37 22 5 1 1 Transposon Tn7: 1 2 0 1 1 3 0 4 4 1 2 1 2 1 1 5 4 2 2 4 1 3 2 0 1 0 3 4 3 4 2 2 7 1 0 1 3 6 2 4 4 5 2 4 3 5 1 8 4 6 8 5 2 2 1 5 3 1 5 5 2 4 1 0 0 Transposon Tn9: 1 0 1 1 2 1 0 1 1 6 2 3 0 3 1 2 0 0 4 0 8 3 2 0 2 3 2 2 8 3 2 1 5 2 2 1 3 5 7 7 5 4 6 6 7 5 7 6 6 4 8 4 7 1 4 10 10 3 1 5 9 5 1 0 0 Transposon Tn903: 3 9 16 16 20 5 7 0 8 35 10 0 2 8 8 9 5 9 7 11 18 12 8 2 5 8 10 19 16 26 14 2 14 8 21 7 10 12 8 31 15 17 14 3 23 6 9 23 5 20 20 15 6 5 6 18 11 3 27 14 16 16 0 0 3 Transposon Tn916: 12 32 10 6 44 42 2 19 18 24 49 52 40 29 6 5 13 14 32 44 30 8 31 45 4 3 17 66 18 8 44 35 18 9 34 25 15 15 46 129 92 43 83 43 39 8 31 100 42 47 98 51 64 8 16 23 58 32 23 87 66 12 4 7 1 Transposon Tn917: 5 24 12 7 15 20 9 32 9 13 33 67 20 28 7 5 33 9 34 24 14 12 34 13 1 7 18 24 10 8 34 25 7 16 13 19 15 10 24 103 24 26 55 41 15 11 29 72 21 18 66 17 44 1 7 13 48 29 14 77 29 11 4 1 0 Treponema denticola: 19 33 60 15 50 115 39 30 60 46 204 153 100 100 77 65 108 87 56 140 150 70 121 18 57 52 124 223 148 41 225 173 126 37 237 177 49 51 247 384 229 169 250 142 90 38 61 402 111 166 353 70 182 18 19 86 240 186 119 257 183 80 15 3 1 Treponema pallidum: 82 152 489 322 584 155 213 146 498 590 669 241 638 220 283 322 538 293 344 270 366 517 347 141 205 317 341 824 392 1198 503 493 397 658 672 457 378 1173 693 482 892 381 488 342 846 320 267 808 1070 613 944 402 405 181 216 388 867 255 560 770 728 231 24 36 23 Treponema pallidum subsp. pallidum: 1 3 6 4 8 0 2 1 5 9 9 1 6 1 3 4 2 2 3 5 5 8 2 2 3 3 5 12 2 8 5 5 7 7 6 4 2 15 6 14 11 4 6 6 12 3 6 14 8 6 12 9 10 0 3 3 15 6 5 5 10 7 0 0 1 Treponema phagedenis: 11 21 24 11 18 38 7 11 25 21 82 60 57 42 31 28 36 39 23 58 47 35 33 8 21 29 25 134 59 88 81 74 33 27 55 47 16 28 84 180 65 62 101 88 63 8 22 210 53 49 105 29 58 9 7 27 96 48 43 110 80 20 9 0 2 Trichodesmium sp. IMS101: 1 0 3 0 13 1 0 8 1 0 2 10 2 0 2 0 3 2 0 1 1 0 12 2 0 0 7 10 0 0 24 3 2 0 23 10 1 0 9 10 4 13 1 11 4 3 1 17 10 8 8 4 4 3 3 5 2 2 11 10 10 0 1 0 0 Trichodesmium thiebautii: 1 0 2 0 12 2 0 8 2 1 2 9 4 0 2 0 3 2 0 1 2 1 10 2 2 0 5 6 1 1 21 3 3 0 21 11 1 1 8 10 8 13 2 9 7 5 0 16 9 10 3 4 4 3 3 4 3 0 12 10 10 0 1 0 0 Tsukamurella tyrosinosolvens: 1 0 17 3 2 0 0 0 24 24 0 0 0 0 3 15 0 3 0 1 28 3 1 0 9 7 0 0 54 20 3 0 44 0 13 0 39 9 4 6 36 15 0 0 15 2 0 5 44 26 7 5 0 0 0 9 1 0 32 1 7 1 0 1 0 Ureaplasma urealyticum: 15 16 7 5 83 49 7 41 2 6 51 229 34 99 6 6 48 20 53 124 10 15 89 81 6 12 47 97 16 13 150 103 13 24 151 94 12 23 172 258 41 59 142 97 14 40 59 244 24 55 188 36 106 10 31 38 109 45 42 230 107 5 11 4 26 Ureaplasma urealyticum serovar 3: 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 2 11 2 6 0 0 3 0 7 7 1 0 6 44 0 0 2 44 0 1 7 4 0 0 48 0 0 1 7 61 2 5 7 46 0 0 1 54 0 1 4 2 2 0 1 1 5 3 1 5 2 0 1 0 1 Veillonella parvula: 10 4 18 0 46 2 0 6 10 0 38 68 68 2 44 0 44 16 10 56 8 2 68 70 0 6 56 120 12 30 178 4 54 6 146 110 0 10 78 106 12 42 58 68 2 10 20 110 16 22 68 22 28 6 12 68 28 4 86 78 96 10 10 0 0 Vibrio alginolyticus: 43 57 127 9 275 31 7 350 76 221 267 172 216 168 33 107 249 144 140 194 144 138 213 252 22 89 171 418 152 347 322 78 311 69 601 324 138 251 367 390 244 349 170 363 196 148 122 516 304 316 390 260 108 32 87 339 277 44 454 394 409 148 35 6 2 Vibrio anguillarum: 48 120 125 35 231 171 70 217 134 178 330 520 284 320 92 133 307 202 273 247 216 137 264 199 59 89 212 356 204 232 378 213 249 146 467 279 180 215 417 736 266 335 615 498 249 118 264 668 366 251 709 202 460 71 163 218 559 307 296 605 386 218 24 13 11 Vibrio anguillarum serovar O1: 1 2 1 1 12 1 0 4 4 4 9 8 9 12 2 8 4 5 2 2 16 6 4 2 0 2 0 19 5 13 9 4 12 2 17 1 1 5 7 12 5 13 12 20 8 0 1 12 10 6 20 2 1 0 0 5 4 1 7 14 10 1 1 0 0 Vibrio cholerae: 278 501 962 243 1314 576 212 903 833 1431 1171 2029 1640 1259 490 824 1293 1011 1362 1042 1363 845 1191 1028 395 668 889 1721 1243 1725 1815 868 1491 716 2344 1119 943 1729 1648 3353 1342 1741 2516 2555 1347 644 1133 3228 1772 1101 3439 1060 1900 337 533 1072 2642 923 1686 2804 1990 1033 150 54 75 Vibrio cholerae O139: 10 17 40 12 76 18 7 47 20 53 65 108 96 37 19 44 61 27 45 42 62 33 52 46 21 34 51 53 73 87 104 26 58 39 112 52 41 100 120 144 54 57 90 90 52 30 62 121 79 52 160 50 68 17 21 21 132 28 59 137 85 40 8 1 1 Vibrio cholerae non-O1: 3 5 8 2 24 0 0 26 12 47 16 22 11 11 5 6 23 12 5 22 19 15 14 19 4 5 21 35 25 45 39 10 33 10 67 22 18 27 38 49 12 34 23 41 10 18 15 44 20 19 40 17 14 3 13 41 24 1 49 45 32 4 1 0 2 Vibrio damsela: 1 7 0 1 1 9 0 10 1 0 6 20 2 24 1 2 16 6 7 17 1 4 10 10 0 0 13 19 2 3 14 10 4 1 14 10 4 1 6 38 9 11 38 17 5 2 8 23 7 8 35 3 20 3 3 8 18 18 3 15 8 17 0 1 0 Vibrio eltor: 1 5 3 1 2 3 1 3 3 7 2 5 3 4 0 2 3 2 7 1 4 2 2 4 4 3 0 5 7 1 4 6 0 1 4 3 3 3 3 7 3 5 4 8 3 6 1 2 6 6 4 1 2 3 0 2 8 5 3 6 3 1 0 0 1 Vibrio fischeri: 20 26 17 6 48 42 12 53 24 19 65 202 46 112 16 32 110 45 110 111 36 39 93 67 11 17 90 118 24 47 118 70 35 28 109 103 27 27 108 313 68 89 271 138 37 31 97 224 68 68 238 50 160 41 57 48 176 118 53 262 118 72 17 2 1 Vibrio furnissii: 12 22 76 12 71 3 2 35 57 152 52 43 123 48 19 60 63 69 29 38 107 89 40 54 33 73 40 109 132 208 74 37 175 67 157 31 88 197 77 139 51 113 59 110 84 66 70 156 65 121 174 101 69 30 31 97 107 12 128 169 151 78 9 0 3 Vibrio harveyi: 29 70 133 7 208 51 18 170 95 154 179 158 203 130 36 93 204 128 123 146 137 137 185 178 24 86 131 301 123 251 235 71 196 60 381 172 139 230 269 329 213 300 245 300 142 129 139 525 243 251 425 210 150 53 86 223 276 39 302 301 279 137 20 3 6 Vibrio hollisae: 1 1 0 0 1 2 0 0 0 0 3 1 5 4 3 1 9 1 3 5 1 2 4 3 0 2 3 4 1 0 3 0 1 1 8 7 2 3 5 13 2 2 9 5 1 0 3 8 3 4 5 4 7 0 2 4 12 6 1 2 5 2 1 0 0 Vibrio marinus: 1 0 1 0 6 0 0 8 0 0 10 0 0 1 0 0 5 4 0 3 0 1 7 6 0 0 2 18 0 2 28 0 12 0 11 2 0 0 17 11 2 11 1 8 0 5 1 17 5 8 4 4 0 0 2 5 3 0 15 2 6 2 1 0 0 Vibrio metschnikovii: 1 6 8 0 11 1 0 6 6 4 0 17 6 8 3 8 7 8 10 7 8 9 11 13 2 4 5 12 15 19 13 7 13 4 21 9 14 8 10 15 0 14 22 24 7 3 8 18 4 5 22 9 13 2 5 5 8 6 8 19 11 6 0 1 0 Vibrio mimicus: 3 4 11 2 31 3 0 4 12 16 15 17 28 15 7 9 23 26 21 16 15 20 22 12 6 14 14 23 15 21 22 5 18 9 35 19 14 30 25 43 11 33 32 35 22 8 15 37 24 19 52 20 24 0 10 20 37 7 25 22 21 17 3 0 0 Vibrio ordalii: 1 2 5 1 4 3 1 6 3 1 7 5 4 6 1 1 5 6 2 8 5 4 2 3 0 2 3 6 3 4 7 1 11 2 1 2 3 5 1 14 14 4 9 12 5 4 3 12 6 3 6 10 6 3 3 3 14 7 4 9 4 2 1 0 0 Vibrio parahaemolyticus: 72 120 260 11 501 58 16 412 125 374 365 343 423 362 105 215 413 298 212 349 307 251 340 378 31 153 237 716 243 565 505 108 529 57 813 390 224 407 496 908 299 787 428 824 285 250 202 992 478 527 763 441 229 63 106 427 494 110 564 586 669 186 53 14 5 Vibrio proteolyticus: 5 4 11 0 35 1 0 10 3 61 13 4 14 35 17 19 33 44 18 23 53 21 44 20 6 19 19 44 45 52 47 6 41 11 84 22 25 40 39 53 25 76 25 47 35 30 7 53 27 44 54 52 27 5 12 45 22 2 28 30 47 23 3 0 2 Vibrio sp.: 13 19 37 3 104 24 3 69 8 40 97 196 60 102 8 43 94 84 63 87 82 51 113 108 12 31 82 198 77 99 194 35 123 21 238 126 37 78 201 249 97 144 146 154 49 47 61 269 107 113 253 86 93 13 51 75 140 37 92 198 132 83 10 3 0 Vibrio vulnificus: 12 25 59 6 84 12 4 55 56 84 58 63 86 46 33 45 58 83 70 51 78 68 69 50 24 51 58 96 94 122 81 36 145 27 142 48 83 107 109 167 73 144 98 131 62 64 53 160 79 110 180 95 92 20 30 80 100 17 112 114 113 72 6 2 4 Vitreoscilla sp.: 3 0 3 0 3 0 0 0 0 0 0 3 39 0 0 0 3 0 0 0 12 6 6 3 0 3 15 24 9 24 12 0 15 0 9 12 9 12 9 21 9 9 3 21 6 3 9 21 6 9 15 3 9 0 3 0 12 0 6 30 9 3 3 0 0 Vitreoscilla stercoraria: 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 13 0 0 0 1 0 0 0 4 2 2 1 0 1 5 8 3 8 4 0 5 0 3 4 3 4 3 7 3 3 1 7 2 1 3 7 2 3 5 1 3 0 1 0 4 0 2 10 3 1 1 0 0 Weeksella zoohelcum: 4 10 4 6 14 24 8 11 9 9 42 58 31 34 7 6 19 18 20 24 13 17 29 17 6 13 20 28 9 6 20 28 12 7 25 24 4 11 38 134 23 17 72 50 20 12 21 88 13 28 61 28 37 9 13 12 83 25 25 64 18 20 2 1 1 Weissella confusa: 1 0 4 0 9 0 0 0 1 1 4 0 19 10 0 0 2 2 1 3 3 11 2 5 0 1 0 12 6 8 11 5 6 2 16 4 7 11 8 0 11 11 2 14 0 6 1 9 5 12 15 6 1 0 0 7 4 0 7 15 8 2 1 0 0 Wolbachia sp.: 2 0 3 0 7 8 3 6 4 3 16 13 7 18 0 0 13 10 7 14 4 2 15 10 0 1 8 28 1 2 30 15 6 4 28 17 5 8 28 38 23 10 21 7 8 1 2 39 16 9 29 5 8 1 3 2 7 18 9 29 18 1 1 1 0 Wolinella succinogenes: 42 221 102 11 72 177 51 184 420 54 424 70 224 99 153 58 170 233 119 160 327 109 183 51 227 29 266 188 361 298 315 403 356 180 258 117 289 344 231 614 342 283 243 291 134 202 153 331 626 211 483 169 271 156 61 275 343 33 517 370 437 165 26 7 9 Xanthobacter autotrophicus: 9 11 122 56 23 2 5 7 123 157 27 4 28 11 50 41 7 46 3 14 104 46 7 12 57 77 16 30 217 146 26 17 203 41 19 14 102 107 23 13 97 68 28 18 93 38 27 59 127 140 47 52 38 30 2 139 31 5 144 30 81 38 0 1 8 Xanthobacter flavus: 11 5 186 56 20 0 5 1 151 155 21 1 9 1 86 54 4 37 0 4 166 45 1 1 87 101 3 18 331 164 22 9 283 32 28 2 116 175 10 8 152 86 13 3 89 72 33 67 186 188 54 50 42 31 0 132 4 1 186 12 105 44 1 0 10 Xanthobacter sp.: 5 4 59 16 2 0 4 0 60 47 7 0 1 0 16 17 0 18 1 0 57 29 1 2 25 29 1 4 106 75 5 5 117 21 2 0 58 67 2 4 55 40 15 4 37 22 8 19 67 63 21 23 19 23 1 46 1 2 70 7 42 17 0 1 4 Xanthomonas albilineans: 1 4 9 8 4 1 2 2 5 7 0 2 9 6 3 9 2 5 4 5 14 6 7 7 5 5 6 6 5 10 5 4 7 9 5 5 4 8 4 9 9 13 4 1 8 5 3 5 11 4 5 3 4 3 2 7 5 4 11 9 15 12 0 1 0 Xanthomonas campestris: 110 149 1705 463 473 58 107 107 591 2736 207 61 862 131 420 702 133 977 236 167 1421 749 185 233 490 1378 206 722 2257 1746 357 223 2416 430 557 142 839 1905 255 239 1018 749 387 356 1568 547 421 939 1065 1314 906 618 340 345 49 954 286 60 1432 324 897 625 27 11 72 Xanthomonas campestris pv. campestris: 4 9 62 13 27 3 3 2 20 104 2 1 10 1 14 27 0 25 4 2 59 26 1 5 17 41 7 10 84 46 7 4 85 8 20 2 44 48 6 3 82 42 7 7 57 19 7 58 52 65 23 23 7 14 1 32 3 1 91 8 50 21 0 0 4 Xanthomonas campestris pv. manihotis: 3 14 50 7 13 11 6 8 32 59 24 3 31 10 24 19 13 22 13 12 34 28 16 14 26 41 14 25 66 36 26 22 65 14 16 16 23 39 18 17 49 31 23 19 48 19 9 31 37 50 42 32 16 10 4 45 20 12 34 20 27 32 1 1 1 Xanthomonas campestris pv. vesicatoria: 14 19 144 49 53 9 15 7 57 234 40 3 100 11 52 77 23 95 19 17 99 63 15 20 41 97 26 93 197 182 33 33 151 59 54 16 74 140 32 15 66 52 28 40 144 42 48 83 107 96 104 45 23 47 14 72 19 7 107 30 85 57 2 2 10 Xanthomonas citri: 2 4 29 27 19 3 5 2 14 111 6 5 37 5 13 18 4 31 6 9 41 29 4 9 21 64 12 28 92 53 13 6 96 11 22 1 24 93 9 9 48 11 20 14 104 19 23 23 60 32 30 5 4 21 0 17 6 0 47 11 20 7 1 0 1 Xanthomonas oryzae: 8 19 133 49 59 10 12 20 51 230 28 9 79 9 35 64 18 94 14 17 102 64 19 28 54 139 26 82 209 152 57 27 205 41 41 18 68 177 29 35 122 53 41 40 174 52 55 88 99 120 109 40 23 37 9 99 24 4 120 39 73 50 4 2 2 Xanthomonas oryzae pv. oryzae: 1 0 12 2 5 0 0 0 1 26 2 0 4 1 2 7 0 6 0 0 13 1 1 0 0 12 2 4 20 10 1 0 28 4 1 1 13 10 3 0 25 7 3 1 16 1 0 22 7 15 5 6 1 0 1 6 0 0 21 3 11 1 1 0 0 Xanthomonas sp.: 1 0 7 1 4 0 0 0 9 29 6 0 5 5 14 46 1 29 7 1 53 41 1 0 7 26 1 10 40 55 10 8 46 6 30 3 26 26 5 0 20 32 7 1 33 8 8 16 4 22 16 17 6 2 0 28 3 0 29 2 4 11 0 0 1 Xenorhabdus bovienii: 1 0 5 1 9 0 0 2 0 14 1 1 13 4 4 2 8 2 3 7 4 1 5 3 0 3 2 12 8 5 8 2 11 4 20 4 8 3 11 22 5 13 6 5 7 1 3 24 4 4 16 3 6 1 2 4 6 2 11 10 11 2 1 0 0 Xenorhabdus luminescens: 21 49 74 30 62 71 14 48 43 68 119 225 149 111 47 40 121 51 134 139 66 71 96 71 36 50 83 112 61 113 192 119 89 60 175 119 85 87 191 332 115 126 345 169 88 44 205 375 135 98 387 57 274 45 82 83 282 152 91 329 200 103 15 4 2 Xenorhabdus nematophilus: 5 1 15 12 50 13 3 6 13 77 16 29 42 16 21 7 38 21 18 30 28 10 44 21 6 14 6 37 27 25 59 25 42 11 58 19 18 10 52 98 26 62 42 40 44 7 9 92 29 33 72 25 22 3 5 24 28 9 44 50 39 9 3 1 1 Xylella fastidiosa: 3 2 6 7 24 1 5 2 9 4 7 2 11 3 7 3 6 4 2 1 3 7 6 5 5 3 6 0 6 4 13 6 7 12 15 1 13 10 12 5 4 6 4 2 9 3 10 4 13 6 11 6 6 8 9 5 9 0 5 7 13 13 0 2 1 Yersinia enterocolitica: 165 228 826 333 921 247 130 358 484 1757 691 1140 939 733 401 377 716 778 785 562 1159 506 767 623 345 665 572 1067 1158 1050 1122 440 1253 772 1380 674 757 1111 1204 1863 642 863 1425 1215 1231 339 690 1860 989 901 1836 448 1073 206 257 724 1052 597 1046 1595 1362 619 86 21 58 Yersinia enterocolitica (type 0:8): 26 39 72 40 129 94 37 102 56 132 144 327 213 169 49 60 195 82 156 100 105 60 159 111 42 65 113 194 124 116 226 98 123 88 240 129 87 122 248 347 143 141 360 157 129 36 159 315 159 100 376 77 312 34 78 118 310 226 131 389 201 117 18 3 5 Yersinia enterocolitica (type 0:9): 2 7 14 6 16 1 0 6 3 16 12 16 21 8 4 3 2 12 10 7 5 2 7 7 4 4 3 7 11 8 8 6 9 8 6 3 3 6 10 10 5 6 13 17 15 1 8 28 15 7 11 2 13 2 2 6 13 7 3 17 11 8 2 0 0 Yersinia intermedia: 1 0 1 0 2 0 0 0 0 3 1 2 1 2 0 0 0 4 2 1 4 2 0 1 0 1 0 2 4 1 0 1 4 1 5 1 0 3 1 2 2 1 4 4 3 1 2 7 4 0 5 3 2 1 0 4 4 0 2 2 2 2 1 0 0 Yersinia kristensenii: 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 1 1 0 2 2 0 0 3 0 0 1 0 2 1 1 1 1 1 4 1 2 0 1 2 0 1 2 3 1 1 1 1 1 0 0 1 3 0 3 0 0 5 2 2 3 1 1 0 2 1 0 1 0 Yersinia pestis: 71 133 343 149 391 126 66 203 206 721 323 545 458 308 209 171 301 369 361 327 472 262 279 290 163 305 289 445 458 405 430 220 507 369 506 234 371 457 446 753 299 385 729 569 565 179 314 804 447 363 886 255 584 91 118 355 516 238 459 662 558 329 31 7 33 Yersinia pseudotuberculosis: 87 146 286 150 422 159 78 242 238 570 397 729 609 435 227 206 451 364 507 410 521 313 411 374 173 245 352 513 461 483 633 310 533 457 735 421 327 514 691 1069 423 439 938 665 555 188 426 971 657 377 1133 257 687 85 179 392 680 427 517 844 664 344 43 6 38 Zoogloea ramigera: 2 2 29 0 8 0 0 0 27 43 3 0 7 0 14 22 2 18 1 0 32 18 0 1 11 38 0 4 74 46 2 0 84 3 6 2 22 31 6 8 36 35 13 8 40 5 6 23 19 34 17 16 3 9 1 30 4 1 43 7 32 21 0 1 1 Zymomonas mobilis: 77 95 449 220 556 161 54 97 248 637 525 441 738 207 279 240 451 393 181 194 632 406 242 203 222 578 445 582 894 461 1160 262 785 215 1108 165 624 275 933 1097 473 450 766 364 553 130 597 1433 279 487 1313 161 717 175 128 520 594 152 788 835 760 465 50 18 9 alpha proteobacterium M2: 1 0 1 1 0 0 0 0 8 6 0 0 1 0 3 1 0 2 1 0 4 2 0 0 0 6 0 0 5 4 1 1 3 0 1 0 4 3 0 0 7 3 2 0 0 1 1 3 11 10 2 3 1 4 0 4 1 0 6 0 3 3 0 0 1 dibenzofuran-degrading bacterium DPO360: 1 1 5 3 4 2 0 6 12 7 4 0 1 0 1 1 1 9 2 6 5 8 2 1 3 7 0 3 13 8 3 6 13 2 7 3 12 11 6 1 9 3 1 2 4 13 1 7 17 18 7 6 2 1 1 14 3 0 8 1 6 5 0 0 1 group G streptococcus: 5 4 5 3 44 20 4 19 5 3 56 72 36 38 4 4 12 20 23 53 6 13 56 35 3 6 23 73 10 17 81 27 9 10 46 24 13 16 54 160 57 42 65 88 25 4 9 182 55 44 73 16 30 2 0 11 33 6 12 37 25 9 2 1 1 manganese-oxidizing bacterium SI85-9A1: 2 0 23 16 0 0 2 0 14 24 3 0 1 1 9 15 0 1 0 1 30 16 1 0 9 16 0 3 33 24 1 2 45 4 2 0 19 16 1 2 26 16 7 2 19 8 6 10 30 34 9 19 7 6 1 21 2 0 31 1 24 13 0 1 1 naphthalenesulfonate-degrading bacterium BN6: 2 0 12 10 2 0 0 0 6 19 3 1 5 1 6 7 0 16 2 3 7 5 3 3 10 15 3 3 25 19 5 4 34 6 0 4 15 10 3 2 11 9 6 4 9 7 14 19 9 22 16 2 13 2 0 24 5 0 18 2 11 8 0 1 1 thermophilic anaerobe NA10: 1 3 0 0 2 12 6 6 2 10 11 14 22 15 3 1 7 24 16 61 6 19 14 41 4 17 15 23 3 12 14 28 7 7 18 24 2 12 16 36 30 27 45 11 18 5 11 24 24 19 39 22 33 2 6 6 29 37 6 25 10 38 0 0 1 thermophilic bacterium PS3: 22 13 175 60 49 8 4 7 118 102 102 44 251 14 40 126 19 71 12 61 51 257 12 20 6 210 14 55 193 296 77 65 275 107 77 25 222 163 100 260 95 150 55 163 70 56 85 264 117 160 100 90 100 5 18 199 149 8 221 216 212 83 11 1 9 thermophilic bacterium RT8.B4: 4 2 2 2 2 33 18 8 8 24 48 34 36 31 8 10 18 18 20 36 10 5 18 31 4 9 13 53 9 4 36 29 13 17 31 29 8 19 56 76 52 30 52 17 25 9 18 61 29 32 51 28 36 8 9 15 72 60 18 59 30 22 3 1 0 .